Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Шмид Р. Наглядная биотехнология и генетическая инженерия..pdf
Скачиваний:
896
Добавлен:
30.05.2021
Размер:
9.07 Mб
Скачать

инженерии

Маркерные группы

ВВЕДЕНИЕ. Маркерные молекулы имеют важное зна-

 

 

чение в фундаментальных исследованиях и приклад-

генетической

ной биотехнологии. Их используют: 1) при гисто- и

цитохимическом изучении клеток; 2) при отборе не-

 

 

обходимых клеток в клеточном анализаторе; 3) для

 

визуализации комплексов, например, с ДНК или с

 

антителами; 4) в генетической инженерии – при кло-

 

нировании промоторов. Для мечения используют ра-

 

диоактивные изотопы, флуорофоры, ферменты, ди-

Методы

гоксигениновую

или биотин-стрептавидиновую

систему, а в качестве генетических маркеров исполь-

 

 

зуют гены β-галактозидазы, люциферазы или GFP

 

(зеленого флуоресцентного белка).

 

РАДИОАКТИВНОЕ

МЕЧЕНИЕ. Для радиоиммуного

 

анализа белки метят с помощью 131I или 35S, а де-

 

тектирование осуществляют на сцинтилляционном

 

счетчике. В генетической инженерии в ДНКили

 

РНК-зонды вводят 32Р-фосфатные группы, используя

 

ДНК-полимеразу I, фрагмент Клёнова или РНК-поли-

 

меразу. Результаты гибридизации меченых фрагмен-

 

тов наблюдают с помощью авторадиографа. Соблю-

 

дение техники безопасности при работе с

 

радиоактивными изотопами сопряжено с финансо-

 

выми затратами. Несмотря на это, радиоактивное

 

мечение чаще всего используется благодаря высокой

 

чувствительности методов детекции. Поиск новых

 

меток и подходящих быстрых методов детекции про-

 

должается

 

 

ФЛУОРОФОРЫ. Использование таких флуорофоров,

 

как флуоресцеин или родамин, позволяет обнаружи-

 

вать вещества в пикомолярных концентрациях. В ги-

 

сто- и цитохимических исследованиях особенно ши-

 

рокое применение находят меченные флуорофорами

 

антитела. В клеточном анализаторе FACS за одну ми-

 

нуту можно отделить до 1000 клеток, несущих флу-

 

оресцентный маркер. Примером использования этого

 

метода в клеточной биологии является разделение

 

различных типов Т- и В-клеток, имеющих на своей

 

поверхности специфические антитела. Другой при-

 

мер применения флуорофоров – поиск в смеси бак-

 

терий тех, чья 16S-рРНК гибридизуется со специфи-

 

ческим меченым зондом (FISH). Флуоресцентными

 

маркерами для ДНК являются SYBR-GreenTM и бро-

 

мистый этидий.

 

 

ФЕРМЕНТЫ. Преимущества ферментных меток об-

 

условлены их мощной каталитической активностью,

 

благодаря которой достигается высокая чувствитель-

 

ность при многократном усилении сигнала. Это важ-

 

но при проведении анализов. Часто в качестве мар-

 

керов используются кислая фосфатаза и

 

пероксидаза хрена. Реакции, катализируемые этими

 

ферментами, можно изучать электрохимическими

266

(биосенсоры), фотометрическим, а также особенно

чувствительным хемилюминесцентным или флуорес-

центным методом. Эти методы имеют очень высокую чувствительность и позволяют определять концентрации веществ от пикодо аттомолей.

ДИГОКСИГЕНИН И СИСТЕМА БИОТИН/СТРЕПТАВИДИН.

Это так называемые непрямые маркеры – они присоединяются к другим, настоящим маркерным группам на биомолекуле. Стероид дигоксигенин присоединяется к нуклеотиду через гидроксильную группу и не препятствует гибридизации. Для выявления гибридизовавшегося зонда, меченного дигоксигенином, используют его способность с высокой аффинностью (10–9 М) связываться с антителами, которые несут метку.

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ. Встраивание в плазмиду генов, кодирующих маркерные группы, значительно облегчает отбор клонов, несущих такую ДНК-конст- рукцию. При так называемом «бело-голубом» скрининге используют ген β-галактозидазы. В последовательности гена находятся сайты для встраивания чужеродной ДНК. Если плазмида несет соответствующую вставку, синтез β-галактозидазы прекращается и ее субстрат 5-бром-4-хлор-3-индолил-β- D-галактопиранозид (X-Gal) в среде роста не гидролизуется, а значит, не образуется продукт синего цвета. Особенно просто доказать экспрессию зеленого флуоресцентного белка (GFP – green flourescent protein), ген которого выделен из медузы и кодирует образование флуоресцирующих белков, не требуя никаких дополнительных субстратов. Ген GFP часто применяется как метка, для того чтобы наблюдать функционирование промоторов, которые участвуют в экспрессии или регуляции генов. Для похожих целей можно использовать ген люциферазы, который, в отличие от GFP, нуждается в специфическом субстрате люциферине и АТФ (светляки) или деканале (фотобактерии).

Введение радиоактивной метки

 

Проточная цитометрия с использованием

Введение 32P-dATP

 

 

флуоресцентной метки (FACS*)

 

 

 

Электрод

 

 

 

 

 

 

 

 

Фрагмент Клёнова

 

 

Пьезо-

 

 

 

преобразователь

 

+ 32P-dATP

 

 

 

Липкий

 

 

 

 

 

 

Меченые

 

Кювета

 

 

конец (EcoRI)

 

 

 

 

концы

 

 

 

Лазерный

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

луч

Гибридизация с радиоактивно меченными зондами

 

 

 

 

 

 

 

Заземление

Меченые клетки

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Немеченые клетки

Носитель

Разделение

 

 

Заряженные

* FACS – метод

 

 

пластины

с иммобили-

хромосомы

Зонд,

 

сортировки клеток

 

 

с флуоресцентной

зованными

 

авторадио-

 

меткой

клетками

 

графия

 

 

 

 

Положение пятен

 

 

Вакуум

 

 

на авторадио-

 

 

 

 

 

 

грамме указывает

 

 

 

 

 

на локализацию

 

 

 

 

 

 

исследуемого

 

 

 

 

 

 

гена на хромосоме

 

 

X/Y-столик

 

 

 

 

 

 

 

 

Оптические методы наблюдения результатов гибридизации

 

 

Флуоресценция

Хемилюминесценция

Визуальное наблюдение

1

2

Диоксетан

 

Индолилфосфат

Индиго

 

 

 

 

Щелочная фосфатаза

 

Метка

 

 

 

 

 

Антитело

 

 

Сайт связывания

 

Участок

 

 

 

связывания

 

 

 

 

с ДНК через

 

 

 

 

 

 

с антителом

 

 

 

 

спейсер

 

 

 

 

 

 

 

Дигоксигенин

 

 

 

 

 

(гаптен)

 

 

 

 

 

 

 

Спейсер

 

 

 

 

 

 

Зонд

 

 

Дигоксигенин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Мишень (последовательность)

 

 

Часто используемые метки

 

 

 

 

 

 

Ген

Субстрат

Детектирование

 

 

lacZ ': фрагмент гена

5-Бром-4-хлор-3-индолил-

Белый или голубой цвет

 

 

 

β-галактозидазы

β-D-Галактопиранозид (X-Gal)

 

 

 

 

lux: люцифераза светляков

Люциферин

Люминесценция

 

 

или фотобактерий

 

 

 

 

 

GFP: зеленый флуоресцентный

Флуоресценция

 

 

белок из медузы

 

 

 

267