Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Шмид Р. Наглядная биотехнология и генетическая инженерия..pdf
Скачиваний:
551
Добавлен:
30.05.2021
Размер:
9.07 Mб
Скачать

среда

Микробиологическое выщелачивание руд и биокоррозия

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

окружающая

ВВЕДЕНИЕ. В США, Канаде, Австралии и Мексике для

веденных местах, куда руда транспортируется. В дру-

 

 

выщелачивания бедных руд (то есть для извлечения

гом способе используют отработанные шахты. Хоро-

 

отдельных составляющих руды путем их растворе-

шо разработан метод чанового бактериального выще-

 

ния) используются тиобактерии. Около 25% всего

лачивания. Его преимущество по сравнению с

 

мирового объема меди, более 10% золота и 3% ко-

другими способами заключается в высокой эффек-

 

бальта и никеля добываются с помощью биовыщела-

тивности извлечения ценных металлов и экологиче-

и

чивания.

ской безопасности процесса. Изучается также метод

МИКРОБИОЛОГИЯ И ФИЗИОЛОГИЯ ПРОЦЕССА. Тио-

выщелачивания гетеротрофными микроорганизма-

Биотехнология

бактерии осуществляют выщелачивание руд; эти хе-

ми. В основе метода лежит секреция активных хела-

 

 

молитотрофные грамотрицательные палочки, как

тирующих веществ (таких, как лимонная или глюко-

 

правило, фиксируют СО2. Для получения энергии эти

новая кислоты), например штаммами пеницилла,

 

микроорганизмы окисляют восстановленные соеди-

которым для роста требуются органические источни-

 

нения серы, например сульфиды, в результате чего

ки углерода.

 

 

 

 

 

 

 

образуется серная кислота. В отличие от Thiobacillus

БИОКОРРОЗИЯ. В круговороте веществ в природе

 

thiooxidans бактерии Т. ferroоxidans способны окис-

один из важных процессов – анаэробное окисление

 

лять не только восстановленные соединения серы, но

металлического железа с образованием FeS (биокор-

 

и растворимые соли Fe2+. Оба вида бактерий растут

розия). Реакцию

 

 

 

 

в кислой среде и устойчивы при рН 2. Сульфидные и

 

 

 

2–

 

+ 2H2O + 2Н+ → FeS + 3Fe(OH)2

 

оксидные компоненты руды, такие как пирит (серный

4Fe + SO4

 

 

или железный колчедан, FeS2), халькозин (CuS2),

осуществляют анаэробные микроорганизмы, способ-

 

ковеллин (медный блеск, CuS), сфалерит (цинковая

ные восстанавливать сульфат, например Desulfovib-

 

обманка, ZnS), галенит (свинцовый блеск, PbS), мо-

rio vulgaris. В анаэробных условиях железо также

 

либденит (молибденовый блеск, MoS2), антимонит

окисляется до Fe2+:

 

 

 

 

(сурьмяный блеск, Sb2S3), сульфид кобальта (CoS)

4Fe + 8H

+

 

2+

+ 4H2

 

и уранинит (UO2) могут выщелачиваться посредст-

 

→ 4Fe

 

Образующаяся в этом процессе водородная пленка

 

вом тиобактерий. При прямом микробиологическом

 

выщелачивании происходит непосредственный кон-

защищает железо от

дальнейшего разрушения.

 

такт между бактериями и сульфид-содержащим ми-

В присутствии сульфата Desulfovibrio окисляет H2:

 

нералом. Окисление до сульфата происходит в не-

4H

2

+ SO2–

→ H S + 2H

2

O + 2OH,

 

сколько стадий согласно следующему суммарному

 

 

4

 

2

 

 

 

уравнению:

что приводит к образованию нерастворимых сульфи-

 

MS + 2O2 → MSO4

да железа и гидроксида железа:

 

4Fe2+ + H2S + 2OH+ 4H2O →

 

Непрямое бактериальное выщелачивание заключа-

 

ется в химическом превращении сульфидсодержа-

 

 

 

 

 

 

FeS + 3Fe(OH) + 6H+

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2

 

щих минералов в растворимые сульфаты и свобод-

Биокоррозия существенно разрушает железные тру-

 

ную серу:

бы подземных коммуникаций.

 

 

 

MS + Fe2(SO4)3 → MSO4 + 2FeSO4 + S°

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Образующееся двухвалентное железо Fe2+ окисля-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ется бактериями до Fe3+ и снова может участвовать

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

в окислительном процессе в кислых условиях. При

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

рН 2–3 микробное окисление Fe2+ происходит в

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

105–106 раз эффективнее, чем химическое окисле-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ние. На практике два описанных способа выщелачи-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

вания руд часто проводят одновременно, так как ру-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ды имеют сложный состав.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ТЕХНИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ. Для процесса вы-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

щелачивания руд оптимальны следующие условия:

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

руда подходящего состава с требуемым размером

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

частиц, проведение реакций в кислых условиях и при

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

температуре около 30 °С, интенсивная аэрация. На

 

 

 

 

 

 

 

 

 

120

практике выщелачивание руды проводят in situ непо-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

средственно на рудном отвале или в специально от-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Биологическое выщелачивание руды

 

 

 

Выщелачивание

 

Вскрыша

 

 

 

 

рудного отвала

 

 

 

 

 

 

Добавление воды

 

Нетронутый

 

 

 

 

Выщела-

 

Анализ,

 

породный массив

 

 

 

 

 

контроль

 

 

 

 

 

чивание

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

процесса

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Отвал, в который

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

внесены микро-

 

 

 

 

 

Thiobacillus

 

 

 

организмы

 

 

 

Сульфид меди

ferrooxidans

Сульфат меди

Кислота

 

Плавка

 

 

 

 

 

 

 

 

Высу-

Расплавление

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Железный шлам

Осаждение

 

шива-

 

 

 

 

 

ние

 

 

Fe° + Cu2+

Cu+ + Fe2+

 

 

Медный шлам

Электролиз

 

 

 

 

 

 

Стадии биохимического процесса

 

 

 

 

SO32– + АМФ

 

АФС + 2е

 

 

 

 

АФС + P

i

 

АДФ + SO2–

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

АМФ

АФС

АДФ

2АДФ

 

 

АМФ + АТФ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

АМФ – аденозинмонофосфат

 

 

 

Сульфидоксидаза

AФС-редуктаза

 

 

АДФ – аденозиндифосфат

 

 

 

Тиосульфатгидролаза

Сульфатаденилилтрансфераза

 

АФС – аденозинфосфосульфат

 

 

 

Серная оксидаза

Аденилаткиназа

 

 

 

 

 

 

 

 

Сульфитоксидаза

 

 

Кинетика выщелачивания

 

 

 

 

Варианты осуществления выщелачивания

 

100

 

 

 

 

T. ferrooxidans

а

 

Выщелачивание

 

90

 

 

 

 

T. ferrooxidans +

 

 

рудного отвала

 

80

 

 

 

 

T. thiooxidans

 

 

 

%

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

70

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

урана,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Подача

60

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

50

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Экстракция

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Отвод

40

 

 

 

 

 

T. thiooxidans

 

 

 

30

 

 

 

 

 

 

 

Выщелачивание

 

 

 

 

 

 

 

б

 

20

 

 

 

 

 

 

 

 

 

складированного

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

шлама

 

10

 

 

 

 

 

Стерильные

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

условия

 

 

 

 

 

10

20

30

40

 

50

сут.

 

 

 

Культуры в качалочных колбах,

 

 

 

 

 

 

 

5% урановой руды, зерна < 600 мм

 

 

 

 

 

 

Биокоррозия

 

 

 

 

 

 

в

 

Выщелачивание

Металлическое

 

 

 

 

 

 

 

 

in situ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

железо

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Desulfo-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

vibrio

 

 

 

121

медицине

Инсулин

рующий уровень глюкозы крови. При лечении сахар-

 

ВВЕДЕНИЕ. Инсулин – это пептидный гормон, регули-

в

ного диабета (Diabetes mellitus) инсулин незаменим.

Биотехнология

До 1985 г. инсулин получали из отходов мясной про-

 

 

мышленности (поджелудочная железа крупного рога-

 

того скота и свиней). Современная технология произ-

 

водства инсулина основана на использовании

 

рекомбинантных штаммов Escherichia coli и Saccharo-

 

myces cerevisiae. Объем рынка инсулина составляет

 

около 8 тонн в год и оценивается в 5 млрд долларов

 

США.

 

DIABETES MELLITUS (сахарный диабет). Это заболева-

 

ние вызвано нарушениями образования или секреции

 

инсулина в кровь. Более распространен диабет II типа,

 

при котором лечение заключается в дополнительной

 

стимуляции синтеза гормона в организме. При диабе-

 

те I типа образование собственного инсулина наруше-

 

но из-за генетического дефекта, вирусной инфекции

 

или аутоиммунного заболевания, и для поддержания

 

нормального уровня глюкозы крови пациенту необхо-

 

димы регулярные инъекции инсулина. В мире от диа-

 

бета страдают 170 млн человек, из которых 60 млн

 

больны диабетом I типа (в Германии ~400 000 паци-

 

ентов с диабетом I типа). Более 2% населения инду-

 

стриальных регионов Земли являются диабетиками II

 

типа (в Германии – 2,4 млн).

 

БИОСИНТЕЗ ИНСУЛИНА. Синтез препроинсулина про-

 

исходит в β-клетках поджелудочной железы живот-

 

ных. Образовавшийся в результате внутриклеточного

 

процессинга проинсулин запасается в аппарате Голь-

 

джи. При недостатке глюкозы в крови проинсулин

 

расщепляется мембранными протеазами на три поли-

 

пептидные цепи – А, В и С. Цепи А и В (21 и

 

30 аминокислотных остатков соответственно) сближа-

 

ются и соединяются посредством трех дисульфидных

 

мостиков, а центральная С-цепь (31 аминокислотный

 

остаток) под действием ферментов отщепляется. Так

 

образуется активная форма инсулина.

 

ПОЛУЧЕНИЕ ИНСУЛИНА. Возможность использова-

 

ния инсулина при терапии диабета была продемонст-

 

рирована в 1922 г. Традиционная методика получе-

 

ния инсулина заключалась в экстракции бутанолом

 

из поджелудочной железы крупного рогатого скота

 

или свиней, последующей кристаллизации цинксо-

 

держащей формы инсулина с дальнейшей очисткой

 

гормона методами хроматографии. Количества инсу-

 

лина, полученного из поджелудочной железы одной

 

свиньи, хватает больному диабетом на 3 дня, а инсу-

 

лина из одной коровы – на 10 дней. Однако свиной и

 

коровий инсулин по аминокислотному составу отли-

 

чаются от инсулина человека (в положениях 1 и 2 со-

 

ответственно), поэтому при длительном приеме чу-

122

жеродного инсулина у больных может развиваться

иммунная реакция. Метод химического синтеза

инсулина, полностью аналогичного человеческому, был предложен еще в 1964 г., однако осуществление в промышленном масштабе такого сложного и дорогостоящего синтеза оказалось экономически нецелесообразным. В 1975 г. был разработан метод получения из поджелудочной свиньи инсулина, полностью идентичного инсулину человеку. Для этого происходит ферментативное замещение остатка Ala30 в В-цепи на остаток Thr30 с помощью иммобилизованной карбоксипептидазы Y. Промышленное получение инсулина методами генетической инженерии стало возможным с 1985 г. В качестве клеток-хозяев, продуцирующих инсулин, были выбраны клетки Escherichia coli К12. Частота встречаемости кодонов аминокислот в клетках человека и бактерии значительно различается, поэтому, несмотря на то что кДНК препроинсулина можно выделить из культуры β-клеток человека (она составляет 75% фракции суммарной мРНК этих клеток), для создания экспрессирующего вектора более целесообразно оказалось получать кДНК методом химического синтеза. В ранних методах синтеза А- и В-цепи экспрессировали раздельно, очищали, а затем после химического окисления цистеина и образования дисульфидных мостиков получали активный инсулин. В современном производстве проинсулин в клетках Escherichia coli синтезируется в виде белка, слитого с триптофансинтазой, которую впоследствии отщепляют протеолизом. Такой проинсулинсодержащий слитый белок составляет до 40% клеточной массы оптимизированных штаммов-продуцентов, таким образом из 40 м3 клеточной культуры после очистки методом обращенно-фазовой хроматографии удается получить около 100 г чистого инсулина. Разработан способ получения укороченного, так называемого «мини-проин- сулина» в клетках Saccharomyces cerevisiae.

НОВЫЕ ТИПЫ ИНСУЛИНА. Было показано, что препарат инсулина человека, содержащего в В-цепи Lys28Pro29 вместо Pro28Lys29 значительно быстрее усваивается организмом, что помогает больным диабетом планировать свое питание. Такой лизпро-инсу- лин, как и обычную форму, получают в рекомбинантном штамме E. coli. В настоящее время изучаются возможности терапевтического применения других производных инсулина: Pro28Asp (инсулин аспарт – короткого действия, разрешен к применению), Asn3LysLys29Glu (В-цепь, инсулин глулизин – аналог инсулина быстрого действия, фаза III), Thr30Arg31Arg (В-цепь) Asn21Gly (А-цепь, инсулин гларгин – длительного действия), а также инсулина, содержащего Thr30delLys29, ацетилированного жирной кислотой (препарат «Инсулин Детемир»).

Первичная структура инсулина человека

 

 

А-цепь

 

 

 

В-цепь

 

 

 

С-концевой Thr отщепляется карбоксипептидазой Y, а октапептид – трипсином

Пространственная структура

Биосинтез инсулина и экспрессирующая плазмида

молекулы инсулина

 

 

 

Структура инсулина

Препосле-

Препроинсулин

Проинсулин = ВСА

дователь-

 

 

свиньи была

 

ATG

ность

 

установлена путем

 

Спонтанное

кодирует

рентгено-

Met

стркутурного

расщепление

 

анализа моно-

 

 

 

кристалла

 

 

 

с разрешением

 

 

 

0,18 нм (9INS)

 

 

 

Коричневым

Протео-

Точка начала репликации

цветом

литическое

Селективный маркер

показана

расщепление

Промотор

А-цепь,

 

 

голубым – В-цепь,

 

 

Препоследовательность Р

желтым – дисульфидные мостики,

 

 

с кодоном ATG

красным – замена Ala30 (инсулин свиньи)

 

Инсулин

для расщепления

на Thr30 (инсулин человека)

 

с помощью BrCN

 

 

Структура инсулина из различных источников (С-конец В-цепи)

 

 

 

 

Трипсин

 

 

 

 

Заменен С-концевой

 

 

 

 

октапептид

 

 

 

 

Карбоксипептидаза Y

 

 

 

 

Заменен С-концевой остаток

 

 

 

 

аланина на треонин

 

Замена Lys

Рекомбинант-

Природный

Инсулин

Инсулин

на Pro –

ный инсулин

инсулин

свиньи

крупного

инсулин

человека,

человека

 

рогатого

с повышенной

полученный

 

 

скота*

биологической

в клетках

 

 

 

активностью

E. coli K12

 

* Дополнительные замены двух аминокислотных остатков в А-цепи

Получение рекомбинантного инсулина человека в клетках E. coli K12

 

Биореактор

 

Выделение

 

 

Обработка

 

Объем 40 м3,

Выделение телец

1.

Расщепление слитого белка по остатку метионина

~ 2,5 г

30 ч, 37 °C,

включения,

 

с помощью CNBr

инсулина

 

человека

источник

удаление

2.

Получение S-сульфопроизводных

на 1 м3

углерода

клеточных

3.

Восстановление S-сульфоцистеина до цистеина

за 30 ч

и источник

фрагментов

4. Образование дисульфидных мостиков (O2, рН 10,6)

 

азота

 

 

5.

Трипсин/карбоксипептидаза В, удаление С-пептида

 

123