- •Содержание
- •Предисловие
- •Предисловие ко 2-му изданию
- •Введение
- •Этапы развития биотехнологии
- •Биотехнология сегодня
- •Биотехнологическое производство пищевых продуктов
- •Алкогольные напитки
- •Пивоварение
- •Ферментация в пищевой промышленности
- •Пищевые продукты и молочнокислое брожение
- •Этиловый спирт
- •1-Бутанол, ацетон
- •Уксусная кислота
- •Лимонная кислота
- •Молочная и глюконовая кислоты
- •Аминокислоты
- •L-Глутаминовая кислота
- •D,L-Метионин, L-лизин и L-треонин
- •Антибиотики
- •Антибиотики: источники, применение и механизмы действия
- •Антибиотики: получение. Устойчивость к антибиотикам
- •β-Лактамные антибиотики: промышленное получение
- •Гликопептидные, полиэфирные и нуклеозидные антибиотики
- •Аминогликозидные антибиотики
- •Тетрациклины, хиноны, хинолоны и другие ароматические антибиотики
- •Поликетидные антибиотики
- •Получение новых антибиотиков
- •Специальные продукты
- •Витамины
- •Нуклеозиды и нуклеотиды
- •Биодетергенты и биокосметика
- •Микробные полисахариды
- •Биоматериалы
- •Биотрансформация
- •Биотрансформация стероидов
- •Ферменты
- •Ферменты
- •Ферментативный катализ
- •Ферменты в клинических анализах
- •Тесты с помощью ферментов
- •Применение ферментов в промышленных технологиях
- •Ферменты в производстве моющих средств
- •Ферменты, расщепляющие крахмал
- •Ферментативное расщепление крахмала в промышленности
- •Ферментативное превращение сахаров
- •Утилизация целлюлозы и полиозы
- •Использование ферментов в целлюлозно-бумажной промышленности
- •Пектиназы
- •Ферменты в производстве молочных продуктов
- •Использование ферментов в хлебобулочной и мясоперерабатывающей промышленности
- •Ферменты в кожевенной и текстильной промышленности
- •Перспективы получения ферментов для промышленных технологий
- •Белковая инженерия
- •Пекарские и кормовые дрожжи
- •Пекарские и кормовые дрожжи
- •Белки и жиры из одноклеточных организмов
- •Аэробная очистка сточных вод
- •Анаэробная очистка сточных вод и переработка ила
- •Биологическая очистка газовых выбросов
- •Биологическая очистка почв
- •Микробиологическое выщелачивание руд и биокоррозия
- •Инсулин
- •Гормон роста и другие гормоны
- •Гемоглобин, сывороточный альбумин и лактоферрин
- •Факторы свертывания крови
- •Антикоагулянты и тромболитики
- •Ингибиторы ферментов
- •Иммунная система
- •Стволовые клетки
- •Тканевая инженерия
- •Интерфероны
- •Интерлейкины
- •Эритропоэтин и другие факторы роста
- •Другие белки, имеющие медицинское значение
- •Вакцины
- •Рекомбинантные вакцины
- •Антитела
- •Моноклональные антитела
- •Рекомбинантные и каталитические антитела
- •Методы иммуноанализа
- •Биосенсоры
- •Биотехнология в сельском хозяйстве
- •Животноводство
- •Перенос эмбрионов и клонирование животных
- •Картирование генов
- •Трансгенные животные
- •Генетическая ферма и ксенотрансплантация
- •Растениеводство
- •Культивирование растительных клеток: поверхностные культуры
- •Культивирование растительных клеток: суспензионные культуры
- •Трансгенные растения: методы получения
- •Трансгенные растения
- •Вирусы
- •Бактериофаги
- •Микроорганизмы
- •Бактерии
- •Некоторые бактерии, важные для биотехнологии
- •Грибы
- •Дрожжи
- •Усовершенствование штаммов микроорганизмов
- •Основы биотехнологических методов
- •Микроорганизмы: рост в искусственных условиях
- •Кинетика образования продуктов метаболизма и биомассы в культуре микроорганизмов
- •Технология ферментации
- •Промышленные процессы ферментации
- •Культивирование животных клеток
- •Биореакторы для культивирования животных клеток
- •Биореакторы с иммобилизованными ферментами и клетками
- •Очистка биотехнологических продуктов
- •Очистка биотехнологических продуктов: хроматографические методы
- •Экономические аспекты биотехнологического производства
- •Методы генетической инженерии
- •Структура ДНК
- •Функции ДНК
- •Эксперимент в генетической инженерии
- •Методы выделения ДНК
- •Ферменты, модифицирующие ДНК
- •ПЦР: лабораторная практика
- •ДНК: химический синтез и определение размера молекул
- •Секвенирование ДНК
- •Введение ДНК в живые клетки (трансформация)
- •Идентификация и клонирование генов
- •Экспрессия генов
- •Выключение генов
- •Геном прокариот
- •Геном эукариот
- •Геном человека
- •Функциональный анализ генома человека
- •ДНК-анализ
- •Белковые и ДНК-чипы
- •Маркерные группы
- •Тенденции развития
- •Генная терапия
- •Поиск биологически активных веществ
- •Протеомика
- •Обмен веществ
- •Метаболомика и метаболическая инженерия
- •Системная биология
- •«Белая» биотехнология
- •Сертификация биотехнологической продукции
- •Этические аспекты генетической инженерии
- •Патентование в биотехнологии
- •Биотехнология в разных странах
- •Биотехнология в разных странах
- •Литература
- •Источники иллюстраций
- •Указатель микроорганизмов
Основы биотехнологических методов
Очистка биотехнологических продуктов: хроматографические методы
ВВЕДЕНИЕ. Хроматографические методы занимают важное место среди методов очистки биотехнологических продуктов. Для расчета оптимальных условий хроматографического процесса в колонке пользуются уравнением Ван-Деемтера. В зависимости от принципа разделения выделяют 1) гель-хроматогра- фию (по молекулярной массе), 2) адсорбционную хроматографию (гидрофильные/гидрофобные взаимодействия), 3) ионообменную хроматографию (по заряду), 4) изоэлектрофокусирование (по изоэлектрическим точкам) и 5) аффинную хроматографию (основана на специфическом взаимодействии с лигандами). Для выделения рекомбинантных белков чаще всего используют метод аффинной хроматографии, для которой разработано большое количество
разнообразных приборов, носителей и реагентов. На-
..
пример, система Аkta-System™ позволяет в течение нескольких часов подобрать оптимальные условия очистки белкового продукта. В лабораторных условиях хроматографическое разделение белков часто проводят, подавая элюент под высоким давлением (например, высокоэффективная жидкостная хроматография белков, или англ. fast protein liquid chromatography, FPLC). Для разделения белков в больших объемах также используют методы хроматографии, однако разделение под высоким давлением в промышленности осуществляется очень редко.
ГЕЛЬ-ХРОМАТОГРАФИЯ. В качестве носителя наиболее часто используют декстрановые или агарозные гели. Изменяя состав геля (т. е. содержание в нем декстрана или агарозы), можно регулировать размер пор. После частичного алкилирования гидроксильных групп на таком носителе можно работать с органическими растворителями.
АДСОРБЦИОННАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ. Гидроксиапатит – самый широко используемый гидрофильный носитель для адсорбционной хроматографии. В качестве гидрофобных носителей применяют бутилили фенилсефарозные гели. Разделение основано на гидрофобных или гидрофильных взаимодействиях между компонентами смеси и материалом носителя.
ИОНООБМЕННАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ. Ионообменную хроматографию обычно применяют для разделения смеси белков. Метод часто используется для очистки продуктов биотехнологической промышленности. Смесь пропускают через колонку с неподвижным слоем ионообменной смолы. Смолы представляют собой производные полисахаридов с сульфонильными (катионит) или аминогруппами (анионит). Разделение происходит в зависимости от заряда белка при определенных значениях рН.
АФФИННАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ. Этот элегантный метод основан на взаимодействии белков со специфическими лигандами, иммобилизованными на носителе. Например, для выделения дегидрогеназ используют производное декстрана с необычной структурой. Определенные группы такого носителя взаимодействуют с дегидрогеназой непосредственно в ее участке связывания с NADH. Для элюирования связавшегося белка используют низкомолекулярные соединения, конкурирующие с носителем за участки связывания с белком. В промышленности очистку препаратов для фармацевтического применения проводят методом иммунной хроматографии. На носителе иммобилизуют моноклональные антитела, специфически взаимодействующие с белком. Элюирование связавшегося продукта происходит при повышении ионной силы раствора или закислении среды. В лабораторных условиях процедура очистки рекомбинантного белка часто облегчается путем его специфической модификации. Например, рекомбинантный белок часто экспрессируют слитым с другим белком, для которого процедура очистки хорошо разработана. Таким «партнером» для облегчения выделения может служить стрептавидин. Для выделения слитых со стрептавидином белков используют колонки, на которых иммобилизован биотин. Другой распространенный метод модификации белка с целью облегчения его очистки заключается в генетически запрограмированном надстраивании С- или N-конца последовательностью из нескольких (4–6) остатков гистидина (таг) с использованием методов генетической инженерии. Белок, содержащий такую последовательность, с высокой эффективностью связывается с носителем – никельсодержащим производным полисахарида. Часто при оптимизации выделения белка прибегают к таким модификациям, чтобы обработка выделенного продукта специфическими протеиназами вновь приводила к образованию исходного белка.
220
Уравнение Ван-Деемтера |
|
|
Полимерный носитель |
||
|
|
|
|
Пример катионообменной смолы |
|
|
ВЭТТ |
|
|
на основе полисахарида |
|
|
|
|
|
|
|
мм |
|
|
|
|
100 мкм |
|
ВЭТТ |
|
|
|
|
ВЭТТ, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 мкм |
|
Скорость потока |
|
|
|
|
Н = Высота, эквивалентная |
В = Bклад неоднородности |
|
|
||
теоретической тарелке |
потока подвижной фазы |
Белок |
|||
(ВЭТТ) |
|
С = Bклад кинетики |
|||
|
Ионооб- |
|
|||
ν = Скорость потока |
массопередачи |
10 нм |
|||
А = Вклад продольной диффузии |
|
|
менные |
||
|
|
процессы |
|||
|
|
|
|
||
Белки |
Низкомолекулярные соединения |
10 мм |
|
||
|
|
||||
Способы применения полимерного носителя |
Примеры лигандов |
||||
Аффинные лиганды |
|
|
Гидрофобные взаимодействия |
||
|
Гидрофобные лиганды |
|
бутил-, октил-, фенил- |
||
|
«Слабый» катионит |
|
|||
|
|
|
|
||
Полимерный |
«Сильный» катионит |
|
Катионит |
|
|
матрикс |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
«Слабый» анионит |
|
карбоксиметил- |
||
«Сильный» анионит |
|
|
сульфопропил- |
||
|
|
|
|
||
Гель-проникающая хроматография |
|
Анионит |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
диэтиламиноэтил- |
|
|
|
|
|
триметиламинометил- |
|
|
|
|
Декстран |
Аффинная хроматография |
|
|
|
|
специфические лиганды |
||
|
|
|
в качестве |
||
|
|
|
молекулярного |
иммунные взаимодействия |
|
|
|
|
сита |
||
|
|
|
|
|
|
Аффинная иммунохроматография |
Хроматография с использованием |
||||
|
|
|
гистидинового тага (tag) |
|
|
Связавшийся белок |
|
Модифицированный |
Hитрилотриуксусная |
||
|
белок, несущий на конце |
кислота как лиганд |
|||
|
|
|
|||
|
|
|
4–6 остатков гистидина |
|
|
Носитель с иммуносорбентом |
|
|
|
||
|
Повышение ионной силы |
|
|
|
|
(концентрации солей)или снижение рН |
|
|
|
||
|
Элюированный |
|
|
Линкер |
|
|
белок |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
221 |
Основы биотехнологических методов
222
Экономические аспекты биотехнологического производства
ВВЕДЕНИЕ. При разработке и оптимизации биотехнологических процессов важную роль играют экономические факторы. Экономика диктует следующие важные цели: 1) разработать простые и технически надежные процессы; 2) минимизировать капитальные затраты, а также по возможности сократить персонал; 3) повысить эффективность производства: использовать дешевые энергоносители и сырье, повысить выход продукта, сократить время проведения технологического процесса; 4) разработать недорогие методы переработки отходов и очистки стоков.
УПРОЩЕНИЕ ТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ. В биотехнологической промышленности, где производство практически всегда состоит из множества отдельных стадий, и возможность объединить хотя бы две стадии получения или обработки продукта имеет важное экономическое значение. Так, в произодстве антибиотиков широкое распространение получил декантатор фирмы Westphalia, позволивший одновременно осуществлять стадии отделения клеток и экстракции растворителем. Обеспечение личной безопасности персонала во время технологического процесса является важнейшим критерием. В биотехнологической промышленности кроме обычных правил техники безопасности, связанных с инженерным обслуживанием системы, особое значение имеют меры по предотвращению заражения персонала инфекционными заболеваниями при работе с патогенными штаммами. Полная стерильность процесса также имеет очень важное экономическое значение: попадание нежелательных микроорганизмов в ферментер в результате неудовлетворительной стерилизации может привести к потере большого объема продукта и к значительным финансовым потерям.
УМЕНЬШЕНИЕ КАПИТАЛЬНЫХ ЗАТРАТ И СОКРАЩЕНИЕ ПЕРСОНАЛА. От 10 до 40% стоимости биотехнологического продукта составляют затраты на оплату труда персонала. Обычный процесс ферментации и очистки продукта занимает около недели: как правило, процесс постоянно контролируется персоналом, работающим посменно. Объем капитальных затрат на биотехнологическое производство составляет 107–108 евро. Амортизационные отчисления и страховые расходы составляют около 10% капитальных затрат.
СЫРЬЕ И ЭНЕРГОНОСИТЕЛИ. Основные энергетические затраты связаны с работой систем стерилизации, охлаждения ферментера и перемешивания культуральных жидкостей. Крупные промышленные ферментеры стерилизуют в непрерывном режиме (140 °С, 4 мин). В процессе роста клеток около половины полученной при переработке питательных веществ энергии высвобождается в виде тепла, при перемешивании также выделяется тепло. Для отвода тепла крупных ферментеров используются охлажда-
ющие рубашки или змеевики. В современных производствах система теплообменников позволяет рационально использовать до 90% выделившейся при культивировании микроорганизмов энергии. При проведении ферментации по традиционной технологии 30–60% затрат приходится на закупку сырья, прежде всего источников углерода. В последнее время все большее распространение получают сложные среды, например на основе мелассы или соевого молока. Применение таких сред экономически выгодно, однако их недостатком является непостоянство состава. Мерам стандартизации и контроля качества сырья в промышленности уделяется большое внимание.
БИОМАССА И ОЧИСТКА СТОЧНЫХ ВОД. В процессе ферментации образуется биомасса и сточные воды с высоким показателем БПК5. Например, при производстве лимонной кислоты в реакторе объемом 300 м3 образуется около 15 тонн (сырой вес) клеточной массы Aspergillus niger. По экологическим соображениям биомассу, образовавшуюся при ферментации, сжигают. Это достаточно дорогая операция, если учесть высокое содержание воды в клетках. Как правило, продукт ферментации оказывается сильно разбавленным: обычно это раствор, в котором концентрация продукта не превышает 10%. В результате концентрирования и очистки продукта образуется большое количество стоков, загрязненных питательными веществами, сульфатом кальция, растворителями и т. д. Очистка сточных вод вносит значительный вклад в производственные затраты.
АНАЛИЗ ЭФФЕКТИВНОСТИ ПРОЦЕССА. Любой технологический процесс можно разделить на стадии и составить экономическую характеристику каждой стадии. Таким образом, можно установить, какая из стадий требует наибольших затрат, и попытаться ее оптимизировать. Разработаны специальные компьютерные программы, с помощью которых можно учесть практически все сложные экономические взаимосвязи в биотехнологическом производстве.
Основные расходы при производстве |
|
|
|
Затраты на очистку продукта |
|
||||||||
L-аминокислот |
|
|
|
|
|
% |
100 |
|
|
|
|
|
|
Непрерывный |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
продукта, |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
процесс (иммоби- |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
лизованные клетки) |
|
|
|
|
|
|
80 |
|
|
|
|
|
|
Периодический |
|
|
|
|
|
|
выход |
60 |
|
|
|
|
|
процесс |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0 |
20 |
40 |
60 |
80 |
100 |
Общий |
40 |
Выход |
|
|
|
|
|
за стадию |
|
|
|
|||||||||
ДЕАД- |
|
|
Относительные затраты |
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
очистки |
|
|
|
||||||
|
на технологический процесс, % |
|
|
|
|
|
|||||||
сефадекс |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Энергия |
Аминоацилаза (стоимость ферментов) |
|
|
|
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
||||
Персонал |
Ацетил-D, L-аминокислоты (стоимость сырья) |
|
|
Число стадий очистки |
|
||||||||
Промышленное производство лимонной кислоты |
|
|
|
|
|
|
|
||||||
Расходные материалы |
|
Производственная стадия |
|
|
|
Продукт |
|
|
|
||||
|
|
|
Среда ферментации 284 000 л |
|
|
|
|
|
|
|
|||
Вода для промывки |
|
Отстаивание |
|
|
|
|
|
Сырая биомасса |
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(3400 кг сырого веса) |
|
Фильтрование
22 000 кг извести [Са(ОН)2] |
Сепаратор |
Оксалат кальция |
|
Нагревание до 80–90°С, затем до 95°С |
|
|
Фильтрование в ротационном фильтре, |
|
|
осадок – 40 000 л суспензии цитрата кальция |
Отходы (фильтрат) |
35 000 кг 95% серной кислоты |
Обработка кислотой |
|
(маточный раствор) |
|
|
Вода для промывки |
Фильтрование |
6000 кг сульфата кальция |
|
Выпаривание: 67% лимонная кислота |
|
|
Ионообменная хроматография, |
|
|
активированный уголь |
|
|
Кристаллизация |
|
Вода для промывки |
Центрифугирование |
Маточный раствор |
Горячий воздух |
Высушивание |
|
|
Упаковка |
40 456 кг безводной |
|
|
лимонной кислоты |
|
|
Затраты на производство рекомбинантного белка |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
(получение препаратов человеческого инсулина в клетках E. coli, ферментер объемом 35 м3, |
|
|
|
||||
|
|
периодическая ферментация, 24 ч, 25 г инсулина на 1 кг сухого веса клеток, 1 т продукта в год) |
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Реагенты |
Количество, |
Цена, |
Стоимость, |
Вклад |
|
||
|
|
|
кг/год |
долл. США/кг |
долл. США/год |
в стоимость, % |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Глюкоза |
432 640 |
0,69 |
|
298 520 |
68,3 |
|
|
|
|
Кукурузный экстракт |
652 800 |
0,12 |
|
78 336 |
17,9 |
|
|
|
|
Соли |
~ 12 000 |
|
|
~ 40 000 |
8,4 |
|
|
|
|
Пеногасители |
2 448 |
4,86 |
|
11 897 |
2,7 |
|
|
|
|
Тетрациклин |
163,2 |
55 |
|
8 965 |
2,7 |
|
|
|
|
Сырье для ферментации |
|
|
|
437 000 |
100 |
|
|
|
|
Гуанидинхлорид |
1 007 |
2,15 |
|
2 165 100 |
56,4 |
|
|
|
|
(для растворения |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
телец включения) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Карбоксипептидаза В |
0,8 |
1 023,00 |
|
818 400 |
21,3 |
|
|
|
|
(для расщепления |
|
(цена 1 г) |
|
|
|
|
|
|
|
слитого белка) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Муравьиная кислота |
262 280 |
1,25 |
|
327 850 |
8,5 |
|
|
|
|
Бромциан |
22 848 |
11,00 |
|
251 330 |
6,5 |
|
|
|
|
Другие химикаты |
|
|
|
28 000 |
7,3 |
|
|
|
|
Очистка |
|
|
|
3 839 000 |
100 |
|
223 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|