- •Биология дрожжей
- •Глава 1. Зарождение и развитие знаний о дрожжах
- •Глава 2. Дрожжевая клетка. Цитология
- •Компоненты дрожжевой клетки Ядро
- •Митохондрии
- •Цитоплазматическая мембрана
- •Эндоплазматический ретикулум и комплекс Гольджи
- •Вакуоли
- •Клеточная стенка
- •Капсула
- •Цитоплазма
- •Изменения клеточных структур в онтогенезе
- •Цитологические особенности дрожжей в различных условиях роста
- •Глава 3. Морфология и бесполое размножение
- •Макроморфология дрожжей
- •Микроморфология дрожжей
- •Типы вегетативного размножения
- •Псевдомицелий
- •Истинный мицелий
- •Диморфизм и плеоморфизм
- •Баллистоспоры
- •Эндоспоры
- •Хламидоспоры
- •Клеточный цикл
- •Глава 4. Половое размножение и жизненные циклы дрожжей
- •Дифференциация пола у дрожжей
- •Аскомицетовые дрожжи
- •Гаплоидные дрожжи
- •Диплоидные дрожжи
- •Гапло-диплоидные дрожжи
- •Базидиомицетовые дрожжи
- •Глава 5. Особенности метаболизма
- •Спиртовое брожение
- •Субстраты брожения
- •Дыхание
- •Углеводы
- •Жирные кислоты и н-алканы
- •Одноуглеродные соединения
- •Ароматические соединения
- •Вторичные продукты метаболизма
- •Источники азота
- •Глава 6. Лимитирующие факторы
- •Температура
- •Активность воды
- •Кислотность среды
- •Ингибиторы роста
- •Киллерный эффект у дрожжей
- •Глава 7. Распространение дрожжевых грибов в природе
- •Специфические локусы развития дрожжей Виноград и другие сочные плоды
- •Нектароносные цветки и насекомые-опылители
- •Сокотечения деревьев
- •Разлагающиеся ткани кактусов
- •Буровая мука насекомых-ксилофагов
- •Кишечный тракт беспозвоночных животных
- •Дрожжи на растениях, растительных остатках и в почве
- •Эпифитные дрожжи
- •Растительные остатки
- •Смена дрожжевых сообществ при разложении растительных остатков
- •Географические закономерности в распространении дрожжей
- •Лесная полоса
- •Пустыня
- •Высокогорья
- •Функции дрожжевых грибов в природных экосистемах
- •Жизненные формы дрожжей
- •Глава 8. Дрожжи - возбудители заболеваний человека
- •Кандидоз
- •Криптококкоз
- •Malassezia
- •Глава 9. Промышленное использование дрожжей
- •Традиционные процессы
- •Виноделие
- •Пивоварение
- •Хлебопечение
- •Дрожжи в современной биотехнологии Дрожжи как источник белка
- •Производство этанола
- •Различные продукты, получаемые из дрожжей
- •Глава 10. Систематика дрожжей
- •Концепция вида у дрожжей
- •Признаки и критерии, используемые в систематике дрожжей
- •Стандартное описание вида у дрожжей
- •Моносахаридный состав клеточных стенок
- •Тип кофермента q
- •Ультраструктура септовых пор
- •Особенности систематики анаморфных дрожжей
- •Коллекции дрожжей
- •Идентификация дрожжей
- •Роды дрожжей
- •Аскомицетовые дрожжи
- •Роды аскомицетовых дрожжей
- •Базидиомицетовые дрожжи
- •Роды базидиомицетовых дрожжей
- •Литература
- •Ресурсы Интернета Сайты крупнейших коллекций дрожжей:
- •Сайты некоторых научных журналов, наиболее часто публикующих статьи по биологии дрожжей:
- •Персональные страницы крупнейших зимологов
- •Дрожжевая клетка
- •Цитоплазматическая мембрана
- •Фосфолипиды
- •Стероиды
- •Ядрышко
- •Нуклеолемма
- •Бляшка (центриолярная пластинка)
- •Конденсация днк и образование хромосом
- •Хромосомы
- •Митохондрии
- •Petite-мутации и генетика митохондрий
- •Микротрубочки
- •Полисомы
- •Вакуоли в дрожжевых клетках
- •Эндоплазматический ретикулум
- •Комплекс Гольджи
- •Пероксисомы
- •Гликоген
- •Строение клеточной стенки
- •Моносахариды клеточной стенки дрожжей
- •Полисахаридный состав клеточной стенки
- •Β-Глюкан
- •Маннопротеины клеточной стенки
- •Капсулы дрожжей при различных способах микроскопирования
- •Внеклеточные полисахариды липомицетов
- •Пуллулан
- •Меланоидные пигменты
- •Астаксантин
- •Трегалоза
- •Рост дрожжей на н-алканах
- •Гигантские колонии
- •Рост различных видов дрожжей на скошенном агаре
- •Красные дрожжи
- •«Черные дрожжи»
- •Рост в жидких средах
- •Типы вегетативного размножения у дрожжей
- •Клеточный цикл
- •Артрический и бластический конидиогенез
- •Форма клеток и типы почкования у различных дрожжей
- •Голобластическое и энтеробластическое почкование
- •Шрамы почкования
- •Многостороннее почкование
- •Мицелиально-дрожжевой диморфизм
- •Истинный мицелий
- •Псевдомицелий
- •Бластоспоры
- •Артроспоры
- •Баллистоспоры
- •Хламидоспоры
- •Эндоспоры
- •Апрессории
- •Жизненный цикл
- •Мейоз и споруляция
- •Аски и аскоспоры
- •Дифференциация пола у дрожжей
- •Механизм конверсии mat-гена
- •Типы полового процесса у дрожжей
- •Педогамия
- •Гологамия
- •Адельфогамия
- •Слияние гаметангиев
- •Образование аска
- •Зиготические и азиготические аски
- •Аски на мицелии у дрожжеподобных грибов
- •Форма аскоспор у дрожжей
- •Число спор в аске
- •Лизирующиеся аски
- •Поверхность аскоспор в сканирующем электронном микроскопе
- •Жизненный цикл Schizosaccharomyces pombe
- •Жизненный цикл Debaryomyces hansenii
- •Жизненный цикл Nadsonia elongata
- •Жизненный цикл Lipomyces tetrasporus
- •Жизненный цикл Saccharomycodes ludwigii
- •Жизненный цикл Hanseniaspora uvarum
- •Жизненный цикл Saccharomyces cerevisiae
- •Жизненный цикл Metschnikowia pulcherrima
- •Базидии и базидиоспоры
- •Дикариотический мицелий с пряжками
- •Телиоспоры
- •Типы базидий
- •Морфология промицелия со споридиями у различных видов диморфных базидиомицетов
- •Жизненный цикл Rhodosporidium toruloides
- •Жизненный цикл Filobasidiella neoformans
- •Жизненный цикл Tremella mesenterica
- •Общая схема метаболизма дрожжей
- •Гликолиз
- •Глицериновое брожение у дрожжей
- •Вторичные продукты брожения
- •Эффект Пастера и эффект Кребтри
- •Цикл Кребса
- •Пентозофосфатный цикл
- •Цикл β-окисления
- •Цепь переноса электронов
- •Синтез атф
- •Β-Кетоадипиновый путь
- •Метилотрофные дрожжи
- •Ксилулозо-монофосфатный цикл
- •Механизм расщепления мочевины
- •Антимикотики
- •Киллерный эффект
- •Потребность дрожжей в витаминах
- •Учет дрожжей методом посева
- •Применение низкотемпературной инкубации для селективного выделения дрожжей
- •Учет липомицетов методом обрастания почвенных комочков
- •Метод отпечатков для исследования эпифитных дрожжей
- •Метод fish
- •Микробиологические методы определения витаминов
- •Температурные диапазоны роста дрожжей
- •Психрофильные дрожжи
- •Ксеротолерантные дрожжи
- •Комменсализм
- •Форезия
- •Жизненные формы дрожжей
- •Дрожжи на ягодах винограда и других сахаристых плодов
- •Дрожжи в цветочном нектаре
- •Дрожжи в сокотечениях деревьев
- •Сукцессии дрожжей в сокотечениях деревьев
- •Дрожжи в разлагающихся тканях кактусов
- •Медвяная роса
- •Эпифитные дрожжи
- •Автохтонные почвенные дрожжи
- •Бактериально-дрожжевые ассоциации
- •Дрожжи в домашней пыли
- •Кандидоз
- •Созревание вина
- •«Дикие дрожжи»
- •«Чайный гриб»
Смена дрожжевых сообществ при разложении растительных остатков
Итак, обычными наземными местообитаниями дрожжей являются растения, растительные остатки и почвы. Хотя численность дрожжей в таких местообитаниях существенно ниже, чем в высокосахаристых локусах, они являются постоянным компонентом их микробного населения. Эти субстраты можно рассматривать в достаточно естественной последовательности (живые части растений → мертвые части растений → растительные остатки → органогенные горизонты почв → минеральные горизонты почв), соответствующей слоям вертикальной стратификации биогеоценоза или стадиям сукцессии при разложении растительных остатков. Поэтому их называют пространственно-сукцессионным рядом. В этом ряду закономерно уменьшается концентрация легкодоступных источников питания, в первую очередь свободных сахаров, поэтому для дрожжей, как типичных сахаролитиков, среда обитания становится все более неблагоприятной. В пространственно-сукцессионном ряду в структуре дрожжевых сообществ происходят следующие изменения:
- уменьшается общая численность дрожжей, в среднем от 104-105КОЕ/г на зеленых листьях растений (иногда с некоторым увеличением на стадии отмирания листьев) до 102-103КОЕ/г в почве;
- снижается видовое разнообразие дрожжей (его можно измерить, например, средним числом видов, которое удается выделить из отдельного образца стандартного объема, или общим количеством видов в заданной выборке образцов);
- все более выраженным становится доминирование одного вида: если на живых частях растений на долю самого обильного вида приходится обычно не более половины общей численности дрожжей, то в почве - до 90% и более;
- дрожжевое население становится все более единообразным, т.е. отдельные образцы растений, взятые в разных местах или в разные сроки, значительно больше отличаются друг от друга по видовому составу дрожжей, чем образцы почвы.
Все эти изменения действительно свидетельствуют о том, что в ходе сукцессии при разложении растительных остатков среда обитания для дрожжей становится все более неблагоприятной. Они вполне аналогичны тем изменениям в структуре растительности и животного населения, которые происходят при перемещении в области климатического пессимума, например, при переходе от бореальных лесов к высокоширотной Арктике или от равнин к высокогорьям. Таким образом, пространственно-сукцессионный рядследует рассматривать как важный экологический градиент в распределении дрожжевых грибов в природе.
Географические закономерности в распространении дрожжей
Микроорганизмы обычно считают космополитами. Мельчайшие размеры позволяют им неограниченно расселяться и находить благоприятные микрозоны в любой достаточно гетерогенной среде, в среднем характеризующейся неподходящими условиями для данного вида. Вместе с тем, особенности распространения организмов зависят и от климатических условий, которые закономерно изменяются по географической широте. Вопрос о наличии таких широтно-зональных закономерностей в распространении микроорганизмов был в центре внимания особого направления в отечественной микробиологии, получившего название «эколого-географического». В первую очередь оно связано с именем академика Е.Н.Мишустина, которому в 30-50-х гг. XX в. впервые удалось продемонстрировать широтно-зональные изменения таксономического состава почвенных бацилл. Эти работы привлекли внимание многих микробиологов к вопросу о широтно-зональных закономерностях в распределении микроорганизмов. Спустя несколько десятилетий самой изученной группой в этом отношении оказались дрожжевые грибы благодаря относительной простоте их учета и невысокому видовому разнообразию. Особенно многочисленные данные были получены на кафедре биологии почв МГУ в лабораторииИ.П.Бабьевой. На основе этих данныхИ.Ю.Черновымбыла созданабаза данныхпо географическому распространению дрожжей, которая позволила подойти к анализу распределения дрожжевых грибов в природе количественно, с использованием методов математической статистики.
Численность, разнообразие и таксономическая структура дрожжевых сообществ, формирующихся на растениях, растительных остатках и в почве, изменяются в зависимости от широты местностии среднегодовой температуры. Все эти зависимости соответствуют идее экологического оптимума, причем этиоптимумы различныдля разных видов. По приуроченности к различным природным зонам среди дрожжей выделяются виды арктические (Cryptococcus gilvescens), аркто-бореальные (Cryptococcus laurentii), бореальные (Cryptococcus podzolicus), пустынно-степные (Cryptococcus diffluens).
Тундра
В пределах тундровой зоныдрожжи наиболее подробно исследованы в различных районах Таймырского полуострова. Сообщества дрожжевых грибов в тундре представлены двумя весьма различными комплексами: довольно разнообразным эпифитным комплексом, который формируется на зеленых и мертвых надземных частях растений, и более однородным подстилочно-почвенным комплексом на разлагающихся частях растений и в почвенных горизонтах. Автохтонные почвенные дрожжи в тундровой зоне отсутствуют.
На листьях тундровых растений дрожжи достигают довольно высокой численности - до 105-106КОЕ/г. Для этой зоны характерна высокая доля дрожжей среди других эпифитных микроорганизмов. Очень часто дрожжи являются единственными представителями грибов, населяющих филлосферу.
Эпифитные дрожжи в тундре характеризуются довольно постоянным составом доминирующих видов. На живых и мертвых частях растений обычно преобладает Cryptococcus laurentii. Как правило, его доля составляет 30-80% от общей численности дрожжей. На листьях обычны также видыMrakia frigida,Leucosporidium scottii, большинство штаммов которых относятся кпсихрофилам, а также широко распространенные и в других природных зонах видыCryptococcus albidus,Rhodotorula glutinis,Sporobolomyces roseus,черные дрожжи. Все эти виды можно выделить с любого тундрового растения. Особенностью эпифитных дрожжевых сообществ тундры является почти полное отсутствие аскомицетовых дрожжей, например, видовMetschnikowia pulcherrimaиMetschnikowia reukaufii, которые являются характерными обитателями листьев ицветковэнтомофильных растений в бореальной полосе.
В разлагающихся растительных остатках - в подстилке, торфянистых горизонтах тундровых почв, в нижней части моховой дернины - дрожжи также постоянно присутствуют, но представлены здесь очень однородным комплексом, в котором обычно более 90% общей численности дрожжей приходится на долю одного вида Cryptococcus gilvescens. Это единственный настоящий арктический вид дрожжей, который встречается только в пределах тундровой зоны, причем циркумполярно. ШтаммыCryptococcus gilvescensбыли выделены в разных районах Таймыра, в низовьях Колымы, на Аляске. Другие дрожжи, обычные в разлагающихся растительных остатках тундровых почв, представлены видамиMrakia frigida,Trichosporon pullulans,Rhodotorula minuta,Cryptococcus albidus.
Из минеральных горизонтов тундровых почв дрожжи выделяются редко, не более чем в 20% случаев. Их численность здесь обычно лежит на границе чувствительности метода посева и редко превышает 103КОЕ/г. В почве представлены те же виды, что и в разлагающихся остатках, но с еще более выраженным доминированиемCryptococcus gilvescens. Липомицеты полностью отсутствуют в почвах тундровой зоны. Различные типы тундровых почв: тундровые глеевые, дерновые почвы тундровых луговин, примитивные, тундрово-болотные не отличаются по видовой структуре населяющих их дрожжевых сообществ: во всех типах резко доминирует один видCryptococcus gilvescens. Несколько более разнообразны дрожжи, обитающие в зоогенных почвах, которые обычно формируются на южных сторонах холмов, на легких породах, в местах, активно посещаемых животными (например около норовищ песцов, колоний леммингов, мест постоянного кормления хищных птиц). Кроме лучших температурных условий в таких местах есть постоянный приток свежего органического вещества (экскрементов, остатков пищи). Биомасса дрожжей на 1 м2такой зоогенной почвы может быть выше чем на 10000 м2пятнистой тундры. Видовое разнообразие дрожжей в таких почвах также довольно высокое. Здесь могут быть обнаружены многие виды дрожжей, в том числе аскомицетовые, более характерные для южных зон.