- •Оглавление
- •РАЗДЕЛ 1. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИНЖЕНЕРИЯ НИЗШИХ ОРГАНИЗМОВ
- •Задание 1.1.1. Выделение плазмидной ДНК
- •Задание 1.2.2. Трансформация клеток E. сoli электропорацией
- •Задание 1.5.1. Приготовление смесей дНТФ/Cy5 ддНТФ
- •Задание 1.5.2. Постановка реакции
- •Задание 1.5.3. Осаждение и нанесение образцов на гель
- •Задание 1.5.4. Заливка геля и постановка электрофореза
- •Задание 1.5.5. Анализ сиквенсов
- •Задание 1.6.1. Выделение ДНК из биомассы водорослей
- •Задание 1.6.3. Проведение секвенирования
- •Задание 1.6.4. Анализ полученных данных
- •РАЗДЕЛ 2. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ВЫСШИХ РАСТЕНИЙ
- •Задание 2.2.1. Проведение электрофореза выделенной ДНК в агарозном геле
- •Задание 2.2.4. Определение концентрации ДНК с помощью спектрофотометра
- •Задание 2.3.2. Разделение амплифицированных фрагментов ДНК с помощью электрофореза
- •Порядок выполнения работы
- •РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ И ТКАНЕВОЙ ИНЖЕНЕРИИ
- •Задание 3.5.1 Приготовление питательной среды
- •Задание 3.6.3. Посев клеток на материалах
- •Задание 3.6.5. Подсчет клеток
- •Задание 3.6.6. Процесс трипсинизации клеток
- •Задание 3.8.1. Освоение техники субкультивирования клеток
- •Задание 3.8.2. Замораживание прикрепленных клеток
- •РАЗДЕЛ 4. КУЛЬТУРА РАСТИТЕЛЬНЫХ КЛЕТОК И ТКАНЕЙ. Технология микроклонального размножения растений
- •Задание 4.3.1. Выделение и культивирование апикальных меристем картофеля
- •РАЗДЕЛ 5. МЕТОДЫ И АППАРАТУРА ДЛЯ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ
- •Задание 5.6.1. Определение показателей роста и спорообразования грибных культур поверхностным и глубинным способом
- •Задание 5.8.1. Освоить методы культивирования микроводорослей
- •РАЗДЕЛ 6. СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ МАКРОМОЛЕКУЛ И МЕТАБОЛИТОВ
- •Задание 6.10.1. Снятие ИК-спектра полигидроксибутирата
- •РАЗДЕЛ 7. ОПТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ СТРУКТУРЫ БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ
- •Задание 7.1.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.2.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.2.3. Проверка светорассеяния в исследуемых образцах
- •Составление отчета
- •4. Составление отчета.
- •Задание 7.4.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.4.2. Исследование спектров люминесценции.
- •Задание 7.5.1. Оценить численность микроорганизмов в водных образцах
- •РАЗДЕЛ 8. ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ФОТОСИТЕЗИРУЮЩИХ ОРГАНИЗМОВ
- •РАЗДЕЛ 9. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ КИНЕТИКИ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ
- •Задание 9.1.3. Определение константы Михаэлиса. Специфичность
- •Задание 9.2.2. Определение типов взаимодействия эффекторов с ферментом по отношению к субстрату
- •РАЗДЕЛ 10. СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДЫ КЛИНИЧЕСКОЙ ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКИ
- •Задание 10.3.1. Выделение ДНК из биопроб
- •Задание 10.5.1. Построение абсолютного калибровочного графика зависимости концентрации глюкозы в пробе от изменений оптической плотности
- •Задание 10.7.1. Исследование образца крови на анализаторе МЕК-6400J/К
- •РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
- •Задание 11.4.1. Ознакомление с метордом автоматической фотоколориметрии
- •РЕКОМЕНДОВАННАЯ ЛИТЕРАТУРА
- •РАЗДЕЛ 1
- •РАЗДЕЛ 2
- •РАЗДЕЛ 3
- •РАЗДЕЛ 4
- •РАЗДЕЛ 5
- •РАЗДЕЛ 6
- •РАЗДЕЛ 7
- •РАЗДЕЛ 8
- •РАЗДЕЛ 9
- •РАЗДЕЛ 10
- •РАЗДЕЛ 11
- •Приложение. Перечень научного оборудования, использованного в лабораторном практикуме
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА 3.5. ПОСУДА И ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ ДЛЯ РАБОТЫ С КЛЕТОЧНЫМИ КУЛЬТУРАМИ
Таблица 3.2
Примеры широко используемых культуральных сред
Компонент питательной среды |
Содержание, |
|
% |
||
|
||
|
|
|
Среда DМЕМ |
40 |
|
Гидролизат лакт-альбумина (ГЛА) |
40 |
|
Среда 199 |
10 |
|
Глутамин |
1-2 |
|
Сыворотка эмбриональная |
8-9 |
|
Нистатин |
0,05 |
|
|
|
Задание на выполнение лабораторной работы
Задание 3.5.1 Приготовление питательной среды
Порядок выполнения работы
1.Перед использованием готовых питательных сред в них следует добавить определенное количество (обычно 5–10%) сыворотки (эмбриональной, крупного рогатого скота и т. д.).
2.Внести ростовые факторы, обеспечивающие диффренцировку исходных клеток в нужном направление (эпидермальные ростовые факторы – EGF, факторы роста фибробластов – FGF, эритропоэтин, интерлейкин-3 – IL-3). Ростовые факторы – это высокоспецифичные белки сыворотки; большинство из них вносится в питательные среды в очень незначительных количествах: 10-9–10-11М. Функцией ростовых факторов является прежде всего стимуляция пролиферации клеток и клеточного метаболизма.
3.В среду обязательно внести антибиотики из расчета на 100 мл): пенициллин 1000000 ед. 20 мкг, гентамицин 1000 ед. 25 мкл.
4.Питательные среды готовятся переливанием в один →флакон→всех составных→ частей в направлении уменьшения объема (DМЕМ ГЛА среда
199 и т. д.).
5. Компоненты составных питательных сред, которые не могут быть стерилизованы в автоклаве или сухожаровом шкафу, необходимо подвергнуть стерилизации фильтрованием.
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
153 |
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА 3.5. ПОСУДА И ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ ДЛЯ РАБОТЫ С КЛЕТОЧНЫМИ КУЛЬТУРАМИ
6. Внести индикатор. Культуральная клеточная среда имеет красный цвет в результате добавления в среду индикатора фенолового красного. Индикаторы добавляют в питательные среды для того, чтобы контролировать кислотность среды в любой момент выращивания клеток, которые подкисляют среду продуктами обмена, и индикатор приобретает желто-оранжевое окрашивание. В процессе культивирования клеток необходимо следить за степенью прозрачности среды. Замутнение среды или изменение цвета индикатора на ярко-желтый или красно-синий (малиновый) может свидетельствовать о заражении среды и культуры клеток посторонними микроорганизмами.
В ходе культивирования и пересева клеток используют, помимо основных ростовых, антибиотических и индикаторных компонентов,трипсин и версен. Эти реагенты необходимы для дезагрегации монослоя при пересеве клеточной культуры или для выделения клеток из тканей при получении первичных культур. Обычно при пересеве используют раствор трипсин– версена в соотношении 1:1.
Лабораторная посуда и мелкий инструментарий, необходимые для выращивания клеток:
1.Пластиковые планшеты.
2.Чашки Петри.
3.Стеклянные и пластиковые флаконы.
4.Плоскодонные бутыли.
5.Сосуды Карреля.
6.Флаконы для питательных сред различного объема.
7.Пипетки автоматические с пластиковыми одноразовыми наконечни-
ками.
8.Стеклянные мерные пипетки.
9.Пеналы для стерилизации и хранения пипеток.
10.Фильтры, пробки резиновые и ватно-марлевые.
11.Насосы-дозаторы.
12.Шейкеры-инкубаторы.
13.Шпатели.
Вслучае использования стеклянной посуды перед процедурой стерилизации посуда тщательно моется в поверхносто-активными веществами. Для этого используется посудомоечная машина LABCONCO ® фирмы Fiaskscrubber ® (США). После высушивания посуды все отверстия в стеклянной посуде (горлышки бутылей, флаконов, сосудов Карреля) заворачиваются
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
154 |
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА 3.5. ПОСУДА И ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ ДЛЯ РАБОТЫ С КЛЕТОЧНЫМИ КУЛЬТУРАМИ
в двойной слой фольги таким образом, чтобы внешний слой фольги был длиннее внутреннего. Это обеспечивает дополнительную защиту внутренней среды сосуда или флакона. Резиновые пробки, наконечники для автоматических пипеток, фильтродержатели с фильтрами помещаются в стеклянные стаканы, которые также закрываются перед стерилизацией двойным слоем фольги. Манипулирование с посудой, переливание растворов в ходе приготовления сред, пересевы клеток и пр., то есть все процедуры выполняются в работающем боксе-ламинаре таким образом, что горящая спиртовка отделяет рабочую зону от работающего.
Контрольные вопросы
1.Какие компоненты являются обязательными в составе сред для выращивания клеток тканей и органов ?
2.Для чего необходимо вносить в состав питательных сред для клеток антибиотики
3.Какую роль играют в ходе выращивания клеток индикаторные краси-
тели
4.Какую посуду, изготовленную из какого материала, используют для приготовления сред и культивирования клеток?
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
155 |
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА3.6. ПЕРЕСЕВКЛЕТОК. ОКРАСКА, ПОДСЧЕТИФОТОГРАФИРОВАНИЕ КЛЕТОК
Цель лабораторной работы
•обучить основным приемам работы с клеточными культурами in vitro в лаборатории.
Краткие теоретические сведения
Различают два основных типа культуры клеток: первичную культуру и культуру стабильных клеточных линий. Первичные культуры получаются непосредственно из тканей животных и человека и культивируются либо как маленькие кусочки тканей, либо как отдельные клетки, полученные после обработки тканей ферментами, например трипсином и коллагеназой. Главным недостатком первичных культур является то, что они стареют физиологически и клетки утрачивают способность к делению, а также некоторые фенотипические признаки. Главное преимущество первичных культур – в сохранении многих первоначальных характеристик в течение всего ограниченного срока жизни. Стабильные клеточные линии могут поддерживаться в культуре либо в течение ограниченного числа клеточных делений, либо неопределенно долгий срок. Многие из таких линий получают из опухолевых тканей пациентов, при этом некоторые из клеточных линий становятся бессмертными (иммортализованными) при внедрении в клетку онкогенных вирусов. Эти клеточные линии могут продуцировать неограниченное число клеток, но клетки сохраняют очень мало специфичных для ткани характеристик.
Для роста клеток, полученных из твердых тканей, требуется прикрепление к субстрату, в то время как клетки, полученные из крови, растут во взвеси. Клетки во взвеси имеют округлую форму, а клетки, прикрепленные к субстрату, различны по форме в зависимости от происхождения. Как только клетки прикрепятся к субстрату, они начинают делиться и размножаться, образуя плотный непрерывный слой, покрывающий субстрат. Большинство клеток, в особенности первичные клетки, контактируя с соседними клетками, прекращают рост, однако опухолевые клетки обычно имеют тенденцию к трехмерному росту с образованием множества слоев. Клетки в культуре, занимающие 70-80% субстрата, в идеале можно обрабатывать трипсином, и затем пересевать часть клеток в новый флакон со свежей культуральной средой, т.е. получать субкультуры.
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум.Учебебное пособие |
156 |
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА 3.6. ПЕРЕСЕВ КЛЕТОК. ОКРАСКА, ПОДСЧЕТ И ФОТОГРАФИРОВАНИЕ КЛЕТОК
Материалы и оборудование
1.Флакон со стерильной средой.
2.Образец культуры.
3.Пипетки, шпатели.
4.Культуральные планшеты, флаконы.
5.Спиртовка.
6.Бокс-ламинар.
Задания на выполнение лабораторной работы
Задание 3.6.1.Размораживаниеклеток
Большинство имеющихся в продаже клеток приобретается в замороженном виде. После получения эти замороженные клетки должны незамедлительно переводиться в жидкий азот для хранения. В нижеприведенном протоколе дается описание того, как оживить замороженные клетки, хранящиеся под жидким азотом.
Порядок выполнения работы:
1.Подготовить среду для выращивания клеток.
2.Подогреть среду.
3.Наклеить этикетку на культуральный флакон и на центрифужную пробирку объемом 15 мл.
4.Добавитье 8 мл среды в центрифужную пробирку.
5.Достать ампулу, содержащую клетки, из банка жидкого азота (необходимо надеть термические перчатки и маску).
6.Оставтить ампулу при комнатной температуре около 1 мин, но не
дольше.
7.Перенести ампулу в водяную баню при 37 °С и дать ей оттаивать около 4 мин.
8.Вытереть ампулу салфеткой, смоченной в 70%-ном спирте, и перенести сразу же в ламинарный шкаф.
9.Аккуратно пипеткой внесите клетки в центрифужную пробирку.
10.Промойте ампулу в 1 мл свежей среды и добавьте в пробирку.
11.Осадите клетки в пробирке при 200 х g в течение 5 мин.
12.Удалите надосадочную жидкость, не задевая осадок.
13.Встряхните пробирку для того, чтобы поднять осадок.
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
157 |
РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
РАБОТА 3.6. ПЕРЕСЕВ КЛЕТОК. ОКРАСКА, ПОДСЧЕТ И ФОТОГРАФИРОВАНИЕ КЛЕТОК
14.Добавьте 1 мл свежей среды и аккуратно суспендируйте клетки пи-
петкой.
15.Добавьте необходимое количество культуральной среды во флакон.
16.Добавьте во флакон со средой суспензию клеток и хорошо пере-
мешайте.
17.Поставьте флакон в термостат.
Когда клетки покроют 70–80% поверхности флакона, их нужно пассировать на материалы или во флаконы со свежей средой. С каждой субкультурой число пассажей растет. Для воспроизводимости эксперимента число пассажей в культуре должно быть одинаковым в различных экспериментах с культурами клеток. Увеличение числа пассажей может привести к фенотипическим изменениям в клетках.
Задание3.6.2. Тестирование состояния клеток иконтаминации
Порядок выполнения работы:
1.Проверить культуральную среду. Если среда мутная, есть вероятность бактериальной инфекции (для прикрепленных на субстрате клеток).
2.Определить число прикрепленных клеток по сравнению с числом плавающих клеток. Плавающие клетки – это, как правило, мертвые клетки.
3.Исследовать морфологию клетки. Как правило (в зависимости от типа клетки), прикрепленные здоровые клетки распластаны и имеют веретеновидную удлиненную форму, иногда с отростками, округлые клетки – это либо делящиеся клетки, либо гибнущие клетки.
4.Ищите гигантские клетки. В большинстве культур частота таких клеток относительно низкая и постоянна при одинаковых условиях культивирования.
5.Определите скорость, с которой клетки прикрепляются и приступают
кделению после пассажа. Прикрепление в течение 1–4 часов свидетельствует о том, что клетки не травмированы.
6.В то время как грибковые и бактериальные инфекции относительно легко обнаруживаются опытными учеными, заражение микоплазмой невидимо и поэтому более трудное для распознавания. Наборы для распознавания микоплазмы имеются в продаже и должны использоваться, если возникают признаки инфекции.
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
158 |