- •Зміст лабораторного заняття:
- •Техніка безпеки при роботі у біохімічній лабораторії
- •Забороняється з метою уникнення травм, опіків, нещасних випадків:
- •Перша домедична допомога
- •Заняття 1 Тема: Історія біохімії. Якісні (кольорові) реакції на амінокислоти та білки теоретична частина
- •Практична частина:
- •ХIд роботи
- •Заняття 2 Тема: Властивості білків теоретична частина
- •Практична частина
- •ХIд роботи
- •Заняття 3 Тема: Кількісне визначення білків за допомогою біуретового реактиву теоретична частина:
- •Практична частина
- •Хід роботи
- •Заняття 4 Тема: амінокислоти і білки (семінар)
- •Заняття 5 Тема: Властивості вуглеводів теоретична частина:
- •Практична частина:
- •Хід роботи
- •Заняття 6 Тема: властивості, будова, роль лІпІдІв. Реакція на жири і жироподІбнІ речовини теоретична частина:
- •Практична частина:
- •Хід роботи
- •Заняття 7 Тема: будова і властивості нуклеопротеЇдІв теоретична частина:
- •Цитозин
- •Практична частина:
- •Заняття 8 Тема: загальні властивості ферментів теоретична частина:
- •Властивості ферментів:
- •ПРактична частина:
- •Хід роботи
- •Заняття 9 Тема: Якісні реакції на вітаміни теоретична частина:
- •Практична частина:
- •Хід роботи
- •ВодоРозчинні вітаміни
- •ЖироРозчинні вітаміни
- •Заняття 10 Тема: біологічне Окиснення речовин теоретична частина:
- •Практична частина
- •Заняття 11 Тема: обмін вуглеводів (частина 1). Визначення концентрації глюкози в крові теоретична частина:
- •Практична частина
- •Хід роботи
- •Заняття 12 Тема: обмін вуглеводів (частина 2). Визначення молочної кислоти у біологічному матеріалі теоретична частина:
- •Практична частина:
- •Хід роботи
- •Заняття 13 Тема: обмін вуглеводів (семінар)
- •Заняття 14 Тема: Перетравлення білків у шлунково-кишковому тракті. Визначення сечовини в біологічних рідинах діацетилмонооксимним методом теоретична частина:
- •Катаболизм аминокислот:
- •Біосинтез сечовини (орнітиновий цикл)
- •Практична частина:
- •Хід роботи
- •У пробірки відміряють послідовно, відповідно таблиці, біологічну рідину і робочі розчини. Для зменшення похибки аналізу рекомендується притримуватися обговореного порядку змішання розчинів.
- •Заняття 15 Тема: Обмін ліпідів. Визначення концентрації загального холестерину у біологічних рідинах (за методом Ілька) теоретична частина:
- •Окисний розпад нейтральних жирів (ацилгліцеринів) у тканинах
- •Хід роботи
- •Хід роботи:
- •Заняття 16 Тема: Обмін води та мінеральних солей. Біохімія крові теоретична частина:
- •Заняття 17 Тема: Механізм м’язового скорочення. Біологічні мембрани
- •Механізм м’язового скорочення.
- •Механізм м’язового розслаблення.
- •Особливості енергетичного обміну у скелетних м’язах.
- •Тестовий контроль модуль 1 «Будова і фізико-хімічні властивості біоорганічних речовин»
- •30. Електрофорез − це:
- •82. Каталітичний центр ферменту − це:
- •83. Адсорбційний центр ферменту − це:
- •84. Алостеричний центр ферменту – це:
- •94. Неконкурентне інгібування – це:
- •Модуль 2 «Обмін речовин»
- •71. Склад плазми крові:
- •72. Фібриноген − це:
- •85. Актин − це:
- •86. Тропоміозин − це:
- •92. Роль ядерної мембрани:
- •93. Роль ендоплазматичного ретикулуму:
- •94. Роль мембрани апарату Гольджі:
- •95. Роль мембрани лізосом:
- •Індивідуальні завдання
- •Питання до іспиту
- •Глосарій
- •Рекомендована література Основна:
- •Додаткова:
- •Навчально-методичний посібник
ЖироРозчинні вітаміни
Дослід 1. Реакція на вітамін А.
Принцип методу: при взаємодії вітаміну А, що знаходиться в риб'ячому жирі, із концентрованою сульфатною кислотою виникає червоне забарвлення.
Хід роботи: у суху пробірку відміряють 3 краплі ретинолу додають 1 краплю концентрованої сульфатної кислоти. З'являється фіолетове забарвлення, що переходить у червоно-буре.
Дослід 2. Реакція на вітамін Д.
Принцип методу: вітамін Д, що знаходиться в риб'ячому жирі, при взаємодії з розчином брому в хлороформі набуває зеленувато-блакитного забарвлення.
Хід роботи: у суху пробірку вносять 2 – 3 краплі риб'ячого жиру і 2 – 4 краплі розчину брому в хлороформі (1:60). При наявності вітаміну Д поступово з'являється зеленувато-блакитне забарвлення.
Результати дослідів вносять у таблицю:
№ з/п |
Назва реакції |
Застосовувані реактиви |
Забарвлення |
Що відкриває ця реакція |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
|
|
|
|
|
В кінці роботи зробити висновок.
Заняття 10 Тема: біологічне Окиснення речовин теоретична частина:
Біологічне окислення – сукупність ферментативних окислювально-відновних реакцій, що протікають в живих клітинах. У процесі біологічного окислення відбувається розщеплення поживних речовин, і енергія, яка при цьому звільняється, запасається в зручній для використання клітинами формі так званих багатих енергією сполуках - аденозинтрифосфату та ін. Ці сполуки потім витрачаються на забезпечення всіх процесів життєдіяльності; частина енергії розсіюється у вигляді тепла. Значна частина реакцій біологічного окислення здійснюється в мітохондріях. В якості джерел енергії та субстратами для біологічного окислення є жири, вуглеводи і білки.
У кишечнику жири розщеплюються до жирних кислот і гліцерину (гліцеридів), потім всмоктуються, ресинтезуються в ентероцитах і надходять у кров. Кров'ю тригліцериди досягають підшкірного жиру, де депонуються. При потребі в енергії, тригліцериди адипоцитів розщеплюються з утворенням вільних жирних кислот і гліцерину. Ці речовини надходять у кров і досягають органів-споживачів. У клітинах гліцерин перетворюється на піруват і потім в ацетил-КоА, а жирні кислоти в процесах β-окислення прямо перетворюються на ацетил-КоА.
Полісахариди в кишечнику під дією травних ферментів розщеплюються до моносахаридів, велика частина яких перетворюється на глюкозу в ентероцитах. Потім глюкоза надходить у кров, розноситься клітинами і може депонуватися в печінці та м'язах у вигляді глікогену. Моносахариди в клітинах перетворюються в піруват і потім в ацетил-КоА.
Білки в кишечнику розпадаються до вільних амінокислот, які надходять у кров. У клітинах, амінокислоти окиснюються при відсутності вуглеводів з утворенням пірувату або ацетил-КоА.
Таким чином, прямо або через утворення пірувату, загальним проміжним продуктом при катаболізмі жирів, вуглеводів і білків є ацетил-КоА, який потім надходить у цикл трикарбонових кислот (ЦТК, цикл лимонної кислоти, цикл Кребса).
У ЦТК відбувається послідовне відщеплення молекул СО2 від проміжних субстратів з утворенням НАДН2 (3 молекули) і ФАДН2 (1 молекула), а також ГТФ, який конвертується в АТФ. Таким чином, в ЦТК може утворитися 3 × 3 +1 × 2 +1 = 12 молекул АТФ.
Відновлені НАДH2 і ФАДH2 є донорами електронів і протонів для комплексів ланцюга перенесення електронів.
Катаболізм органічних речовин у тканинах супроводжується споживанням кисню і виділенням СО2. Цей процес називають тканинним диханням. Кисень у цьому процесі використовується як акцептор водню від окиснюємих (дегідруємих) речовин (субстратів), в результаті чого синтезується вода. Процес окиснення можна представити таким рівнянням: SH2 + 1/2 O2 → S + H2O. Окиснювані різні органічні речовини (S - субстрати), являють собою метаболіти катаболізму, їх дегідрування є екзоергічним процесом.
Енергія, що звільняється в ході реакцій окиснення, або повністю розсіюється у вигляді тепла, або частково витрачається на фосфорилювання ADP з утворенням АТР. Організм перетворює близько 40% енергії, що виділяється при окисненні, в енергію макроергічних зв'язків АТР. Реакція дегідрування і спосіб перетворення енергії, яка виділяється шляхом синтезу АТР - це енергетично зв'язані реакції. Цілком весь процес називається окислювальне фосфорилювання ADP:
SH2 + 1/2 O2 → S + H2O окиснення, екзоергічний процес
Енергія → теплова енергія
АDP + H3PO4 → ATP фосфорилювання, ендоергічний процес
Зазначене вище рівняння для окислювально-відновної реакції є узагальненою формою, тому як змальовує процес окиснення субстратів як пряме дегідрування, причому кисень виступає в ролі безпосереднього акцептора водню. Насправді кисень бере участь у транспорті електронів іншим чином. Існують проміжні переносники при транспорті електронів від вихідного донора електронів SH2 до термінального акцептору - О2. Повний процес являє собою ланцюг послідовних окисно-відновних реакцій, в ході яких відбувається взаємодія між переносниками. Кожен проміжний переносник спочатку виступає в ролі акцептора електронів і протонів і з окисненого стану переходить у відновну форму. Потім він передає електрон наступному переноснику і знову повертається в окиснений стан. На останній стадії переносник передає електрони кисню, який потім відновлюється до води. Сукупність послідовних окисно-відновних реакцій називається ланцюгом переносу (транспорту) електронів, або дихальним ланцюгом.
Дихальний ланцюг - це система ферментів і коферментів, які беруть участь у транспорті електронів і протонів від окиснюваного субстрату на кисень. Склад дихального ланцюга: а) ферменти: дегідрогенази (НАД і ФМН-залежні); цитохроми, б) коферменти: НАД, ФМН, КоQ, гем. Ферменти та коферменти об'єднані в комплекси (I, III, IV), або (II, III, IV). Структура дихального ланцюга:
Матрикс
Комплекс II
СДГ
(ФАД)
Комплекс I НАДН2-КоQ редуктаза |
2е-
2Н+ |
Комплекс IІІ КоQН2 – цит. с редуктаза |
2е-
|
Комплекс IV цитохромоксидаза |
2е- О2 |
2Н+ 2Н+ 2Н+ 2Н+ 2Н+
Міжмембранний простір (ММП)
Окисне фосфорилювання (хеміосмотична теорія Мітчела) - це процес утворення АТФ з АДФ і Фн при русі електронів по дихальному ланцюзі в мітохондріях (тканинне дихання). Субстрат віддає в дихальний ланцюг 2Н+ і 2е- У результаті руху двох е- по дихальному ланцюгу з матриксу в ММП транспортується 8-10 протонів (Н+), тобто в ММП відбувається генерація електрохімічного градієнта протонів (Н+) - Н+. У матриксі мітохондрій відбувається дисоціація ендогенної води: Н2O → Н+ + ОН-. Рухом двох електронів по дихальному ланцюгу ці протони (Н+) переходять у між ММП. У результаті чого зовнішня поверхня внутрішньої мембрани, звернена в ММП, заряджається позитивно (+), а внутрішня негативно (-). Виникає електрохімічний потенціал, який призводить до транслокації (переходу) протонів в матрикс через протонну АТФ-азу (Н+-АТФ-синтаза). Остання складається з 2-х фрагментів: F0 і F1 (білкові субодиниці). F1 - каталітична частина ферменту. Частково F0 (блокується олігоміцином) представляє собою протонний канал. При русі протонів активується F1-фтагмент, який каталізує реакцію синтезу АТФ з АДФ і неорганічного фосфату. 40% енергії йде на синтез АТФ, а 60% виділяється у вигляді тепла. В умовах окиснення субстратів через НАДН-КоQ-редуктазу і далі, тобто через I, III, IV комплекси, утворюється 3 молекули АТФ. При окисненні субстратів через сукцинат-КоQ-редуктазу і далі через II, III, IV комплекси утворюється 2 молекули АТФ.
мітохондріальний
матрикс
Міжмембранний
простір
Макроергічні сполуки - це речовини, які містять багаті енергією (макроергічні) зв'язки. При гідролізі такого зв'язку виділяється 8-10 ккал енергії. До них відносяться: АТФ, інші трифосфонуклеозиди: ГТФ, ЦТФ, УТФ, ТТФ; аргінінфосфат, креатинфосфат, ацетилфосфат, дифосфогліцерат, фосфоенолпіруват та ін.
Човниковий механізм транспорту протонів з цитоплазми в мітохондрії:
НАДН утворюється і в цитоплазмі (при гліколізі). Мембрана мітохондрій для НАДН непроникна, отже передати протони в дихальний ланцюг безпосередньо неможливо. Тому цитоплазматичний НАДН передає Н на молекулу фосфодіоксиацетону, який грає роль човника, перетворюючись на фосфогліцерин, який переносить його в мітохондрії і віддає в дихальний ланцюг.