Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
мед.микробиология 1 часть каз.doc
Скачиваний:
2156
Добавлен:
20.05.2015
Размер:
3.47 Mб
Скачать

2.5.2. Вирустардың жіктелуі (классификациясы)

Вирустарды жіктеудің алғашқы ұмтылысы ХХ ғасырдың 40-жылдарында болды. Вирусология микробиологияның бір бөлігі деп есептелетіндіктен вирустарды классификациялау да бактериялар үшін критериялар бойынша атқарылды. Бірақ, көп кешікпей бактериялар таксономиясына қарағанда вирустар таксономиясының айырмашылығы болатыны айқын болды. 1966 жылы Мәскеуде вирустар номенклатурасы бойынша Халықаралық комитет құрылды. Әрбір 5 жыл сайын жаңа вирустардың ашылуына немесе белгілі вирустардың жаңа қасиеттерінің анықталуына байланысты вирустар номенклатурасы жаңартылып отырады. 2.2–кестеде вирустардың қазіргі кездегі классификациясы берілген. Бұл классификация бойынша 4 иерархиялық деңгей қарастырылған: түр, туыстастық, тұқымдастық (кейде тұқымдасша) және қатары. Қатар, тұқымдастық, тұқымдастықша (подсемейство) және туыстастықты -virales, -viridae, -virinae, -virus сөздерін қосып белгілейді. Бүгінгі күнде 3 қатар, 64 тұқымдастық, 9 тұқымдасша, 233 туыстастық және 1550-ден астам түрлер анықталған. Вирустардың қазіргі заманғы классификациясы негізіне мынадай критерийлер жатады:

• нуклеин қышқылының типі (РНҚ немесе ДНҚ), оның құрылымы (тізбекше немесе жіпше саны);

• липопротеидті қабатының болуы;

• вирус геномының стратегиясы;

• вирионның морфологиясы және мөлшері, симметрия типі, капсомерлер саны;

• генетикалық өзара әсерлесу феномендері;

• қабылдағыш иелер шеңбері;

• патогенділігі, соның ішінде жасушаларда патологиялық өзгерістер және жасушаішілік қосындылар пайда болуы;

• географиялық таралуы;

• антигендік қасиеттері.

Вирустарды классификациялаудың негізгі критерийлері жасалғанына қарамастан, қандай тұқымдастыққа жатқызуға болатыны анық емес вирустардың түрлері бар. Әсіресе ол өсімдіктердің вирустарына қатысты.

Кесте 2.2.

Вирустардың жіктелуі (классификациясы) – 2005 ж.

Қатары

Тұқымдастығы [тұқымдастықша]

Туыстастығы

Типі (тип өкілі)

1

2

3

4

-

Inoviridae

Inovirus

Энтеробактериялар фагы М 13

Plectovirus

Фаг MV – L 51 - Acholeplasma

-

Microviridae

Microvirus

Энтеробактериялар фагы φ174

Spiromicrovirus

Фаг 4 Spiroplasma

Bdellomicrovirus

Фаг MAC 1 Bdellovibrio

Chlamydiamicrovirus

Хламидия фагы 1

-

Geminiviridae

Mastrevirus

Жүгерінің шұбарландыру вирусы

Curtovirus

Қызылша жапырағының бұйралану вирусы

Begomovirus

Бұршақтар сарғаюы теңбілінің вирусы (Пуэрто-Рико)

Circoviridae

Circovirus

Шошқалардың цирковирусы

-

Gyrovirus

Балапандар анемиясының вирусы

-

Nanoviridae

Nanovirus

Жоңышқа түбірінің өсуін тежейтін вирус

Babuvirus

Babana bunchy top virus

Parvoviridae [Parvovirinae]

Parvovirus

Тышқандардың ұсақ вирусы

Erythrovirus

B19 вирус

Dependovirus

Адено-ассоциацияланғаң вирус 2

[Densovirinae]

Densovirus

Жәндіктердің денсонуклеоз вирусы Janonia coenia

Iteravirus

Жібек құртының денсонуклеоз вирусы

Brevidensovirus

Аралардың денсонуклеоз вирусы

дн ДНҚ – құрамды вирустар

Caudovirales

Myoviridae

«T 4 – like viruses»

Энтеробактериялар фагы T 4

«P 1 – like viruses»

Энтеробактериялар фагы P 1

«P 2 – like viruses»

Энтеробактериялар фагы P 2

«Mu – like viruses»

Энтеробактериялар фагы Mu

«SPO1–like iruses»

Бациллалар фагы SPO 1

«φ H– like viruses»

Вирус φH Halobacterium

Siphoviridae

«λ- like viruses»

Энтеробактериялар фагы – фагы λ

« T 1 - like viruses»

Энтеробактериялар фагы Т 1

« T 5 - like viruses»

Энтеробактериялар фагы Т 5

« c 2 - like viruses»

Лактококтар фагы с 2

« L 5 - like viruses»

Микобактериялар фагы L 5

«ψM1-like viruses»

Метанобактериялар фагы ψM 1

Podoviridae

«T 7 - like viruses»

Энтеробактериялар фагы T 7

«φ29- like viruses»

Бациллалар фагы φ29

«P22– like viruses»

Энтеробактериялар фагы P 22

Rudiviridae

Rudivirus

Вирус SIRV1 Salfolobus

Tectiviridae

Tectivirus

Энтеробактериялар фагы PRD 1

-

Corticoviridae

Corticovirus

Фаг PM2 Alteromonas

-

Lipothrixviridae

Alphalipothrixvirus

Вирус 1 Thermoproteus

Betalipothrixvirus

Таяқшапішінді вирус Sulfolobus islandicus

Gammalipothrixvirus

Таяқшапішінді вирус 1 Acidianus

-

Plasmoviridae

Plasmovirus

Фаг L2 Acholeplasma

-

Fuselloviridae

Fusellovirus

Вирус SSV 1 Sulfolobus

-

Phycodnaviridae

Chlorovirus

Қарапайымдалар вирусы Paramecium bursaria 1

Prasinovirus

Қарапайымдалар SP1 вирусы Micromonas pusilla

Prymnesiovirus

Вирус PW1 Chrysachromulina brevifilum

Phaeovirus

Вирус 1 Ectocarpus siliculosis

-

Raphidovirus

Вирус 01 Heterosigma akashiwo

Coccolithovirus

Вирус 86 Emiliania huxleyi

-

Guttaviridae

Guttavirus (бұрынғы туыстастығы «Sulfolodus SNDV-like viruses»)

Тамшытәріздес вирус Sulfolobus neozealandicus (бұрынғы вирус SNDV Sulfolobus)

-

Poxviridae

[Chordopoxvirinae]

Orthopoxvirus

Шешек вакцина вирусы

Parapoxvirus

Паравакцина вирусы

Aviposvirus

Тауық шешегінің вирусы

Capripoxvirus

Қой шешегінің вирусы

Leporipoxvirus

Миксома вирусы

Suipoxvirus

Шошқалар шешегінің вирусы

Molluscipoxvirus

Жұқпалы моллюска вирусы

Yatapoxvirus

Яба маймылдары ісігінің вирусы

-

[Entomopoxvirinаe]

Alphaentomopox-virus

Жәндіктер шешегінің вирусы Melalontha melalontha

Betaentomopoxvirus

Жәндіктер шешегінің вирусы Amsacta moorei

Gammaentоmopoxvirus

Жәндіктер шешегінің вирусы Chironomus luridus

-

Iridiviridae

Iridovirus

Жәндіктерде жарқырауық тудыратын вирус 6

Chloridovirus

Жәндіктерде жарқырауық тудыратын вирус 3

Ranavirus

Бақалар вирусы 3

Lymphocystivirus

Балықтардың лимфоцистия ауруының вирусы 1

-

Polydnaviridae

Ichnovirus

Ихновирус Campoletis sonorensis

Bracovirus

Браковирус Cotesia melanosclera

-

Herpesviridae

Ictalurivirus (бұрынғы туыстастығы «Ictalurid herpes-like-viruses»)

Ұшық вирусы 1 Ictalurid

[Alphaherpesvirinae]

Simplexvirus

Адамдардың ұшық вирусы 1

Varicellovirus

Адамдардың ұшық вирусы 3

Mardivirus (бұрынғы туыстастығы «Marek,s discase-like viruses»)

Тауық ұшығының вирусы 2

Iltovirus («Infections laryngotracheitis - like viruses»)

Тауық ұшығының вирусы 1

[Betaherpesvirinae]

Cytomegalovirus

Адамдардың ұшық вирусы 5

Muromegalovirus

Тышқандардың ұшық вирусы 1

Roseolovirus

Адамдардың ұшық вирусы 6

[Gammaherpesvirinae]

Lymphocryptovirus

Адамдардың ұшық вирусы 4

Rhadinovirus

Маймылдардың ұшық вирусы 2 Saimirine

-

Polyomaviridae

Polyomavirus

Маймыл полиомасының вирусы SV40

-

Papillomaviridae

Papillomavirus

Қояндар папилломасының вирусы

-

Adenoviridae

Mastadenovirus

Адамның С аденовирусы

Aviadenovirus

Құстардың А аденовирусы

Atadenovirus

Қойлардың D аденовирусы

Siadenovirus

Түйетауықтардың В аденовирусы

-

Ascoviridae

Ascovirus

Асковирус Spodoptera frugiperda

-

Baculoviridae

Nucleopolyhedra-virus

Ядролық полиэдроз вирусы Autographs californica

Granulovirus

Гранулез вирусы Cydia pomonella

-

Nimaviridae

Whispovirus

Ақ таңдақ синдромы вирусы 1

Asfarviridae

Asfivirus

Шошқалардың африкалық қызба вирусы

-

Rhizidiovirus

Rhizidiomyces саңырауқұлақтарының вирусы

Кері транскриптаза бар ДНҚ және РНҚ- құрамды вирустар

ДНҚ-құрамды вирустар

Hepadnoviridae

Orthohepadnovirus

Адамдардың В гепатит вирусы

Avihepadnovirus

Үйректердің В гепатит вирусы

Caulimoviridae

Badnavirus

Камелиялардың сары таңдақтық вирусы

Caulimovirus

Түсті орамжапырақ теңбілінің вирусы

Tungovirus («Rice tungro bacilliform –

like viruses»)

Тунгро күрішінің таяқшапішінді вирусы

Soymovirus (бұрынғы туыстастығы «Soybean chlorotic-mottle-like viruses»)

Жүгерінің хлоретикалық таңдағының вирусы

Cavemovirus (бұрынғы туыстастығы «Cassava vein mosaic-like viruses»)

Маниока теңбілділігінің вирусы

Petuvirus (бұрынғы туыстастығы «Petunia vein clearing-like viruses»)

Петунья тармақтарының түссіздену вирусы

РНҚ-құрамды вирустар

Pseudoviridae

Pseudovirus

Бактериялардың Ту1 вирусы Saccharomyces cerevisae

Hemivirus

Дрозофила вирусы Drosophila melanogaster copia

Metavirus

Бактериялардың Ту3 вирусы Saccharomyces cerevisae

Metaviridae

Errantivirus

Дрозофила вирусы Drosophila melanogaster

Retrоviridae

Alpharetroviruses

Құстар лейкозының вирусы

Betaretroviruses

Тышқандардың емшек без ісігінің вирусы

Gammaretroviruses

Тышқандар лейкемиясының вирусы

Deltaretroviruses

Сиырлар лейкемиясының вирусы

Epsiloretroviruses

Тері саркомасының вирусы

Lentivirus

Адамдардың иммундытапшылық вирусы

Spumavirus

Адамдардың көбіктену вирусы

РНҚ-құрамды вирустар – дн РНҚ вирустар

-

Cystoviridae

Cystovirus

Фаг ψ 6 Pseudomonas

-

Reoviridae

Orthoreovirus

Сүтқоректілердің ортореовирусы

Orbivirus

Тіл көгертпесінің вирусы

Rotavirus

Ротавирус А

Coltivirus

Колорадалық кенелік қызба вирусы

Aquareovirus

Балықтардың А реовирусы

Cynovirus

Цитоплазматикалық полиэдроз вирусы 1

Fujivirus

Фиджи ауруының вирусы

Phytoreovirus

Күріш ергежейлігінің вирусы

Oryzavirus

Күріш бұдырлануының вирусы

-

Birnaviridae

Aquabirnavirus

Жұқпалы панкреатит вирусы

Avibirnavirus

Құстар бурсасының жұқпалы ауруының вирусы

Entomobirnavirus

Х дрозофилланың вирусы

-

Totiviridae

Totivirus

Saccharomyces cerevisae бактерияларының L-A вирусы

Giardiavirus

Giardia lamblia қарапайымдылардың вирусы

Leishmaniavirus

Лейшманиялардың РНҚ вирусы 1-1

-

Chrysoviridae

Chrysovirus

Penicillium chrysogenium вирусы

-

Partitiviridae

Partitivirus

Atkinsonella hypoxylon вирусы

Alphacryptovirus

Ақ жоңышқаның латентті вирусы 1

Betacryptovirus

Ақ жоңышқаның латентті вирусы 2

-

Hypoviridae

Hypovirus

Cryphonectria-ның 1-EP 713 гиповирусы

Varicosavirus

Салат тармақтарының кеңею вирусы

РНҚ-құрамды вирустар – (-) он РНҚ-ы вирустар

Mоn

оnegavira

les

Paramyxoviridae

[Paramyxovirinae]

Respirovirus

Сендай вирусы

Morbillivirus

Қызылша вирусы

Rubulavirus

Паротит вирусы

Henipavirus

Hendra вирусы

Avulavirus

Ньюкастл ауруының вирусы

[Pneumоvirinae]

Pneumovirus

Адамдардың респираторлы-синциалдылық вирусы

Metapneumovirus

Құстардың пневмовирусы

Rhabdoviridae

Vesicolovirus

Индиананың везикулярлы стоматит вирусы

Lyssavirus

Құтыру вирусы

Ephemerovirus

Сиырлардың біркүндік қызбасының вирусы

Cytorhabdovirus

Салаттың сарғайып некроздануының вирусы

Nucleorhabdovirus

Картофельдің ергежейлі сарғаюының вирусы

Novirhabdovirus

Гемапоэздің жұқпалы некроз вирусы

Filoviridae

Marburgvirus

Марбург вирусы

Ebolavirus

Заирдағы Эбола вирусы

-

Bornaviridae

Bornavirus

Борн ауруының вирусы

-

Orthomyxoviridae

Influenzavirus A

А тұмауы вирусы

Influenzavirus B

В тұмауы вирусы

Influenzavirus C

С тұмауы вирусы

Thogotovirus

Тоготовирус

Isavirus

Бекіре балық жұқпалы анемиясының вирусы

-

Bunyaviridae

Bunyavirus

Буньявера вирусы

Hantavirus

Ханта вирусы

Nairovirus

Найроби вирусы

Phlebovirus

Рифт ойпатының қызба қоздыру вирусы

Taspovirus

Томаттың дақ түсіп солу вирусы

-

Arenaviridae

Arenovirus

Лимфоцитарлық хориоменингит вирусы

Ophiovirus

Цитрустылардың қабыршақтану вирусы

Tenuivirus

Күріштің жолақтанушылығының вирусы

Delta virus

Дельта гепатитінің вирусы

РНҚ-құрамды вирустар – (+) он РНҚ-ы вирустар

-

Leviviridae

Levivirus

Энтеробактериялар фагы MS 2

Allolevivirus

Энтеробактериялар фагы Qβ

-

Dicistroviridae

Cripavirus (бұрынғы туыстастығы «Infectious flacherie-like- viruses»)

Шырылдауық шегіртке салының вирусы Infectious flacheric virus

-

Picornаviridae

Enterovirus

Полиовирус

Rhinovirus

Адамдардың А риновирусы

Hepatovirus

А гепатит вирусы

Cardiovirus

Энцефаломиокардит вирусы

Aphthavirus

Аусыл вирусы

-

Sequiviridae

Parechovirus

Адамдардың пареховирусы

Sequivirus

Пастернак сары таңдақтық

вирусы

Waikavirus

Тунгро күрішінің спецификалық вирусы

-

Comovirus

Сиыр бұршағының теңбілдік вирусы

Fabavirus

Бұршақтар солу вирусы

Nepovirus

Темекінің сақиналы таңдақтану вирусы

-

Patyvirus

Картофель вирусы Y

Rymovirus

Қарабидай теңбілінің вирусы

Bymovirus

Арпа теңбілінің вирусы

Macluravirus

Маклюра теңбілінің вирусы

Ipomavirus

Тәтті картофель теңбілдігінің вирусы

Tritimovirus

Бидайдың жолақты теңбілінің вирусы

-

Vesivirus

Шошқалардың везикулярлы экзантемасының вирусы

Lagovirus

Қояндарының геморрагиялық қызбасының вирусы

«Norfolk-like viruses»

Норфольк вирусы

«Sapporo-like viruses»

Саппаро вирусы

-

«Hepatitic E–like viruses»

Гепатит Е вирусы

-

Astrovirus

Адамның астровирусы 1

-

Alphanodavirus

Қанаттылардың вирусы

Betanodavirus

Шортанның некроздық ауруының вирусы

-

Betatetravirus

Nudaurelia capensis в қанаттылардың вирусы

Omegatetravirus

Nudaurelia capensis щ қанаттылардың вирусы

-

Tombusvirus

Томат бұталарының ергежейлгі вирусы

Carmovirus

Қызыл қалампыр дақтану вирусы

Necrovirus

Темекінің А некроз вирусы

Dianthovirus

Қалампырдың сақиналық теңбілдік вирусы

Machlomovirus

Жүгерінің хлоретиялық таңдақтану вирусы

Avenavirus

Жалбыз хлоретикалық солу вирусы

Aureusvirus

Pathos латентті вирусы

Panicovirus

Тарының теңбілдену вирусы

Nidovi-rales

Coronaviridae

Coronavirus

Жұқпалы бронхит вирусы

Torovirus

Жылқының торавирусы

Arteriviridae

Arterivirus

Жылқының артериит вирусы

Roniviridae

Okavirus

Gill-ассоциаланған вирусы

-

Togoviridae

Alphavirus

Синдбис вирусы

Rubivirus

Қызамық вирусы

-

Flaviviridae

Flavivirus

Сары қызба вирусы

Pestivirus

Бұзау диареясының вирусы

Hepacivirus

C гепатит вирусы

-

Bromoviridae

Alfamovirus

Жоңышқа теңбілденуінің вирусы

Ilarvirus

Темекі теңбілінің вирусы

Bromovirus

Костра теңбілінің вирусы

Cucumovirus

Қияр теңбілінің вирусы

Oleavirus

Латентті вирус 2

-

Closteroviridae

Closterovirus

Қызылша сарғаюының вирусы

Crinivirus

Салат сарғаюының жұқпалы вирусы

Ampelovirus

Жүзім жапырағының бүрісуінің вирусы 3

-

Barnaviridae

Barnavirus

Bacciform саңырауқұлағының вирусы

-

Luteoviridae

Luteovirus

Арпа ергежейлігінің PAV вирусы

Palerovirus

Картофель жапырағын бүрістіретін вирус

Enamavirus

Бұршақ теңбілінің вирусы 1

Tobravirus

Доғалжапырақты ақшайыр вирусы

Tobamavirus

Темекі теңбілінің вирусы

Hordeivirus

Арпаның жолақты теңбілінің вирусы

Furovirus

Бидай теңбілінің вирусы

Pomavirus

Картофель тамырларын солытатын вирус

Pecluvirus

Арахистің түйіршіктену вирусы

-

Benyvirus

Қызылша тармақтарының сары некроз вирусы

-

Idaeovirus

Таңқұрай ергежейлігінің вирусы

-

Sobemovirus

Оңтүстік асбұршақтың теңбілдік вирусы

-

Umbravirus

Сәбіздің дақтану вирусы

-

Tymovurudae

Tumovirus

Репаның сары теңбілідік вирусы

Marafivirus

Жүгері собығының солуының вирусы

Maculovirus

Жүзім теңбілінің вирусы

-

Flexiviridae

Allexivirus

Шаллот-пиязының Х вирусы

-

-

Manadrivirus

Индиана цитрустарының таңдақтану вирусы

-

-

Carlovirus

Қызыл қалампырдың латентті вирусы

-

-

Capillovirus

Алма ағашының шіріту вирусы

-

-

Faveavirus

Алма дәнін зақымдайтын вирус

-

-

Potexvirus

Картофельдің Х вирусы

Trichovirus

Алманың хлоретикалық таңдақтану вирусы

Vitivirus

Жүзім жапырақтарының А вирусы

Ourmiavirus

Мускустық қауынның вирусы

РНҚ-құрамды «жалаңаш» вирустар

-

Narnaviridae

Narnavirus

Saccharomyces cerevisae бактерияларының

20 S PHK вирусы, нарнавирусы

Mitovirus

Crypinnectria parasiticaның 1NB631 митовирусы

Вириоидтар

-

Paspivroidae

Pаspiviroid

Картофель түбірінің ұршықпішінді вироиды

Hostaviroid

Хмель ергежейлігінің вироиды

Cocadviroid

Кокос пальмасы каданг-каданг ауруының вироиды

-

Avsunviroidae

Apscaviroid

Алма терісінің тыртықтану вироиды

Coleviroid

Колеустің 1-вироиды

Avsunviroid

Авокаданың «күнгейлік» таңдақтану вироиды

Pelamoviroid

Шабдалы теңбілігінің латентті вироиды

Субвирусты агенттер

Агенттер

Топтары

Типі

Топша/ түр

Satellites

Satellite Viruses

Біртізбекті РНҚ-ы сателитті вирустар

Аралардың созылмалы сал вирусының сателлиті

Темекі некрозы вирусының сателлиті

Satellite Nucleic Acid

Біртізбекті сателитті ДНҚ

Томат жапырағының бұйралану вирусының сателлиті ДНҚ

Екітізбекті сателитті ДНҚ

Saccharomyces cerevisae-ның М вирусының сателлиті

Біртізбекті сателитті РНҚ

Ірі сателлиттік РНҚ

Кіші сызықша сателлитті РНҚ

Циклдік сателлитті РНҚ

Prions

Сүтқоректілердің приондары

Скрепи агенттері

Саңырауқұлақтар-дың приондары

[URE 3]

Ескерту: он - бір жіпшелі (однонитевые), дн – екі жіпшелі (двухнитевые)