- •Предисловие
- •Глава 1. Аминокислоты и белки
- •1.1 Общая характеристика
- •1.2 Классификация аминокислот
- •1.3 Модификация аминокислот
- •1.4 Ионизация аминокислот
- •1.5 Пептидная связь
- •1.6 Пептиды и белки
- •1.7 Функции белков
- •1.8 Уровни структурной организации белков
- •А Первичная структура белка
- •Б Вторичная структура белка
- •В Третичная структура белка
- •Д Четвертичная структура белка
- •1.9 Глобулярные и фибриллярные белки
- •А Кератин
- •1.10 Простые и сложные белки
- •1.11 Денатурация и ренатурация белков
- •1.12 Методы работы с белками
- •А Очистка и выделение белка
- •Б Высаливание
- •В Диализ
- •Д Аналитические методы работы с белками
- •Термины
- •Вопросы к семинарскому занятию (1-я часть)
- •Вопросы к семинарскому занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Аминокислоты
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 2. Ферменты
- •2.1 Общая характеристика
- •2.2 Номенклатура ферментов
- •2.3 Свойства ферментов
- •2.4 Строение фермента
- •2.5 Специфичность ферментов
- •А Модель «ключ-замок»
- •Б Модель индуцированного соответствия
- •2.7 Термодинамика ферментативных реакций
- •2.8 Кинетика ферментативных реакций
- •А Вывод уравнения Михаэлиса-Ментен (по Бергу)
- •В Уравнение Лайнуивера-Берка
- •2.9 Механизмы ферментативного катализа
- •2.10 Влияние факторов среды на скорость протекания ферментативной реакции
- •А Концентрация субстрата
- •2.12 Мультисубстратные реакции
- •А Последовательный механизм
- •2.13 Ингибирование ферментов
- •Б Бесконкурентные ингибиторы
- •В Неконкурентные ингибиторы
- •2.14 Кооперативные взаимодействия внутри молекул ферментов
- •А Параллельная модель
- •2.15 Аллостерическая регуляция активности ферментов
- •2.16 Регуляция активности ферментов с помощью ковалентной модификации
- •2.17 Анти-, мульти- и изоферменты
- •2.18 Ферменты в медицине
- •А Энзимодиагностика
- •Термины
- •Вопросы к занятию (1-я часть)
- •Вопросы к занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 3. Нуклеиновые кислоты
- •3.1 Общая характеристика
- •3.2 Строение нуклеотида
- •3.3 Первичная структура ДНК
- •3.4 Вторичная структура ДНК
- •3.5 Денатурация и ренатурация ДНК
- •3.6 Третичная структура ДНК
- •3.7 Четвертичная структура ДНК
- •3.8 Виды РНК и их функции
- •3.9 Первичная структура РНК
- •3.10 Вторичная структура РНК
- •3.11 Третичная структура РНК
- •3.12 Четвертичная структура РНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 4. Репликация
- •4.1 Общая характеристика
- •4.2 Инициация репликации у прокариот
- •4.3 Элонгация репликации у прокариот
- •Б Механизм ферментативной реакции
- •4.4 Терминация репликации у прокариот
- •4.5 Репликация у эукариот
- •4.6 Проблемы репликации
- •Б Проблема высокой точности процесса
- •4.7 Плазмиды
- •В Типы плазмид
- •Д Механизмы репликации кольцевых плазмид
- •4.8 Репликация вирусов
- •Б Репликация генома РНК-вирусов
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 5. Транскрипция
- •5.1 Организация генетической информации
- •5.2 Общая характеристика транскрипции
- •5.3 Гипотеза Жакоба и Моно
- •5.4 Строение РНК-полимераз
- •5.5 Инициация транскрипции у прокариот
- •5.6 Элонгация транскрипции у прокариот
- •5.7 Терминация транскрипции у прокариот
- •5.8 Инициация транскрипции у эукариот
- •5.9 Элонгация транскрипции у эукариот
- •5.10 Терминация транскрипции у эукариот
- •А Кэпирование
- •Б Полиаденилирование
- •В Сплайсинг
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 6. Трансляция
- •6.1 Общая характеристика
- •6.2 Свойства генетического кода
- •6.3 Основные этапы биосинтеза белка
- •А Этап 1. Активация аминокислот
- •Д Этап 5. Фолдинг и посттрансляционная модификация
- •6.4 Рибосомы
- •6.5 Инициация у прокариот
- •6.6 Инициация у эукариот
- •6.7 Элонгация у прокариот
- •6.8 Элонгация у эукариот
- •6.9 Терминация у прокариот
- •6.10 Терминация у эукариот
- •6.11 Гипотеза «качания»
- •6.12 Фолдинг и посттрансляционная модификация белков
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 7. Регуляция биосинтеза белка
- •7.1 Регуляция экспрессии генов у прокариот
- •В Катаболическая репрессия. Лактозный оперон
- •Д Аттенуация. Триптофановый оперон
- •Е «Сильные» и «слабые» промоторы
- •Ж σ-Субъединица РНК-полимеразы
- •7.2 Регуляция экспрессии генов у эукариот
- •Хроматин-перестраивающие комплексы
- •Архитектурные белки высокомобильной группы
- •Ковалентная модификация гистонов
- •Метилирование ДНК
- •В Регуляция с помощью факторов транскрипции
- •7.3 Регуляция на уровне трансляции у про- и эукариот
- •А Дискриминация мРНК
- •Б Трансляционная репрессия
- •7.4 Другие механизмы регуляции у эукариот
- •Б РНК-интерференция
- •Интерференция с помощью малых интерферирующих РНК
- •Интерференция с помощью микроРНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Регуляция на уровне транскрипции (прокариоты)
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 8. Мутации и репарация
- •8.1 Мутации
- •8.2 Классификация мутаций по вызвавшим их причинам
- •8.3 Классификация мутаций по степени изменений генома
- •8.4 Классическая классификация
- •8.5 Репарация
- •А Прямая репарация
- •8.6 Эксцизионная репарация оснований (BER)
- •8.7 Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)
- •8.8 Мисметч репарация
- •8.9 Репарация двунитевых разрывов
- •8.10 Негомологичное соединение цепей ДНК при двунитевых разрывах
- •8.11 SOS-репарация (SOS-ответ)
- •8.12 Рекомбинационная репарация
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 9. Иммунитет и антитела
- •9.1 Иммунитет: его виды и элементы
- •9.2 Врожденный (неспецифический) иммунитет
- •В Химические медиаторы врожденного иимунитета
- •Е Классический путь активации комплемента
- •Ж Альтернативный путь активации комплемента
- •З Активация терминальных компонентов комплемента
- •И Как фагоциты отличают чужеродные клетки от «своих»?
- •9.3 Приобретенный (специфический) иммунитет
- •А T-лимфоциты
- •В Антитела
- •Е Вторичный иммунный ответ
- •Ж Активация гуморального иммунитета
- •9.4 Группы крови
- •9.5 Трансфузионные реакции
- •9.6 Правила переливания
- •9.7 Резус-фактор (Rh)
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 10. Биологические мембраны
- •10.1 Строение биомембран
- •В Липиды биомембран
- •10.2 Функции мембран
- •10.3 Мембранный транспорт
- •10.4 Эндо- и экзоцитоз
- •10.5 Трансмембранная передача сигнала
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 11. Энергетический обмен
- •11.1 Энергия в клетке
- •11.2 Дыхательная цепь митохондрий
- •11.3 Сопряжение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •11.4 Разобщение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 12. Введение в метаболизм
- •12.1 Общая характеристика
- •А Метаболические пути
- •Б Метаболиты
- •В Гомеостаз
- •12.2 Функции метаболических путей
- •А Образование энергии
- •Б Катаболизм органических соединений
- •Переваривание
- •Гликолиз
- •Окисление жирных кислот
- •Катаболизм аминокислот
- •В Синтез органических соединений и предшественников макромолекул
- •Глюконеогенез: синтез глюкозы
- •Синтез жирных кислот
- •Синтез гема
- •Креатинфосфат
- •Гликоген
- •Жиры или триацилглицеролы
- •Д Выведение потенциально опасных соединений
- •Цикл мочевины
- •Синтез желчных кислот
- •Катаболизм гема
- •Е Образование регуляторных молекул
- •12.3 Ключевые положения всех метаболических путей
- •А АТФ — донор энергии для синтеза
- •В Эссенциальные органические соединения
- •Д Взаимосвязи метаболических путей
- •Е Нелинейность метаболических путей
- •Ж Локализация метаболических путей в клетке
- •З Тканеспецифичность метаболических путей
- •И Метаболизм при голодании
- •12.4 Интеграция метаболизма
- •А Основные физиологические состояния организма и роль различных органов в интеграции метаболизма
- •Состояние насыщения
- •Состояние голодания
- •Б Интеграция метаболизма в различных физиологических состояниях
- •Состояние голодания
- •Продолжительное голодание
- •Состояние насыщения
- •Физические нагрузки
- •В Регуляция метаболизма
- •Инсулин
- •Глюкагон
- •Адреналин
- •Гидрокортизон
- •Адипоцитокины
- •Рекомендуемая литература
- •Приложение 1. Аминокислоты и белки
- •Классификация аминокислот
- •Приложение 2. Ферменты
- •Строение химотрипсина
- •Приложение 3. Нуклеиновые кислоты
- •Приложение 4. Репликация
- •Приложение 5. Транскрипция
- •Приложение 6. Трансляция
- •Приложение 7. Регуляция биосинтеза белка
- •Приложение 8. Мутации и репарация
- •Приложение 9. Иммунитет и антитела
- •Приложение 10. Биологические мембраны
- •Приложение 11. Энергетический обмен
- •Оглавление
190 |
Глава 10 |
Биологические мембраны |
ГМембранные белки
Все мембранные белки можно разделить на 4 группы:
1.Интегральные политопические белки прочно связаны с мембраной с помощью гидрофобных взаимодействий и пронизывают её насквозь (см. Рис. 113 ▲). При этом интегральные белки амфифильны, т.е. имеют как гидрофобные участки, погружённые в мембрану, так и гидрофильные, обращённые к водой среде. Некоторые белки содержат липидные группы, заякоривающие их в мембране: пренильные группы, ацильные группы (жирные кислоты) и гликозилфосфатидилинозитол.
Примеры интегральных политопических белков: транспортеры (АТФазы), ионные каналы (аквапорины, хлоридные каналы), портеры (унипортеры, симпортеры, антипортеры), некоторые ферменты (метанмонооксигеназа, ромбоидпротеаза).
2.Интегральные монотопические белки прочно связаны лишь с одним слоем липидов мембраны и не пронизывают её насквозь (другое назва-
ние — полуинтегральные).
Примеры интегральных монотопических белков: простагландин H2 син-
таза 1 и 2 (циклооксигеназы), ланостеролсинтаза и скваленциклаза, микросомальная простагландин E синтаза, карнитин-O-пальмитоилтранс- фераза-2.
3.Периферические белки ассоциированы с поверхностью мембран с помощью ионных и водородных связей с липидами и интегральными белками.
Примеры периферических белков: цитохром c (связанный со внешней поверхностью внутренней митохондриальной мембраны), липоксиге-
назы, холестеролоксидазы, каротиноидоксигеназы, фосфолипаза С, фосфолипаза А2, сфингомиелиназа С.
4.Амфитропические белки обнаруживаются как в свободном виде в цитозоле, так и в связанном виде с мембранами. Их аффинность к мембранам обусловлена нековалентными взаимодействиями с мембранными белками и липидами, а в других случаях — наличием липидных групп.
Примеры амфитропических белков: Src-киназы (нерецепторные тирозиновые киназы), фосфолипаза С (участвующая в инозитолфосфатном сиг-
нальном пути), цитидилтрансфераза, протеинкиназа С, винкулин (белок цитоскелета).
10.2Функции мембран
1.Формирование физиологического клеточного барьера и отделение клеточного содержимого (образование мембранных органелл), поддержание его постоянства.
2.Транспорт веществ:
а. Пассивный; б. Активный.
Мембранный транспорт 191
3.Коммуникация между клетками и внутриклеточная сигнализация (сигнальные пути).
4.Клеточная адгезия.
5.Участие в энергетических процессах и проведении нервных импульсов.
10.3 Мембранный транспорт
Мембранный транспорт может быть:
1.Неопосредованным (простая диффузия) — так переносятся неполярные соединения (преимущественно — газы), белки в этом процессе не участвуют;
2.Опосредованным — так транспортируются полярные соединения и происходит это с помощью белков-переносчиков:
а. Пассивно-опосредованный транспорт (пассивный транспорт); б. Активно-опосредованный транспорт (активный транспорт).
—Первично-активный транспорт.
—Вторично-активный транспорт.
Пассивный транспорт происходит по градиенту концентрации (из места с повышенной концентрацией вещества в место с его пониженной). Его осуществляют:
1.Ионофоры: переносят ионы или формируют каналы (валиномицин, переносящий ионы K+);
2.Ионные каналы: переносят ионы и могут быть высокоселективными;
3.Порины: переносят ионы или неполярные вещества (бактериальный белок мальтопорин, переносящий мальтодекстрины);
4.Транспортные белки: отвечают за унипорт, симпорт и антипорт;
5.Аквапорины: осуществляют трансмембранный перенос молекул воды. Активный транспорт происходит против градиента концентрации с затратой
энергии по двум механизмам: первично-активному и вторично-активному.
В большинстве случаев первично-активный транспорт сопряжён с гидролизом АТФ (дефосфорилированием — отщеплением остатка фосфорной кислоты), что обеспечивает энергию для транспорта против градиента концентрации. Первично-актив- ный транспорт осуществляется АТФ-зависимыми транспортерами:
1.АТФазы типов «P», «F», «V», «A»: переносят H+, Na+, K+, Ca2+, и другие ионы. Пример: (Na+–K+)-АТФаза, Ca2+-АТФаза;
2.ABC-транспортеры: переносят ионы, небольшие молекулы метаболи-
тов и лекарственных веществ. Пример: P-гликопротеин. Вторично-активный транспорт использует энергию электрохимического гра-
диента (градиента концентрации ионов), которая обеспечивается с помощью пер- вично-активного транспорта. Иными словами, не используя энергию АТФ напрямую, вторично-активный транспорт зависит от первично-активного, а значит, косвенно нуждается в энергии АТФ. Примеры: Na+-глюкозная транспортная система (в энтероцитах), лактозная пермеаза (у кишечной палочки E. coli).
192 |
Глава 10 |
Биологические мембраны |
Рис. 114. Первично-активный (Na+–K+–АТФаза) и вторично-активный транспорт
(Na+-глюкозный симпортный переносчик)
Пассивный и активный транспорт может осуществляться по трем механизмам
(см. Рис. 115 ▼):
1.Унипорту (один ион/молекула в одном направлении);
2.Симпорту (два иона в одном направлении);
3.Антипорту (два иона в разных направлениях).
Рис. 115. Транслоказные системы и механизмы транспорта: унипорт, симпорт и антипорт.
Эндо- и экзоцитоз 193
10.4 Эндо- и экзоцитоз
Помимо небольших молекул и ионов клеткам необходимо поглощать и экспортировать частицы и крупные молекулы, которые не могут быть перенесены в клетку или из неё с помощью пассивного и активного транспорта. Для этого существует ве-
зикулярный транспорт в клетку (эндоцитоз) и из клетки (экзоцитоз).
Эндоцитоз — это процесс захвата макромолекул плазматической мембраной
итранспорта их в клетку путем образования липидной везикулы. Пути эндоцитоза:
1.Клатрин-зависимый эндоцитоз осуществляется путём образования небольших везикул (100 нм в диаметре), покрытых белковой оболочкой, состоящей из комплекса разных белков с белком клатрином. Так захватываются: ЛПНП, трансферрин, ростовые факторы и антитела. В этом пути участвуют мембранные рецепторы.
2.Кавеолярный эндоцитоз осуществляется с помощью мембранных впячиваний (кавеол) внутрь клетки в особых участках плазматической мембраны, богатых холестеролом и гликолипидами и связанных с белком кавеолином. Кавеолами богаты клетки гладкой мускулатуры, пневмоциты, фибробласты, адипоциты и эндотелиальные клетки. В этом пути участвуют мембранные рецепторы.
3.Макропиноцитоз происходит путем впячивания значительной области мембраны внутрь клетки и образования везикулы (0,5–5 мкм в диаметре), эквивалентной 100 клатриновым везикулам по объёму захваченных молекул. Затем такая везикула сливается с эндосомой и лизосомой. Этот эндоцитоз в рецепторах не нуждается (неселективный).
4.Фагоцитоз — это процесс захвата больших частиц диаметром более 0,75 мкм — пыль, клеточный мусор, микроорганизмы и даже клетки, под-
вергшиеся апоптозу.
Экзоцитоз — это процесс везикулярного транспорта соединений из клетки во внеклеточное пространство. Различают:
1.Ca2+-зависимый экзоцитоз (регулируемый) происходит чаще всего в нейронах и служит для проведения нервных сигналов (в химических синапсах).
2.Ca2+-независимый экзоцитоз (конститутивный) происходит во всех клетках и служит для секреции компонентов внеклеточного матрикса или доставки новосинтезированных мембранных белков, встроенных в плазматическую мембрану.
Внастоящее время известно, что в узнавании и направлении везикул к нужному месту участвуют v-SNARE (везикулярные белки) и t-SNARE (target-белки, встроенные в мембрану) белки. В сборке содержимого везикулы и самой везикулы участвуют ЭПР и комплекс Гольджи.