- •Предисловие
- •Глава 1. Аминокислоты и белки
- •1.1 Общая характеристика
- •1.2 Классификация аминокислот
- •1.3 Модификация аминокислот
- •1.4 Ионизация аминокислот
- •1.5 Пептидная связь
- •1.6 Пептиды и белки
- •1.7 Функции белков
- •1.8 Уровни структурной организации белков
- •А Первичная структура белка
- •Б Вторичная структура белка
- •В Третичная структура белка
- •Д Четвертичная структура белка
- •1.9 Глобулярные и фибриллярные белки
- •А Кератин
- •1.10 Простые и сложные белки
- •1.11 Денатурация и ренатурация белков
- •1.12 Методы работы с белками
- •А Очистка и выделение белка
- •Б Высаливание
- •В Диализ
- •Д Аналитические методы работы с белками
- •Термины
- •Вопросы к семинарскому занятию (1-я часть)
- •Вопросы к семинарскому занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Аминокислоты
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 2. Ферменты
- •2.1 Общая характеристика
- •2.2 Номенклатура ферментов
- •2.3 Свойства ферментов
- •2.4 Строение фермента
- •2.5 Специфичность ферментов
- •А Модель «ключ-замок»
- •Б Модель индуцированного соответствия
- •2.7 Термодинамика ферментативных реакций
- •2.8 Кинетика ферментативных реакций
- •А Вывод уравнения Михаэлиса-Ментен (по Бергу)
- •В Уравнение Лайнуивера-Берка
- •2.9 Механизмы ферментативного катализа
- •2.10 Влияние факторов среды на скорость протекания ферментативной реакции
- •А Концентрация субстрата
- •2.12 Мультисубстратные реакции
- •А Последовательный механизм
- •2.13 Ингибирование ферментов
- •Б Бесконкурентные ингибиторы
- •В Неконкурентные ингибиторы
- •2.14 Кооперативные взаимодействия внутри молекул ферментов
- •А Параллельная модель
- •2.15 Аллостерическая регуляция активности ферментов
- •2.16 Регуляция активности ферментов с помощью ковалентной модификации
- •2.17 Анти-, мульти- и изоферменты
- •2.18 Ферменты в медицине
- •А Энзимодиагностика
- •Термины
- •Вопросы к занятию (1-я часть)
- •Вопросы к занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 3. Нуклеиновые кислоты
- •3.1 Общая характеристика
- •3.2 Строение нуклеотида
- •3.3 Первичная структура ДНК
- •3.4 Вторичная структура ДНК
- •3.5 Денатурация и ренатурация ДНК
- •3.6 Третичная структура ДНК
- •3.7 Четвертичная структура ДНК
- •3.8 Виды РНК и их функции
- •3.9 Первичная структура РНК
- •3.10 Вторичная структура РНК
- •3.11 Третичная структура РНК
- •3.12 Четвертичная структура РНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 4. Репликация
- •4.1 Общая характеристика
- •4.2 Инициация репликации у прокариот
- •4.3 Элонгация репликации у прокариот
- •Б Механизм ферментативной реакции
- •4.4 Терминация репликации у прокариот
- •4.5 Репликация у эукариот
- •4.6 Проблемы репликации
- •Б Проблема высокой точности процесса
- •4.7 Плазмиды
- •В Типы плазмид
- •Д Механизмы репликации кольцевых плазмид
- •4.8 Репликация вирусов
- •Б Репликация генома РНК-вирусов
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 5. Транскрипция
- •5.1 Организация генетической информации
- •5.2 Общая характеристика транскрипции
- •5.3 Гипотеза Жакоба и Моно
- •5.4 Строение РНК-полимераз
- •5.5 Инициация транскрипции у прокариот
- •5.6 Элонгация транскрипции у прокариот
- •5.7 Терминация транскрипции у прокариот
- •5.8 Инициация транскрипции у эукариот
- •5.9 Элонгация транскрипции у эукариот
- •5.10 Терминация транскрипции у эукариот
- •А Кэпирование
- •Б Полиаденилирование
- •В Сплайсинг
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 6. Трансляция
- •6.1 Общая характеристика
- •6.2 Свойства генетического кода
- •6.3 Основные этапы биосинтеза белка
- •А Этап 1. Активация аминокислот
- •Д Этап 5. Фолдинг и посттрансляционная модификация
- •6.4 Рибосомы
- •6.5 Инициация у прокариот
- •6.6 Инициация у эукариот
- •6.7 Элонгация у прокариот
- •6.8 Элонгация у эукариот
- •6.9 Терминация у прокариот
- •6.10 Терминация у эукариот
- •6.11 Гипотеза «качания»
- •6.12 Фолдинг и посттрансляционная модификация белков
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 7. Регуляция биосинтеза белка
- •7.1 Регуляция экспрессии генов у прокариот
- •В Катаболическая репрессия. Лактозный оперон
- •Д Аттенуация. Триптофановый оперон
- •Е «Сильные» и «слабые» промоторы
- •Ж σ-Субъединица РНК-полимеразы
- •7.2 Регуляция экспрессии генов у эукариот
- •Хроматин-перестраивающие комплексы
- •Архитектурные белки высокомобильной группы
- •Ковалентная модификация гистонов
- •Метилирование ДНК
- •В Регуляция с помощью факторов транскрипции
- •7.3 Регуляция на уровне трансляции у про- и эукариот
- •А Дискриминация мРНК
- •Б Трансляционная репрессия
- •7.4 Другие механизмы регуляции у эукариот
- •Б РНК-интерференция
- •Интерференция с помощью малых интерферирующих РНК
- •Интерференция с помощью микроРНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Регуляция на уровне транскрипции (прокариоты)
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 8. Мутации и репарация
- •8.1 Мутации
- •8.2 Классификация мутаций по вызвавшим их причинам
- •8.3 Классификация мутаций по степени изменений генома
- •8.4 Классическая классификация
- •8.5 Репарация
- •А Прямая репарация
- •8.6 Эксцизионная репарация оснований (BER)
- •8.7 Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)
- •8.8 Мисметч репарация
- •8.9 Репарация двунитевых разрывов
- •8.10 Негомологичное соединение цепей ДНК при двунитевых разрывах
- •8.11 SOS-репарация (SOS-ответ)
- •8.12 Рекомбинационная репарация
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 9. Иммунитет и антитела
- •9.1 Иммунитет: его виды и элементы
- •9.2 Врожденный (неспецифический) иммунитет
- •В Химические медиаторы врожденного иимунитета
- •Е Классический путь активации комплемента
- •Ж Альтернативный путь активации комплемента
- •З Активация терминальных компонентов комплемента
- •И Как фагоциты отличают чужеродные клетки от «своих»?
- •9.3 Приобретенный (специфический) иммунитет
- •А T-лимфоциты
- •В Антитела
- •Е Вторичный иммунный ответ
- •Ж Активация гуморального иммунитета
- •9.4 Группы крови
- •9.5 Трансфузионные реакции
- •9.6 Правила переливания
- •9.7 Резус-фактор (Rh)
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 10. Биологические мембраны
- •10.1 Строение биомембран
- •В Липиды биомембран
- •10.2 Функции мембран
- •10.3 Мембранный транспорт
- •10.4 Эндо- и экзоцитоз
- •10.5 Трансмембранная передача сигнала
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 11. Энергетический обмен
- •11.1 Энергия в клетке
- •11.2 Дыхательная цепь митохондрий
- •11.3 Сопряжение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •11.4 Разобщение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 12. Введение в метаболизм
- •12.1 Общая характеристика
- •А Метаболические пути
- •Б Метаболиты
- •В Гомеостаз
- •12.2 Функции метаболических путей
- •А Образование энергии
- •Б Катаболизм органических соединений
- •Переваривание
- •Гликолиз
- •Окисление жирных кислот
- •Катаболизм аминокислот
- •В Синтез органических соединений и предшественников макромолекул
- •Глюконеогенез: синтез глюкозы
- •Синтез жирных кислот
- •Синтез гема
- •Креатинфосфат
- •Гликоген
- •Жиры или триацилглицеролы
- •Д Выведение потенциально опасных соединений
- •Цикл мочевины
- •Синтез желчных кислот
- •Катаболизм гема
- •Е Образование регуляторных молекул
- •12.3 Ключевые положения всех метаболических путей
- •А АТФ — донор энергии для синтеза
- •В Эссенциальные органические соединения
- •Д Взаимосвязи метаболических путей
- •Е Нелинейность метаболических путей
- •Ж Локализация метаболических путей в клетке
- •З Тканеспецифичность метаболических путей
- •И Метаболизм при голодании
- •12.4 Интеграция метаболизма
- •А Основные физиологические состояния организма и роль различных органов в интеграции метаболизма
- •Состояние насыщения
- •Состояние голодания
- •Б Интеграция метаболизма в различных физиологических состояниях
- •Состояние голодания
- •Продолжительное голодание
- •Состояние насыщения
- •Физические нагрузки
- •В Регуляция метаболизма
- •Инсулин
- •Глюкагон
- •Адреналин
- •Гидрокортизон
- •Адипоцитокины
- •Рекомендуемая литература
- •Приложение 1. Аминокислоты и белки
- •Классификация аминокислот
- •Приложение 2. Ферменты
- •Строение химотрипсина
- •Приложение 3. Нуклеиновые кислоты
- •Приложение 4. Репликация
- •Приложение 5. Транскрипция
- •Приложение 6. Трансляция
- •Приложение 7. Регуляция биосинтеза белка
- •Приложение 8. Мутации и репарация
- •Приложение 9. Иммунитет и антитела
- •Приложение 10. Биологические мембраны
- •Приложение 11. Энергетический обмен
- •Оглавление
183
Глава 10. Биологические мембраны
10.1 Строение биомембран
Биомембраны представляют собой липидный бислой, с которым ассоциированы различные белки. Выделим ключевые особенности биомембран:
1.Толщина большинства биомембран колеблется в пределах от 6 нм (60 Å)
до 10 нм (100 Å).
2.Мембраны состоят главным образом из белков и липидов. Их соотношение в мембранах разное — от 1:4 до 4:1 — в зависимости от особенностей клетки (или органеллы) и метаболизма.
3.Мембранные липиды — небольшие молекулы, имеющие гидрофильные и гидрофобные участки. Эти липиды спонтанно формируют замкнутые бимолекулярные листы в водной среде. Мембраны являются препятствием для полярных молекул.
4.Специфические мембранные белки выполняют различные функции: они служат насосами, каналами, рецепторами, энергетическими станциями и ферментами. Белки погружены в липидный бислой, который создаёт для них «удобную» среду.
5.Мембраны — нековалентно связанные структуры. Формирование липидного бислоя происходит за счет гидрофобных взаимодействий.
6.Мембраны асимметричны. Их внешний слой отличается по составу от внутреннего, обращённого в цитозоль.
7.Мембраны — текучие структуры. Их можно назвать двухмерными растворами белков и липидов.
8.Большинство клеточных мембран поляризованы. На внутренней поверхности мембран обычно сосредоточен отрицательный заряд (–60 мВ). Мембранный потенциал играет ключевую роль в клеточном транспорте, энергетических процессах и нервной возбудимости.
АМодель «сэндвича»
Первой общепринятой моделью строения мембран стала модель «сэндвича» Хью Давсона и Джеймса Даниэлли. Её положения:
1.Липидный бислой состоит из фосфолипидов:
—Внутри — гидрофобные хвосты;
—Снаружи — гидрофильные головки.
—Наружные слои формируют две взаимодействующих с водной фазой поверхности.
2.Белки покрывают наружную поверхность мембраны.
—Образуется белково-липидный сэндвич;
—Белки не пронизывают липидный бислой.
3.Проблемы:
—Модель предполагает, что все мембраны идентичны, а это не так.
184Глава 10 Биологические мембраны
—Белки мембран взаимодействуют с водной фазой на обеих поверхностях мембраны, а такая конфигурация нестабильна.
БЖидкостно-мозаичная модель
Внастоящее время принята жидкостно-мозаичная модель строения мембран (её предложили Джонатан Зингер и Гарт Николсон). Её положения:
1.Мембрана — «жидкая мозаика» фосфолипидов и белков.
2.Существует две основные категории мембранных белков:
—Периферические белки;
—Интегральные белки.
3.Мембраны асимметричны по составу:
—Снаружи и изнутри с мембранами связаны разные периферические белки;
—Внешний и внутренний липидный слои имеют разный липидный состав;
—Некоторые белки пронизывают мембрану насквозь; они называются интегральными;
—Липидный бислой текуч и обеспечивает латеральную диффузию белков и самих липидов.
—Липиды способны и к медиальной диффузии (т.е. вертикальному переносу или «флип-флопу»).
В Липиды биомембран
Липидную основу всех биомембран составляют 3 класса липидов: 1. Фосфолипиды:
а. Глицерофосфолипиды (или фосфоглицериды) состоят из глице-
рол-3-фосфата, C1 и С2 атомы которого связаны с жирными кислотами, а с C3 атомом обычно связан остаток фосфорной кислоты
иполярная группа X (см. Рис. 108 и Таблицу 17 ▼). Функции:
—
Рис. 108. Общая структурная формула глицерофосфолипида
|
|
|
Строение биомембран |
185 |
||
|
|
|
|
|
|
|
Таблица 16 |
Глицерофосфолипиды |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
X-группа |
|
Название соединения |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидная кислота |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидилхолин |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидилэтаноламин |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидилсерин |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидилглицерол |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Дифосфатидилглицерол |
|
|
|
|
|
|
(кардиолипин) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Фосфатидилинозитол
186 |
Глава 10 |
Биологические мембраны |
Рис. 109. Примеры глицерофосфолипидов: фосфатидилэтаноламин, фосфатидилсерин и фосфатидилхолин
б. Сфингофосфолипиды (или сфингомиелины) состоят из церамида
(аминоспирт сфингозин + жирная кислота, связанная с аминогруппой сфингозина с помощью амидной связи) и полярной головки — фосфохолин или фосфоэтаноламин (связаны с основной гидроксильной группой сфингозина) (см. Рис. 110 ▼). Функции этих липидов:
—Входят в состав миелиновой оболочки аксонов нейронов (хотя сфинголипиды обнаруживаются и в мембранах других клеток).
—Участие в сигнальных путях (при синтезе сфингомиелинов образуется диацилглицерол, вторичный мессенджер клетки) и апоптозе (путём расщепления до церамида).
—Входят в состав липидных рафтов. Их функции: регуляция текучести мембран, регуляция нейротрансмиссии, рецепции и трансмембранного движения белков.
Строение биомембран 187
Рис. 110. Структурные формулы сфингозина, церамида и сфингомиелина
188 |
Глава 10 |
Биологические мембраны |
в. Плазмалогены состоят из глицерола, у которого C1 атом связан с ацильной группой α,β -ненасыщенной связью (см. Рис. 111 ).
Рис. 111. Общая структурная формула плазмалогена.
2.Гликолипиды — группа мембранных липидов, содержащих углеводную группу в составе молекулы. Гликолипиды подразделяются на:
а. Глицерогликолипиды состоят из глицерола, связанных с ним двух жирных кислот (в виде ацильных групп) и углеводного остатка:
—Галактолипиды:
галактоза, глицерол и 2 ЖК;
—Сульфолипиды:
сульфохиновоза, глицерол и 2 ЖК.
б. Гликосфинголипиды состоят из церамида (сфингозин + жирная кислота) и углеводного остатка:
—Цереброзиды:
Галактоцереброзиды
церамид + галактоза.
Глюкоцереброзиды
церамид + глюкоза.
Сульфатиды
церамид + сульфатированная галактоза.
—Ганглиозиды:
церамид + олигосахарид + остаток сиаловой кислоты.
—Глобозиды:
церамид + несколько углеводных остатков (R-групп).
3.Стероиды:
а. Холестерол (у животных). Его функции:
Строение биомембран 189
—Контролирует текучесть биомембран, взаимодействуя с полярными головками фосфо- и сфинголипидов. Это взаимодействие повышает мембранную упаковку и снижает текучесть. А это, в свою очередь, уменьшает проницаемость мембран для нейтральных соединений, ионов H+ и Na+.
—Участвует в кавеолярном и клатрин-зависимом эндоцитозе.
—Является мембранным антиоксидантом.
Рис. 112. Структурная формула холестерола
б. Фитостеролы (у растений — эрго- и ситостерол).
Рис. 113. Плазматическая мембрана.