Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Словарь-справочник терминов и понятий в области госпитальной эпидемиологии

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
08.09.2026
Размер:
2 Мб
Скачать
☆
рез ко му уве ли че нию доли го мо зи гот. Кон цеп ция ге не ти че ско го дрейфа раз ра бо та на С. Рай том, а не за ви си мая кон цеп ция ге не ти ­ко-ав то ма ти че ских про цес сов — Н. П. Ду би ни ным и Д. Д. Ро ма шо ­вым в на ча ле 1930-х гг. [2].
ÃÅ ÍÅ ÒÈ ×Å ÑÊÈÉ ÌÀÐ ÊÅÐ (GE NE TIC MAR KER)
Ген, де тер ми ни ру ю щий от чет ли во вы ра жен ный фе но ти пи че ский при знак, ис по ль зу е мый для ге не ти че ско го кар ти ро ва ния и ин ди ви ­ду а ль ной иден ти фи ка ции ор га низ мов или кле ток; так же в ка че ст ве ге не ти че ско го маркера мо гут слу жить це лые (мар кер ные) хро мо со ­мы [2].
ÃÅ ÍÅ ÒÈ ×Å ÑÊÎÅ ÐÀÑ ÑÒÎ ß ÍÈÅ, ÃÅ ÍÅ ÒÈ ×Å ÑÊÀß ÄÈ Ñ ÒÀÍ ÖÈß (GE NE TIC DIS TAN CE)
Ко ли че ст вен ная ха рак те ри сти ка срав ни ва е мых объ ек тов (по пу ля ­ции, виды и т. п.), опре де ля ю щая сред нее чис ло за мен нук ле о ти дов в каж дом ло ку се, ко то рые про и зош ли за вре мя раз де ль ной эво лю ции двух групп ор га низ мов; в на сто я щее вре мя наи бо лее ши ро ко при ме ­ня ет ся ме тод рас че та ге не ти че ско го рас сто я ния по Нэю (Nei ge ne tic dis tan ce) [2].
ÃÅ ÍÎÌ (GE NO ME)
1. Со во куп ность ге нов в гап ло ид ном на бо ре хро мо сом кон к рет ной
æè âîò íîé èëè ðàñ òè òå ëü íîé êëåò êè. Ñî îò âåò ñò âåí íî äèï ëî èä íûå
клет ки эука ри от име ют 2 генома, трип ло ид ные — 3 и т. д. У бак те -
рий под геномом по ни ма ют ге не ти че скую ин фор ма цию, за клю -
чен ную в бак те ри а ль ной хро мо со ме. В от ли чие от ге но ти па, геном
ïðåä ñòàâ ëÿ åò ñî áîé õà ðàê òå ðè ñòè êó âèäà, à íå îò äå ëü íîé îñî áè
[6].
2. Cо во куп ность ге нов гап ло ид но го на бо ра хро мо сом дан но го вида
îð ãà íèç ìîâ; îð ãà íèçì ìî æåò çà êëþ ÷àòü â ñåáå ðàç íûå ãå íî ìû
(ìíî ãèå ïî ëè ïëî èä íûå ðàñ òå íèÿ ÿâ ëÿ þò ñÿ àë ëî ïî ëèï ëî è äà ìè),
åñëè îí âîç íèê â ðå çó ëü òà òå ãèá ðè äè çà öèè; â ñëó ÷àå åñëè îð ãà íèçì
íå ÿâ ëÿ åò ñÿ àë ëîï ëî è äîì, òî òåð ìèí «ãå íîì» èñ ïî ëü çó åò ñÿ äëÿ
îáî çíà ÷å íèÿ âñåé ñî âî êóï íî ñòè ãå íîâ (äèï ëî èä íîé è ò. ï.), èíî -
ãäà òåð ìèí «ãå íîì» èñ ïî ëü çó þò â êà ÷å ñò âå ñè íî íè ìà ïî íÿ òèÿ
«êà ðè î òèï» (ka ry o ty pe), ÷òî íå âåð íî; òåð ìèí «ãå íîì» ïðåä ëî æåí
Ã. Âèí ê ëå ðîì â 1920 ã. [2].
ÃÅ ÍÎ ÌÈ ÊÀ (GE NO MICS)
На прав ле ние со вре мен ной мо ле ку ляр ной био ло гии и ге не ти ки, изу ча ю щее ге но мы ви дов. Вы де ля ют струк тур ную, фун к ци о на ль ­ную и срав ни те ль ную ге но ми ку. Цель струк тур ной ге но ми ки — изу че ние со дер жа ния и ор га ни за ции ге ном ной ин фор ма ции. Ее основ ная за да ча — сек ве ни ро ва ние ге но мов и кар ти ро ва ние. Цель
201
фун к ци о на ль ной ге но ми ки — изу че ние ре а ли за ции на след ст вен ­ной ин фор ма ции, за ко ди ро ван ной в ге но ме (от гена к при зна ку). Ее основ ная за да ча — пред ска за ние фун к ции ге нов. Основ ной за ­да чей срав ни те ль ной ге но ми ки яв ля ет ся срав ни те ль ный ана лиз струк тур ге но мов раз ных ор га низ мов [12].
ÃÅ ÍÎ ÒÈÏ (GE NO TY PE)
1. Cо во куп ность на след ст вен ных за дат ков клет ки или ор га низ ма —
íà áîð àë ëå ëåé, õà ðàê òåð èõ ñöåï ëå íèÿ è èíûõ ôîðì âçàè ìî äåé ñò -
âèÿ; ãå íî òèï — ãå íå òè ÷å ñêàÿ êîí ñòè òó öèÿ îð ãà íèç ìà, èìå þ ùàÿ
про яв ле ние в своем фе но ти пе (phe no ty pe); тер мин «генотип» пред -
ло жен В. Иоган зе ном в 1909 г. [2].
2. Со во куп ность всех ге нов ор га низ ма (дей ст ву ю щих и ре прес си ро -
âàí íûõ), âêëþ ÷àÿ âíå ÿäåð íûå (õëî ðî ïëà ñ òîâ, ìè òî õîí ä ðèé, ïëàç -
ìèä). Êàæ äûé ãåí ãå íî òè ïà íà õî äèò ñÿ â ñëîæ íîì âçàè ìî äåé ñò âèè
с оста ль ны ми, что опре де ля ет ин ди ви ду а ль ность осо би [6].
ÃÅ ÍÎ ÔÎÍÄ, ÃÅÍ ÍÛÉ ÏÓË (GENE POOL)
Âñÿ ãå íå òè ÷å ñêàÿ èí ôîð ìà öèÿ, ñî äåð æà ùà ÿ ñÿ â ãå íî ìàõ îñî áåé ðå ­ïðî äóê òèâ íîé ÷à ñ òè ïî ïó ëÿ öèè [2].
ÃÈÁ ÐÈ ÄÈ ÇÀ ÖÈß ÌÎ ËÅ ÊÓ ËßÐ ÍÀß (NUC LE IC ACID HYB RI DI ZA ­TI ON).
Îá ðà çî âà íèå êîì ï ëåê ñîâ ìåæ äó öå ïÿ ìè íóê ëå è íî âûõ êèñ ëîò â ðå ­çó ëü òà òå âçàè ìî äåé ñò âèÿ êîì ï ëå ìåí òàð íûõ íóê ëå î òè äîâ. Ìå òîä èñ ïî ëü çó åò ñÿ äëÿ èäåí òè ôè êà öèè ìèê ðî îð ãà íèç ìîâ [6].
ÃËÎ ÁÀ ËÜ ÍÎÅ (ÏÎË ÍÎÅ) ÂÛ ÐÀÂ ÍÈ ÂÀ ÍÈÅ (GLO BAL ALIG N ­MENT)
Âû ðàâ íè âà íèå íóê ëå î òèä íûõ èëè àìè íî êèñ ëîò íûõ ïî ñëå äî âà òå ëü ­íî ñòåé ïî èõ ïîë íîé äëè íå [5].
ÃÎ ÐÈ ÇÎÍ ÒÀ ËÜ ÍÛÉ ÏÅ ÐÅ ÍÎÑ ÃÅ ÍÎÂ (HO RI ZON TAL GENE TRAN S FER)
Ýâî ëþ öè îí íûé ìå õà íèçì, çà êëþ ÷à þ ùèé ñÿ â ïå ðå äà ÷å ãå íîâ ìåæ äó îä íî âðå ìåí íî ñó ùå ñò âó þ ùè ìè îð ãà íèç ìà ìè, à íå îò ðî äè òå ëåé — ïî òîì ñò âó [2].
ÄÅ ËÅ ÖÈß (DE LE TI ON)
Хро мо сом ная абер ра ция (пе ре строй ка), при ко то рой про ис хо дит вы па де ние уча ст ка хро мо со мы из ее ин тер сти ци а ль ной ча с ти (от не ­ско ль ких нук ле о ти дов до ви зу а ль но иден ти фи ци ру е мых на хро мо ­сом ных пре па ра тах фраг мен тов) [2].
202
ÄÅ ÐÅ ÂÎ ÃÅÍÀ (GENE TREE)
Ôè ëî ãå íå òè ÷å ñêîå äå ðå âî, ïî ñòðî åí íîå íà îñíî âå íà áëþ äà å ìîé âà ­ðè à áå ëü íî ñòè îä íî ãî ãåíà â ðàç íûõ îð ãà íèç ìàõ [5].
ÄÅ ÐÅ ÂÎ ÊÎÍ ÑÅÍ ÑÓ ÑÀ (CON SEN SUS TREE)
«Обоб щен ное» де ре во — усред нен ный ва ри ант не ско ль ких ре а ли зо ­вав ших ся де ре вь ев [5].
ÄÈ ÂÅÐ ÃÅÍ ÖÈß (DI VER GEN CE)
Pас хож де ние при зна ков фи ле ти че ских групп в про цес се эво лю ции. Кон цеп ция «ди вер ген ции при зна ков» сфор му ли ро ва на Ч. Дар ви ным в 1859г. Ди вер ген ция мо жет быть ре зу ль та том диз руп тив но го от бо ра (dis rup ti ve se lec ti on) è èçî ëÿ öèè, ò. å. íå î áÿ çà òå ëü íî ñâÿ çà íà ñ âíóò ðè ­âè äî âîé êîí êó ðåí öèåé, êàê ýòî ïî ëà ãàë ×. Äàð âèí [2].
ÄÈ ÊÈÉ ÒÈÏ (WILD TYPE)
Наи бо лее ча с то встре ча ю щий ся в при род ной по пу ля ции фе но тип, при зна ки ко то ро го де тер ми ни ро ва ны «нор ма ль ны ми» (не му тан т ны ­ми) ал ле ля ми [2].
ÄÈ ÊÎ ÃÎ ÒÈÏÀ ÃÅÍ (WILD TYPE GENE)
Íàè áî ëåå øè ðî êî ïðåä ñòàâ ëåí íûé â äàí íîé ïðè ðîä íîé ïî ïó ëÿ öèè ãåí (àë ëåëü) [2].
ÄÈ ÍÀ ÌÈ ÊÀ ÏÎ ÏÓ Ëß ÖÈÉ (PO PU LA TI ON DY NA MICS)
Pаз дел био ло гии, изу ча ю щий внут ри- и меж по пу ля ци он ные про цес ­сы с ис по ль зо ва ни ем ап па ра та ма те ма ти че ско го мо де ли ро ва ния; мно гие за ко но мер но сти ди на ми ки популяций име ют ге не ти че ски и эво лю ци он но обу слов лен ный ха рак тер [2].
ÄÎ ÌÀØ ÍÅ ÃÎ ÕÎ ÇßÉ ÑÒ ÂÀ ÃÅÍÛ, ÊÎÍ ÑÒÈ ÒÓ È ÒÈ ÍÛÅ ÃÅÍÛ (CON S TI TU TI VE (HO U SE KE E PING) GE NES)
Ãåíû, îáåñ ïå ÷è âà þ ùèå îñó ùå ñò â ëå íèå ôóí ê öèé, ñâîé ñò âåí íûõ âñåì òè ïàì êëå òîê (â îò ëè ÷èå îò ãå íîâ «ðî ñ êî øè» — lu xu ry ge nes). Êàê ïðà âè ëî, õà ðàê òå ðè çó þò ñÿ âû ñî êèì ñî äåð æà íè åì ïàðû ãó à íèí-öè òî ­çèí è ëî êà ëè çî âà íû â ñåã ìåí òàõ õðî ìî ñîì, ïî ëî æè òå ëü íî îêðà øè ­âà å ìûõ ïðè R-áýí äèí ãå (R-ban ding) Ó áàê òå ðèé êîí ñòè òó è òèâ íûå ãåíû — ïî ñòî ÿí íî ýê ñ ï ðåñ ñè ðó þ ùè å ñÿ, íå ðå ãó ëè ðó å ìûå ãåíû [2].
ÄÎ ÌÅÍ (DO MEN)
Ýòî ó÷à ñ òîê àìè íî êèñ ëîò íîé ïî ñëå äî âà òå ëü íî ñòè, êî òî ðûé ÿâ ëÿ åò ñÿ ñî ñòàâ íîé ÷à ñòüþ ðàç ëè÷ íûõ áåë êîâ è, âîç ìîæ íî, îá ëà äà åò ñîá ñò ­âåí íîé ôóí ê öèåé. Êàê ïðà âè ëî, äî ìå íàì ñâîé ñò âåí íà âû ñî êàÿ ñòå ­ïåíü êîí ñåð âà òèâ íî ñòè [5].
203
ÇÀ ÊÐÅÏ ËÅ ÍÈÅ ÌÓ ÒÀ ÖÈÈ (FI XA TI ON)
Про цесс вы тес не ния ал ле ля ди ко го типа му тан т ным ал ле лем (у ча с ­ти или у всех осо бей по пу ля ции) со ста би ль ным со хра не ни ем его в по том ст ве (при этом воз ни ка ет по ли мор физм — po ly mor p hism). За ­креп ле ние му та ции обу слов ле но на ли чи ем се лек тив ных пре и му ­ществ у му тан т но го фе но ти па либо вза им ным от сут ст ви ем пре и му ­ще ст ва у ди ко го и му тан т но го фе но ти пов [2].
ÇÂÅÇ ÄÎ ÎÁ ÐÀÇ ÍÀß ÒÎ ÏÎ ËÎ ÃÈß (STAR-LI KE TO PO LO GY)
Тип вза им но го рас по ло же ния вет вей фи ло ге не ти че ско го де ре ва, для ко то ро го ха рак тер но на ли чие на ден д рог рам ме ко рот ких внут рен них вет вей при от но си те ль но длин ных внеш них вет вях, т. е. раз лич ные фи ло ге не ти че ские ли нии от поч ко вы ва ют ся прак ти че ски из од ной точ ки. Звез до об раз ная фи ло ге ния ха рак тер на для мик ро ор га низ мов, ко то рые ак тив но за хва ты ва ют но вые эко ло ги че ские ниши, фор ми ­руя мно же ст во ге не ти че ских ва ри ан тов. При ме ни те ль но к воз бу ди ­те лям ин фек ци он ных за бо ле ва ний, звез до об раз ная то по ло гия ха рак ­тер на для пе ри о да эпи де ми че ско го рас про стра не ния возбудителя [3].
ÇÎÍÄ (PRO BE)
Не кое со е ди не ние (мо ле ку ла), по ме чен ное тем или иным спо со бом (вклю че ни ем ра дио ак тив но го изо то па, пу тем био ти ни ли ро ва ния и т. п.) и ис по ль зу е мое для иден ти фи ка ции род ст вен ных био хи ми че ­ских струк тур (мо ле кул) и их от де ль ных уча ст ков. Обыч но в ка че ст ве зонда ис по ль зу ют мРНК или кДНК (cDNA), гиб ри ди зу ю щие с ком ­п ле мен тар ны ми уча ст ка ми те с ти ру е мой мо ле ку лы ДНК, или мо но ­кло на ль ные ан ти те ла, ре а ги ру ю щие со «сво им» бел ком [2].
ÈÍ ÂÅÐ ÑÈß (IN VER SI ON)
Tип хро мо сом ной пе ре строй ки, за клю ча ю щий ся в раз во ро те уча ст ка хро ма ти ды меж ду дву мя раз ры ва ми на 180°, при этом цен т ро ме ра мо жет за хва ты ва ть ся (пе ри цен т ри че ская инверсия) или нет (па ра ­цен т ри че ская ин вер сия). Ин вер сия обу слов ли ва ет из ме не ние по сле ­до ва те ль но сти ло ку сов на про ти во по лож ную [2].
ÈÍ ÄÅË (IN DEL)
 ýâî ëþ öè îí íûõ èñ ñëå äî âà íè ÿõ — èíñåð öèÿ èëè äåëåöèÿ [8].
ИН СEР ЦИЯ, ВСТАВ КА (IN SER TI ON, IN TER LO CA TI ON)
Mó òà öèÿ, â ðå çó ëü òà òå êî òî ðîé ââî äèò ñÿ îäíî èëè íå ñêî ëü êî èç áû ­òî÷ íûõ îñíî âà íèé ìî ëå êó ëû ÄÍÊ èëè ÐÍÊ, ìî æåò áûòü îáó ñëîâ ëå ­íà ïå ðå ìå ùå íè åì ìî áè ëü íûõ ãå íå òè ÷å ñêèõ ýëå ìåí òîâ (tran s po sab le ele ments) [2].
204
ÊÀÊ ÒÓ ÑÎ ÎÁ ÐÀÇ ÍÀß ÒÎ ÏÎ ËÎ ÃÈß (ÑAC TUS-LI KE TO PO LO GY)
Òèï âçà èì íî ãî ðàñ ïî ëî æå íèÿ âåò âåé ôè ëî ãå íå òè ÷å ñêî ãî äå ðå âà, õà ­ðàê òå ðè çó þ ùèé ñÿ íà ëè ÷èåì äëèí íûõ âíóò ðåí íèõ âåò âåé, êî òî ðûå îò äå ëÿ þò ñÿ ÷å ðåç çíà ÷è òå ëü íûå ïðî ìå æóò êè âðå ìå íè. Äàí íûé òèï òî ïî ëî ãèè õà ðàê òå ðåí äëÿ ìå æý ïè äå ìè ÷å ñêî ãî ïå ðè î äà öèð êó ëÿ öèè ìèê ðî îð ãà íèç ìà — âîç áó äè òå ëÿ èí ôåê öè îí íî ãî çà áî ëå âà íèÿ [3].
ÊËÀ ÄÀ, ÊËÀ Ñ ÒÅÐ (CLA DE, CLUS TER)
Ãðóï ïà îïå ðà òèâ íûõ òàê ñî íî ìè ÷å ñêèõ åäè íèö â ôè ëî ãå íå òè ÷å ñêîì äå ðå âå, èìå þ ùèõ îá ùå ãî ïðåä êà [4].
ÊËÀÑ ÑÈ ÔÈ ÊÀ ÖÈß (CLAS SI FI CA TI ON, TA XO NO MY)
Раз бив ка мно же ст ва ор га низ мов на осно ве их ха рак те ри стик по опре де лен ной си с те ме иерар хи че ски со под чи нен ных групп — так со ­нов (клас сы, се мей ст ва, роды, виды и др.). Раз ли ча ют ес те ст вен ную и ис кус ст вен ную клас си фи ка ции. Ес те ст вен ная, или фи ло ге не ти че ­ская, клас си фи ка ция учи ты ва ет всю со во куп ность при зна ков, при ­су щих клас си фи ци ру е мым жи вым объ ек там, что по зво ля ет их сбли ­жать и про ти во по с тав лять друг дру гу; она от ра жа ет ис то ри че ски сло ­жив ши е ся за ко но мер ные (эво лю ци он ные) свя зи меж ду ними. В силу слож но сти опре де ле ния у про ка ри от не об хо ди мых при зна ков для по стро е ния ес те ст вен ной клас си фи ка ции в на сто я щее вре мя для их си с те ма ти ки ис по ль зу ет ся ис кус ст вен ная клас си фи ка ция. В 9-м из ­да нии Опре де ли те ля бак те рий Бер д жи все про ка ри о ты раз би ты на 35 групп, не име ю щие так со но ми че ско го ста ту са. Рас пре де ле ние бак те рий по груп пам осно вы ва ет ся на не мно гих лег ко опре де ля е мых при зна ках (на при мер, в груп пу 1 вхо дят спи ро хе ты, в груп пу 4 — гра мот ри ца те ль ные аэроб ные па лоч ки и кок ки, груп пу 10 со став ля ­ют фо то троф ные бак те рии, осу ще ст в ля ю щие бес кис ло род ный фо то ­син тез, и т. д.) Од на ко в этом же ру ко вод ст ве на осно ве раз ли чий в стро е нии кле точ ной стен ки пред ло же на схе ма де ле ния цар ст ва Pro - ka ry o tae íà âû ñøèå òàê ñî íû — îò äå ëû, êëàñ ñû (Mur ray, 1984). Ïåð ­âûé îò äåë âêëþ ÷à åò ãðà ìîò ðè öà òå ëü íûå áàê òå ðèè ñ êëå òî÷ íîé ñòåí ­êîé (Gra ci li cu tes); âòî ðîé — ãðàì ïî ëî æè òå ëü íûå áàê òå ðèè ñ êëå òî÷ ­íîé ñòåí êîé (Fir mi cu tes); òðå òèé — áàê òå ðèè, ó êî òî ðûõ êëå òî÷ íàÿ ñòåí êà îò ñóò ñò âó åò (Te ne ri cu tes ñ îä íèì êëàñ ñîì Mol li cu tes); в чет ­вер тый от дел вклю че ны ар хе бак те рии, ко то рые в на сто я щее вре мя вы де ля ют в от де ль ное цар ст во (до мен) ар хей, как пред став ля ю щих са мо сто я те ль ную эво лю ци он ную ветвь. На чи ная с 60-х гг. XX в. в свя зи с успе ха ми мо ле ку ляр ной био ло гии воз ник ли се рь ез ные пред ­по сыл ки для со зда ния ес те ст вен ной клас си фи ка ции про ка ри от. По ­я ви лась воз мож ность уста нов ле ния сте пе ни род ст ва меж ду от де ль ­ны ми ор га низ ма ми на осно ва нии: опре де ле ния про цен т но го со дер ­жа ния гу а ни на и ци то зи на (ГЦ) от об ще го ко ли че ст ва осно ва ний
205
ÄÍÊ ó ðàç íûõ îáú åê òîâ; îïðå äå ëå íèÿ ãå íå òè ÷å ñêî ãî ñõîä ñò âà ñ ïî ­ìî ùüþ ÄÍÊ—ÄÍÊ-ãèá ðè äè çà öèè; ñðàâ íå íèÿ ïðî äóê òîâ îò äå ëü íûõ ãå íîâ, îò âåò ñò âåí íûõ â êëåò êå çà îá ðà çî âà íèå âàæ íûõ ôóí ê öè î íà ëü ­íûõ áåë êîâ (ôåð ðå äîê ñè íîâ, öè òî õðî ìîâ è äð.). Íà êî íåö, áûëî óñòà ­íîâ ëå íî, ÷òî âàæ íóþ èí ôîð ìà öèþ äëÿ ðå øå íèÿ ïðîá ëåì ýâî ëþ öè ­îí íîé ñè ñ òå ìà òè êè íå ñóò ðè áî ñî ìà ëü íûå ÐÍÊ (ðÐÍÊ). Äàí íûå ìî ëå êó ëû îá íà ðó æå íû ó âñåõ êëå òî÷ íûõ ôîðì æèç íè, îíè ýâî ëþ öè ­î íè ðó þò â ðå çó ëü òà òå ñïîí òàí íûõ ìó òà öèé, ïðî èñ õî äÿ ùèõ ñ ïî ñòî ­ÿí íîé ñêî ðî ñòüþ, èõ íà êîï ëå íèå çà âè ñèò òî ëü êî îò âðå ìå íè. Íà ýòîì îñíî âà íèè ìå ðîé ýâî ëþ öè îí íîé áëè çî ñòè èëè îò äà ëåí íî ñòè àíà ëè çè ðó å ìûõ îð ãà íèç ìîâ ÿâ ëÿ åò ñÿ êî ëè ÷å ñò âî íóê ëå î òèä íûõ çà ­ìåí â ìî ëå êó ëàõ ñðàâ íè âà å ìûõ ðÐÍÊ [6].
ÊËÀ Ñ ÒÅÐ ÃÅ ÍÎÂ (GENE CLUS TER)
Ãðóï ïà ïî âòî ðîâ îä íî ãî è òîãî æå èëè ðîä ñò âåí íûõ ãå íîâ, ðàñ ïî ëî ­æåí íûõ ðÿ äîì íà õðî ìî ñî ìå, âõî äÿ ùèõ â ñî ñòàâ ìóëü òè ãåí íî ãî ñå ­ìåé ñò âà (mul ti ge ne fa mi ly) [2].
ÊËÎÍ (CLO NE)
Êó ëü òó ðà ìèê ðî îð ãà íèç ìà (ïî ïó ëÿ öèÿ êëå òîê), ïî ëó ÷åí íàÿ èç îä íîé (ðî äè òå ëü ñêîé) êëåò êè ïó òåì áåñ ïî ëî ãî ðàç ìíî æå íèÿ [6].
КОН СЕН СУС НАЯ ПО СЛЕ ДО ВА ТЕ ЛЬ НОСТЬ (CON SEN SUS SE QU ­EN CE)
Ис кус ст вен но со здан ная по сле до ва те ль ность, в каж дой по зи ции ко ­то рой на хо дит ся нук ле о тид (ами но кис ло та), наи бо лее ча с то встре ча ­ю щий ся у ана ли зи ру е мых по сле до ва те ль но стей [4].
ÊÎÍ ÖÅÏ ÖÈß ÌÎ ËÅ ÊÓ ËßÐ ÍÛÕ ×À ÑΠ(MO LE CU LAR CLOCK HY POT HE SIS)
Ïî ñòî ÿí ñò âî ñêî ðî ñòåé ýâî ëþ öèè (ìó òà öèé) äëÿ ðàç íûõ òàê ñî íîâ [5].
ÊÎ ÐÅÍÜ (ROOT)
Îá ùèé ãè ïî òå òè ÷å ñêèé áëè æàé øèé ïðå äîê âñåõ ðàñ ñìàò ðè âà å ìûõ ôîðì â ôè ëî ãå íå òè ÷å ñêîì äå ðå âå.
ËÈ ÇÎ ÃÅ ÍÈß (LY SO GE NY, LY SO GE NI CI TY)
1. Èí òåã ðà öèÿ ãå íî ìà áàê òå ðè î ôà ãà â ãå íîì êëåò êè-õî çÿ è íà ïðè ñî -
õðà íå íèè ñïî ñîá íî ñòè âû õî äèòü èç íåãî â ðå çó ëü òà òå èí äóê öèè
ïðî ôà ãà ñ îá ðà çî âà íè åì çðå ëûõ ôà ãî âûõ ÷à ñ òèö; òå î ðèÿ ëè çî ãå -
íèè ðàç ðà áî òà íà À. Ëüâî âûì íà ìà òå ðè à ëå Bac te ri um me ga te ri um
[2].
2. Ñâîå îá ðàç íûé ñèì áè îç áàê òå ðèé ñ íå êî òî ðû ìè óìå ðåí íû ìè áàê -
òå ðè î ôà ãà ìè, ïðè ñóò ñò âó þ ùè ìè â êëåò êå â âèäå îñî áîé, íå èí -
ôåê öè îí íîé ôîð ìû — ïðî ôà ãà. Êëåò êè, ñî äåð æà ùèå ïðî ôàã, íà -
206
çû âà þò ñÿ ëè çî ãåí íû ìè. Ëè çî ãåí íûå êëåò êè ìî ãóò ñ îïðå äå ëåí íîé
÷à ñ òî òîé èëè ïîä âîç äåé ñò âè åì îïðå äå ëåí íûõ ôàê òî ðîâ ïðî äó öè -
ðî âàòü çðå ëûå ôà ãî âûå ÷à ñ òè öû, ïðè ýòîì ïîä âåð ãà ÿñü ëè çè ñó.
Îò ñþ äà èõ íà çâà íèå è íà çâà íèå ñà ìî ãî ÿâ ëå íèÿ. Ëè çî ãåí íûå êëåò -
êè ïðè îá ðå òà þò ðÿä íî âûõ ïðè çíà êîâ, îïðå äå ëÿ å ìûõ ïðè ñóò ñò âè -
ем про фа га, на при мер устой чи вость к по втор но му за ра же нию
род ст вен ным фа гом, спо соб ность об ра зо вы вать ток си ны (на при -
ìåð, äèô òå ðèé íûé òîê ñèí, êî äè ðó å ìûé ïðî ôà ãîì). Ëè çî ãå íèÿ
èñ ïî ëü çó åò ñÿ äëÿ èçó ÷å íèÿ ìíî ãèõ âî ïðî ñîâ ãå íå òè êè áàê òå ðèé
[6].
ËÈ ÇÎ ÃÅÍ ÍÀß ÁÀÊ ÒÅ ÐÈß (LY SO GE NIC BAC TE RI UM)
Áàê òå ðè à ëü íàÿ êëåò êà, ñî äåð æà ùàÿ ïðî ôàã (pro pha ge) [2].
ËÈ ÇÎ ÃÅÍ ÍÀß ÊÎÍ ÂÅÐ ÑÈß (PHA GE (LY SO GE NIC) CON VER SI ON
Яв ле ние из ме не ния ге не ти че ских свойств бак те ри а ль ной клет ки, обу слов лен но го при сут ст ви ем в ней ви рус ной нук ле и но вой кис ло ­ты, ког да ви рус на хо дит ся в со сто я нии про фа га. Ñì. òàê æå ëè çî ãå ­íèÿ, ïðî ôàã [6].
ËÈ ÇÎ ÃÅÍ ÍÛÉ ÂÈ ÐÓÑ (LY SO GE NIC VI RUS)
Âè ðóñ, ñïî ñîá íûé îá ðà çî âû âàòü ïðî ôàã è ó÷à ñò âî âàòü â ïðî öåñ ñå ëè çî ãå íèè (ly so ge ny) ñ áàê òå ðèåé; ëè çî ãåí íûé âè ðóñ — óìå ðåí íûé âè ðóñ (tem pe ra te pha ge) [2].
ËÎ ÊÀ ËÜ ÍÎÅ (×À Ñ ÒÈ× ÍÎÅ) ÂÛ ÐÀ ÍÈ ÂÀ ÍÈÅ (LO CAL ALIG N ­MENT)
Âû ðàâ íè âà íèå (ñì.) ÷à ñ òè íóê ëå î òèä íûõ èëè áåë êî âûõ ïî ñëå äî âà òå ­ëü íî ñòåé [5].
ËÎ ÊÓÑ Ñ ÂÀ ÐÈ À ÁÅ ËÜ ÍÛÌ ×ÈÑ ËÎÌ ÒÀÍ ÄÅÌ ÍÛÕ ÏÎ ÂÒÎ ÐΠ(VA RI AB LE NUM BER OF TAN DEM RE PE AT (VNTR) LO CUS)
Ëþ áîé ãåí, àë ëå ëè êî òî ðî ãî ñî äåð æàò ðàç ëè÷ íîå ÷èñ ëî òàí äåì íî ïî ­âòî ðÿ þ ùèõ ñÿ îëè ãî íóê ëå î òè äîâ. Ïî ñëå ðàñ ùåï ëå íèÿ òà êèõ àë ëå ëåé ðå ñò ðèê òà çà ìè îá ðà çó þò ñÿ ðå ñò ðèê öè îí íûå ôðàã ìåí òû ðàç ëè÷ íîé äëè íû, êî òî ðûå ìî ãóò áûòü ýô ôåê òèâ íî èñ ïî ëü çî âà íû â êà ÷å ñò âå ìàð êå ðîâ ïðè êàð òè ðî âà íèè ãå íîâ [2].
ÌÅ ÒÀ ÃÅ ÍÎÌ (ME TA GE NO ME)
Ге не ти че ский ма те ри ал со об ществ мик ро ор га низ мов, при сут ст ву ю ­щих в ис сле ду е мом об раз це [11].
ÌÅ ÒÀ ÃÅ ÍÎ ÌÈ ÊÀ (ME TA GE NO MICS)
Один из раз де лов ге но ми ки, по свя щен ный изу че нию все го ге не ти ­че ско го ма те ри а ла (ме та ге но ма) со об ществ мик ро ор га низ мов, при ­сут ст ву ю щих в ис сле ду е мом об раз це. Объ ек та ми изу че ния ме та ге но -
207
ми ки мо гут яв ля ть ся лю бые по пу ля ции мик ро ор га низ мов, оби та ю ­щих в воде, поч ве, ор га низ ме жи вот но го, че ло ве ка или лю бой дру гой сре де. Глав ной це лью ме та ге но ми ки яв ля ет ся по лу че ние и ана лиз всех ге но мов для уста нов ле ния ви до во го со ста ва и ме та бо ли че ских взаи мо свя зей в со об ще ст ве. Важ ной осо бен но стью ме та ге ном ных ис сле до ва ний яв ля ет ся от сут ст вие не об хо ди мо сти в вы де ле нии и ку ­ль ти ви ро ва нии мик ро ор га низ мов, что яв ля ет ся прин ци пи а ль ным мо мен том, по ско ль ку не все из них рас тут на пи та те ль ных сре дах. Ме та ге ном ное ис сле до ва ние по зво ля ет вы я вить в лю бом объ ек те не то ль ко ши ро кий спектр бак те рий, но так же при сут ст вие ви ру сов и про стей ших [1].
ÌÅ ÒÎÄ ÌÀÊ ÑÈ ÌÀ ËÜ ÍÎ ÃÎ ÏÐÀÂ ÄÎ ÏÎ ÄÎ ÁÈß (MA XI MUM LI ­KE LI HO OD MET HOD, ML MET HOD)
Этот ме тод ис по ль зу ет ся, в ча ст но сти, для по стро е ния фи ло ге нии. Стро ят так на зы ва е мую фун к цию прав до по до бия от не из ве ст ных па ­ра мет ров. За тем под би ра ют зна че ния па ра мет ров (дли ны вет вей для каж дой то по ло гии), обес пе чи ва ю щие мак си мум этой фун к ции. Ме ­тод до пу с ка ет раз ную ско рость для раз ных вет вей [5].
ÌÅ ÒÎÄ ÌÀÊ ÑÈ ÌÀ ËÜ ÍÎÉ ÏÀÐ ÑÈ ÌÎ ÍÈÈ (ÝÊÎ ÍÎ ÌÈÈ) (MA XI ­MUM PAR SI MO NY MET HOD, MÐ MET HOD)
Ìå òîä ïî ñòðî å íèÿ ôè ëî ãå íèè, êî òî ðûé íà õî äèò äå ðå âî (èëè äå ðå ­âüÿ), ñî äåð æà ùåå íàè ìåíü øåå êî ëè ÷å ñò âî çà ìåí, íå îá õî äè ìûõ äëÿ îáú ÿñ íå íèÿ ðàç ëè ÷èé ìåæ äó èçó ÷à å ìû ìè òàê ñî íà ìè.  íåì ïðåä ïî ­ëà ãà åò ñÿ, ÷òî ðàç íûå âà ðè àí òû íóê ëå î òèä íûõ èëè àìè íî êèñ ëîò íûõ çà ìåí ðàâ íî âå ðî ÿò íû. Ìå òîä ÌÐ áëè çîê ïî ñìûñ ëó ê ÌÅ, íî ñïî ñîá îöåí êè äëè íû âåò âåé â ÌÐ îò ëè ÷à åò ñÿ [5].
ÌÅ ÒÎÄ ÌÈ ÍÈ ÌÓ ÌÀ ÝÂÎ ËÞ ÖÈÈ (MI NI MUM EVO LU TI ON MET HOD, ME MET HOD)
 ýòîì ìå òî äå ïî ñòðî å íèÿ ôè ëî ãå íèè äëÿ êàæ äîé èç âîç ìîæ íûõ òî ­ïî ëî ãèé äå ðå âà (ñì.) âû ÷èñ ëÿ åò ñÿ ñóì ìà îöå íîê äëèí âñåõ åãî âåò âåé (S). Ðàñ ñìàò ðè âà þò ñÿ âñå âîç ìîæ íûå òî ïî ëî ãèè è ñðå äè íèõ âû áè ðà ­åò ñÿ òî ïî ëî ãèÿ ñ íàè ìåíü øèì çíà ÷å íè åì S [5].
ÌÅ ÒÎÄ ÍÀÈ ÌÅÍÜ ØÈÕ ÊÂÀÄ ÐÀ ÒÎÂ (ÍÊ) (OR DI NA RY LE AST SQU A RES, OLS MET HOD)
В ши ро ком смыс ле ме тод под бо ра мо де ли, обес пе чи ва ю щей наи ­мень шую сум му квад ра тов от кло не ний ре а ль ных дан ных от про гно за по мо де ли. В уз ком смыс ле — ме тод по стро е ния фи ло ге нии, в ко то ­ром под би ра ют ся дли ны вет вей и вы чис ля ют ся ожи да е мые рас сто я ­ния меж ду так со на ми, обес пе чи ва ю щие ми ни мум оста точ ной сум мы квад ра тов от кло не ний. До пу с ка ет раз ную ско рость эво лю ции для вет вей фи ло ге не ти че ско го де ре ва [5].
208
ÌÅ ÒÎÄ ÏÎ ÏÀÐ ÍÎ ÃÎ ÂÍÓÒ ÐÈ ÃÐÓÏ ÏÎ ÂÎ ÃÎ ÍÅ ÂÇÂÅ ØÅÍ ÍÎ ÃÎ ÑÐÅÄ ÍÅ ÃÎ (UN WE IG H TED PAIR GRO UP MET HOD WITH ARIT H ­ME TIC MEAN, UPGMA)
 ýòîì ìå òî äå ïî ñòðî å íèÿ ôè ëî ãå íèè ñíà ÷à ëà äëÿ êàæ äîé ïàðû òàê ­ñî íîâ ñî ãëàñ íî âû áðàí íîé ìî äå ëè çà ìåí îïðå äå ëÿ þò ñÿ ýâî ëþ öè îí ­íûå ðàñ ñòî ÿ íèÿ. Çà òåì ïðè ìå íÿ þò êëà ñ òåð íûé àíà ëèç. Ïðåä ïî ëà ãà ­åò ñÿ ðàâ íàÿ äëè íà âåò âåé, èñ õî äÿ ùèõ èç îä íî ãî óçëà. Ìå òîä ñòðî èò óêî ðå íåí íîå äå ðå âî. Ìî æåò èñ ïî ëü çî âà òü ñÿ äëÿ àíà ëè çà ìî ëå êó ëÿð ­íûõ äàí íûõ, åñëè ñïðà âåä ëè âà ãè ïî òå çà ìî ëå êó ëÿð íûõ ÷à ñîâ [5].
МЕ ТОД ОБЪ Е ДИ НЕ НИЯ СО СЕ ДЕЙ (ОС МЕТОД) (NE IG H BOR JO I ­NING, MJ MET HOD)
Ìå òîä ïî ñòðî å íèÿ ôè ëî ãå íèè, êî òî ðûé îñíî âàí íà ïðèí öè ïå ìè íè ­ìó ìà ýâî ëþ öèè. Íà ÷à ëü íàÿ òî ïî ëî ãèÿ äå ðå âà — êîí ôè ãó ðà öèÿ çâåç ­äû. Çà òåì ïî ñëå äî âà òå ëü íî ðàçú å äè íÿ þò ñî ñå äåé (ñì.).  èòî ãå ïî ëó - ÷à þò íàè ëó÷ øåå äå ðå âî áåç êîð íÿ [5].
ÌÈÊ ÐÎ ÁÈ Î ÒÀ, ÌÈÊ ÐÎ ÁÈ ÎÌ (MIC RO BI O TA, MIC RO BI O ME)
1. Со во куп ность раз лич ных ви дов мик ро ор га низ мов, на се ля ю щих
îïðå äå ëåí íóþ ñðå äó îáè òà íèÿ (ìèê ðî áè î òà ïî÷ âû, âîäû, âîç äó -
õà, ãîð íûõ ïî ðîä è äð.). Ïî ïðî èñ õîæ äå íèþ ðàç ëè ÷à þò àâ òî õòîí -
íóþ ìèê ðî áè î òó è àë ëîõ òîí íóþ ìèê ðî áè î òó, ïî òèïó ïè òà íèÿ —
ýâ ò ðîô íóþ, ïðåä ñòàâ ëÿ þ ùóþ êîì ï ëåêñ ìèê ðî îð ãà íèç ìîâ, ðàç -
ëà ãà þ ùèõ îð ãà íè ÷å ñêèå âå ùå ñò âà; îëè ãîò ðîô íóþ ìèê ðî áè î òó,
èëè ìèê ðî áè î òó ðàñ ñå ÿ íèÿ, çà âåð øà þ ùóþ ìè íå ðà ëè çà öèþ îð ãà -
ни че ско го ве ще ст ва; ли то троф ную мик ро би о ту, транс фор ми ру -
þ ùóþ ìè íå ðà ëü íûå ñî å äè íå íèÿ ãîð íûõ ïî ðîä, ãàçû. Ìèê ðî îð -
ãà íèç ìû, ðàç âè âà þ ùè å ñÿ íà ïî âåð õ íî ñòè ðàñ òå íèé (ýïè ôèò íàÿ
ìèê ðî áè î òà), ìå òà áî ëè çè ðó þò âû äå ëå íèÿ èç òêà íåé. Êîæà, ñëè -
çè ñòûå îáî ëî÷ êè, êè øå÷ íèê è äðó ãèå îð ãà íû ÷å ëî âå êà è æè âîò íûõ
èìå þò ïî ñòî ÿí íóþ, òàê íà çû âà å ìóþ íîð ìà ëü íóþ ìèê ðî áè î òó. Â
çíà ÷å íèè ìèê ðî áè î òû èñ ïî ëü çî âàë ñÿ è èñ ïî ëü çó åò ñÿ òåð ìèí
«ìèê ðî ôëî ðà», ÷òî íå ñî âñåì êîð ðåê ò íî, ïî ñêî ëü êó áàê òå ðèè,
ìèê ðî ñêî ïè ÷å ñêèå ãðè áû íå îò íî ñÿò â íàñò. âðå ìÿ ê öàð ñò âó ðàñ -
òå íèé [6].
2. Ñî îá ùå ñò âî êîì ìåí ñà ëü íûõ, ñèì áè î òè ÷å ñêèõ è ïà òî ãåí íûõ ìèê -
ðî îð ãà íèç ìîâ, íà ñå ëÿ þ ùèõ îð ãà íèçì ÷å ëî âå êà [10].
ÌÍÎ ÆÅ ÑÒ ÂÅÍ ÍÎÅ ÂÛ ÐÀÂ ÍÈ ÂÀ ÍÈÅ (MUL TIP LE SE QU EN CE ALIG N MENT)
Ýòî âû ðàâ íè âà íèå íà áî ðà èç òðåõ è áî ëåå ïî ñëå äî âà òå ëü íî ñòåé îä ­íî âðå ìåí íî, ïðè êî òî ðîì ýëå ìåí òû â îäè íà êî âûõ ïî çè öè ÿõ ãðóï ïè ­ðó þò ñÿ â êî ëîí êè [5].
209
ÌÎ ÁÈ ËÜ ÍÛÉ ÃÅ ÍÅ ÒÈ ×Å ÑÊÈÉ (ÏÎ ÄÂÈÆ ÍÛÉ) ÝËÅ ÌÅÍÒ (TRAN S PO SAB LE (CON T ROL LING) ELE MENT)
Hук ле о тид ная по сле до ва те ль ность (уча с ток ДНК), спо соб ная из ме ­нять по ло же ние в ге но ме [2].
ÌÓËÜ ÒÈ ËÎ ÊÓÑ ÍÎÅ ÑÅÊ ÂÅ ÍÈ ÐÎ ÂÀ ÍÈÅ-ÒÈ ÏÈ ÐÎ ÂÀ ÍÈÅ (MUL ­TI LO CUS SE QU EN CE TY PING, MLST)
Îïðå äå ëå íèå ïåð âè÷ íîé ïî ñëå äî âà òå ëü íî ñòè íóê ëå î òè äîâ (ñèê âåí ­ñà) â íå ñêî ëü êèõ âà ðè à áå ëü íûõ ãå íàõ (ó÷à ñò êàõ ÄÍÊ) èçó ÷à å ìûõ øòàì ìîâ ìèê ðî îð ãà íèç ìîâ, ïðî âî äè ìîå ñ ýïè äå ìè î ëî ãè ÷å ñêè ìè öå ëÿ ìè [3].
ÌÓËÜ ÒÈ ËÎ ÊÓÑ ÍÛÉ ÀÍÀ ËÈÇ VNTR-ÏÎ ÑËÅ ÄÎ ÂÀ ÒÅ ËÜ ÍÎ ÑÒÅÉ (MUL TIP LE LOCI VNTR ANA LY SIS, MLVA)
MLVA осно ва но на иден ти фи ка ции рас се ян ных в хро мо со ме VNTR­ло ку сов (уча ст ков, со дер жа щих раз ное чис ло тан дем ных по вто ров) при по мо щи ПЦР. По до брав прай ме ры к кон сер ва тив ным кон цам VNTR-ло ку са, мож но, при ме нив ме тод ПЦР с элек т ро фо ре ти че ской де тек цией, опре де лить его дли ну и, зная раз мер вхо дя щих в него тан дем ных по вто ров, опре де лить их ко ли че ст во. По ско ль ку раз лич ­ные изо ля ты со дер жат не о ди на ко вое чис ло по вто ров в VNTR-ло ку ­сах, ин фор ма ция об их ко ли че ст ве по зво ля ет от не с ти те с ти ру е мые ку ль ту ры бак те рий к тому или ино му штамму [3].
ÌÓ ÒÀ ÖÈß (MU TA TI ON)
Ес те ст вен но воз ни ка ю щие или вы зы ва е мые му та ге на ми из ме не ния на след ст вен ных свойств ор га низ ма, про ис хо дя щие в ре зу ль та те нор ­ма ль ных пе ре стро ек (ес те ст вен ные мутации) и на ру ше ний (ис кус ст ­вен ные мутации) в ге не ти че ском ма те ри а ле ор га низ ма [6].
ÌÓ ÒÀ ÖÈß, ÃÅÍ ÍÀß (GENE MU TA TI ON)
Ëþ áàÿ ìó òà öèÿ, ïðè âî äÿ ùàÿ ê èç ìå íå íè ÿì ïî ñëå äî âà òå ëü íî ñòè íóê ëå î òè äîâ êà êî ãî-ëè áî ãåíà, — îò èç ìå íå íèÿ îä íî ãî íóê ëå î òè äà (âêëþ ÷àÿ ìó òà öèè òèïà «ñäâè ãà ðàì êè» — fra mes hift mu ta ti on è òî÷ êî ­âûå ìó òà öèè — po int mu ta ti on) до му та ций, за хва ты ва ю щих круп ные бло ки нук ле о ти дов (де ле ции — de le ti on, встав ки — in ser ti on и т. д.) [2].
ÍÀ ÐÓÆ ÍÛÅ ÓÇËÛ (EX TER NAL NO DES)
Óçëû ôè ëî ãå íå òè ÷å ñêî ãî äå ðå âà (ñì.), îáî çíà ÷à þ ùèå òàê ñî íû, ïî ­ïó ëÿ öèè èëè äðó ãèå ôîð ìû âíå ðàñ ñìîò ðå íèÿ [5].
ÎÄ ÍÎ ÍÓÊ ËÅ Î ÒÈÄ ÍÛÅ ÏÎ ËÈ ÌÎÐ ÔÈÇ ÌÛ (SIN G LE NUC LE O ­TI DE PO LY MOR P HISM, SNP)
Òî ÷å÷ íûå ìó òà öèè â êî äè ðó þ ùèõ (ãåíû «äî ìàø íå ãî õî çÿé ñò âà», ãåíû âè ðó ëåí ò íî ñòè è äð.) è íå êî äè ðó þ ùèõ ïî ñëå äî âà òå ëü íî ñòÿõ ãå -
210
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]