![](/user_photo/_userpic.png)
книги из ГПНТБ / Гласкер, Дж. Анализ кристаллической структуры
.pdf90°
90°
Рис. 16. Векторное представление структурных факторов.
(а) Соотношения между | F |, А, В и а; | F | является ве личиной (или длиной) вектора F.
(б) Сложение векторов каждого атома дает результирующий вектор F. Длины f-векторов на рисунке пропорциональны значе ниям ! для отдельных атомов при отношении sin 0Д , соответ ствующем изучаемому отражению, включая все эффекты тепло вого движения (определение векторов и действий над ними дано в Словаре).
(в) Если тяжелый атом (М) имеет значительно больший атомный номер, а следовательно, значительно более длинный вектор на диаграмме рис. 16(6), чем какой-либо другой атом, то на векторной диаграмме для F обычно получается картина, напо минающая случайные блуждания с малыми шагами из точки, которая является концом вектора Fm . Поскольку эти шаги (или
значения f) |
для более легких атомов относительно малы [ср. |
с рис. 16(6)], |
вероятность того, что вектор F лежит близко к Fm, |
весьма велика; однако еще больше вероятность того, что а ока жется в том же квадранте, что и ам -
82 Часть II
где суммирование проводится по всем атомам эле ментарной ячейки, а выбранное значение fj соответ ствует величине sin В/Х для изучаемого отражения (причем фактор fj включен с поправкой на тепловое колебание атома). Модуль |Е| зависит только от от носительных положений атомов внутри элементарной ячейки, a f определяется еще и углом рассеяния, ко торый зависит от размеров ячейки. Размер и форма элементарной ячейки в чистом виде не входят в вы ражения для А и В. На рис. 16 структурный фактор F представлен как вектор. Сдвиг при выборе начала элементарной ячейки добавляет к фазовому углу каждого атома постоянную величину [см. уравнения (22) и (23)], т. е. диаграмма рис. 16 должна быть повернута по отношению к координатным осям, в ре зультате чего длина вектора |F |, а следовательно, и значения |F |2 (интенсивности) остаются неизмен ными.
При увеличении колебания атомов интенсивность с увеличением фазового угла уменьшается (рис. 15), причем эти колебания в свою очередь возрастают с повышением температуры. Уменьшение интенсивности в результате колебательного движения (которое, как правило, бывает очень существенным при больших значениях 26) можно аппроксимировать экспонен циальной функцией [см. рис. 15(в)]. Если амплитуда колебаний достаточно велика, то при углах, больших некоторого предельного значения угла рассеяния, ни какой дифрагированной интенсивности не наблю дается, т. е. «щель» эффективно уширяется при коле бании, а «оболочка» сужается (рис. 4). Если ко лебания приблизительно изотропны, т. е. если они практически не зависят от направления, то экс
поненциальный |
фактор |
можно записать в |
виде |
ехр(—2£iso sin2 0/А,2), где |
Biso — температурный |
фак |
|
тор*. Он равен |
8зт2(«2), |
где (и2) — среднеквадратич |
ная амплитуда колебания атома.
* Многие кристаллографы пренебрегают индексом «iso», по лагаясь на то, что в контексте невозможно спутать температур ный фактор с величиной В, определяемой уравнениями (21)
и (23).
Дифракционные картины и пробные структуры |
83 |
Поскольку интенсивность любого излучения, рас пространяющегося в виде волны, пропорциональна квадрату амплитуды этой волны, то интенсивность дифрагированного пучка, соответствующего дифрак ционному максимуму hkl, пропорциональна |Е |2, если не считать поправки на геометрические факторы, по глощение и другие второстепенные эффекты. Геомет рическая поправка является функцией 20 и зависит как от времени экспозиции, так и от эффектов поля ризации рентгеновского излучения, когда оно рассеи вается электронами. В наиболее точных работах делают также поправку на эффект поглощения рентге новского излучения кристаллом; для этого необхо димо вычислить разности хода многокомпонентных волн для каждого дифрагированного пучка, а также уменьшение интенсивности в результате поглощения. Если используют кристалл, сильно поглощающий из лучение, то лучше всего отшлифовать его и придать ему сферическую форму, поскольку в этом случае размеры его становятся известными с большей точ ностью, а поправки можно вычислить более простым способом с применением стандартной процедуры.
Принимая во внимание эти факторы, можно запи сать общее выражение для интенсивности:
|
/ = КI А I2 (Lp) (Т„) (Abs), |
(24) |
||
где |
(Lp)— сокращенное |
обозначение |
упомянутых |
|
выше |
геометрических факторов, (Т„) — сокращенное |
|||
обозначение поправки |
на |
тепловые |
колебания. |
|
(Abs) — фактор поглощения |
и К — масштабный фак |
тор. Таким образом, значения К |Е |2 (где К — перво начально неизвестный масштабный фактор), а следо вательно, и K1/s|vF| легко можно вычислить сразу же после измерения интенсивностей. Если известна сред няя амплитуда колебаний, то можно легко, вычислить и соответствующие значения К. Кроме того, можно вычислить Lp и Abs и, если I поправлено на Lp и Abs, то его обозначают /СОГг, т. е.
Icorr = //(Abs) (Lp) = к(A)2 exp ( - 2BUo sin2 0/Я2). (25)
84 |
Часть II |
Расчет Lp и Abs весьма прост и не требует знания структуры. Чтобы определить К и Biso, для начала предполагают, что средняя интенсивность дифракции при некотором угле 20 зависит только от содержи мого ячейки, но не от положений отдельных атомов, т. е. структура предполагается беспорядочной.' При ближенные значения К и Bi30 можно найти в резуль тате сравнения средних наблюдаемых интенсивностей
внекотором интервале sin2 0/Л2 с теоретическими зна чениями этих средних для элементарной ячейки с тем же содержимым. Найденный таким образом масштаб ный фактор К можно в дальнейшем использовать для полного перечисления значений |А| в шкале, которую
впервом приближении можно рассматривать как аб солютную (по отношению к рассеянию одним элек троном) для всех измеренных рефлексов.
Выводы
При дифракции рентгеновских лучей от кристалла интенсивность рассеяния при любом угле можно вы числить, рассматривая комбинацию волн, рассеянных от различных атомов; такое рассеяние приводит к различным степеням усиливающей или ослабляющей интерференции. Определение структуры требует сравнения интенсивностей наблюдаемой дифракцион ной картины и картины, рассчитанной при помощи постулированной модели. Поэтому необходимо уметь рассчитывать интенсивности дифракционной картины для любой желаемой модели. Комбинацию рассеян ных волн можно представить несколькими способами:
1. Волны можно представить графически, а сме щения волн в каждом данном направлении необхо димо просуммировать.
2. Волны можно представить алгебраически в виде
Xj = Яу cos (ср + (Ху) для j-й волны,
и если в некоторой точке просуммировать все сме щения Xj, то для результирующей волны получим
хг — аг cos (ф + аг),
Дифракционные картины и пробные структуры |
85 |
где |
cos aj + |
а2cos a2 + ... |
аг cos <xr = |
||
И |
|
|
аг sin ar = |
a, sin a, + |
a2 sin a2+ |
3. Волны можно выразить в виде двумерных век торов в ортогональной системе координат, где ампли туда волны равна a а фазовый угол ее aj измеряет ся в направлении против часовой стрелки, если про изводить отсчет от горизонтальной оси.
Такое представление равносильно предположению, что длина волны равна 360°, т. е. таким способом выражается периодичность волны. Фаза по отноше нию к некоторому началу представляется обычно в виде доли полного вращения. В этом случае можно просуммировать векторы, суммируя их компоненты.
4. Волны можно представить в виде комплексных чисел
А] -(- iB] = о,j& ai,
что является удобным способом представления двух ортогональных компонентов вектора (при 0 и 90°) в одном уравнении. Уславливаются, что А является компонентом при 0°, а В — компонентом при 90°.
Рентгеновские лучи рассеиваются электронами. Протяженность рассеяния зависит от атомного но мера и угла рассеяния 20 и записывается в виде атомного фактора рассеяния f. Для группы атомов амплитуды (по сравнению с рассеянием одним элек троном) и фазы рентгеновских лучей, рассеянных од ной элементарной ячейкой, представляют в виде структурного фактора F(hkl) = A (hkl) + iB (hkl) для каждого рефлекса. Структурные факторы можно вы числить при помощи соотношений
A (hkl) = 2 fi cos 2л (hXj + kys + lz})
В (hkl) = 2 f) sin 2л (hXj + kyf + lzt),
где суммирование проводят по всем атомам элемен тарной ячейки. Фазовый угол а есть arctg(B//l), а
амплитуда структурного фактора, 1/Т, равна
(Л2+ 52),/а.
86 |
Часть П |
6. ФАЗОВАЯ ПРОБЛЕМА
Для получения трехмерного изображения рассеи вающей материи (распределения электронной плот ности), являющегося конечной целью любого струк турного исследования, необходимо выполнить трех мерное суммирование рядов Фурье (синтез). В этом случае имеет смысл использовать ряды Фурье так, как они обычно служат для описания периодических функций, а кристаллы как раз и состоят из периоди чески размещенной рассеивающей материи. Число электронов в единице обьема, или электронная плот ность в любой точке X, У, Z, обозначается символом р(XYZ) и дается следующим выражением:
р(Х, У, Z) =
F(hkl)exp\— 2ni(hX + kY + IZ)]. (26)
по всем hkl
Здесь Vc— объем элементарной ячейки, a F(hkl) — структурный фактор для некоторого набора индек сов ft, k и /. Тройное суммирование проводят по всем индексам ft, k и /. Это суммирование является мате матической аналогией процесса, происходящего в микроскопе. Как уже упоминалось выше, амплитуду F легко вывести из интенсивностей дифрагированного пучка, однако фазу получить невозможно.
Если подставить
Ф = 2я (hX + kY.+ lZ),
в уравнения (17) и (19)*, то получим
Fe~lф = |
(Л + iB) (cos ф— i этф ) = |
= |
A cos ф + В sin ф— г (Л sin ф— В cos ф). (27) |
* Следует отметить, что экспоненциальные члены в выраже ниях для F и р имеют противоположные знаки. Поскольку вели
чины F = 2 F ei<P |
и р = (1 /У )2 Л Г г<р |
являются фурье-транс- |
||
формантами (фурье-образами) |
одна другой, то |
интенсивность |
||
в некоторой точке дифракционной картины |
(набор |
относительных' |
||
величин | F |2) |
пропорциональна |
квадрату |
фурье-трансформанты |
объекта для данной точки (той точки, в которой распределение материи объекта обозначается буквой р),
Дифракционные картины и пробные структуры |
87 |
Поскольку суммирование в уравнении (26) проводят по всем значениям индексов, оно включает для каж дого рефлекса hkl также и соответствующий рефлекс с индексами, имеющими противоположные знаки
—Я—Я—/ (обозначаемые также Я, Я, Т). Слагаемые для этой пары рефлексов [см. уравнение (27)] для удобства можно объединить при суммировании. Ве личина каждого слагаемого (А, В, cos ср и sin ср) для рефлексов с индексами hkl и —Я—k—I является оди наковой. Знак этого члена изменяется, когда в него входят синусоидальные функции [поскольку sin (—х) = = —sin х], и остается неизменным для косинусо идальных функций [поскольку cos (—х) = cos х]. Поэ тому как А, так и cos ф имеют одинаковый знак для hkl и —Я—Я—I, тогда как В и sin ф имеют для этой пары рефлексов противоположные знаки. Вот почему, если подставить уравнение (27) в уравнение (26) и провести суммирование, то члены l(A sin ф— Всоэф)
взаимно уничтожаются. Оставшиеся |
члены |
A cos ф |
и В sin ф необходимо просуммировать |
только |
по по |
ловине рефлексов, пренебрегая теми членами, в кото рых один индекс (например, Я) является отрицатель ным; поскольку учитывается только половина рефлек сов, то в приводимых ниже выражениях имеется множитель 2. Таким образом, используя уравнение
(26) и (27), |
можно записать |
|
|
|
оо |
= |
+ |
2 2 (Лсозф+Взшф). (28) |
|
h ^ 0, все k, I, |
|
|
кЛоме F (Об 0) |
|
Поскольку А = |.F|cosa |
и В — |.F|sina [см. уравне |
ние (18)], то уравнение (28) для электронной плот ности можно переписать в виде *
ОО
P( X Y Z ) = lF{0v °c 0)l- + j - ^ 2 2 1^ 1cos (ф — а). (29)
Л^О, все kt U кроме F (00 0)
* Схематический пример расчета функции, описываемой урав нением (29), показан на рис. 17.
88 |
Часть If |
Поэтому, если |
бы было известно |/*'| н а (для каж |
дого рефлекса hkl), то можно было бы вычислить р
для всех значений X, Y и Z и, используя эти значе ния, построить трехмерную карту электронной плот ности. Затем, предположив, что атомы находятся в центрах пиков, можно было бы фактически узнать структуру (см. рис. 17).
Однако непосредственно из экспериментальных данных можно получить только амплитуды |.F|, но не фазы а структурных факторов. Поэтому приходится находить а либо из значений А и В, вычисленных из структур, которые найдены каким-либо способом или постулированы (из «пробных структур»), либо чисто аналитическим методом. Проблема получения оценок фазовых углов, знание которых достаточно для вы числения картины рассеивающей материи, называется
Дифракционные картины и пробные структуры |
89 |
фазовой проблемой и является центральной пробле мой рентгеновской кристаллографии. Несколько сле дующих. глав посвящено методам, используемым для решения фазовой проблемы или для вывода пробной структуры, позволяющей рассчитать приближенное значение а для каждого рефлекса; кроме того, рас смотрены прямые методы вычисления а.
Рис. 17. Схема расчета карты электронной плотности.
Электронную плотность |
р (X,Y,Z) |
в |
произвольной точке |
X, |
|
У, Z элементарной ячейки |
объема |
Vc |
можно |
вычислить |
по |
уравнению (29): |
|
|
|
|
|
Vcp (XYZ) = F (0 0 0) + 2 2 |
2 2 I F I cos (2jt (А* + |
kY + Ю - а ) |
|||
h ^ |
0, все |
|
|
|
|
k, l, кроме
F(000)
Вприведенном на рисунке одномерном примере использованы следующие данные:
Л |
-3 |
-2 |
- I |
0 |
1 |
2 |
|
3 |
|
|F | |
2 |
|
I |
1 |
2 |
I |
1 |
|
2 |
а(°) |
0 |
ISO |
ISO |
0 |
180 |
180 |
|
0 |
|
cos (2я(ЛХ—а) cos 6лХ |
—cos 4яХ |
—cos2nX +2 —cos 2nX |
—cos 4яХ |
-cos |
|||||
. : Vcp (Х )= 2 — |
2 cos 2яХ— |
2 cos 4лХ + 4 cos 6яХ |
|
|
|
|
|||
Для пояснения смысла приведенного выше уравнения сумми |
|||||||||
рование выполнено |
графически. При |
h — 0 функция не |
зависит |
||||||
от X, поэтому она может быть изображена в виде горизонталь |
|||||||||
ной прямой. |
При |
Л = |
1 функция есть |
— cos 2пХ и |
т. |
д. Эти |
|||
функции суммируются |
для |
каждого |
значения |
X, что |
приводит |
к результату, показанному сплошной полужирной линией. Эта линия имеет пики при X = ± '/з :. Подобные вычисления можно проделать для многих сотен и даже тысяч рефлексов, и в ре зультате получится полная трехмерная карта электронной плот ности. Чтобы выполнять такие суммирования достаточно эффек тивно, необходимы быстродействующие вычислительные машины. Высоты пиков трехмерной карты электронной плотности изобра зить невозможно (поскольку пространство не имеет четвертого измерения), поэтому приходится строить сечения трехмерной карты и проводить на них контуры равной электронной плот ности. Такая карта схематически показана на рис. 1; в дальней шем будут приведены и другие карты. Получающиеся в резуль тате карты внешне напоминают топографические и метеорологи ческие карты. Атомы обнаруживаются в центрах областей с высокой электронной плотностью и похожи на кружки, изо бражающие горы на топографических картах. Заметим, что при фурье-синтезе наибольшие значения F являются доминирующими.
90 |
Часть II |
Если приближенные положения всех атомов асим метрической единицы известны (конечно, известно, какие именно это атомы), т. е. фактически имеется информация о кристаллической структуре, то вычис лить амплитуды и фазы структурных факторов не представляет труда. Тогда вычисленные амплитуды |ЕС| можно будет сравнить с наблюдаемыми iK l- Если использованная структурная модель правиль ная, а экспериментальные данные достаточно точны, то согласие между этими величинами должно быть удо влетворительным. Что же касается фаз, то, разумеет ся, рассчитанные фазы нельзя сравнивать с наблю даемыми, поскольку наблюдаемых фаз не существует.
Однако, приступая к определению структуры, кри сталлограф не знает положения всех атомов (ибо тогда не было бы никакой проблемы). Как уже выше было отмечено, существуют некоторые приемы, ис пользуя которые можно вывести приближенную структуру. Для этой приближенной структуры рассчи танные амплитуды и фазы структурных факторов бу дут не вполне точны, причем для последних расхож дение тем больше, чем больше несоответствие между использованной моделью и реальной структурой. Од нако неточно вычисленные фазы представляют собой, по крайней мере, грубое приближение к правильным фазам; что же касается наблюдаемых амплитуд, то их предполагают правильными (в пределах той точ ности, которая обусловлена случайными или неиз вестными систематическими ошибками). Следователь но, при помощи трехмерного суммирования ряда Фурье, включающего наблюдаемые амплитуды струк турных факторов lEol и вычисленные фазы, можно найти некоторое приближение к истинной электрон ной плотности. В результате многочисленных иссле дований было установлено, что характер карты элек тронной плотности значительно сильнее зависит от фазовых углов, чем от амплитуд структурных факто ров. Поэтому карта, вычисленная только с приблизи тельно правильными фазами, будет давать неплохое представление о структуре, и различие между рассчи танной структурой и реальной будет обусловлено