Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Гласкер, Дж. Анализ кристаллической структуры

.pdf
Скачиваний:
20
Добавлен:
22.10.2023
Размер:
10.62 Mб
Скачать

Рис. 34. Аномальная дисперсия.

(а) Разности хода при наличии аномального источника рас­ сеяния в элементарной ячейке. Предположим, что для опреде­

ленного

отражения аномальный источник рассеяния (жирные

кружки)

приводит

к разности фаз q, что добавляется к обычной

разности

2р между

излучением, рассеянным нормальным атомом

в этом положении, и излучением, рассеянным нормальным ато­ мом в некотором другом положении (светлые кружки). Нетрудно понять, что разность хода для отражения hkl при аномальном рассеянии есть + q, а для отражения Rffi 2р q. Если бы аномальйое рассеяние вообще не имело места, то в обоих случаях разность хода была бы одинаковой, а именно 2р. Поскольку ин­ тенсивность дифрагированного пучка зависит от разности хода между волнами, рассеянными различными атомами элементарной ячейки, результатом аномального рассеяния является разность

интенсивностей между

hkl и Ш1. Можно

вычислить значения

| F(hkl) | и \F (hkl)\

и выяснить, какое из

них больше. Если

вычисленный знак разности между ними соответствует экспери­ ментально измеренной разности, то, следовательно, конфигурация модели была правильной; если нет, то конфигурацию модели

следует изменить, т. е. если

| F0 {hkl) \ > | F0 (Ш) | , то с необхо­

димостью

будем иметь \Fc(hkl)\

> | Fc{Fik7) | . См. приложение 9,

стр.

204.

Найденная абсолютная конфигурация гидроизоцитрат-

иона

(б)

в кристалле калиевой

соли

(+)-изолимонной кислоты, изо­

лированной из Bryophyllum calycinum [Е]. Молекула не может быть совмещена со своим зеркальным отражением. Показаны также соответствующие формулы Фишера и Ньюмена,

6 Зак. 81

162 Часть III

Для определения других величин, описывающих гео­ метрию молекулы и их упаковку в кристалле, сущест­ вуют некоторые другие формулы. .Однако, если чита­ тель, изучающий статью по кристаллографии, поже­ лает проделать (особенно в неортогональной системе) какие-либо расчеты расстояний, углов, плоскостей или вообще геометрии, то ему лучше всего воспользовать­ ся векторной (или тензорной) алгеброй. Погрешности определения углов, расстояний и других молекуляр­ ных характеристик можно получить, используя урав­ нения (36) и (37), из погрешностей атомных пара­ метров и размеров ячейки.

Атомное и молекулярное движение. Влияние теп­ ловых колебаний атомов в кристаллах на рассеяние рентгеновских лучей этими атомами обсуждалось в подрисуночной подписи к рис. 15 и в соответствую­ щем тексте (стр. 82). Простейшее допущение заклю­ чается в том, что каждый атом предполагается движущимся одинаково во всех направлениях, т. е. движение считается изотропным. Уменьшение интен-

270°

Уточнение структуры и структурная информация

163

сивности рассеяния, обусловленное этим движением, зависит только от угла рассеяния и не зависит от ориентации кристалла по отношению к первичному пучку рентгеновских лучей. Как указывалось в под* пней к рис. 1 5 ( b ) , такое изотропное движение приво­ дит к экспоненциальному уменьшению эффективных

Рис. 35. Изоморфное замещение плюс аномальное рассеяние.

Для устранения неоднозначности в определении фазовых уг­ лов методом изоморфного замещения можно использовать эф­ фект аномального рассеяния замещенным атомом М. Эффект аномального рассеяния (приложение 9) заключается в появлении фазового сдвига, приводящего к тому, что атомный фактор рас­ сеяния замещенного атома становится вместо действительного числа f комплексным (f + Дf') + i&f". Предположим, что А к В относятся к компонентам структурного фактора полной структуры без аномального рассеяния, А" и В" — к тем же компонентам для структуры с аномальным рассеянием, а Лы и Вм — к ком­ понентам для одного замещенного атома с аномальным рас­ сеянием.

Лм = 0(/ + ДК + /ДП.

В М = Я (f + Д / '- И Д Г ) ,

A" = A + G ДК + Ю Дf" = А' + Ю ДГ,

В" = В + В Д/' + 1Н Ц" = В' + Ш Ц".

Как показано в приложении 9, для полной структуры с ано­ мальным рассеянием имеем

| F (hkl) | =

У {А' — Н Д И * +

(В' +

G Д П 2.

| F (hkl) | =

У (А' +

Я Д Г )2 +

(В' -

GДf")K

Поэтому | F(hkl) | и

| F(IUil) |

различны; чтобы выяснить, кото­

рый из этих факторов больше, следует измерить интенсивность каждого рефлекса, как это показано в приложении 9.

Предположим, что методом изоморфного замещения с ис­ пользованием двух производных некоторой молекулы (рис. 27) найдены два возможных фазовых угла ai и аг. Как видно из диаграммы, для оц можно ожидать, что | F(FM) | больше, чем

\F(hkl)\, а для аг \F(hkl)\ больше, чем \ Р(Ш )\. Таким об­ разом, если абсолютное положение атома М (в рассматриваемой координатной системе) известно, то сравнение измеренных интен­ сивностей hkl и Ш позволяет выбрать из этих двух возможно­ стей правильный фазовый угол. В этом случае можно вычислить величины G и Я.

6*

Уточнение структуры и структурная информация

165

атомных рассеивающих факторов при увеличении угла рассеяния 20. Рассеивающий фактор f любого неподвижного атома заменяется при этом на

(38)

где Biso представляет собой изотропный температур­ ный фактор *. Однако ясно, что изотропное прибли­ жение слишком грубо для описания истинного движения атомов в большинстве кристаллов, ибо окру­ жение этих атомов на самом деле далеко не изотроп­ но. Благодаря развитию быстродействующих вычи­ слительных машин в последние два десятилетия появилась возможность получать точные данные по интенсивности и анализировать их, учитывая такие

Рис. 36. Молекулярное движение.

Анизотропное движение атомов обычно описывается «тепло­ выми эллипсоидам»», как в примере, взятом при изучении струк­ туры дигидроцитрата натрия [Ж]. Полностью показаны два иона дигидроцитрата и два иона натрия, сгруппированные около центра симметрии; кроме того, показаны два атома [0(5) и 0 (2 )] каж­ дого из двух ионов дигидроцитрата. Жирные линии представляют собой ковалентные связи, светлые означают координационные взаимодействия атомов кислорода с ионом натрия.

Три числа около каждого из эллипсоидов в правой половине рисунка указывают среднеквадратичные смещения (А) вдоль трех главных осей этого эллипсоида. Для некоторых атомов анизотро­ пия движения видна достаточно хорошо, а особенно для тех, которые находятся на концах иона; для этих периферических ато­ мов самое большое движение всегда происходит в направлениях, перпендикулярных к направлению связи. Именно такого резуль­ тата и следовало ожидать. Тот факт, что он получился в рас­ чете, основанном на экспериментальных данных, можно рассмат­ ривать как доказательство корректности интерпретации дифрак­ ционных данных.

* Термин «температурный фактор» обычно используют для обозначения констант в экспонентах уравнения (38) и приведен­ ного ниже уравнения (39), несмотря на то что уже давно было известно, что поправка на тепловые колебания необходима даже; при- О °К, поскольку колебания сохраняются при низких темпера­ турах, и если исследование проводится только при какой-либо одной температуре, то статический беспорядок может моделиро­ вать динамический.

166

Часть III

тонкие эффекты, как весьма сложное атомное и моле­ кулярное движение. Следующим приближением после рассмотренного выше простейшего приближения (изо­ тропного) является допущение, что движение атомов эллипсоидально, т. е. что его можно описать при по­ мощи шести параметров эллипсоида общего типа, а не одним параметром, характеризующим сферу. Три из этих шести параметров определяют длины трех взаимно перпендикулярных осей, описывающих дви­ жения в трех направлениях, а три других — опреде­ ляют ориентацию осей эллипсоида по отношению к осям кристалла. Такое представление атомного дви­ жения для части структуры дигидроцитрата натрия показано на рис. 36. Важно отметить, что как степень анизотропии, так и протяженность атомного движе­ ния (амплитуды) в различных местах цитрат-иона различны, причем наибольшие амплитуды характер­ ны для периферических атомов. Чтобы учесть вклад этого эллипсоидального движения в уравнения для структурных факторов, вводят экспоненциальный фактор, аналогичный фактору, описываемому форму­ лой (38), однако поскольку на этот раз имеется шесть «анизотропных температурных факторов» Ьц, то их используют в качестве множителей индексов каждого рефлекса hkl в экспоненте, т. е.

Q -(b \\h :i-{'b2ik'1+biTl2-\-biihk-\-b2ikl-¥bb\hl)'

( 39)

Температурные факторы b{j различных атомов струк­ туры, как правило, все разные.

Описанное выше эллипсоидальное движение ато­ мов удобно для практических расчетов, однако с фи­ зической точки зрения оно может и не быть наиболее реалистичным; что же касается современного струк­ турного анализа, то такое приближение оправдало Себя как вполне адекватное. На современной стадии развития техники кристаллографии лишь очень редко делаются попытки проанализировать атомное движе­ ние в терминах более сложной модели, чем эллипсои­ дальная модель, хотя ясно, что движения атомов в кристалле часто могут быть и более сложными. Так, атомы могут двигаться скорее по дуге, чем по

Уточнение структуры и структурная информация

167

прямой линии; кроме того, энгармонизм потенциаль­ ной функции колебания приводит к тому, что движе­ ние от положения равновесия будет более пологим в одну сторону, чем в другую. Чтобы проанализиро­ вать такое движение, необходимы наилучшие совре­ менные данные. Существует немало примеров опре­ деления кристаллической структуры, в которых даже такая упрощенная модель, как эллипсоидальная, на самом деле является неоправданной просто потому, что данные по интенсивностям не были достаточно качественными. «Колебательные параметры», полу­ ченные на основе этих данных, по крайней мере ча­ стично являются артефактами; в частности, ложная анизотропия движения некоторых атомов структуры может быть следствием пренебрежения поправками на поглощение в кристалле нерегулярной формы. Однако, используя подходящее излучение, а также кристалл с соответствующими размерами и формой, можно либо оценить, либо свести к минимуму ошиб­ ки, связанные с таким поглощением. Когда же это сделано и из рентгенографических данных получены параметры анизотропии движения атомов (а это де­ лается лишь в лучших работах), то найденная таким способом анизотропия должна отражать действитель­ ность.

Движение молекул как целого. Некоторые моле­ кулы приближенно можно рассматривать как твердые тела, т. е. считать, что при их движении относитель­ ные положения всех атомов (а следовательно, и все межатомные расстояния) остаются неизменными. Та­ ким образом, можно считать, что молекулы движутся как целое. Конечно, это всего лишь приближение, поскольку «внутренние» колебания —движение како­ го-нибудь атома в молекуле по отношению к его со­ седям — всегда имеют место, однако во многих крикристаллах движение целых молекул (или ионов) много больше внутренних колебаний. Анализ отдель­ ных анизотропных параметров температурного фак­ тора молекул в кристаллах обнаруживает иногда не­ которые интересные свойства молекулярного движе­ ния, которые часто удается скоррелировать с формой

168

Часть III

■молекулы

и с природой ее окружения в кристалле.

•Движение молекулы, вообще говоря, можно описать в терминах трех компонентов: трансляционного дви­ жения (колебания по прямой линии), либрационного

•движения (колебания по дуге), а также комбинацией трансляционного и либрационного движений, которую можно рассматривать как колебание по спирали. Не­ которые молекулы, не являющиеся вполне жесткими, можно считать состоящими из жестких сегментов, соединенных нежесткими связями. К ним относятся такие молекулы, как дифенил и его производные, в которых торсионные колебания вокруг связи между кольцами очень велики. Методы анализа молекуляр­ ного движения в таких молекулах, которые можно рассматривать как системы, построенные из жестких участков, в настоящее время успешно развиваются.

Одно важное свойство либрационного движения состоит в том, что внутримолекулярные расстояния

•кажутся несколько короче, чем они есть на самом деле; особенно это касается расстояний, перпендику­ лярных осям, около которых наблюдается существен­ ное либрационное движение. Если картина движения известна, то нетрудно найти приближенную поправку -к внутримолекулярным расстояниям, однако для не­ жестких молекул достаточно точных формул для та­ ких поправок не существует. Это еще один пример систематической ошибки, которая приводит к значи­ тельно меньшей точности полученного результата, чем точность, основанная на статистическом анализе и -предположении о случайности ошибок. Что же ка­ сается межмолекулярных расстояний, то при наличии существенного молекулярного движения для них мож­ но указать лишь весьма неопределенные пределы из- ■менения, ибо корреляция движения одной молекулы -с ее соседями неизвестна.

Дифракция нейтронов. Рентгено- и нейтронография

• во многих отношениях дополняют одна другую, по-

• скольку суть процесса в них различна. Рентгеновские

-лучи

рассеиваются

почти

исключительно атомными

-электронами,

тогда

как нейтроны рассеиваются ядра-

•ми.

Поэтому,

если

центр

тяжести электронного рас­

Уточнение структуры и структурная информация

169

пределения какого-либо атома не совпадает с поло­ жением его ядра, то положение атома, определяемое этими двумя методами, будет различаться. Это разли­ чие особенно заметно в положениях атомов водорода; в рентгеновских исследованиях связи, в которых уча­ ствуют атомы водорода, обычно кажутся на 0,1 А ко­ роче, чем они есть на самом деле, так как связанный атом водорода не имеет сферической симметрии, ха­ рактерной для внутренних электронных оболочек, — его единственный электрон смещен к атому, с которым связан данный атом водорода.

Рассеяние от ядер мало зависит от атомного но­ мера (или по крайней мере не зависит от него регу­ лярным образом). Этот факт можно использовать для выяснения некоторых неоднозначностей рентгено­ структурного исследования. Типичные значения рас­ сеивающего фактора для рентгеновских лучей и ней­ тронов приведены в приложении 10. Водород имеет отрицательный * рассеивающий фактор для нейтронов (см. рис. 37), тогда как дейтерий имеет положитель­ ный фактор, причем оба они достаточно велики, так что эти два изотопа легко можно различить; что же касается рентгеновских лучей, то для них эти изотопы одинаковы. Поэтому дифракцию нейтронов можно ис­ пользовать для изучения структур, которые были по­ мечены дейтерием. При помощи нейтронов можно также различить атомы с примерно одинаковыми атомными номерами, что невозможно установить рентгенографически (например, Fe, Со и N1), ибо для нейтронов их рассеивающая сила существенно раз­ лична. Нейтронографический анализ позволяет опре­ делить положения атома водорода или дейтерия с такой же точностью, как и положения урана и многих других тяжелых атомов. Это очень важное преиму­ щество нейтронографических исследований. Как и в случае рентгеновских лучей, для нейтронов также

* Если ядро имеет отрицательный рассеивающий фактор, то излучение, рассеянное этим ядром, отличается по фазе от излу­ чения, рассеянного ядром с положительным рассеивающим фак­ тором. (и занимающим, разумеется, то же положение), ровно на 180° (cos 180° = — 1).

170

Часть III

может иметь место аномальное рассеяние. Поскольку ядра малы по сравнению с длинами волн обычного нейтроновского излучения (порядка 1А), то интен­ сивность нейтронов, рассеянных от стационарного

 

v

 

 

V

 

\

 

 

Ъ//Л

' SNA \ '

 

г

' Л \

 

/ ' / / /

\

*

 

 

 

 

I 1 l ! l

J

/1 /1 >1

,.

' \

H I 1,

 

 

I

\

(Уу

'- - А * '

сг!W

o

1) н)__

 

0 ш /

\ ,V,v-

W in

/

/

<

---. N» \

////

;

1

к

у , г ,

 

 

 

 

\Ч —

Рис. 37. Плотность рассеяния нейтронов кристаллом, спроециро­ ванная на плоскость (001).

Положительная плотность (главным образом в положениях лтомов С) указана сплошными линиями, отрицательная плотность (главным образом в положениях атомов Н ) — пунктиром. Неме­ ченые атомы Н принадлежат другим молекулам бензола. Пло­ скость кольца не перпендикулярна к направлению проекции; по- -этому кольцо не кажется правильным шестиугольником.

•ядра, в отличие от интенсивности рентгеновских лучей заметно не уменьшается на больших углах. Однако ■так же, как и для рентгеновских лучей, колебания фатомов даже при низкой температуре должны приво­

дить

к уменьшению интенсивности на больших углах

[рис.

1 5 ( b ) ] .

. .

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ