Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Яцюк, Зубкова _Основы биоорганической химии

.pdf
Скачиваний:
125
Добавлен:
20.05.2015
Размер:
1.99 Mб
Скачать

Характерной особенностью α-аминокислот является способность образовывать комплексные соли с ионами тяжелых металлов:

 

O

 

 

 

O

 

 

 

C

H2N

 

 

C

 

H2N

R-CH

OH

CH-R

 

R-CH

O

Cu

CH-R

+ Cu 2+ +

 

 

HO

 

 

 

O

 

NH2

C

 

 

NH

 

C

 

 

 

 

 

2

 

 

 

 

O

 

 

 

 

O

Медные соли аминокислот нерастворимы в воде, имеют интенсивное синее окрашивание. Эта реакция используется для обнаружения α-аминокислот.

Другой общей качественной реакцией α-аминокислот является их взаимодействие с нингидрином с образованием продукта сине-фиолетового цвета:

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

O

 

 

 

 

OH

+ H2N-

 

CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

OH

нингидрин

 

 

 

 

 

продукт сине-фиолетового цвета

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

+ R-C

 

+ CO2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Как карбоновые кислоты,

α-аминокислоты образуют

сложные эфиры при взаимодействии со спиртами и хлорангидри-

ды при взаимодействии с тионилхлоридом или хлоридами фос-

фора:

 

 

CH3OH

 

 

 

 

 

 

 

R-

 

CH-COOCH 3 + H2O

 

 

 

 

HCl газ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R-CH-COOH

 

 

 

NH2

 

 

SOCl2

метиловый эфир

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH

R-CH-COCl + SO2 + HCl

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

хлорангидрид

Сложные эфиры α-аминокислот летучи, они имеют сравнительно низкие температуры кипения. Это их свойство используется для разделения смеси аминокислот в белковых гидролизатах (эфирный метод Фишера). С этой целью аминокислоты сначала этерифицируют, а потом подвергают перегонке.

191

За счет аминогруппы α-аминокислоты подвергаются реакциям ацилирования и алкилирования, взаимодействуют с оксосоединениями. Так, при ацилировании аминокислоты уксусным ангидридом образуется N-ацетильное производное. При взаимодействии с формальдегидом образуется продукт нуклеофильного присоединения – N-метилольное производное, которое достаточно устойчиво (с другими оксосоединениями протекает реакция нуклеофильного присоединения-отщепления).

 

 

 

(CH3CO)2O

R-

 

CH-COOH

+ CH3COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R-CH-COOH

 

O

NH-CO-CH

3

 

 

N-ацетилпроизводное

 

 

 

 

 

NH2

 

H-C-H

R-CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH-CH2OH

 

 

 

 

 

N-метилольное производное

Реакцию ацилирования раньше использовали для защиты аминогруппы в синтезе пептидов. Реакция с формальдегидом лежит в основе метода количественного анализа аминокислот (метод формольного титрования, метод Зеренсена). Сущность метода формольного титрования заключается в следующем: до взаимодействия с формальдегидом растворы большинства аминокислот имеют реакцию, близкую к нейтральной; N-метилольное производное проявляет кислотные свойства и может быть оттитровано раствором щелочи с известной концентрацией.

Как первичные алифатические амины α-аминокислоты подвергаются действию азотистой кислоты с образованием соответствующих α-оксикислот и выделением азота:

R-

 

CH-COOH

HNO2

R-

 

CH-COOH + N2

+ H2O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

OH

 

 

 

 

 

α -оксикислота

 

Эту реакцию называют реакцией дезаминирования in vitro. Ее используют и как качественную реакцию для доказательства наличия первичной алифатической аминогруппы (наблюдают выделение пузырьков газа), и для количественного анализа (ме-

192

тод Ван-Слайка) – по объему выделившегося азота рассчитывают количество аминокислоты, вступившей в реакцию.

Специфическим свойством α-аминокислот является их способность к декарбоксилированию при нагревании в присутствии гидроксида бария:

R-CH-COOH

to

R-CH2-NH2 + BaCO3 + H2O

Ba(OH)2

 

 

амин

NH2

 

 

 

Рассмотренные выше реакции характерны для всех α- аминокислот. Существуют также реакции на определенные группы аминокислот.

Для обнаружения ароматических аминокислот используют так называемую ксантопротеиновую реакцию. При нагревании этих аминокислот (или белков, в структуре которых присутствуют их остатки) с концентрированной азотной кислотой образуются продукты нитрования желтого цвета, которые в щелочной среде приобретают оранжевую окраску:

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HNO3

, to

 

 

 

 

 

CH2-

 

CH-COOH

HO

 

 

 

 

 

 

 

CH2-

 

CH-COOH

 

 

HO

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

O2N

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

тирозин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

продукт нитрования

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(желтая окраска)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NaOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

оранжевая

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

окраска

Серосодержащие аминокислоты (цистеин, цистин, метионин) обнаруживают по реакции с ацетатом свинца (реакция Фоля).

 

 

 

NaOH, to

(CH3COO)

2Pb

CH -CH-COOH

продукты разложения (Na2S)

PbS

 

 

2

 

 

сульфид

 

 

 

 

 

 

 

 

SH NH2

 

 

свинца

 

 

цистеин

 

(серо-черный

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

осадок)

При нагревании с щелочью серосодержащие аминокислоты разлагаются, одним из продуктов разложения является сульфид натрия. При дальнейшем добавлении ацетата свинца образуется осадок сульфида свинца серо-черного цвета.

193

Реакции α-аминокислот in vivo

Аминокислоты не накапливаются в клетке: как правило, их избыток разрушается при помощи реакций, которые снабжают живую систему энергией. Аминокислоты принимают участие в метаболических процессах, в результате которых в клетке синтезируются необходимые ей соединения. Основные реакции, за счет которых осуществляется превращение аминокислот в клетке, – это декарбоксилирование, дезаминирование, переаминирование. Эти реакции катализируются соответствующими ферментами.

В результате реакций декарбоксилирования образуются био-

генные амины.

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2-CH-COOH

декарбоксилазы

 

 

 

CH -CH

-NH

 

+ CO

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

2 2

 

2

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

H

 

гистамин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

гистидин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2-

 

CH-COOH

декарбоксилазы

 

CH2

-CH2

-OH + CO2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

NH2

 

 

 

 

NH2

коламин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

серин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Реакции дезаминирования могут осуществляться как по окислительному, так и по неокислительному пути.

Неокислительное дезаминирование встречается в основном у растений и грибов. Так, например, с участием фермента аспартазы протекает дезаминирование аспарагиновой кислоты с образованием транс-бутендиовой (фумаровой) кислоты:

аспартаза

HOOC-CH2-CH-COOH HOOC-CH=CH-COOH + NH 3

фумаровая кислота

NH2

аспарагиновая кислота

Окислительное дезаминирование осуществляется через образование промежуточной иминокислоты, которая затем подвергается гидролизу:

CH3-

 

CH-COOH

[O]

CH3-C-COOH

H2O

CH3-C-COOH + NH 3

 

 

 

 

фермент

фермент

 

 

 

NH2

 

NH

 

O

аланин

 

α-иминопропионовая

пировиноградная

 

кислота

 

кислота

 

 

 

 

 

194

Переаминирование α-аминокислот сводится к взаимопревращению их аминогрупп и карбонильных групп α-кетокислот под действием ферментов трансаминаз (аминотрансфераз). Это основной путь биосинтеза α-аминокислот из α-кетокислот. Донором аминогруппы служит аминокислота, имеющаяся в клетке в достаточном количестве, а ее акцептором – кетокислота. Например, таким образом, из аспарагиновой кислоты в клетке может быть синтезирован аланин или глютаминовая кислота:

 

HOOC-CH2-

CH-COOH +

CH3-C

-COOH

фермент

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

O

аспарагиновая кислота

пировиноградная

 

 

 

 

 

кислота

 

 

HOOC-CH2-C-COOH + CH3-CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

NH2

 

 

щавелевоуксусная

 

аланин

 

 

кислота

 

 

 

 

HOOC-CH -CH-COOH +

HOOC-CH -CH -C-COOH

фермент

 

2

 

 

2

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

O

аспарагиновая кислота

α-кетоглютаровая

 

 

 

 

 

кислота

 

 

 

 

 

 

 

 

HOOC-CH2-

C-COOH

+ HOOC-CH2-CH2-

 

CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

NH2

 

 

щавелевоуксусная

глютаминовая

 

 

кислота

кислота

Реакция переаминирования является связующим звеном между процессами метаболизма белков (аминокислоты) и углеводов (кетокислоты).

ПЕПТИДЫ И БЕЛКИ Пептиды и белки – соединения, построенные из остатков α-

аминокислот. Деление между ними условное: принято считать, что пептиды построены из остатков менее 100 аминокислот, белки – более 100 аминокислот.

Можно рассматривать полипептидную цепь как продукт поликонденсации α-аминокислот, а пептидную связь – как амид-

195

ную, т.е. пептиды и белки являются полиамидами. Схематично образование трипептида можно показать следующим образом:

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

O

 

 

O

H2N-

 

CH-C +

H2N-

 

CH-C

 

 

+ H2N-CH-C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

OH

 

R"

OH - 2 H2O

 

 

 

 

R'

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N-конец

O

O

 

 

C-конец

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2N-

CH-C-NH-CH-C-NH-CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

R'

 

 

 

R"

 

 

пептидные связи

трипептид

Пептидная цепь имеет неразветвленное строение и состоит из чередующихся пептидных (амидных) групп и CH-групп с соответствующими радикалами. Принято записывать структуру пептида, начиная со свободной аминогруппы (N-конца молекулы) и заканчивая свободной карбоксильной группой (C-конец).

Названия пептидов строятся путем последовательного перечисления аминокислотных остатков, начиная с N-конца. Названия аминокислот, вступивших в образование пептидной связи своей карбоксильной группой, заканчиваются суффиксом «-ил»,

например:

 

O

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2N-CH-C-NH-CH2-C-NH-CH-COOH

 

CH3

 

 

CH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

аланилглицилфенилаланин (Ала-Гли-Фен)

Амидная связь между двумя α-аминокислотными остатками называется пептидной связью. Атомы углерода, азота и кислорода пептидной связи находятся в sp2-гибридизации, все 4 атома CONH-группы расположены в одной плоскости под углом 120о.

O

H

H

Неподеленная пара

электронов

азота

вступает в p,π-сопряжение с электрон-

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C ..

C

N

ным облаком π-связи карбонильной

 

 

N

C

..

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

группы, вследствие чего связь C=O не-

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

сколько удлиняется

(0,124 нм

вместо

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

196

0,121 нм),

0,147 нм).

O

C N

а связь C-N несколько укорачивается (0,132 нм вместо Вследствие делокализации электронной плотности в p,π-сопряженной системе связи C-O и C-N становятся как бы «полуторными», поэтому вращение вокруг них затруднено. Такое электронное строение обусловлива-

Hет жесткую плоскостную структуру пептидной связи:

Качественной реакцией на пептидную связь является биу- ретовая реакция: при взаимодействии пептида с Cu(OH)2 наблюдается красновато-фиолетовое окрашивание. Обратите внимание, что эта реакция не характерна для дипептидов.

При единообразно построенной цепи пептиды и белки отличаются аминокислотным составом и аминокислотной последовательностью. Аминокислотный состав показывает, какие аминокислоты и в каких соотношениях входят в структуру пептидов и белков. Для определения аминокислотного состава пептид или белок подвергают гидролизу и гидролизат анализируют (чаще всего хроматографическими методами).

Пептидные связи гидролизуются и в кислой, и в щелочной среде. При кислотном гидролизе пептидов образуются соли аминокислот по аминогруппе, при щелочном гидролизе – соли по карбоксильной группе:

 

 

 

H2O,HCl

+

 

 

+

 

 

 

 

 

 

H3N-CH 2

-COOH

+ H3N-CH-COOH

 

 

 

 

Cl-

 

 

Cl-

 

 

 

 

гидрохлорид

CH3

H2N-CH 2-CO-NH-CH-COOH

 

 

 

глицина

гидрохлорид

 

 

 

аланина

 

 

 

 

 

 

CH3

 

 

H O,NaOH

 

 

 

 

 

 

глицилаланин

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2

H N-CH

-COONa + H N-CH-COONa

 

 

 

 

 

 

 

 

2

2

 

2

 

CH3

 

 

 

 

натриевая соль

 

 

 

 

 

 

глицина

натриевая соль

 

 

 

 

 

 

 

аланина

197

Практически для гидролиза пептидов и белков используют кислотный катализ, т.к. многие аминокислоты в щелочной среде неустойчивы. Полный кислотный гидролиз любого белка протекает при его нагревании с 20% раствором соляной кислоты при 110оС в течение 24 час. Некоторые аминокислоты (например, триптофан) разрушаются и в кислой среде.

Более удобным является ферментативный гидролиз пептидов и белков. Ферментативный гидролиз протекает под действием ферментов – пептидаз. Определенные пептидазы расщепляют пептидные связи между остатками определенных аминокислот. Например, трипсин гидролизует связи, образованные лизином или аргинином с другими аминокислотами, пепсин – связи между аминокислотами с гидрофобными радикалами (аланин, валин, лейцин, изолейцин), химотрипсин – связи, образованные ароматическими аминокислотами. Чтобы осуществить полный ферментативный гидролиз, нужно использовать набор различных ферментов.

При ферментативном гидролизе образуются свободные аминокислоты.

Первичная структура белков это определенная аминокис- лотная последовательность, т.е. порядок чередования амино- кислотных остатков в полипептидной цепи. Определение ами-

нокислотной последовательности заключается в последовательном отщеплении аминокислотных остатков с N- или C-конца и их идентификации. Существуют различные методы определения аминокислотной последовательности, один из них – фенилтиогидантоиновый, или метод Эдмана.

Этот метод заключается во взаимодействии N-концевой аминокислоты с фенилизотиоцианатом в щелочной среде:

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

O

 

δ+

..

 

..

 

 

 

 

 

 

δ+

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C H -N=C=S +

H N-CH-C-NH-CH-CONH-

 

C6H5-NH-

C-NH-CH-C-NH-CH-CONH-

 

6

5

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

 

R'

 

S

R

 

 

R'

меченый полипептид

Образуется так называемый меченый полипептид, в структуре которого появился остаток фенилизотиоцианата (это реак-

198

ция AN). При обработке меченого пептида слабой кислотой при комнатной температуре происходит внутримолекулярная циклизация в фенилтиогидантоиновое производное (ФТГ-производное) с одновременным гидролизом пептидной связи:

 

S

 

 

 

 

 

 

C6H5-N

C

 

 

 

 

NH + H2N-CH-CO-

C

 

 

 

CH

R'

 

 

 

O

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ФТГ-производное

 

ФТГ-производное идентифицируется методом тонкослойной хроматографии. Преимущество метода Эдмана в том, что остальная часть пептидной молекулы не нарушается, и можно повторять операции по отщеплению следующей N-концевой аминокислоты. Сейчас этот метод воспроизводится в автоматическом приборе, который осуществляет до 50 стадий отщепления и автоматически анализирует ФТГ-производные.

Для белков, наряду с первичной структурой, характерны более высокие уровни организации – вторичная, третичная и четвертичная структуры.

Под вторичной структурой белка понимают пространст-

венное расположение атомов полипептидной цепи. Существует два типа вторичной структуры – α-спираль и β-складчатая структура.

На основании теоретических расчетов в 1950 г. Полинг и Кори доказали, что для полипептидной цепи наиболее выгодной конформацией является α-спираль – структура, сходная с правозакрученной винтовой лестницей (рис. 5). Поскольку α-спираль построена из повторяющихся единиц –NH-CHR-CO-, то размеры ее относительно постоянны. На один виток спирали приходится 3,6 аминокислотных остатка, шаг спирали 0,54 нм, диаметр – 0,5 нм. Плоскости двух соседних пептидных групп находятся под углом ~108о, боковые радикалы находятся на наружной стороне спирали (направлены как бы от цилиндра).

Фиксируют такую спиральную конформацию водородные связи, которые возникают между атомом кислорода карбониль-

199

ной группы каждого первого аминокислотного остатка и атомом водорода NH-группы каждого пятого остатка:

 

 

 

 

H

 

O

 

 

 

 

H

 

 

O

H O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

-N-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-N-

CH-C-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H R O

R'

H R" O

R'"

 

 

H R"" O

 

R'""

..

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

I

II

 

III

IV

 

 

 

V

 

VI

Водородные связи почти параллельны оси спирали, а так как каждая C=O и NH-группы α-спирали участвуют в образовании водородной связи, это делает вторичную структуру весьма устойчивой.

Рис. 5. Фрагмент белковой α-спирали.

Другим видом вторичной структуры является β-складчатая структура. В складчатые листы укладываются вытянутые полипептидные цепи, связываемые множеством водородных связей между пептидными группами этих цепей. Складчатый лист включает обычно не более шести полипептидных цепей. Если полипептидные цепи имеют одинаковую направленность от N- к C-концу, то образуется параллельная β-структура, если противоположную – то антипараллельная:

200