- •Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования
- •Содержание
- •Список сокращений
- •Введение
- •І. Тема: белки
- •1. Строение и биологическая роль аминокислот, пептидов, белков
- •Аспарагиновая кислота (асп)
- •Лизин (лиз)
- •Серин (сер)
- •1.1. Первичная структура белка
- •1.2. Варианты вторичной структуры белка
- •1.3. Третичная структура белка
- •1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
- •Свойства протеинов
- •2.1. Физико - химические свойства биополимеров
- •2.2. Особенности биологических свойств белков
- •3. Методы очистки и выделения белков
- •4. Классификация белков
- •4.1. Простые белки
- •4.1.1. Глобулярные белки
- •4.1. 2. Фибриллярные белки
- •4.2. Сложные белки
- •Отличительные особенности строения углеводсодержащих белков
- •Характеристика липопротеиновых частиц
- •5. Биологическая роль протеинов
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний
- •Ситуационные задачи
- •II. Тема: ферменты
- •1. Особенности строения ферментов
- •1.1. Энзим – сложный белок
- •1.1.1. Природа и роль кофермента
- •Витамины – компоненты коферментов
- •1.1.2. Апофермент и его значение
- •1.2. Функциональные центры фермента
- •2. Энзимы как биокатализаторы
- •2.1. Теории, объясняющие механизм действия ферментов
- •I стадия. Образование es-комплекса
- •II стадия. Активация es-комплекса
- •III стадия. Образование eр-комплекса
- •IV стадия. Распад eр-комплекса
- •2.2. Специфичность действия энзимов
- •2.3. Кинетика ферментативных реакций
- •2.3.1. Зависимость скорости реакции от содержания субстрата
- •2.3.2. Влияние концентрации фермента на скорость реакции
- •2.3.3. Эффект колебаний температуры
- •2.3.4. Связь интенсивности процесса с величинами рН среды
- •3. Классификация, номенклатура ферментов
- •3.1. Классификация
- •2.1.1. Характеристика отдельных классов ферментов
- •4. Положительная и отрицательная регуляции работы ферментов
- •4.1. Механизмы аллостерической регуляции
- •4.2. Последствия белок - белкового взаимодействия
- •4.3. Регуляция путём ковалентной модификации
- •4.4. Частичный протеолиз как способ активации зимогена
- •Особенности конкурентного ингибирования
- •5. Использование ферментов в медицине
- •5.1. Энзимопатии
- •Энзимодиагностика
- •Энзимотерапия
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
- •Приложение № 1
- •Варианты правильных ответов на контрольные тесты
- •Список литературы
1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
Когда глобулы состоят из двух и более полипептидных цепей, ассоциированных между собой нековалентными (непептидными и недисульфидными) связями, то это свидетельствует, что они обладают четвертичной структурой. Подобные белки называются олигомерами, а их индивидуальные цепи – протомерами (мономерами, субъединицами). Если их молекулы содержат 2 протомера, это димеры, если 4 - тетрамеры и т.д. Их число всегда чётное (от 2 до 24).
Например, гемоглобин А (HbА) – белок эритроцитов, связывающий кислород, состоит из четырёх субъединиц (2 α- и 2 β) (Рис.5). Лактатдегидрогеназа (ЛДГ) – фермент, принимающий активное участие в окислении и синтезе глюкозы, также включает 4 протомера – Н (heart) и М (muscle) в разных сочетаниях: Н4, Н3М1, Н2М2, Н1М3, М4. Креатинкиназа – энзим, используемый в регенерации АТФ при мышечном сокращении, имеет только две субъединицы – В (brain) и М (muscle) в разных сочетаниях: ВВ, ВМ или ММ. Взаимодействие протомеров друг с другом осуществляется по принципу комплементарности, т.е. их поверхность подходит друг другу по геометрической форме и по функциональным группам аминокислот (возникновение ионных и водородных связей).
Стабилизируется с помощью добавочных связей.
Биороль: отвечает за проявление специфических функций белка, выполнение которых обеспечивает только мультимер; его диссоциация приводит к снижению или потере активности протеина.
Особенности строения обуславливают свойства белков.
Свойства протеинов
2.1. Физико - химические свойства биополимеров
Высокая молекулярная масса и большие размеры. Мr белков колеблется от 6000 – 1 млн. Дальтон и выше. Это зависит от количества а/к остатков и числа протомеров.
Различная форма молекул. Выделяют глобулярные (globula - шар), фибриллярные (fibrille - нить) и смешанные белки.
Их растворимость в воде зависит, в первую очередь, от следующих факторов:
а) Аминокислотного состава: чем больше гидрофильных (полярных) а/к, тем лучше это свойство.
б) Уровня организации белковой молекулы. Протеины, обладающие вторичной структурой (фибриллярные), содержат гидрофобные и гидрофильные а/к остатки, обращённые наружу, следовательно, данные полимеры плохо растворимы в воде (кератин волос, коллаген соединительной, эластин покровных тканей). Белки, компактно сложившиеся в пространстве (имеющие третичную и четвертичную структуры - глобулярные), хорошо растворимы, т.к. гидрофобные радикалы аминокислот находятся внутри глобулы, а полярные - направлены наружу, благодаря чему молекула приобретает заряд и способна притягивать диполи воды, образующие вокруг неё гидратную оболочку.
Врезультате одноимённо заряженные частицы (подавляющее количество природных протеинов - кислые) отталкиваются, а гидратная оболочка отделяет их друг от друга и не даёт им склеиваться. Отсюда наличиезаряда и гидратной оболочки – ключевые факторы стабильности белковых растворов (Рис.6).
в) Значений рН
В физиологических условиях в тканях человека рН = 7,35 – 7,40 (слабощелочная). Это оптимальная среда для работы протеинов. Если изменять этот показатель так, что заряд мицеллы будет приближаться к нулю (ИЭТ), то их молекулы будут сближаться, склеиваться и выпадать в осадок. В сильнокислой и сильнощелочной средах белки также осаждаются, так как происходит их денатурация (см. ниже).
Способность протеинов к осаждению применяют в клинике для диагностики патологий и разделения белков плазмы крови на фракции. Его осуществляют двумя способами денатурацией и высаливанием.
Высаливание (ренатурация) – это обратимое осаждение белков, под действием высаливающих реагентов, которые лишают мицеллу гидратной оболочки или/и уменьшают величину заряда. К ним относятся: соли щелочных металлов, аммония, разбавленные растворы кислот и щелочей.
Но так как внутрь мицеллы они не проникают и структуру протеина не нарушают, то при добавлении воды (восстановлении гидратной оболочки) можно вернуть нативность полимеру (возвратить растворимость).
Денатурация – необратимое осаждение белков, вызванное повреждением структуры и последующей за этим потерей физико-химических и биологических свойств молекул.
Среди денатурирующих реагентов можно выделить:
- физические: высокая t0 (свыше 430) усиливает амплитуду колебаний и движения атомов, нарушает их взаимодействие, что приводит к разрыву связей; при низкой t0 кристаллизуются молекулы воды, разрывая острыми краями мицеллу протеина; излучение (УФО, ,β,-лучи) – источник добавочной энергии, которая разрушает связи в белке; изменение давления повреждает структуру, сдавливая протеин.
- химические: концентрированные кислоты и щёлочи резко изменяют рН и вызывают перераспределение электронной плотности, потерю заряда и разрыв, в первую очередь, ионных связей; соли тяжёлых металлов (Cu, Ag, Hg, Pb и т.д.) вступают в прочные контакты с важными функциональными группами белков, изменяют их конформацию и т.д.
Такие реагенты вначале повреждают гидратную оболочку протеина, изменяют заряд (производят высаливание), затем проникают вглубь мицеллы, разрушая добавочные связи. Это приводит к потере нативной конформации белка (вторичной, третичной и четвертичной структур), сопровождающейся утратой специфических функций молекулы. При денатурации не происходит разрыва пептидных связей, т.е. первичная структура сохраняется. Её распад осуществляется только с помощью гидролиза.
Это свойство белков используется в медицине для стерилизации инструментов и материалов (хранение под спиртом, автоклавирование), помещений (кварцевание), обеззараживания раневых поверхностей (с помощью антисептиков), остановки кровотечений электрокоагуляторами при операциях и т.д.