- •Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования
- •Содержание
- •Список сокращений
- •Введение
- •І. Тема: белки
- •1. Строение и биологическая роль аминокислот, пептидов, белков
- •Аспарагиновая кислота (асп)
- •Лизин (лиз)
- •Серин (сер)
- •1.1. Первичная структура белка
- •1.2. Варианты вторичной структуры белка
- •1.3. Третичная структура белка
- •1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
- •Свойства протеинов
- •2.1. Физико - химические свойства биополимеров
- •2.2. Особенности биологических свойств белков
- •3. Методы очистки и выделения белков
- •4. Классификация белков
- •4.1. Простые белки
- •4.1.1. Глобулярные белки
- •4.1. 2. Фибриллярные белки
- •4.2. Сложные белки
- •Отличительные особенности строения углеводсодержащих белков
- •Характеристика липопротеиновых частиц
- •5. Биологическая роль протеинов
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний
- •Ситуационные задачи
- •II. Тема: ферменты
- •1. Особенности строения ферментов
- •1.1. Энзим – сложный белок
- •1.1.1. Природа и роль кофермента
- •Витамины – компоненты коферментов
- •1.1.2. Апофермент и его значение
- •1.2. Функциональные центры фермента
- •2. Энзимы как биокатализаторы
- •2.1. Теории, объясняющие механизм действия ферментов
- •I стадия. Образование es-комплекса
- •II стадия. Активация es-комплекса
- •III стадия. Образование eр-комплекса
- •IV стадия. Распад eр-комплекса
- •2.2. Специфичность действия энзимов
- •2.3. Кинетика ферментативных реакций
- •2.3.1. Зависимость скорости реакции от содержания субстрата
- •2.3.2. Влияние концентрации фермента на скорость реакции
- •2.3.3. Эффект колебаний температуры
- •2.3.4. Связь интенсивности процесса с величинами рН среды
- •3. Классификация, номенклатура ферментов
- •3.1. Классификация
- •2.1.1. Характеристика отдельных классов ферментов
- •4. Положительная и отрицательная регуляции работы ферментов
- •4.1. Механизмы аллостерической регуляции
- •4.2. Последствия белок - белкового взаимодействия
- •4.3. Регуляция путём ковалентной модификации
- •4.4. Частичный протеолиз как способ активации зимогена
- •Особенности конкурентного ингибирования
- •5. Использование ферментов в медицине
- •5.1. Энзимопатии
- •Энзимодиагностика
- •Энзимотерапия
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
- •Приложение № 1
- •Варианты правильных ответов на контрольные тесты
- •Список литературы
Особенности конкурентного ингибирования
В отличие от активаторов, подавляющее большинство которых положительно действует на ход реакции за счёт связывания с группировками, отдалёнными от активного центра, ингибиторы могут находить контакт и с ним, и с его аллостерическим аналогом (см. выше). Отсюда выделяют два варианта угнетения процесса: конкурентное и неконкурентное. Последнее в природе более распространено, так как не требует пространственного и химического сходства с субстратом, а только необходимо наличие в нём группировок, способных присоединиться к аллостерическому центру.
Если в направленности сдвигов ингибирование отличается от активирования, то по прочности образующейся связи в комплексе ингибитор – фермент (InE) оно аналогично, т.е. также различают обратимый и необратимый механизмы. Логично предположить, что живой организм обычно использует неконкурентное обратимое подавление скорости реакций, оно даёт возможность быстрого ответа на изменившиеся условия. Необратимость отрицательной регуляции не физиологична, о чём свидетельствует следующий пример. Йодацетат, диизопропилфторфосфат (ДФФ), а также диэтил-n-нитрофенилфосфат, соли синильной кислоты cвязывают и выключают функциональные группы или ионы металлов в молекуле энзима. ДФФ – соединение из группы нервнопаралитических отравляющих веществ, прикрепляясь к остатку серина, находящегося в активном центре ацетилхолинэстеразы, образует фермент-ингибиторный комплекс. В норме данный биокатализатор гидролизует ацетилхолин, играющий роль нейромедиатора. Почти сразу после очередного нервного импульса ацетилхолинэстераза расщепляет его на холин и уксусную кислоту, и нейрон готов к передаче следующего импульса. Если же формируется InE - комплекс, распад медиатора подавляется, он накапливается, нервные импульсы следуют один за другим и мышца длительное время не расслабляется. В конце концов, наступает паралич или смерть.
Некоторые ферменты полностью угнетаются очень малыми концентрациями ионов тяжелых металлов, например ионов ртути (Hg2+), серебра(Ag+) и мышьяка (As+) или йодуксусной кислотой. Эти электролиты необратимо соединяются с сульфгидрильными группами (–SH) и вызывают денатурацию апофермента.
Подавление скорости химической реакции используют в медицинской практике. Для лечения инфекционных заболеваний, вызываемых бактериями, применяют сульфаниламидные препараты. Это обусловлено тем, что они имеют структурное сходство с парааминобензойной кислотой (ПАБК), которая необходима бактериальной клетке для синтеза жизненно важной фолиевой кислоты, являющейся коферментом. Благодаря близости пространственного строения сульфаниламид блокирует действие фермента путем вытеснения ПАБК из комплекса с ним, что ведет к торможению роста и размножения микроорганизмов.
5. Использование ферментов в медицине
Достижения энзимологии находят все большее применение в медицине, в частности в профилактике, диагностике и лечении болезней. Успешно развивается её новое направление – медицинская энзимология. Выделяются три основных направления этой науки: 1) изучение энзимопатологий (энзимопатий), то есть таких болезней, причина которых лежит в изменённой активности или полном отсутствии какого-либо фермента; 2) энзимодиагностика – раздел науки, использующей эти вещества с целью диагностики; 3) энзимотерапия основана на применении энзимов и модуляторов (активаторов и ингибиторов) их действия в качестве лекарственных средств.