- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •Р е ц е н з е н т ы
- •К о л л е к т и в а в т о р о в
- •Оглавление
- •Введение
- •История открытия и разработка метода пцр
- •Механизм полимеразной цепной реакции
- •Праймеры
- •Полимераза
- •Пробоподготовка (выделение днк/рнк)
- •Амплификация
- •Факторы, влияющие на эффективность амплификации
- •Использование «горячего старта» при постановке пцр
- •Приборное обеспечение
- •Регистрация результатов
- •Возможности лабораторной диагностики инфекционных болезней
- •Преимущества пцр перед другими методами клинической лабораторной диагностики
- •Универсальность процедуры выявления различных возбудителей
- •Специфичность
- •Чувствительность
- •Актуальность ответа (быстрота получения результата анализа)
- •Возможность экспертизы
- •Исследуемый биологический материал
- •Локализация возбудителей
- •Правила забора материала и транспортировки клинического материала для пцр-диагностики
- •Кровь, плазма, сыворотка
- •Соскоб с эпителиальных клеток для выявления днк возбудителей инфекций, передающихся половым путем
- •Факторы, влияющие на эффективность выявления урогенитальных патогенных микроорганизмов с помощью нк
- •Правила подготовки больного для пцр-диагностики урогенитальных инфекций
- •Мазок с конъюнктивы, слизистой зева и дыхательных путей
- •Гепатит а (hаv), е (hеv)
- •Гепатит в (hвv)
- •Гепатит d (вгd)
- •Гепатит с (hcv)
- •Использование пцр в пульмонологии и фтизиатрии
- •Применение пцр в урогинекологической практике
- •Основные клинические синдромы и урогенитальные инфекции
- •Генитальный герпес вызывает вирусы простого герпеса I и II типов
- •Криминология
- •Установление отцовства
- •Персонализированная медицина
- •Клонирование генов
- •Онкология
- •Применение пцр в практике службы крови
- •Управление качеством пцр-исследований
- •Преаналитический этап
- •Аналитический этап
- •Контроль качества пцр-исследований
- •Контроль реакции амплификации
- •Внутренний контроль вко
- •Проблема контаминации
- •Действия при возникновении контаминации нуклеиновыми кислотами
- •Постаналитический этап
- •Заключение
- •Вопросы для самопроверки
- •Ответы на вопросы для самопроверки
- •Список литературы
- •Приложение
- •Возможности пцр-диагностики в гуз иоккдц
- •Комплекс исследований на заболевания,
- •Передающиеся половым путем (зппп), 2ж3001
- •Хламидиоз, 2ж3002
- •Туберкулез, 2жз003
- •Гепатит с, 2ж3004
- •Микоплазма гоминис, 2ж3005
- •Трихомониаз, 2ж3006
- •Гепатит в, 2ж3007
- •Уреаплазма, 2ж3009
- •Папиллома (впч с определением онкогенности), 2ж3010
- •Гонорея, 2ж3011
- •Гепатит с количественный, 2ж3012
- •Генотипирование вируса гепатита с, 2ж3013
- •Микоплазма гениталиум, 2ж3015
- •Цмв, 2ж3019
- •Вирус Эпштейна-Барр, 2ж3020
- •Вирус герпеса I-го и II-го типов, 2ж3021
- •Вирус герпеса 6-го типа, 2ж3022
- •Токсоплазмы гондии, 2ж3023
- •Энтеровирус, 2ж3027
- •Гепатит в количественный, 2ж3031
- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •664079, Г. Иркутск, м-н Юбилейный, 100, к. 302.
Заключение
В настоящее время ПЦР-анализ остается наиболее распространенной и динамично развивающейся диагностической технологией. Ежегодно стремительно увеличивается количество ПЦР-лабораторий, появляется множество новых тест-систем для ПЦР-анализа, предназначенных как для выявления нуклеотидных последовательностей различных микроорганизмов – возбудителей заболеваний, так и для исследования генов человека. При этом себестоимость ПЦР-анализа неуклонно снижается, что способствует более широкому использованию этого метода диагностики.
Перспективы ПЦР-диагностики лежат в автоматизации всех процедур и совершенствовании преаналитического этапа диагностики, а также развитии мультиплексного и микрочипового подходов.
ПЦР является самым чувствительным и специфичным методом прямого обнаружения возбудителей, позволяющим не только устанавливать этиологию заболевания, но и осуществлять контроль над течением инфекционного процесса и оценивать эффективность проводимой терапии. Учитывая все вышесказанное, становится очевидным, что полимеразная цепная реакция является необходимым и обязательным методом обследования пациентов и должна находиться в арсенале каждого врача, занимающегося инфекционной и наследственной патологиями.
Вопросы для самопроверки
Для закрепления изученного материала по разделу контроля качества рекомендуем ответить на вопросы. Правильные ответы приведены в конце вопросов.
1. Молекулярная биология изучает:
Протекание биологических процессов на молекулярном уровне.
Строение клетки.
Морфологическое и физиологическое многообразие бактерий и вирусов.
2. Нуклеотид – это мономер:
Белков.
Нуклеиновых кислот.
Жиров.
3. ДНК содержит:
Рибозу, остаток фосфорной кислоты, одно из четырех азотистых оснований: аденин, гуанин, цитозин, тимин.
Дезоксирибозу, остаток фосфорной кислоты, одно из четырех азотистых оснований: аденин, гуанин, цитозин, тимин.
Дезоксирибозу, остаток фосфорной кислоты, одно из четырех азотистых оснований: аденин, гуанин, цитозин, урацил.
4. Основания, расположенные комплементарно друг другу:
А – Т; Г – Ц.
А – Ц; Г – Т.
А – Г; Ц – Т.
5. Основной фермент репликации:
ДНК-полимераза.
Геликаза.
Лигаза.
6. К первичной структурной организации ДНК относится:
Трехмерная спираль.
Две комплементарные друг другу антипараллельные полинуклеотидные цепи.
Полинуклеотидная цепь.
7. РНК в ядре сосредоточено в:
Ядерной оболочке.
Ядрышке.
Нуклеоплазме.
8. При работе с контрольной сывороткой возможны погрешности:
Потеря вещества при открывании ампулы.
Несоблюдение времени растворения пробы.
Хранение контрольной сыворотки при комнатной температуре.
Многократное замораживание контрольной сыворотки.
9. Формы контроля качества:
Внутрилабораторный.
Межлабораторный.
Инспекционная проверка.
10. На результат исследований влияет:
Центрифугирование.
Пипетирование.
Осаждение.
Изменение температуры.
11. Принципы проведения внутрилабораторного контроля качества:
Систематичность и повседневность.
Включение положительных и отрицательных образцов.
Включение контроля в обычный ход работы.
12. Межлабораторный контроль качества дает возможность:
Сравнить качество работы нескольких лабораторий.
Аттестовать контрольные материалы.
Стандартизировать методы и условия исследования.
Оценить качество используемых методов и аппаратуры.
13. Цель внешнего контроля качества:
Учет состояния качества проведения отдельных методов исследования в лабораториях определенной территории.
Контроль состояния качества проведения методов исследования в отдельных лабораториях.
Проверка надежности внутреннего контроля качества в отдельных лабораториях.
Воспитательное воздействие на улучшение качества проведения методов исследования.
14. Качественным исследованием можно назвать исследование,
которое:
Получило положительную оценку при проверке вышестоящей организацией.
Назначено для нуждающегося в нем пациента.
Своевременно выполнено.
На достаточном аналитическом уровне.
Имеет информацию для интерпретации.
15. Ошибки чаще всего встречаются на следующем этапе лабораторного исследования:
Преаналитическом.
Аналитическом.
Постаналитическом.
16. В памятке по обследованию пациентов методом ПЦР может отсутствовать информация, касающаяся:
Показаний для назначения необходимых анализов.
Подготовка пациента к обследованию.
Правил взятия биологического материала.
Порядка маркировки пробы и заполнения направления.
Условий транспортировки проб в лабораторию и сроков их доставки.
Температурного режима и продолжительности хранения материала.
Регистрации направлений и материала.
Порядка сортировки проб в лаборатории.
Рекомендуемого лечения в случае обнаружения возбудителя.
17. У пациентки М., 25 лет, в гинекологическом мазке методом микроскопии обнаружен возбудитель Trichomonas vaginalis. После проведенного лечения сделано исследование методом ПЦР на трихомониаз и гонорею. Результат ПЦР исследования трихомониаз – отрицательный, гонорея – положительный. Наиболее вероятное объяснение:
В лаборатории перепутали мазки.
Больная в период лечения заразилась гонореей.
Больная была поражена двумя инфекциями, но наличие возбудитель трихомониаза в мазке маскировало присутствие Neisseria gonorrhoeae до проведения лечения.
18. У пациентки Ж., 35 лет, при обследовании перед ЭКО методом ПЦР в гинекологическом мазке обнаружена ДНК возбудителя хламидиоза Chlamydia trachomatis. У пациентки в анамнезе вылеченная 10 лет назад хламидийная инфекция. У мужа аналогичное ПЦР исследование дало отрицательный результат. Наиболее вероятное объяснение:
ПЦР является одним из наиболее чувствительных клинических методов, позволяющих детектировать единичные молекулы ДНК, в мазке обнаружена ДНК возбудителей, которые погибли в результате химиотерапии 10 лет назад.
У пациентки хроническая хламидийная инфекция.
В лаборатории перепутали мазки.
19. Больной П. проходит лечение по поводу вирусного гепатита С. Перед началом лечения в крови больного методом ПЦР определено количество РНК HCV в крови (вирусная нагрузка) которая составила 106 МЕ/мл. Через месяц после проведенного лечения аналогичное исследование показало 103 МЕ/мл. Интерпретация результата:
Лечение неэффективно.
Лечение эффективно.
Необходимо определить генотип вируса гепатита С.
20. Пациент И., 5 лет, проходит обследование как контактный по поводу вспышки энтеровирусной инфекции в детском дошкольном учреждении. При ПЦР - исследовании на энтеровирусную инфекцию мазка из зева и крови пациента, РНК энтеровируса обнаружена в мазке из зева, но не обнаружена в крови. Дальнейшая тактика обследования пациента:
Срочная госпитализация с проведением диагностической спинномозговой пункции с последующим ПЦР исследованием ликвора на энтеровирус.
Результат отрицательный, больной здоров.
У больного отсутствует вирусемия, необходимо амбулаторное наблюдение в течении инкубационного периода.
21. У пациентки Н. беременность 2 недели, выявлены IgM против краснухи в высоком титре. ПЦР - исследование крови на краснуху возбудителя не выявило. IgG против краснухи не выявлены. Интерпретация результата.
Перекрестная иммунологическая реакция с другим антигеном, поскольку ПЦР отрицательна, пациентка здорова
Признаки начала заболевания, необходимо повторное ПЦР - исследование через 2 недели для подтверждения заболевания.
При краснухе период вирусемии очень короток и к моменту появления иммуноглобулинов вирус в крови обычно не обнаруживается. Диагноз может быть подтвержден при повторном серологическом исследовании.