- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •Р е ц е н з е н т ы
- •К о л л е к т и в а в т о р о в
- •Оглавление
- •Введение
- •История открытия и разработка метода пцр
- •Механизм полимеразной цепной реакции
- •Праймеры
- •Полимераза
- •Пробоподготовка (выделение днк/рнк)
- •Амплификация
- •Факторы, влияющие на эффективность амплификации
- •Использование «горячего старта» при постановке пцр
- •Приборное обеспечение
- •Регистрация результатов
- •Возможности лабораторной диагностики инфекционных болезней
- •Преимущества пцр перед другими методами клинической лабораторной диагностики
- •Универсальность процедуры выявления различных возбудителей
- •Специфичность
- •Чувствительность
- •Актуальность ответа (быстрота получения результата анализа)
- •Возможность экспертизы
- •Исследуемый биологический материал
- •Локализация возбудителей
- •Правила забора материала и транспортировки клинического материала для пцр-диагностики
- •Кровь, плазма, сыворотка
- •Соскоб с эпителиальных клеток для выявления днк возбудителей инфекций, передающихся половым путем
- •Факторы, влияющие на эффективность выявления урогенитальных патогенных микроорганизмов с помощью нк
- •Правила подготовки больного для пцр-диагностики урогенитальных инфекций
- •Мазок с конъюнктивы, слизистой зева и дыхательных путей
- •Гепатит а (hаv), е (hеv)
- •Гепатит в (hвv)
- •Гепатит d (вгd)
- •Гепатит с (hcv)
- •Использование пцр в пульмонологии и фтизиатрии
- •Применение пцр в урогинекологической практике
- •Основные клинические синдромы и урогенитальные инфекции
- •Генитальный герпес вызывает вирусы простого герпеса I и II типов
- •Криминология
- •Установление отцовства
- •Персонализированная медицина
- •Клонирование генов
- •Онкология
- •Применение пцр в практике службы крови
- •Управление качеством пцр-исследований
- •Преаналитический этап
- •Аналитический этап
- •Контроль качества пцр-исследований
- •Контроль реакции амплификации
- •Внутренний контроль вко
- •Проблема контаминации
- •Действия при возникновении контаминации нуклеиновыми кислотами
- •Постаналитический этап
- •Заключение
- •Вопросы для самопроверки
- •Ответы на вопросы для самопроверки
- •Список литературы
- •Приложение
- •Возможности пцр-диагностики в гуз иоккдц
- •Комплекс исследований на заболевания,
- •Передающиеся половым путем (зппп), 2ж3001
- •Хламидиоз, 2ж3002
- •Туберкулез, 2жз003
- •Гепатит с, 2ж3004
- •Микоплазма гоминис, 2ж3005
- •Трихомониаз, 2ж3006
- •Гепатит в, 2ж3007
- •Уреаплазма, 2ж3009
- •Папиллома (впч с определением онкогенности), 2ж3010
- •Гонорея, 2ж3011
- •Гепатит с количественный, 2ж3012
- •Генотипирование вируса гепатита с, 2ж3013
- •Микоплазма гениталиум, 2ж3015
- •Цмв, 2ж3019
- •Вирус Эпштейна-Барр, 2ж3020
- •Вирус герпеса I-го и II-го типов, 2ж3021
- •Вирус герпеса 6-го типа, 2ж3022
- •Токсоплазмы гондии, 2ж3023
- •Энтеровирус, 2ж3027
- •Гепатит в количественный, 2ж3031
- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •664079, Г. Иркутск, м-н Юбилейный, 100, к. 302.
Преаналитический этап
Зарубежная практика показывает, что важнейшим условием успешного лабораторного обследования пациентов и снижения количества лабораторных ошибок является стандартизация деятельности лаборатории и, прежде всего, процедур преаналитического этапа. Стандартизация предполагает разработку инструкций по операциям, использование которых на всех этапах ПЦР-анализа позволяет свести к минимуму вероятность возникновения ошибок.
Разработка инструкций на преаналитическом этапе должна включать следующие разделы работы:
Показания для назначения врачом необходимых анализов.
Подготовка пациента к обследованию.
Взятие биологического материала в процедурном или смотровом кабинете (правильно выбранная стратегия забора материала обеспечивает эффективность ПЦР-диагностики).
Маркировка пробы и заполнение направления.
Условия транспортировки проб в лабораторию, сроки их доставки.
Температурный режим и продолжительность хранения материала.
Регистрацию направлений и материала.
Порядок сортировки проб в лаборатории.
Существуют два вида ошибок на преаналитическом этапе при проведении ПЦР-анализа, которые ведут к неправильной постановке диагноза: ложноположительные и ложноотрицательные.
Ложноположительные результаты на преаналитическом этапе (положительный результат при отсутствии возбудителя в пробе) возникают в случаях:
контаминации (загрязнения) как в отдельных пробах, так и во всех пробах (тотальная контаминация). Она возникает при использовании инструментария, пробирок, перчаток и др. материалов, загрязненных искомыми микроорганизмами, чужой ДНК или ее копиями через предметы и реагенты. В результате обнаруживается "несуществующая" инфекция. Для ее устранения следует использовать одноразовый инструментарий;
неправильной тактики обследования пациента. Выявление микроорганизмов, не имеющих диагностического значения, которые могут присутствовать у здорового человека. Например, Neisseria ssp. в норме может существовать в полости рта и на других слизистых. Для уреаплазм, гарднерелл и других возбудителей значение имеют их количественные характеристики.
Рис. 9. Формализованный бланк направления,
включающий анализы методом ПЦР.
Ложноотрицательные результаты на преаналитическом этапе (отрицательный результат при наличии возбудителя в пробе) возникают в случаях:
неинформированности медицинского персонала по правильности забора клинического материала. Взятие материала должен осуществлять квалифицированный специалист. Перед началом работы следует ознакомиться с «Методическими рекомендациями по взятию, транспортировке, хранению и пробоподготовке биологического материала для ПЦР-диагностики»;
неосмысленного выбора биологического материала для ПЦР-исследования. Например, ДНК некоторых возбудителей неинформативно выявлять в крови (Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorhoeae), осуществлять забор материала в период ремиссии (для инфекций, протекающих с периодами обострений и ремиссий) и т.д.;
загрязнения пробы примесями, ингибирующими ПЦР. Гепарин, продукты гемолиза эритроцитов и некоторые препараты для местного лечения способны ингибировать (тормозить) реакцию ПЦР. Поэтому забор материала должен проводиться до лечебных манипуляций;
разрушения ДНК во время неправильной транспортировки и хранения пробы. Например, цельную кровь нельзя замораживать;
взятия неинформативного мазка (недостаточное содержание в мазке эпителиальных клеток или содержание большого количества неинформативной слизи).
Использование лабораторной информационной системы (ЛИС) позволяет существенно уменьшить процент ошибок. Целесообразно автоматизировать процесс обработки направлений. Это можно сделать, формализовав направления и используя сканер для ввода информации в ЛИС. Немаловажную роль играет форма бланка-заявки на исследование, которая должна упрощать работу клиницистов, медсестер и лабораторных регистраторов. При регистрации в лаборатории правильно заполненная форма заявки считывается специальным сканером, и перечень назначенных врачом анализов автоматически переносится в лабораторную информационную систему, формируя заявку на исследования. На рисунке 9 представлена форма бланка ИОККДЦ, где для анализов методом ПЦР предусмотрены ячейки для заполнения (направляемый тип биологического материала).