- •II часть
- •1.Миниатюризация
- •1.1.Мотивация проведения исследований в области нт
- •1.2.Планы и стратегия развития
- •1.3.Границы изменения масштабов
- •1.4.Связь размеров структур с их функциональностью
- •1.4.1.Распределение атомов и связанные с этим свойства
- •1.4.2.Отношения величина - свойства
- •4 Связь размеров структур с их функциональностью
- •2.1.Введение
- •2.2.Биологические строительные блоки
- •2.2.1. Размеры строительных блоков и наноструктуры
- •2.2.2.Основные объекты нанобиотехнологии
- •2.2.3.Строительные блоки.Синтетические и биологические.
- •2.3.Принципы самосборки
- •2.3.1.Нековалентные взаимодействия
- •2.3.2.Межмолекулярная упаковка
- •2.3.3.Биологическая самосборка
- •2.4.1.Самосборка (Другой источник информации): Понятия и определения
- •2.4.2.Типы межмолекулярных взаимодействий
- •2.4.3.Измерение свойств веществ в наномировом масштабе.
- •3.Нанобиотехнология
- •3.1.Проблемы определения используемых понятий
- •3.2.Технологии типа от нано к био
- •3.3.Технологии типа от био к нано
- •3.4.Нанобиотехнология и молекулярные устройства
- •3.4.1.Общие вопросы
- •3.1. Основные направления развития биотехнологии
- •3.4.2. Молекулярные устройства.3.4.2.1. Общие вопросы
- •3.4.2.2.Молекулярные пинцеты
- •4.4.2.3.Ротаксаны и катенаны
- •4.4.2.4.Вращательное движение
- •4.4.2.5.Возвратно-поступательное движение
- •4.4.2.6.Схемы сборки путем нанизывания кольцевых молекулярных
- •4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
- •4.1. Состояние исследований и разработок
- •4.2. Цели, проблемы и решения
- •4.3. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •4.4. Достижения и новые парадигмы
- •4.4.1. Изучение особенностей биологических систем
- •4.4.2. Нанонаука и нанотехнология в процессах создания биологических тканей (тканевая инженерия)
- •4.4.3. Биологическое детектирование боевых отравляющих веществ
- •4.4.4. Флуоресцентные биологические метки на основе полупроводниковых нанокристаллов
- •4.5.5. Нанотехнология изготовления днк-чипов
- •4.5.Иомиметические нанотехнологии
- •4.5.1. Днк как строительный материал нанотехнологий
- •4.5.1.1. Направленная сборка с помощью днк
- •4.5.1.2. Днк как шаблон для молекулярной электроники
- •4.5.1.3. Моторы и наномашины на основе днк
- •4.5.2.1. Действие биологических моторов
- •4.5.2.2. Биологические моторы как часть синтетических систем
- •4.5.3. Искусственный фотосинтез
- •4.7. Использование наноустройств в космических исследованиях
- •5.2.1.Основные технические характеристики микроскопа "supra 60vp"
- •5.3. Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.3.1. Общие принципы сканирующей зондовой микроскопии
- •5.4.Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.5.Сканирующая туннельная микроскопия
- •5.7.Атомно-силовые измерения в биологических системах
- •6. Технология рекомбинантных днк
- •6.1.Векторы для Escherichia coli
- •6.2.Идентификация клонированных днк
- •6.3.Экспрессия эукариотических белков в е. Coli
- •6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
- •6.5.Получение инсулина на основе методов генетической инженерии
- •6.6.Синтез соматотропина
- •6.7.Получение интерферонов
- •6.8.Генная инженерия растений
- •6.8.1.Получение трансгенных растений
- •6.8.1.6.Применение методов генетической инженерии для улучшения аминокислотного состава запасных белков растений
- •6.8.1.7.Повышение эффективности процесса фотосинтеза
- •6.8.1.8.Генно-инженерные подходы к решению проблемы усвоения азота
- •6.8.1.9.Устойчивость растений к фитопатогенам
- •6.8.1.10.Устойчивость растений к гербицидам
- •6.8.1.11.Устойчивость растений к насекомым
- •6.8.1.12.Устойчивость растений к абиотическим стрессам
- •6.9.1.Типы питания микроорганизмов
- •6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
- •6.9.3.Питательные среды для культивирования микроорганизмов
- •6.9.4.Источники углерода
- •6.9.5.Источники азота
- •6.9.6.Источники витаминов, гормонов и микроэлементов
- •6.9.7.Биохимические и биофизические факторы роста
- •6.9.8.Конструирование питательных сред для выращивания микроорганизмов
- •6.9.9.Технология приготовления питательных сред
- •6.9.10.Пастеризация как вариант термической стерилизации
- •6.9.11.Стерилизация фильтрацией
- •6.9.12Особенности культивирования эукариотических клеток в качестве продуцентов.
- •10. Что такое паспорт культуры?
- •1. Каковы причины введения международных правил в фармацевтическую практику?
- •9. Экобиотехнология
- •9.1. Введение
- •9.2. Состояние исследований и разработок
- •9.3. Цели, проблемы и решения
- •9.4. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •9.5. Достижения и новые парадигмы
- •9.6.Биотехнология утилизации твердых отходов.
- •9.6.1. Биотехнология утилизации твердых отходов
- •9.6.2.Биотехнология очистки сточных вод
- •9.7.Биоэнергетика
- •9.8. Ксенобиотики и их биодеградация
6.9.1.Типы питания микроорганизмов
Потребности микроорганизмов для роста культуры
Рост микроорганизмов требует, как сказано выше, затрат энергии и строительного материала.
Энергию микроорганизмы получают из внешней среды в различных формах. Существуют микроорганизмы, способные воспринимать энергию в виде электромагнитного излучения -света, преобразуя его в энергию возбужденных молекул. Энергия возбужденных молекул преобразуется далее в ходе биохимических процессов в «энергетические запасы длительного хранения» - макроэргические соединения, наиболее распространенным из которых является АТФ. Такого рода процессы происходят в фотосинтезирующих организмах, которые способны обеспечивать себя всеми строительными материалами, исходя из углекислого газа, воды и минеральных солей. Среди микроорганизмов способностью к фотосинтезу обладают цианобактерии, пурпурные бактерии и зеленые бактерии. Другим путем использования «внешней» энергии являются окислительно-восстановительные реакции с участием неорганических соединений из окружающей среды (соединения серы, азота и т. п.). Далее эта энергия также запасается в виде макроэргических соединений и используется в биосинтетических процессах - так называемый хемосинтез. Этот тип питания называют автотрофным, а сами микроорганизмы - автотрофами (фотоавтотрофами или хемоавтотрофами).
Второй путь удовлетворения потребностей в энергии -окисление различных органических и неорганических соединений в процессе метаболизма. При этом в микробной клетке осуществляются химические реакции, приводящие как к накоплению вещества, так и к продукции энергии. В этом случае для роста культуры, помимо воды и минеральных солей, необходимы более сложные, чем углекислый газ, вещества. Такие микроорганизмы называют гетеротрофами. Если это какое-либо простое соединение углерода (например, глюкоза), то такие микроорганизмы называют прототрофами. Часто встречаются, однако, микроорганизмы, требующие для роста более сложные органические соединения, содержащие азот, серу и некоторые другие элементы. Это означает, что такие микроорганизмы не способны использовать минеральные соединения этих элементов. Такие микроорганизмы называют ауксотрофсти. При целенаправленном конструировании продуцентов ауксотрофные штаммы используются специально, чтобы иметь возможность управления ростом культуры.
Среди наиболее распространенных микроорганизмов наиболее часто встречаются гетеротрофы. По этой причине наиболее часто используемые в биотехнологии продуценты относятся к этой же группе микроорганизмов; обычно это прототрофы либо специально отселектированные или сконструированные ауксотрофы.
6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
Производство энергии сводится к производству макроэргических связей АТФ. Энергия для их образования поставляется либо в процессе дыхания, либо в процессе брожения.
Дыхание - метаболический процесс с образованием АТФ, включающий окислительно-восстановительные реакции. При этом в качестве донора электронов выступают либо органические, либо неорганические соединения, а конечным акцептором лектронов обязательно является неорганическое соединение. Обычно конечным акцептором электронов служит молекулярный кислород - аэробное дыхание. У некоторых бактерий в качестве терминального акцептора электронов выступают другие соединения: сульфаты, нитраты, карбонаты. В этом случае говорят об анаэробном дыхании.
Весь процесс дыхания начинается с использования энергии подвижного электрона. В случае фотосинтеза - это электроны, переходящие в возбужденное состояние за счет поглощения кванта света специальными органическими соединениями, содержащими сопряженные системы. Переведенный на возбужденную орбиталь электрон далее передается в цепь переноса электронов и вовлекается в образование восстановленных форм никотинамидных коферментов и далее в непосредственное участие в биохимических превращениях в клетке, приводящих к образованию макроэргических соединений. В случае хемосинтеза в подобных же превращениях участвуют подвижные электроны элементов с переменной валентностью.
Многие микроорганизмы, осуществляющие аэробное дыхание, являются строгими аэробами, т. е. не могут жить без кислорода.
Существуют и строгие анаэробы, для которых кислород губителен. К таковым, в частности, относятся бактерии, использующие в качестве акцепторов электронов сульфат и карбонат.
Довольно широко распространены микроорганизмы, способные существовать как в присутствии кислорода, так и в его отсутствии. Их называют факультативные анаэробы.
Другим способом производства АТФ является брожение. Это метаболический процесс, при котором как донорами, так и акцепторами электронов служат органические соединения. При этом доноры электронов окисляются, акцепторы восстанавливаются. Таким образом, в процессе брожения происходит строго сбалансированное перераспределение электронов между органическими соединениями - без отвода электронов во внешнюю среду. Этот строгий баланс представляет собой главное различие между дыхательным и бродильным типами метаболизма. Пример - спиртовое брожение глюкозы, в ходе которого образуются два моля АТФ на один моль глюкозы:
В случае дыхания синтез АТФ осуществляется путем как окислительного, так и субстратного фосфорилирования, при брожении единственный путь синтеза АТФ - субстратное фосфорилирование.
Известные к настоящему времени типы метаболизма микроорганизмов приведены в табл. 6.2.
Разнообразие метаболических типов микроорганизмов заслуживает серьезного внимания, поскольку дает возможность выбирать продуценты, образующие ценные для практического использования метаболиты в качестве продуктов. В то же время, учитывая определенные взаимоотношения микроорганизмов при совместном обитании, знание особенностей метаболизма каждого из участников такого сообщества позволяет ставить задачи конструирования микробного сообщества, обеспечивающего получение продукта, который является именно продуктом совместного метаболизма различных видов микроорганизмов и не может быть получен каким-либо из этих видов в монокультуре.
Исследования подобной направленности публикуются в последнее десятилетие все чаще и объединяются общим направлением, получившим название «метаболическая инженерия».
Основные типы метаболизма у микроорганизмов Таблица 6.2.
В табл. 6.3 представлены основные типы продуктов, получаемые путем брожения. Видно, что использование технологии, основанной на брожении, позволяет получать большую группу продуктов микробиологическим синтезом
Органотрофы - микроорганизмы, использующие в качестве источника углерода органические соединения; фотороганотрофы -микроорганизмы, сочетающие фототрофный и органотрофный типы метаболизма; хемоорганотрофы сочетают органотрофный и хемотрофный типы метаболизма. Метаногенез известен только у бактерий и представляет собой весьма сложный и во многом до конца не изученный тип метаболизма, хотя и достаточно широко распространенный в природе.
Метаногенез известен только у бактерий и представляет собой весьма сложный и во многом до конца не изученный тип метаболизма, хотя и достаточно широко распространенный в природе.
из углеводов, включая такие, как многие органические кислоты, спирты и органические растворители.
Контрольные вопросы и задания к главе
1. Охарактеризуйте основные сферы обитания микроорганизмов в природе.
2. Опишите принципы построения современной таксономии живых организмов.
3. Охарактеризуйте основные виды взаимоотношений между разными видами микроорганизмов в природных сообществах.
4. Объясните основные особенности метаболизма микроорганизмов.
5. Укажите различия между дыханием и брожением.
6. Укажите основные продукты различных типов брожения.
7. Опишите различные типы энергетического обмена микроорганизмов.
