- •II часть
- •1.Миниатюризация
- •1.1.Мотивация проведения исследований в области нт
- •1.2.Планы и стратегия развития
- •1.3.Границы изменения масштабов
- •1.4.Связь размеров структур с их функциональностью
- •1.4.1.Распределение атомов и связанные с этим свойства
- •1.4.2.Отношения величина - свойства
- •4 Связь размеров структур с их функциональностью
- •2.1.Введение
- •2.2.Биологические строительные блоки
- •2.2.1. Размеры строительных блоков и наноструктуры
- •2.2.2.Основные объекты нанобиотехнологии
- •2.2.3.Строительные блоки.Синтетические и биологические.
- •2.3.Принципы самосборки
- •2.3.1.Нековалентные взаимодействия
- •2.3.2.Межмолекулярная упаковка
- •2.3.3.Биологическая самосборка
- •2.4.1.Самосборка (Другой источник информации): Понятия и определения
- •2.4.2.Типы межмолекулярных взаимодействий
- •2.4.3.Измерение свойств веществ в наномировом масштабе.
- •3.Нанобиотехнология
- •3.1.Проблемы определения используемых понятий
- •3.2.Технологии типа от нано к био
- •3.3.Технологии типа от био к нано
- •3.4.Нанобиотехнология и молекулярные устройства
- •3.4.1.Общие вопросы
- •3.1. Основные направления развития биотехнологии
- •3.4.2. Молекулярные устройства.3.4.2.1. Общие вопросы
- •3.4.2.2.Молекулярные пинцеты
- •4.4.2.3.Ротаксаны и катенаны
- •4.4.2.4.Вращательное движение
- •4.4.2.5.Возвратно-поступательное движение
- •4.4.2.6.Схемы сборки путем нанизывания кольцевых молекулярных
- •4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
- •4.1. Состояние исследований и разработок
- •4.2. Цели, проблемы и решения
- •4.3. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •4.4. Достижения и новые парадигмы
- •4.4.1. Изучение особенностей биологических систем
- •4.4.2. Нанонаука и нанотехнология в процессах создания биологических тканей (тканевая инженерия)
- •4.4.3. Биологическое детектирование боевых отравляющих веществ
- •4.4.4. Флуоресцентные биологические метки на основе полупроводниковых нанокристаллов
- •4.5.5. Нанотехнология изготовления днк-чипов
- •4.5.Иомиметические нанотехнологии
- •4.5.1. Днк как строительный материал нанотехнологий
- •4.5.1.1. Направленная сборка с помощью днк
- •4.5.1.2. Днк как шаблон для молекулярной электроники
- •4.5.1.3. Моторы и наномашины на основе днк
- •4.5.2.1. Действие биологических моторов
- •4.5.2.2. Биологические моторы как часть синтетических систем
- •4.5.3. Искусственный фотосинтез
- •4.7. Использование наноустройств в космических исследованиях
- •5.2.1.Основные технические характеристики микроскопа "supra 60vp"
- •5.3. Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.3.1. Общие принципы сканирующей зондовой микроскопии
- •5.4.Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.5.Сканирующая туннельная микроскопия
- •5.7.Атомно-силовые измерения в биологических системах
- •6. Технология рекомбинантных днк
- •6.1.Векторы для Escherichia coli
- •6.2.Идентификация клонированных днк
- •6.3.Экспрессия эукариотических белков в е. Coli
- •6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
- •6.5.Получение инсулина на основе методов генетической инженерии
- •6.6.Синтез соматотропина
- •6.7.Получение интерферонов
- •6.8.Генная инженерия растений
- •6.8.1.Получение трансгенных растений
- •6.8.1.6.Применение методов генетической инженерии для улучшения аминокислотного состава запасных белков растений
- •6.8.1.7.Повышение эффективности процесса фотосинтеза
- •6.8.1.8.Генно-инженерные подходы к решению проблемы усвоения азота
- •6.8.1.9.Устойчивость растений к фитопатогенам
- •6.8.1.10.Устойчивость растений к гербицидам
- •6.8.1.11.Устойчивость растений к насекомым
- •6.8.1.12.Устойчивость растений к абиотическим стрессам
- •6.9.1.Типы питания микроорганизмов
- •6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
- •6.9.3.Питательные среды для культивирования микроорганизмов
- •6.9.4.Источники углерода
- •6.9.5.Источники азота
- •6.9.6.Источники витаминов, гормонов и микроэлементов
- •6.9.7.Биохимические и биофизические факторы роста
- •6.9.8.Конструирование питательных сред для выращивания микроорганизмов
- •6.9.9.Технология приготовления питательных сред
- •6.9.10.Пастеризация как вариант термической стерилизации
- •6.9.11.Стерилизация фильтрацией
- •6.9.12Особенности культивирования эукариотических клеток в качестве продуцентов.
- •10. Что такое паспорт культуры?
- •1. Каковы причины введения международных правил в фармацевтическую практику?
- •9. Экобиотехнология
- •9.1. Введение
- •9.2. Состояние исследований и разработок
- •9.3. Цели, проблемы и решения
- •9.4. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •9.5. Достижения и новые парадигмы
- •9.6.Биотехнология утилизации твердых отходов.
- •9.6.1. Биотехнология утилизации твердых отходов
- •9.6.2.Биотехнология очистки сточных вод
- •9.7.Биоэнергетика
- •9.8. Ксенобиотики и их биодеградация
4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
ВВЕДЕНИЕ
Нанотехнология позволяет ученым, инженерам и медикам перейти к крупномасштабным исследованиям в области биологии и здравоохранения на клеточном и молекулярном уровне. В 21 в. эти исследования приведут к новым биотехнологическим производственным процессам, а также к принципиальным изменениям в методах медицины.
4.1. Состояние исследований и разработок
Благодаря развитию сканирующей микроскопии и аналитических методов оптического сканирования в последние годы ученым удалось наблюдать химические процессы и микроскопические структуры в биологических системах с недостижимым ранее разрешением. Новейшие аналитические методы дают возможность детально изучать микроскопическое строение живых клеток и химических процессов на молекулярном уровне. Например, АСМ позволяет выявлять направление и величину очень слабых молекулярных сил, определяющих связи рецептор-лиганд на поверхности клеток. Микроскопические электронные зонды позволяют измерять параметры ионного обмена клетки с окружением или величину электрического тока в нервных волокнах. Новейшие высокоразрешающие оптические приборы в сочетании с флуоресцентными светоизлучающими зондами, обладающими химической селективностью, позволяют изучать химические процессы на поверхности и внутри живой клетки. Такая аналитическая аппаратура дает возможность исследовать биохимические процессы и взаимодействия клеток внутри организма.
Биологические клетки содержат внутри себя естественные «молекулярные двигатели» совершенной конструкции. Примером таких природных нанома-шин является Fl-АТФаза, представляющая собой часть значительно более крупного, встроенного в мембрану комплекса, обеспечивающего синтез АТФазы в митохондриях (рис. 4.1). Размеры данной структуры не превышают 10 нм, и она представляет собой весьма надежный и функционально совершенный двигатель, работа которого обеспечивается естественными биохими-
Рис.4.1. Молекулярный протеиновый двитгатель F1-ATФаза. На рисунке из журнала Science показано активное волокно, прикрипленное к ротору двигателя.Вращение волокна,создаваемое протеиновым двигателем,позволяет наблюдать в микроскопе его работу.
ческими процессами. В 1998 г. премия Амершама по биотехнологии и фармакологии была вручена молодому японскому исследователю Хироюки Нодзи, которому удалось экспериментально продемонстрировать работу этого молекулярного двигателя, присоединив к нему длинное молекулярное актиновое волокно и проследив его вращение в оптическом микроскопе. Детальное исследование строения и функционирования этого протеинового двигателя (и аналогичных ему молекулярных биосистем) имеет огромную научную и практическую ценность .
В последние несколько лет ученые разработали технологию быстрого картирования генетической информации в молекулах ДНК и РНК, включая определение мутаций и уровней экспрессии. В этой технологии используется матрица микрочипов ДНК, что имеет сходство с литографической технологией формирования рисунка при промышленном производстве интегральных схем.
В настоящее время технологии такого типа приобретают коммерческое значение и находят применение в биотехнологических исследованиях и производственных процессах. Разработка новых типов химических матриц позволит расширить возможности таких технологий и применить их, например, в биологических устройствах обработки информации или для анализа белков и других биомолекул. Миниатюризация устройств на основе родственных аналитических процессов, в частности электрофореза, повышает эффективность таких технологий и снижает стоимость многих важных аналитических методик, например секвенирования ДНК или создания фингерпринтов (пептидных карт). В качестве примера можно привести исследование [2], которое имело целью заменить утомительный, медленный и дорогой метод секвенирования ДНК в гелевых пластинах на анализ с использованием миниатюрных интегральных систем (рис. 4.2).
Рис.4.2.Фотомозаика чипа для фракционирования ДНК. Изображение составлено
Используя биологические системы в качестве образца, ученые пытаются создать путем самосборки еще более сложные системы. Самосборка становится необходимым условием во многих процессах, поскольку уменьшение размеров компонентов делает манипулирование ими слишком медленным для практических целей. Сложные биологические системы можно рассматривать как модели, по которым создаются отдельные компоненты, объединяемые в дальнейшем единственным возможным способом в требуемую трехмерную нано-структурную систему. Для создания новых материалов можно воспользоваться знаниями, полученными при исследовании биологических систем. Например, изучив молекулярную структуру паутины (которая является одним из самых прочных материалов, известных в настоящее время), можно использовать полученные данные для конструирования новых композитных полимерных материалов, обладающих повышенной прочностью.
Наночастицы, диаметр которых намного меньше 1 мкм, были использованы для разработки эффективных методов доставки лекарственных препаратов и генов внутрь клеток. Дело в том, что многие ценные лекарственные препараты нерастворимы в воде и часто с трудом проникают внутрь клеток. Однако такие соединения можно связать с наночастицами указанных размеров. Частицы-носители движутся в кровотоке, почти не создавая опасности за-
Рис.4.3.устройство называемое <<генным ружьем>> с помощью которого нано-
упорки капилляров и других мелких кровеносных сосудов (что обычно происходит при введении в кровь нерастворимых порошков). Метод позволяет существенно повысить эффективность и скорость воздействия лекарственных препаратов на ткани человеческого организма. Аналогично, наночастицы, переносящие на себе фрагменты ДНК, могут использоваться для введения специфических генов в намеченные клетки организма (рис. 4.3).
Способность макромолекул ДНК к регулируемой и высокоорганизованной сборке делает их идеальным материалом для нанотехнологий. Например, молекулы ДНК применялись для конструирования матриц, которые путем самосборки легко превращаются в запланированные двухмерные структуры. Эти матрицы состоят из жестких пластинок ДНК (площадью около 60 нм2), образованных антипараллельными цепями ДНК, которые соединены двойными перекрестными связями, аналогичными тем, которые наблюдаются при редукционном делении клеток (мейозе). Точную форму и периодичность расположения пластинок можно модифицировать, изменяя последовательность азотистых оснований ДНК, что позволяет формировать специфические решетки с наноразмерными программируемыми структурами. Такой подход в будущем может привести к использованию сконструированных ДНК-кристаллов в качестве основы для кристаллизации макромолекул, для создания новых катализаторов и молекулярных сит, для сборки молекулярных электронных схем или биочипов будущих ДНК-компьютеров. Аналогично, субстраты и подложки из биомолекул могут применяться для исследования уникальных структурных особенностей РНК и полипептидных цепочек или при проведении высокоспецифичных реакций между нуклеиновыми кислотами и белками.
Устройства, которые используются сейчас для регулирования взаимодействия ДНК на поверхностях, могут найти применение для управления процессами самосборки. В этих устройствах электрические поля используются для установки частиц в определенных позициях (или их смещения с этих позиций) на
поверхности. Такой же подход может использоваться и для точной установки заряженных биологических молекул (ДНК, РНК, белки), клеток и других на-норазмерных или микроскопических заряженных частиц.
