
- •II часть
- •1.Миниатюризация
- •1.1.Мотивация проведения исследований в области нт
- •1.2.Планы и стратегия развития
- •1.3.Границы изменения масштабов
- •1.4.Связь размеров структур с их функциональностью
- •1.4.1.Распределение атомов и связанные с этим свойства
- •1.4.2.Отношения величина - свойства
- •4 Связь размеров структур с их функциональностью
- •2.1.Введение
- •2.2.Биологические строительные блоки
- •2.2.1. Размеры строительных блоков и наноструктуры
- •2.2.2.Основные объекты нанобиотехнологии
- •2.2.3.Строительные блоки.Синтетические и биологические.
- •2.3.Принципы самосборки
- •2.3.1.Нековалентные взаимодействия
- •2.3.2.Межмолекулярная упаковка
- •2.3.3.Биологическая самосборка
- •2.4.1.Самосборка (Другой источник информации): Понятия и определения
- •2.4.2.Типы межмолекулярных взаимодействий
- •2.4.3.Измерение свойств веществ в наномировом масштабе.
- •3.Нанобиотехнология
- •3.1.Проблемы определения используемых понятий
- •3.2.Технологии типа от нано к био
- •3.3.Технологии типа от био к нано
- •3.4.Нанобиотехнология и молекулярные устройства
- •3.4.1.Общие вопросы
- •3.1. Основные направления развития биотехнологии
- •3.4.2. Молекулярные устройства.3.4.2.1. Общие вопросы
- •3.4.2.2.Молекулярные пинцеты
- •4.4.2.3.Ротаксаны и катенаны
- •4.4.2.4.Вращательное движение
- •4.4.2.5.Возвратно-поступательное движение
- •4.4.2.6.Схемы сборки путем нанизывания кольцевых молекулярных
- •4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
- •4.1. Состояние исследований и разработок
- •4.2. Цели, проблемы и решения
- •4.3. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •4.4. Достижения и новые парадигмы
- •4.4.1. Изучение особенностей биологических систем
- •4.4.2. Нанонаука и нанотехнология в процессах создания биологических тканей (тканевая инженерия)
- •4.4.3. Биологическое детектирование боевых отравляющих веществ
- •4.4.4. Флуоресцентные биологические метки на основе полупроводниковых нанокристаллов
- •4.5.5. Нанотехнология изготовления днк-чипов
- •4.5.Иомиметические нанотехнологии
- •4.5.1. Днк как строительный материал нанотехнологий
- •4.5.1.1. Направленная сборка с помощью днк
- •4.5.1.2. Днк как шаблон для молекулярной электроники
- •4.5.1.3. Моторы и наномашины на основе днк
- •4.5.2.1. Действие биологических моторов
- •4.5.2.2. Биологические моторы как часть синтетических систем
- •4.5.3. Искусственный фотосинтез
- •4.7. Использование наноустройств в космических исследованиях
- •5.2.1.Основные технические характеристики микроскопа "supra 60vp"
- •5.3. Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.3.1. Общие принципы сканирующей зондовой микроскопии
- •5.4.Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.5.Сканирующая туннельная микроскопия
- •5.7.Атомно-силовые измерения в биологических системах
- •6. Технология рекомбинантных днк
- •6.1.Векторы для Escherichia coli
- •6.2.Идентификация клонированных днк
- •6.3.Экспрессия эукариотических белков в е. Coli
- •6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
- •6.5.Получение инсулина на основе методов генетической инженерии
- •6.6.Синтез соматотропина
- •6.7.Получение интерферонов
- •6.8.Генная инженерия растений
- •6.8.1.Получение трансгенных растений
- •6.8.1.6.Применение методов генетической инженерии для улучшения аминокислотного состава запасных белков растений
- •6.8.1.7.Повышение эффективности процесса фотосинтеза
- •6.8.1.8.Генно-инженерные подходы к решению проблемы усвоения азота
- •6.8.1.9.Устойчивость растений к фитопатогенам
- •6.8.1.10.Устойчивость растений к гербицидам
- •6.8.1.11.Устойчивость растений к насекомым
- •6.8.1.12.Устойчивость растений к абиотическим стрессам
- •6.9.1.Типы питания микроорганизмов
- •6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
- •6.9.3.Питательные среды для культивирования микроорганизмов
- •6.9.4.Источники углерода
- •6.9.5.Источники азота
- •6.9.6.Источники витаминов, гормонов и микроэлементов
- •6.9.7.Биохимические и биофизические факторы роста
- •6.9.8.Конструирование питательных сред для выращивания микроорганизмов
- •6.9.9.Технология приготовления питательных сред
- •6.9.10.Пастеризация как вариант термической стерилизации
- •6.9.11.Стерилизация фильтрацией
- •6.9.12Особенности культивирования эукариотических клеток в качестве продуцентов.
- •10. Что такое паспорт культуры?
- •1. Каковы причины введения международных правил в фармацевтическую практику?
- •9. Экобиотехнология
- •9.1. Введение
- •9.2. Состояние исследований и разработок
- •9.3. Цели, проблемы и решения
- •9.4. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •9.5. Достижения и новые парадигмы
- •9.6.Биотехнология утилизации твердых отходов.
- •9.6.1. Биотехнология утилизации твердых отходов
- •9.6.2.Биотехнология очистки сточных вод
- •9.7.Биоэнергетика
- •9.8. Ксенобиотики и их биодеградация
4.5.2.1. Действие биологических моторов
Благодаря экспериментам на одной молекуле (см. подразд. 8.1.2) и детальным структурным исследованиям методами рентгеновской дифракции и электронной микроскопии высокого разрешения, в настоящее время начали проясняться подробности того, как работают биологические моторы. Прекрасный обзор линейных моторных систем на основе миозина и кинезина представили Вейл и Миллиган (см. библиографию к гл. 9).
В линейных моторах существует два основных элемента. Это каталитический центр, к которому присоединяется запас энергии в виде молекулы АТФ, и липкая головка, которая обратимым образом прикрепляет моторный белок к линейному треку, вдоль которого он двигается. В случае миозина в роли трека выступает актиновое волокно, а в случае кинезина — микротрубочки. Цикл миозинового мотора начинается с того, что одна молекула АТФ занимает каталитический центр. В этот момент связь между миозином и актиновым волокном слаба, иными словами миозиновая липкая головка отсоединена от своего трека. На следующей стадии происходит гидролиз АТФ до АДФ и фосфатной группы. В процессе гидролиза миозиновая головка соединяется с актиновым волокном. Покидание фосфатной группой каталитического центра вызывает существенные конформационные изменения молекулы миозина. Сила, вырабатываемая в результате этих изменений, обеспечивает рабочий ход мотора. Вслед за этим происходит диссоциация молекулы АДФ, после которой каталитический центр освобождается для следующей молекулы АТФ, миозин отсое-. диняется от актинового волокна, а цикл начинается снова.
Такая же связь конформационных изменений и химической реакции лежит в основе действия поворотных моторов. Самым маленьким, но при этом и самым важным поворотным мотором является фермент АТФ-синтаза. Неотъемлемая черта всего живого состоит в том, что оно использует энергию, запасенную в градиенте концентрации ионов водорода, для синтеза энергосо-держащей молекулы адензинтрифостфата (АТФ) из аденозиндифосфата (АДФ) и фосфат-иона, в процессе которого генерируется вращательное движение. Эта машина может быть запущена и в обратную сторону: АТФ будет выступать в роли топлива для насоса, который перекачивает ионы водорода обратно через мембрану, создавая градиент их концентрации. Этот сложный ансамбль белков состоит из двух главных частей. Насос ионов водорода F0, расположенный в мембране, включает в себя канал, через который могут двигаться протоны. Модуль Fv синтезирующий или гидролизующий АТФ, состоит из шести субъединиц, соединенных с модулем FQ жесткими стержнями. В середине между шестью субъединицами модуля F0 располагается поворотный вал. Если АТФ-синтаза работает как насос, конформационные изменения, происходящие в шести субъединицах Fl под действием реакции гидролиза АТФ, вызывают поворот этого вала. Поворот той части, которая пронизывает модуль F0, перекачивает ионы водорода по ионному каналу. И наоборот, если машина синтезирует АТФ, именно движение ионов водорода по ионному каналу приводит к повороту вала.
Производительность АТФ-синтазы потрясающе высокая. При работе в режиме насоса каждая присоединенная молекула АТФ поворачивает вал на 120°. Энергия гидролиза АТФ превращается в энергию деформации, равную примерно 24кБТ, которая превращается в механическую работу с высокой эффективностью, что позволяет мотору развивать вращающий момент до 45 пН/нм. Высокая эффективность является самой важной чертой биологических моторов. Они не являются тепловыми двигателями, поэтому их работа не ограничена известной нам из классической термодинамики теоремой Карно. Они не борются с броуновским движением и конформационными изменениями макромолекул, а используют их для достижения чрезвычайно высокой производительности. При этом эволюция отточила конструкции этих моторов, которым приходится работать в диссипативном окружении почти до совершенства.