- •Предисловие
- •Глава 1. Введение в обмен углеводов
- •1.1 Общая характеристика обмена углеводов
- •1.2 Классификация и структура углеводов
- •Б Полисахариды
- •1.3 Переваривание углеводов пищи
- •А Переваривание углеводов в ротовой полости
- •В Пристеночное пищеварение или гидролиз олиго- и дисахаридазами
- •1.4 Всасывание и транспорт углеводов
- •А Na+-зависимые транспортеры глюкозы
- •Б Na+-независимые транспортеры глюкозы
- •1.5 Пути использования глюкозы в клетках
- •1.6 Гликолиз
- •Б Схема гликолиза
- •1.7 Реакции гликолиза
- •Г Реакция 2
- •Е Реакция 4
- •Ж Реакция 5
- •И Реакция 7
- •К Реакция 8
- •Л Реакция 9
- •М Реакция 10
- •Н Реакция 11
- •1.8 Энергетический баланс гликолиза
- •А Аэробный гликолиз
- •Б Анаэробный гликолиз
- •1.9 Регуляция гликолиза
- •Б Гормональная регуляция
- •1.10 Пути использования пирувата в клетках
- •1.11 Эффекты Пастера и Кребтри
- •Б Эффект Кребтри
- •1.12 Вовлечение других углеводов в гликолиз
- •А Фруктоза
- •Мышцы
- •Печень
- •Б Галактоза
- •В Манноза
- •Термины
- •Вопросы к семинарскому занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Переваривание, абсорбция и транспорт углеводов
- • Гликолиз
- • Метаболизм глюкозы в других клетках и тканях
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 2. Глюконеогенез
- •2.1 Общая характеристика глюконеогенеза
- •2.2 Субстраты глюконеогенеза
- •А Пируват и лактат
- •Б Глюкогенные аминокислоты
- •В Глицерол
- •Г Жирные кислоты
- •2.3 Реакции глюконеогенеза
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакции 3-8
- •Реакция 9
- •Реакция 10
- •Реакция 11
- •В Общая схема глюконеогенеза
- •2.4 Энергетический баланс глюконеогенеза
- •2.5 Биохимический смысл глюконеогенеза и его регуляция
- •Б Механизмы регуляции
- •Аллостерическая регуляция
- •Гормональная регуляция
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Глюконеогенез
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 3. Обмен гликогена
- •3.1 Общая характеристика
- •3.2 Структура и функции гликогена
- •Б Структура гликогена
- •3.3 Синтез гликогена (гликогеногенез)
- •В Синтез УДФ-глюкозы
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Г Синтез праймера
- •Д Элонгация цепей гликогена
- •Реакция 4
- •Е Образование ветвей
- •3.4 Распад гликогена (гликогенолиз)
- •Б Уравнения реакций
- •В Укорочение цепей гликогена
- •Реакция 1а
- •Г Отщепление ветвей
- •Реакция 1б
- •Е Расщепление гликогена в лизосомах
- •3.5 Регуляция обмена гликогена
- •А Аллостерическая регуляция
- •Гликогенфосфорилаза
- •Гликогенсинтаза
- •Глюкагон и адреналин
- •Инсулин
- •Ca2+-зависимая регуляция обмена гликогена
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Метаболизм гликогена
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 4. Цикл трикарбоновых кислот
- •4.1 Общая характеристика
- •4.2 Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •А Строение пируватдегидрогеназного комплекса
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •4.3 Цикл трикарбоновых кислот
- •Б Схема цикла трикарбоновых кислот
- •Г Реакции ЦТК
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •Реакция 6
- •Реакция 7
- •Реакция 8
- •Д Энергетический баланс ЦТК
- •4.4 Регуляция ЦТК и окислительного декарбоксилирования пирувата
- •Регуляция с помощью количества субстрата
- •Ингибирование метаболитами цикла
- •4.5 Амфиболическая роль ЦТК
- •Б Анаплеротические реакции
- •Пируваткарбоксилаза
- •Малик-фермент
- •Фосфоенолпируваткарбоксикиназа
- •Реакции катаболизма аминокислот
- •Реакции катаболизма жирных кислот
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Окислительное декарбоксилирование пирувата (ОДП)
- • Цикл трикарбоновых кислот (ЦТК)
- • Анаплеротические пути
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 5. Пентозофосфатный путь
- •5.1 Общая характеристика
- •5.2 Реакции пентозофосфатного пути
- •А Схема пентозофосфатного пути
- •В Окислительная фаза
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Г Неокислительная фаза
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •Реакция 6
- •Реакция 7
- •Реакция 8
- •5.3 Сценарии и регуляция пентозофосфатного пути
- •Б Сценарии пентозофосфатного пути
- •В Ксилулозо-5-фосфат как регуляторная молекула
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Пентозофосфатный путь
- • Путь уроновых кислот
- •Вопросы для самопроверки
- •Рекомендуемая литература
Цикл трикарбоновых кислот 67
ВУравнения реакций
1.Ацетил-КоА + Оксалоацетат + H2O Цитрат + КоА
2.Цитрат Изоцитрат
3.Изоцитрат + NAD+ α-Кетоглутарат + NADH + CO2 + H+
4.α-Кетоглутарат + NAD+ + КоА Сукцинил-КоА + NADH + CO2 + H+
5.Сукцинил-КоА + ГДФ + Фн Сукцинат + ГТФ + КоА
6.Сукцинат + FAD Фумарат + FADH2
7.Фумарат + H2O L-Малат
8.L-Малат + NAD+ Оксалоацетат + NADH
Суммарное уравнение ЦТК:
3 NAD+ + FAD + ГДФ + Фн + Ацетил-КоА
3 NADH + FADH2 + ГТФ + КоА + 2 CO2
Г Реакции ЦТК
Реакция 1
Субстрат: оксалоацетат и ацетил-КоА |
|
Продукт: цитрат |
|
|
|
Фермент: цитратсинтаза |
|
Кофактор: — |
|
|
|
Аллостерические ингибиторы: |
|
|
NADH, АТФ, сукцинил-КоА, цитрат, ацетил-КоА |
|
|
|
|
|
Впервой реакции ЦТК цитратсинтаза катализирует конденсацию ацетил-КоА
иоксалоацетата с образованием цитрата и свободного кофермента А. Реакция происходит по последовательному упорядоченному механизму: оксалоацетат всегда связывается с ферментом первым. Ацетил-КоА связывается вторым по порядку.
Цитрат — первая из двух трикарбоновых кислот, образующихся в цикле.
68 |
Глава 4 |
Цикл трикарбоновых кислот |
|
Реакция 2 |
|
Субстрат: цитрат |
Продукт: изоцитрат |
|
|
Фермент: аконитаза |
Кофактор: 4Fe-4S |
|
|
Аконитаза катализирует изомеризацию цитрата в изоцитрат через цис-ако- нитат во второй реакции ЦТК. Сначала происходит дегидратация цитрата (отщепление молекулы воды), а затем — гидратация цис-аконитата с образованием изоцитрата. Аконитаза содержит 4 железисто-серных центра, которые участвуют в связывании субстрата и в катализе.
Реакция 3
Субстрат: изоцитрат |
Продукт: α-кетоглутарат |
|
|
Фермент: изоцитратдегидрогеназа |
Коферменты и кофакторы: |
|
NAD+, Mn2+ или Mg2+ |
Аллостерический активатор: |
Аллостерический ингибитор: |
АДФ |
NADH, АТФ |
|
|
В третьей реакции изоцитратдегидрогеназа катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата с образованием α-кетоглутарата. Эта реакция — первая из 4 окислительно-восстановительных реакций цикла. Она сопряжена с восстановлением NAD+ и идёт в две стадии:
1.На первой стадии окисляется гидроксильная группа изоцитрата. Один атом водорода переносится на NAD+ в форме гидрид-иона H– (переносит 2 электрона). В результате образуется оксалосукцинат.
Цикл трикарбоновых кислот 69
2.На второй стадии оксалосукцинат декарбоксилируется с образованием
α-кетоглутарата.
Реакция 4
Субстрат: α-кетоглутарат |
Продукт: сукцинил-КоА |
|
|
Фермент: |
Коферменты: |
α-кетоглутаратдегидрогеназный ком- |
тиаминпирофосфат, липоамид, КоА, |
плекс |
FAD, NAD+ |
Аллостерический активатор: |
Аллостерический ингибитор: |
АМФ, АДФ, Ca2+ |
NADH, сукцинил-КоА |
Окислительное декарбоксилирование α-кетоглутарата схоже с реакцией, катализируемой пируватдегидрогеназой. В обоих случаях субстратами служат α-кето- кислоты и кофермент А, а продуктами являются CO2 и «высокоэнергетическое» тиоэфирное соединение.
Четвертая реакция ЦТК катализируется α-кетоглутаратдегидрогеназным комплексом. Этот комплекс аналогичен пируватдегидрогеназному по структуре и функциям. В реакциях, катализируемых ими, участвуют одни и те же коферменты. Схожи даже механизмы реакций.
α-Кетоглутаратдегидрогеназный комплекс состоит из трёх ферментов:
1.E1 — α-кетоглутаратдегидрогеназа (содержит тиаминпирофосфат).
2.E2 — дигидролипоамидсукцинилтрансфераза (содержит липоамид).
3.E3 — дигидролипоамиддегидрогеназа (содержит FAD).
Это вторая реакция ЦТК, в которой образуется CO2 и восстановительные эквиваленты.
Реакция 5
70 |
Глава 4 |
Цикл трикарбоновых кислот |
|
||
|
|
|
|
||
|
Субстрат: сукцинил-КоА |
|
Продукт: сукцинат |
||
|
|
|
|
||
|
Фермент: сукцинил-КоА-синтетаза |
|
Коферменты: — |
||
|
|
|
|||
|
В пятой реакции ЦТК сукцинил-КоА преобразуется в сукцинат. Эту реакцию |
||||
|
катализирует сукцинил-КоА-синтетаза. Гидролиз тиоэфирной связи в сукцинил- |
||||
|
КоА сопряжен с синтезом нуклеозидтрифосфата — ГТФ. |
|
|||
|
Реакция протекает в три стадии: |
|
|||
|
1. |
На первой стадии образуется сукцинилфосфат, а кофермент А отщепля- |
|||
|
|
ется. |
|
|
|
|
2. |
Затем фосфатная группа переносится на радикал гистидина в активном |
|||
|
|
центре фермента. |
|
||
|
3. |
Третья стадия сопровождается переносом фосфорной группы на ГДФ с |
|||
|
|
образованием ГТФ. |
|
Своё название фермент получил благодаря обратной реакции — образованию сукцинил-КоА из сукцината с затратой молекулы ГТФ.
Реакция 6
Субстрат: сукцинат |
Продукт: фумарат |
|
|
Фермент: |
Коферменты: FAD, Fe-S |
сукцинатдегидрогеназный комплекс |
|
|
|
Сукцинатдегидрогеназный комплекс катализирует окисление сукцината в фумарат, образуя двойную связь –C=C– и восстанавливая FAD до FADH2 путём переноса двух протонов и двух электронов. Следующим их акцептором служит убихинон, который переходит в восстановленную форму QH2, принимая их от FADH2.
Сукцинатдегидрогеназный комплекс входит в состав дыхательной цепи и расположен во внутренней мембране митохондрий. Активный центр фермента находится в матриксе, что облегчает связывание с ним субстрата.