- •Предисловие
- •Глава 1. Введение в обмен углеводов
- •1.1 Общая характеристика обмена углеводов
- •1.2 Классификация и структура углеводов
- •Б Полисахариды
- •1.3 Переваривание углеводов пищи
- •А Переваривание углеводов в ротовой полости
- •В Пристеночное пищеварение или гидролиз олиго- и дисахаридазами
- •1.4 Всасывание и транспорт углеводов
- •А Na+-зависимые транспортеры глюкозы
- •Б Na+-независимые транспортеры глюкозы
- •1.5 Пути использования глюкозы в клетках
- •1.6 Гликолиз
- •Б Схема гликолиза
- •1.7 Реакции гликолиза
- •Г Реакция 2
- •Е Реакция 4
- •Ж Реакция 5
- •И Реакция 7
- •К Реакция 8
- •Л Реакция 9
- •М Реакция 10
- •Н Реакция 11
- •1.8 Энергетический баланс гликолиза
- •А Аэробный гликолиз
- •Б Анаэробный гликолиз
- •1.9 Регуляция гликолиза
- •Б Гормональная регуляция
- •1.10 Пути использования пирувата в клетках
- •1.11 Эффекты Пастера и Кребтри
- •Б Эффект Кребтри
- •1.12 Вовлечение других углеводов в гликолиз
- •А Фруктоза
- •Мышцы
- •Печень
- •Б Галактоза
- •В Манноза
- •Термины
- •Вопросы к семинарскому занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Переваривание, абсорбция и транспорт углеводов
- • Гликолиз
- • Метаболизм глюкозы в других клетках и тканях
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 2. Глюконеогенез
- •2.1 Общая характеристика глюконеогенеза
- •2.2 Субстраты глюконеогенеза
- •А Пируват и лактат
- •Б Глюкогенные аминокислоты
- •В Глицерол
- •Г Жирные кислоты
- •2.3 Реакции глюконеогенеза
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакции 3-8
- •Реакция 9
- •Реакция 10
- •Реакция 11
- •В Общая схема глюконеогенеза
- •2.4 Энергетический баланс глюконеогенеза
- •2.5 Биохимический смысл глюконеогенеза и его регуляция
- •Б Механизмы регуляции
- •Аллостерическая регуляция
- •Гормональная регуляция
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Глюконеогенез
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 3. Обмен гликогена
- •3.1 Общая характеристика
- •3.2 Структура и функции гликогена
- •Б Структура гликогена
- •3.3 Синтез гликогена (гликогеногенез)
- •В Синтез УДФ-глюкозы
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Г Синтез праймера
- •Д Элонгация цепей гликогена
- •Реакция 4
- •Е Образование ветвей
- •3.4 Распад гликогена (гликогенолиз)
- •Б Уравнения реакций
- •В Укорочение цепей гликогена
- •Реакция 1а
- •Г Отщепление ветвей
- •Реакция 1б
- •Е Расщепление гликогена в лизосомах
- •3.5 Регуляция обмена гликогена
- •А Аллостерическая регуляция
- •Гликогенфосфорилаза
- •Гликогенсинтаза
- •Глюкагон и адреналин
- •Инсулин
- •Ca2+-зависимая регуляция обмена гликогена
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Метаболизм гликогена
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 4. Цикл трикарбоновых кислот
- •4.1 Общая характеристика
- •4.2 Окислительное декарбоксилирование пирувата
- •А Строение пируватдегидрогеназного комплекса
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •4.3 Цикл трикарбоновых кислот
- •Б Схема цикла трикарбоновых кислот
- •Г Реакции ЦТК
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •Реакция 6
- •Реакция 7
- •Реакция 8
- •Д Энергетический баланс ЦТК
- •4.4 Регуляция ЦТК и окислительного декарбоксилирования пирувата
- •Регуляция с помощью количества субстрата
- •Ингибирование метаболитами цикла
- •4.5 Амфиболическая роль ЦТК
- •Б Анаплеротические реакции
- •Пируваткарбоксилаза
- •Малик-фермент
- •Фосфоенолпируваткарбоксикиназа
- •Реакции катаболизма аминокислот
- •Реакции катаболизма жирных кислот
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Окислительное декарбоксилирование пирувата (ОДП)
- • Цикл трикарбоновых кислот (ЦТК)
- • Анаплеротические пути
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 5. Пентозофосфатный путь
- •5.1 Общая характеристика
- •5.2 Реакции пентозофосфатного пути
- •А Схема пентозофосфатного пути
- •В Окислительная фаза
- •Реакция 1
- •Реакция 2
- •Реакция 3
- •Г Неокислительная фаза
- •Реакция 4
- •Реакция 5
- •Реакция 6
- •Реакция 7
- •Реакция 8
- •5.3 Сценарии и регуляция пентозофосфатного пути
- •Б Сценарии пентозофосфатного пути
- •В Ксилулозо-5-фосфат как регуляторная молекула
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Пентозофосфатный путь
- • Путь уроновых кислот
- •Вопросы для самопроверки
- •Рекомендуемая литература
61
Глава 4. Цикл трикарбоновых кислот
4.1Общая характеристика
Глюкоза является одним из основных источников энергии для большинства клеток, однако гликолитический путь, в ходе которого она окисляется до 2 молекул пирувата, далеко не единственный катаболический путь живых клеток. Организмы, целиком зависящие от гликолиза, теряют значительную часть энергии, поскольку не окисляют продукты гликолиза.
Окисление органических соединений требует присутствия акцептора электронов — NO3–, SO42–, Fe3+, O2. Аэробные организмы используют кислород O2 в качестве акцептора. Полное окисление глюкозы происходит в ходе окислительного декарбоксилирования пирувата и цикла трикарбоновых кислот (ЦТК): пируват, образующийся в гликолизе, может быть окислен до двухуглеродного фрагмента, который далее поступит в ЦТК в виде молекулы ацетил-КоА, и CO2.
ЦТК часто рассматривают как дополнение к гликолизу, однако ошибочно считать его лишь продолжением обмена углеводов. ЦТК — центральный метаболический блок, участвующий как в катаболизме, так и в анаболизме всех ключевых соединений
— жирных кислот, углеводов и аминокислот.
4.2Окислительное декарбоксилирование пирувата
Окислительное декарбоксилирование пирувата — это метаболический путь окисления пирувата до ацетил-КоА (основной субстрат ЦТК), катализируемый ком-
плексом ферментов и коферментов — пируватдегидрогеназным комплексом
(ПДК).
Реакции окислительного декарбоксилирования служат важным связующим звеном между гликолизом и ЦТК. У эукариотических организмов они происходят в митохондриях. Пируват попадает в матрикс митохондрий из цитозоли с помощью симпорта с H+ (вторично-активный транспорт, осуществляемый Mpc-белки). Далее он окисляется до ацетил-КоА, который поступает в ЦТК.
А Строение пируватдегидрогеназного комплекса
Пируватдегидрогеназный комплекс состоит из множества копий 3 типов ферментов:
1.Пируватдегидрогеназа (E1);
2.Дигидролипоилтрансацетилаза (E2);
3.Дигидролипоилдегидрогеназа (E3).
Комплекс представляет собой крупную частицу диаметром 500 Å (50 нм) и массой 10 МДа, состоящую из:
1.60 субъединиц E2 (образуют ядро комплекса);
2.45 молекул E1 (каждая представляет собой α2β2-гетеротетрамерный белок)
3.9 молекул E3 (гомодимерный белок).
62Глава 4 Цикл трикарбоновых кислот
4.12 молекул E3-связывающего белка, участвующего в связывании E3 и E2.
5.Несколько молекул киназы и фосфатазы, участвующих в регуляции ак-
тивности комплекса (см. Раздел 5.4).
Подобные мультиферментные комплексы являются эволюционно более эффективными и обладают рядом преимуществ:
1.Скорость ферментативной реакции зависит и от частоты, с которой сталкиваются субстрат и фермент. Если серия реакций происходит на мультиферментном комплексе, то расстояние, которое должен преодолеть субстрат, перемещаясь между активными центрами, резко снижается, а значит, субстрат быстрее и с бо́льшей вероятностью попадает в следующий активный центр.
2.Туннелирование метаболитов между ферментами и их активными центрами снижает вероятность реакции этих метаболитов с другими молекулами, что положительно сказывается на скорости и эффективности всего метаболического пути.
3.Реакции, катализируемые мультиферментным комплексом, легче поддаются регуляции, поскольку все ферменты находятся в одном месте и связаны друг с другом (вступают в кооперативные взаимодействия).
БРеакции окислительного декарбоксилирования пирувата
Пируватдегидрогеназный комплекс катализирует 5 последовательных реакций окислительного декарбоксилирования пирувата. Суммарное уравнение:
Пируват + КоА + NAD+ Ацетил-КоА + CO2 + NADH
Вреакциях участвуют 5 коферментов:
1.Тиаминпирофосфат: активная форма витамина B1. Участвует в декарбоксилировании пирувата, образуя гидроксиэтил-ТПФ карбанион.
2.Липоамид: производное липоевой кислоты — витамина N. Акцептирует гидроксиэтильный карбанион от ТПФ в виде ацетильной группы.
3.Кофермент: производное пантотеновой кислоты — витамина B5. Акцептирует ацетильную группу от липоамида.
4.FAD: производное рибофлавина — витамина B2. Восстанавливается, принимая на себя протоны и электроны от липоамида.
5.NAD+: производное никотиновой кислоты (ниацина) — витамина B3. Восстанавливается, принимая электроны и протон от FADH2.
Реакция 1
Окислительное декарбоксилирование пирувата 63
Пируватдегидрогеназа (E1) декарбоксилирует пируват с образованием гид-
роксиэтилтиаминпирофосфата.
Реакция 2
Во второй реакции гидроксиэтильная группа переносится на следующий фермент — дигидролипоилтрансацетилазу (E2). Этот фермент содержит липоамидную группу (производное липоевой кислоты, витамина N). Гидроксиэтильная группа окисляется до ацетильной, образуя с липоамидом ковалентную связь.
Реакция 3
Третья реация катализируется тем же ферментом — дигидролипоилтрансацетилазой. В ходе этой реакции ацетильная группа переносится на кофермент А, в результате чего образуется ацетил-КоА и дигидролипоамид.
Реакция 4
Фермент дигидролипоилдегидрогеназа (E3) окисляет дигидролипоамид, завершая каталитический цикл E2.
Реакция 5
Наконец в последней реакции окислительного декарбоксилирования пирувата E3 восстанавливает NAD+ до NADH, а сам при этом окисляется.