- •Министерство здравоохранения рф
- •Список сокращений
- •Частная микробиология
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Ознакомление с правилами взятия материала для микробиологического исследования
- •Методы диагностических микробиологических исследований Методы обнаружения возбудителя инфекции в материале от больного
- •Иммунохимические методы диагностики возбудителя или его антигенов в материале от больного
- •Биохимические и молекулярно-биологические методы диагностики
- •Серодиагностика и аллергодиагностика
- •Оценка результатов клинико-диагностических микробиологических исследований
- •Микробиологическая диагностика стафилококковых инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика стрептококковых инфекций.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика заболеваний, вызываемых гноеродными условно-патогенными грамотрицательными аэробными микроорганизмами.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 2. Возбудители раневой анаэробной инфекции: анаэробной газовой инфекции, столбняка. Бактероиды.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика анаэробной инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Микробиологическая диагностика столбняка.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •4. Ознакомление с биопрепаратами, применяемыми для специфической профилактики и терапии столбняка:
- •Микробиологическая диагностика неклостридиальной анаэробной инфекции
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 3. Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: чумы, туляремии, сибирской язвы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика чумы.
- •Микроскопический метод
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика туляремии
- •Биологический и бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологический метод диагностики туляремии.
- •Микробиологическая диагностика сибирской язвы
- •Бактериологический метод.
- •Микроскопический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 4.Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: бруцеллеза, лептоспироза, боррелиозов, листериоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бруцеллеза
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика лептоспироза
- •Микроскопический метод.
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Знакомоство с биопрепаратами для профилактики и лечения лептоспироза.
- •Микробиологическая диагностика боррелиозов (возвратные тифы, болезнь Лайма)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика листериоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 5. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: сальмонеллы - возбудители брюшного тифа, паратифов и пищевых токсикоинфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика брюшного тифа и паратифов Ознакомиться со схемой лабораторной диагностики брюшного тифа и паратифов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Бактериологический метод – выделение гемокультуры:
- •2. Серологический метод диагностики тифо-паратифозных заболеваний.
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика сальмонеллезов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Учет посевов сальмонелл на среде Левина и Олькеницкого (демонстрация).
- •3. Идентификация выделенной культуры возбудителя:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 6. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: патогенные кишечные палочки, иерсинии, кампилобактерии, хеликобактерии
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика эшерихиозов
- •Серологический метод - ра, рнга, ифа с целью выявления антител к эшерихиям и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика иерсиниозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика кампилобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика геликобактериоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 7. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: возбудители дизентерии, холеры. Пищевые интоксикации бактериальной природы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика бактериальной дизентерии.
- •Серологический метод. Постановка ра, рнга с целью выявления антител к шигеллам и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Идентификация выделенной культуры шигелл:
- •Микробиологическая диагностика холеры
- •Серологический метод: Постановка ра, рнга, теста иммобилизации вибрионов с целью выявления антител к холерному вибриону и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Пищевые интоксикации бактериальной природы Лабораторная диагностика ботулизма
- •Самостоятельная работа студентов
- •Лабораторная диагностика пищевых интоксикаций стафилококковой этиологии
- •Пищевые интоксикации бактериальной этиологии способны также вызывать:
- •Педиатрические аспекты темы.
- •Тема 8. Возбудители бактериальных воздушно-капельных инфекций: дифтерии, коклюша, гемофильной и пневмококковой инфекции
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика дифтерии
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения дифтерии.
- •Микробиологическая диагностика коклюша и паракоклюша
- •Серологический метод - ра и рск с парными сыворотками больных для констатации нарастания титра антител с целью ретроспективного подтверждения коклюша и диагностики его атипичных форм.
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения коклюша:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика гемофильной инфекции
- •Микробиологическая диагностика бактериальных пневмоний и острых респираторных заболеваний (орз)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 9. Возбудители бактериальных воздушно-капельных бактериальных инфекций: туберкулеза, менингококовой инфекции и актиномикоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика туберкулеза и микобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Ознакомление с препаратами, применяемыми для диагностики, лечения и профилактики туберкулеза:
- •Микробиологическая диагностика проказы
- •Микробиологическая диагностика менингококковой инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики и профилактики менингококковой инфекции:
- •Микробиологическая диагностика актиномикоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 10. Возбудители бактериальных инфекций, передающихся половым путем: гонореи, сифилиса, бактериального вагиноза, урогенитального хламидиоза и микоплазмоза.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бактериальных инфекций, передающихся половым путем
- •Микробиологическая диагностика сифилиса
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологическая диагностика сифилиса.
- •3. Ознакомиться с препаратами для диагностики и лечения сифилиса:
- •Микробиологическая диагностика мягкого шанкра
- •Микробиологическая диагностика гонореи
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить препараты для диагностики и лечения гонореи.
- •Микробиологическая диагностика урогенитального микоплазмоза
- •Лабораторная диагностика урогенитального хламидиоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика бактериального вагиноза
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Тема 11. Возбудители риккетсиозов.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика риккетсиозов
- •Микробиологическая диагностика эпидемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика эндемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика Ку-лихорадка.
- •Микробиологическая диагностика эрлихиозов
- •Микробиологическая диагностика бартонеллезов
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Серологический метод диагностики сыпного тифа:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 12. Общая вирусология: морфология и ультраструктура вирусов, методы их культивирования. Экспресс-диагностика вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы лабораторной диагностики вирусных инфекций
- •Взятие и подготовка материала для вирусологической диагностики
- •Вирусологический метод
- •Выделение вирусов на культурах клеток
- •Выделение вирусов на развивающихся куриных эмбрионах
- •Выделение вирусов на экспериментальных животных.
- •Экспресс-диагностика вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Изучение морфологии вирусов по электронограммам.
- •Тема 13. Общая вирусология: диагностика вирусных инфекций. Вирусологический метод исследования. Индикация и идентификация вирусов. Серологический метод диагностики вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы выявления (индикация) и идентификации вирусов
- •Индикация вирусов
- •Идентификация вирусов
- •Учет вирусиндуцированных патологических изменений в чувствительных живых системах.
- •Серологический метод диагностики вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Индикация вирусов в клетках культуры ткани:
- •3. Выделение и индикация вирусов на ркэ.
- •4. Идентификация вирусов:
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика острых респираторных вирусных инфекций и гриппа
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика натуральной оспы
- •Вирусологическая диагностика герпеса
- •Вирусологическая диагностика кори
- •Вирусологическая диагностика краснухи.
- •Вирусологическая диагностика эпидемического паротита.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 15. Пикорнавирусы. Вирусы гепатитов. Ротавирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика пикорнавирусных инфекций Энтеровирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения:
- •Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Гепатит а
- •Гепатит в
- •Другие гепатиты
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Вирусологическая диагностика ротавирусных гастроэнтеритов.
- •Тема 16. Арбовирусы. Нейровирусы. Онкогенные вирусы. Медленные вирусные инфекции. Ретровирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика нейровирусных инфекций Арбовирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения клещевого энцефалита:
- •Бешенство
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Изучить биопрепараты, используемые для специфической профилактики и лечения бешенства:
- •Лабораторная диагностика вич-инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика парвовирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика аренавирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика филовирусных инфекций (Марбургская лихорадка и лихорадка Эбола)
- •Тема 17. Патогенные грибы. Возбудители глубоких и субкутанных микозов, дерматомикозов, оппортунистических микозов
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Элементы общей микологии и принципы лабораторной диагностики микозов Биологические свойства грибов
- •Лабораторная диагностика микозов
- •Лабораторная диагностика отдельных микозов Лабораторная диагностика глубоких (системных) микозов
- •Криптокккоз
- •Североамериканский бластомикоз (болезнь Джилкрайста—Стокса)
- •Южноамериканский бластомикоз (паракокцидиоидоз)
- •Гистоплазмоз
- •Кокцидиомикоз
- •Лабораторная диагностика подкожных (субкутанных) микозов Споротрихоз
- •Хромомикоз
- •Лабораторная диагностика эпидермомикозов Рубромикоз (руброфития).
- •Эпидермофития паховая.
- •Эпидермофития стоп.
- •Трихомикозы Трихофития
- •Микроспория.
- •Фавус (парша).
- •Лабораторная диагностика поверхностных микозов
- •Лабораторная диагностика микозов, вызываемых условно-патогенными грибами (оппортунистические микозы)
- •Кандидоз (кандидамикоз)
- •Другие оппортунистические микозы
- •Аспергиллез
- •Пенициллиоз
- •Фикомикоз (мукороз)
- •Пневмоцистоз
- •Самостоятельная работ студентов Лабораторная диагностика эпидермомикозов.
- •Лабораторная диагностика кандидозов.
- •Лабораторная диагностика глубоких микозов.
- •2. Серологический метод:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 18. Микробиологическая диагностика протозойных инфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Основные методы лабораторной диагностики протозойных инфекций
- •Малярия
- •Криптоспоридиоз
- •Токсоплазмоз
- •Трипаносомоз
- •Лейшманиоз
- •Лямблиоз
- •Трихомониаз
- •Амебиаз
- •Балантидиаз
- •Самостоятельная работ студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Приложение 1
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для
- •Микробиологических исследований
- •Взятие крови.
- •Взятие спинномозговой жидкости
- •Взятие мочи
- •Взятие желчи.
- •Взятие материала из дыхательных путей
- •Взятие материала из уха.
- •Взятие отделяемого из ран, язв, брюшной полости
- •Взятие материала из глаз.
- •Взятие материала из женских половых органов
- •Взятие материала при аутопсии
- •Взятие, условия хранения и доставки венозной крови для проведения ифа и пцр.
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для вирусологических исследований
Тема 12. Общая вирусология: морфология и ультраструктура вирусов, методы их культивирования. Экспресс-диагностика вирусных инфекций.
Цель занятия: разбор теоретических основ общей вирусологии (классификация, биологические свойства вирусов), освоение методов культивирования вирусов и экспресс-диагностики вирусных инфекций.
Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
1. Вирусология, ее цели и задачи. Периоды развития вирусологии.
2. Классификация вирусов человека. Природа и происхождение вирусов.
3. Морфология вирусов. Форма и размеры вирусов. Принципы структурной организации вирусов. Понятие о простых и сложных вирусах.
4. Вирион и его компоненты. Нуклеиновая кислота, капсид, капсомеры, сердцевина, суперкапсидная оболочка, пепломеры. Типы симметрии нуклеокапсида.
5. Особенности биологии вирусов. Химический состав вирионов: нуклеиновые кислоты, белки, липиды, углеводы и их особенности. Ферменты вирусов.
6. Типы взаимодействия вирусов с клеткой: продуктивный, абортивный, интегративный. Вирогения.
7. Методы культивирования вирусов на клеточных культурах, эмбрионах птиц, в организме лабораторных животных.
Методы лабораторной диагностики вирусных инфекций
Лабораторная диагностика вирусных инфекций базируется на 3 группах методов:
Вирусологический метод - выделение вируса из исследуемого материала и его идентификация.
Серологический метод - определение в сыворотке крови больных специфических противовирусных антител с помощью разнообразных иммунологических реакций.
Генодиагностика - обнаружение в материале от больного специфичных для данного вируса фрагментов нуклеиновых кислот вирусов-возбудителей с помощью метода зондов (гибридизация НК) или ПЦР.
Прямое вирусоскопическое исследование мазков из клинического материала, окрашенных анилиновыми красителями, с целью выявления вирусов в настоящее время в практике работы вирусологических лабораторий проводится редко. Чаще применяются с целью поиска антигенов вируса ИФМ или микроскопический вариант ИФА как экспресс-методы диагностики вирусных инфекций.
Взятие и подготовка материала для вирусологической диагностики
Вирусологическому исследованию подвергают содержимое везикул, пустул, соскобы эпителия, спинномозговую жидкость, фекалии, мазки и смывы из верхних дыхательных путей, взятые у больного с соблюдением правил асептики в ранние стадии вирусной инфекции. Мазки из носоглотки и кожные соскобы помещают в ИРХН или раствор Хенкса с 10% сыворотки крупного рогатого скота и антибиотиками (для подавления сопутствующей микрофлоры). Исследуемый материал хранят и пересылают в вирусологическую лабораторию в специальных контейнерах с сухим льдом. Пробы можно сохранять в условиях глубокой заморозки (-700 С).
Вирусологический метод
Поскольку вирусы относятся к облигатным внутриклеточным паразитам и на искусственных питательных средах не растут, для их культивирования применяются живые системы (культуры клеток, развивающиеся куриные эмбрионы, чувствительные лабораторные животные).
Выделение вирусов на культурах клеток
В практике вирусологических лабораторий для выделения вирусов используют первично-трипсинированные, полуперевиваемые (диплоидные) и перевиваемые клеточные культуры.
Первично-трипсинированные культуры клеток можно получить из любых органов и тканей человека, животных, насекомых, растений, однако наиболее часто используются эмбриональные ткани (фибробласты куриного эмбриона, человека, и др.), обладающие повышенной способностью к росту и размножению.
Для получения клеточной взвеси ткань отмывают от крови в растворе Хенкса, измельчают ножницами и несколько раз обрабатывают трипсином на магнитной мешалке или путем пипетирования. Затем взвесь клеток отмывают от трипсина раствором Хенкса путем центрифугирования при 600 об/мин в течение 5—10 мин, ресуспендируют в питательной среде и определяют концентрацию клеток в камере Горяева. Клеточную взвесь разводят питательной средой (обычно среда № 199 с добавлением сыворотки крупного рогатого скота) до концентрации 4-8х105 клеток в 1 мл, разливают в культуральные сосуды, закрывают резиновыми пробками. Пробирки укладывают под углом 50. Культивирование клеток осуществляют в термостате при 35-370 С 48-96 часов, в течение которых формируется монослой клеток, прикрепляющийся к поверхности стекла (или пластика).
С помощью версена (натриевая соль этилендиаминотетрауксусной кислоты - ЭДТА) (реже трипсина), клетки можно снять с поверхности культуральной емкости и перенести их в другую емкость (произвести пассаж). Для этого в сосуды с клетками после отсасывания питательной среды наливают 0,02% раствор версена или 0,25% трипсина и помещают их на 3-5 мин в термостат. Затем версен или трипсин удаляют, в культуральный сосуд добавляют небольшое количество питательной среды, в которой суспендируют клетки, подсчитывают их количество, доводят их до требуемой концентрации и разливают в новые флаконы. Однако первично-трипсинизированные клеточные культуры не выдерживают более 5-10 пассажей.
Перевиваемые клеточные культуры, в отличие от первично-трипсинированных, переносят неограниченное число пассажей, так как обычно их получают из опухолевых клеток, имеющих высокие способности к росту. Широкое распространение в вирусологии получили культуры клеток карциномы шейки матки (HeLa), раковой опухоли гортани (НЕр-2), костного мозга больного раком легких (Detroit-б) и т.д. Созданы «банки» перевиваемых клеточных культур, в которых хранятся клетки, замороженные жидким азотом.
Полуперевиваемые (диплоидные) культуры получают путем нескольких пассажей, в результате чего формируется популяция клеток, способных выдержать до 60 пассажей, быстро размножаться, быть высокочувствительными ко многим вирусам, сохраняя при этом исходный набор хромосом.
Для культивирования клеток используются специальные стерильные питательные среды (например, среды 199, Игла, гидролизат лактальбумина и др.) с рН 7,2-7,6, содержащие полный набор аминокислот, витамины, факторы роста и набор минеральных веществ, к которым добавляют от 2 до 30 % сыворотки крови животных (сыворотка крупного рогатого скота, эмбриональная телячья сыворотка и др.), а также антибиотики для предотвращения роста бактериальной флоры. Среды содержат индикатор феноловый красный, который имеет оранжево-желтый цвет при кислой реакции среды и красно-малиновый цвет в щелочной среде. Поддерживающие среды либо не содержат сыворотки, либо содержат ее в небольшом количестве. Их применяют для сохранения выросших клеток после заражения их вирусами.
Для выделения вирусов питательную среду из пробирок с культурой клеток удаляют, промывают монослой клеток раствором Хенкса для удаления сывороточных антител и ингибиторов, после чего в пробирку вносят 0,1-0,2 мл обработанного вируссодержащего материала. Через 30-60 мин после заражения материал из пробирки удаляют, вносят 1 мл поддерживающей среды и пробирки помещают в термостат при 370 С для культивирования.