
- •Министерство здравоохранения рф
- •Список сокращений
- •Частная микробиология
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Ознакомление с правилами взятия материала для микробиологического исследования
- •Методы диагностических микробиологических исследований Методы обнаружения возбудителя инфекции в материале от больного
- •Иммунохимические методы диагностики возбудителя или его антигенов в материале от больного
- •Биохимические и молекулярно-биологические методы диагностики
- •Серодиагностика и аллергодиагностика
- •Оценка результатов клинико-диагностических микробиологических исследований
- •Микробиологическая диагностика стафилококковых инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика стрептококковых инфекций.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика заболеваний, вызываемых гноеродными условно-патогенными грамотрицательными аэробными микроорганизмами.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 2. Возбудители раневой анаэробной инфекции: анаэробной газовой инфекции, столбняка. Бактероиды.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика анаэробной инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Микробиологическая диагностика столбняка.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •4. Ознакомление с биопрепаратами, применяемыми для специфической профилактики и терапии столбняка:
- •Микробиологическая диагностика неклостридиальной анаэробной инфекции
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 3. Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: чумы, туляремии, сибирской язвы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика чумы.
- •Микроскопический метод
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика туляремии
- •Биологический и бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологический метод диагностики туляремии.
- •Микробиологическая диагностика сибирской язвы
- •Бактериологический метод.
- •Микроскопический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 4.Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: бруцеллеза, лептоспироза, боррелиозов, листериоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бруцеллеза
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика лептоспироза
- •Микроскопический метод.
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Знакомоство с биопрепаратами для профилактики и лечения лептоспироза.
- •Микробиологическая диагностика боррелиозов (возвратные тифы, болезнь Лайма)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика листериоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 5. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: сальмонеллы - возбудители брюшного тифа, паратифов и пищевых токсикоинфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика брюшного тифа и паратифов Ознакомиться со схемой лабораторной диагностики брюшного тифа и паратифов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Бактериологический метод – выделение гемокультуры:
- •2. Серологический метод диагностики тифо-паратифозных заболеваний.
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика сальмонеллезов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Учет посевов сальмонелл на среде Левина и Олькеницкого (демонстрация).
- •3. Идентификация выделенной культуры возбудителя:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 6. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: патогенные кишечные палочки, иерсинии, кампилобактерии, хеликобактерии
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика эшерихиозов
- •Серологический метод - ра, рнга, ифа с целью выявления антител к эшерихиям и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика иерсиниозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика кампилобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика геликобактериоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 7. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: возбудители дизентерии, холеры. Пищевые интоксикации бактериальной природы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика бактериальной дизентерии.
- •Серологический метод. Постановка ра, рнга с целью выявления антител к шигеллам и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Идентификация выделенной культуры шигелл:
- •Микробиологическая диагностика холеры
- •Серологический метод: Постановка ра, рнга, теста иммобилизации вибрионов с целью выявления антител к холерному вибриону и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Пищевые интоксикации бактериальной природы Лабораторная диагностика ботулизма
- •Самостоятельная работа студентов
- •Лабораторная диагностика пищевых интоксикаций стафилококковой этиологии
- •Пищевые интоксикации бактериальной этиологии способны также вызывать:
- •Педиатрические аспекты темы.
- •Тема 8. Возбудители бактериальных воздушно-капельных инфекций: дифтерии, коклюша, гемофильной и пневмококковой инфекции
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика дифтерии
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения дифтерии.
- •Микробиологическая диагностика коклюша и паракоклюша
- •Серологический метод - ра и рск с парными сыворотками больных для констатации нарастания титра антител с целью ретроспективного подтверждения коклюша и диагностики его атипичных форм.
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения коклюша:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика гемофильной инфекции
- •Микробиологическая диагностика бактериальных пневмоний и острых респираторных заболеваний (орз)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 9. Возбудители бактериальных воздушно-капельных бактериальных инфекций: туберкулеза, менингококовой инфекции и актиномикоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика туберкулеза и микобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Ознакомление с препаратами, применяемыми для диагностики, лечения и профилактики туберкулеза:
- •Микробиологическая диагностика проказы
- •Микробиологическая диагностика менингококковой инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики и профилактики менингококковой инфекции:
- •Микробиологическая диагностика актиномикоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 10. Возбудители бактериальных инфекций, передающихся половым путем: гонореи, сифилиса, бактериального вагиноза, урогенитального хламидиоза и микоплазмоза.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бактериальных инфекций, передающихся половым путем
- •Микробиологическая диагностика сифилиса
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологическая диагностика сифилиса.
- •3. Ознакомиться с препаратами для диагностики и лечения сифилиса:
- •Микробиологическая диагностика мягкого шанкра
- •Микробиологическая диагностика гонореи
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить препараты для диагностики и лечения гонореи.
- •Микробиологическая диагностика урогенитального микоплазмоза
- •Лабораторная диагностика урогенитального хламидиоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика бактериального вагиноза
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Тема 11. Возбудители риккетсиозов.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика риккетсиозов
- •Микробиологическая диагностика эпидемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика эндемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика Ку-лихорадка.
- •Микробиологическая диагностика эрлихиозов
- •Микробиологическая диагностика бартонеллезов
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Серологический метод диагностики сыпного тифа:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 12. Общая вирусология: морфология и ультраструктура вирусов, методы их культивирования. Экспресс-диагностика вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы лабораторной диагностики вирусных инфекций
- •Взятие и подготовка материала для вирусологической диагностики
- •Вирусологический метод
- •Выделение вирусов на культурах клеток
- •Выделение вирусов на развивающихся куриных эмбрионах
- •Выделение вирусов на экспериментальных животных.
- •Экспресс-диагностика вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Изучение морфологии вирусов по электронограммам.
- •Тема 13. Общая вирусология: диагностика вирусных инфекций. Вирусологический метод исследования. Индикация и идентификация вирусов. Серологический метод диагностики вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы выявления (индикация) и идентификации вирусов
- •Индикация вирусов
- •Идентификация вирусов
- •Учет вирусиндуцированных патологических изменений в чувствительных живых системах.
- •Серологический метод диагностики вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Индикация вирусов в клетках культуры ткани:
- •3. Выделение и индикация вирусов на ркэ.
- •4. Идентификация вирусов:
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика острых респираторных вирусных инфекций и гриппа
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика натуральной оспы
- •Вирусологическая диагностика герпеса
- •Вирусологическая диагностика кори
- •Вирусологическая диагностика краснухи.
- •Вирусологическая диагностика эпидемического паротита.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 15. Пикорнавирусы. Вирусы гепатитов. Ротавирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика пикорнавирусных инфекций Энтеровирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения:
- •Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Гепатит а
- •Гепатит в
- •Другие гепатиты
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Вирусологическая диагностика ротавирусных гастроэнтеритов.
- •Тема 16. Арбовирусы. Нейровирусы. Онкогенные вирусы. Медленные вирусные инфекции. Ретровирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика нейровирусных инфекций Арбовирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения клещевого энцефалита:
- •Бешенство
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Изучить биопрепараты, используемые для специфической профилактики и лечения бешенства:
- •Лабораторная диагностика вич-инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика парвовирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика аренавирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика филовирусных инфекций (Марбургская лихорадка и лихорадка Эбола)
- •Тема 17. Патогенные грибы. Возбудители глубоких и субкутанных микозов, дерматомикозов, оппортунистических микозов
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Элементы общей микологии и принципы лабораторной диагностики микозов Биологические свойства грибов
- •Лабораторная диагностика микозов
- •Лабораторная диагностика отдельных микозов Лабораторная диагностика глубоких (системных) микозов
- •Криптокккоз
- •Североамериканский бластомикоз (болезнь Джилкрайста—Стокса)
- •Южноамериканский бластомикоз (паракокцидиоидоз)
- •Гистоплазмоз
- •Кокцидиомикоз
- •Лабораторная диагностика подкожных (субкутанных) микозов Споротрихоз
- •Хромомикоз
- •Лабораторная диагностика эпидермомикозов Рубромикоз (руброфития).
- •Эпидермофития паховая.
- •Эпидермофития стоп.
- •Трихомикозы Трихофития
- •Микроспория.
- •Фавус (парша).
- •Лабораторная диагностика поверхностных микозов
- •Лабораторная диагностика микозов, вызываемых условно-патогенными грибами (оппортунистические микозы)
- •Кандидоз (кандидамикоз)
- •Другие оппортунистические микозы
- •Аспергиллез
- •Пенициллиоз
- •Фикомикоз (мукороз)
- •Пневмоцистоз
- •Самостоятельная работ студентов Лабораторная диагностика эпидермомикозов.
- •Лабораторная диагностика кандидозов.
- •Лабораторная диагностика глубоких микозов.
- •2. Серологический метод:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 18. Микробиологическая диагностика протозойных инфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Основные методы лабораторной диагностики протозойных инфекций
- •Малярия
- •Криптоспоридиоз
- •Токсоплазмоз
- •Трипаносомоз
- •Лейшманиоз
- •Лямблиоз
- •Трихомониаз
- •Амебиаз
- •Балантидиаз
- •Самостоятельная работ студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Приложение 1
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для
- •Микробиологических исследований
- •Взятие крови.
- •Взятие спинномозговой жидкости
- •Взятие мочи
- •Взятие желчи.
- •Взятие материала из дыхательных путей
- •Взятие материала из уха.
- •Взятие отделяемого из ран, язв, брюшной полости
- •Взятие материала из глаз.
- •Взятие материала из женских половых органов
- •Взятие материала при аутопсии
- •Взятие, условия хранения и доставки венозной крови для проведения ифа и пцр.
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для вирусологических исследований
Микробиологическая диагностика бактериальных пневмоний и острых респираторных заболеваний (орз)
Основным возбудителем (около 60%) бактериальных пневмоний в настоящее время является пневмококк (Streptococcus pneumoniae), реже (30-40%) – клебсиеллы (Klebsiella pneumoniae), хламидии (Chlamydophila pneumoniae), микоплазмы (Mycoplasma pneumoniae), стафилококк(Staphylococcus aureus), гемофильные палочки (Haemophilus influenzae), легионеллы(Legionella pneumophila).
Подходы к лабораторной диагностике бактериальных пневмоний и ОРЗ, независимо от вида возбудителя, принципиально, одинаковы.
Материалом для исследования являются мокрота, отделяемое слизистой оболочки трахеи и бронхов, промывные воды бронхов, экссудат из плевральной полости, кровь, спинномозговая жидкость при менингите, отделяемое зева и носа при ОРЗ.
Микроскопический метод (микроскопия мазков из исследуемого материала, окрашенных по Граму) имеет ориентировочное значение. Наличие в препаратах значительного количества удлиненных ланцетовидных, грамположительных диплококков, окруженных капсулой (Streptococcus pneumoniae – рис. 19), скоплений грамположительных кокков в виде гроздьев (S.aureus) или грамотрицательных коккобактерий(H.influenzae)позволяет поставить предварительный диагноз бактериальной пневмонии и служить ориентиром для назначения антибактериальной терапии.
Рис. 19. Пневмококк (Streptococcus pneumoniae). Окраска по Граму. х 900
Бактериологическое исследование является ведущим методом диагностики пневмоний и ОРЗ бактериальной этиологии, которое дает возможность не только выделить возбудителя инфекции, но и определить его чувствительность к антибиотикам.
Для выделения пневмококка (Streptococcus pneumoniae) осуществляют посев исследуемого материала на МПБ с глюкозой и на кровяной МПА. Посевы выращивают в термостате при 370 С в течение суток. Выросшие на кровяном МПА нежные колонии окружены зеленоватой зоной гемолиза. Из колоний готовят мазок, изучают морфологические и тинкториальные свойства, после чего остаток колонии пересевают на скошенный кровяной МПА или сахарный (или сывороточный) МПБ с целью выделения чистой культуры и ее идентификации на основании комплекса биологических свойств.
Дифференциация S.pneumoniae и S.pyogenes основывается на проверке чувствительности выделенной культуры к желчи и оптохину, а также способности ферментировать инулин.
Серотипирование пневмококка проводится с помощью РА на стекле с использованием типоспецифических пневмококковых сывороток (известно около 90 сероваров пневмококка, из которых 23 играют важную роль в патологии человека). Для серотипирования пневмококков может использоваться реакция Нейфельда (феномен набухания капсулы стрептококка в присутствии типоспецифической сыворотки).
Для изоляции клебсиелл выполняют посев исследуемого материала на МПА с пенициллином (для подавления сопутствующей микрофоры) в чашках Петри или на дифференциально-диагностические среды с лактозой и индикатором бром-тимоловым синим, на которых спустя сутки культивирования при 370 С образуются блестящие выпуклые слизистые колонии (на дифференциально-диагностической среде колонии имеют желтый цвет в результате разложения лактозы). На 2 день колонии исследуют визуально и с помощью микроскопического метода (окраска по Граму и Гинсу-Бурри для выявления капсул), после чего пересевают типичные колонии на среду Ресселя или скошенный МПА для выделения чистой культуры возбудителя. На 3 день учитывают рост на указанных средах (окрашивание столбика и скошенной части среды Ресселя в желтый цвет с разрывами агара в результате расщепления глюкозы и лактозы с образованием газа) и проводят идентификацию культуры клебсиелл по основным биологическим свойствам (образование капсулы, отсутствие подвижности, биохимические и антигенные свойства).
Для выделения микоплазм производят посев на специальные питательные среды с добавлением сыворотки, на которых они не ранее чем через месяц после образуют характерные микроскопические колонии с ровными краями и зернистой структурой. Выделенную чистую культуру микоплазм идентифицируют по биохимическим и антигенным свойствам.
Выделение легионелл, являющихся медленно растущими микроорганизмами, осуществляют с применением селективных питательных сред сложного состава, содержащих дрожжевой экстракт и другие факторы роста, а также различные антибиотики для подавления роста сопутствующей микрофлоры. Легионеллы относятся к медленно растущим микроорганизмам, однако микроколонии, видимые под микроскопом, появляются на 2-е сутки роста, тогда как макроскопически видимые мелкие колонии (2-4 мм) правильной округлой формы, с ровными краями и блестящей поверхностью с характерным розовым или сине-зеленым ободком и опалесцирующим центром - через 3-5 суток. Идентификацию выделенной чистой культуры до уровня рода проводят на основании изучения биологических свойств. Для видовой идентификации разработаны ИФМ, газожидкостная хроматография, генодиагностика (рестрикционный анализ, метод ДНК-зондов).
Серологический метод диагностики пневмоний, вызванных пневмококками, микоплазмами, хламидиями и легионеллами при исследовании парных сывороток крови больных (в остром периоде и в стадию реконвалесценции) с помощью РСК, РНГА, ИФА не является клинически обязательным и имеет эпидемиологическое значение. Для определения антител к легионеллам используют, кроме того, непрямой ИФМ с антигеном из легионелл (диагностический титр 1:32 и более).
Экспресс-методы. Разработан иммуноферментный тест для определения в моче специфичного антигена легионелл, а также иммунохроматографический тест для выявления в моче пневмококкового антигена, однако широкое применение этих методов ограничено.
Генодиагностика. Предложена ПЦР для диагностики хламидиозов и микоплазмозов, однако метод широко в клинической практике не используется.
Биопроба. Исследуемый материал для выделения пневмококков вводят внутрибрюшинно белым мышам или морским свинкам. Культуру пневмококка выделяют из крови и органов погибшего или забитого животного, а также проводят бактериоскопию мазков-отпечатков, сделанных из его органов. В настоящее время метод практически не применяется.