
- •Министерство здравоохранения рф
- •Список сокращений
- •Частная микробиология
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Ознакомление с правилами взятия материала для микробиологического исследования
- •Методы диагностических микробиологических исследований Методы обнаружения возбудителя инфекции в материале от больного
- •Иммунохимические методы диагностики возбудителя или его антигенов в материале от больного
- •Биохимические и молекулярно-биологические методы диагностики
- •Серодиагностика и аллергодиагностика
- •Оценка результатов клинико-диагностических микробиологических исследований
- •Микробиологическая диагностика стафилококковых инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика стрептококковых инфекций.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика заболеваний, вызываемых гноеродными условно-патогенными грамотрицательными аэробными микроорганизмами.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 2. Возбудители раневой анаэробной инфекции: анаэробной газовой инфекции, столбняка. Бактероиды.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика анаэробной инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Микробиологическая диагностика столбняка.
- •Самостоятельная работа студентов.
- •4. Ознакомление с биопрепаратами, применяемыми для специфической профилактики и терапии столбняка:
- •Микробиологическая диагностика неклостридиальной анаэробной инфекции
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 3. Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: чумы, туляремии, сибирской язвы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика чумы.
- •Микроскопический метод
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика туляремии
- •Биологический и бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологический метод диагностики туляремии.
- •Микробиологическая диагностика сибирской язвы
- •Бактериологический метод.
- •Микроскопический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 4.Возбудители бактериальных зоонозных инфекций: бруцеллеза, лептоспироза, боррелиозов, листериоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бруцеллеза
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика лептоспироза
- •Микроскопический метод.
- •Бактериологический метод.
- •Биопроба
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Знакомоство с биопрепаратами для профилактики и лечения лептоспироза.
- •Микробиологическая диагностика боррелиозов (возвратные тифы, болезнь Лайма)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика листериоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 5. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: сальмонеллы - возбудители брюшного тифа, паратифов и пищевых токсикоинфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика брюшного тифа и паратифов Ознакомиться со схемой лабораторной диагностики брюшного тифа и паратифов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Бактериологический метод – выделение гемокультуры:
- •2. Серологический метод диагностики тифо-паратифозных заболеваний.
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика сальмонеллезов
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Учет посевов сальмонелл на среде Левина и Олькеницкого (демонстрация).
- •3. Идентификация выделенной культуры возбудителя:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 6. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: патогенные кишечные палочки, иерсинии, кампилобактерии, хеликобактерии
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика эшерихиозов
- •Серологический метод - ра, рнга, ифа с целью выявления антител к эшерихиям и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика иерсиниозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика кампилобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика геликобактериоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 7. Микробиология бактериальных кишечных инфекций: возбудители дизентерии, холеры. Пищевые интоксикации бактериальной природы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика бактериальной дизентерии.
- •Серологический метод. Постановка ра, рнга с целью выявления антител к шигеллам и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Идентификация выделенной культуры шигелл:
- •Микробиологическая диагностика холеры
- •Серологический метод: Постановка ра, рнга, теста иммобилизации вибрионов с целью выявления антител к холерному вибриону и их динамики (исследование парных сывороток) в процессе инфекции.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Пищевые интоксикации бактериальной природы Лабораторная диагностика ботулизма
- •Самостоятельная работа студентов
- •Лабораторная диагностика пищевых интоксикаций стафилококковой этиологии
- •Пищевые интоксикации бактериальной этиологии способны также вызывать:
- •Педиатрические аспекты темы.
- •Тема 8. Возбудители бактериальных воздушно-капельных инфекций: дифтерии, коклюша, гемофильной и пневмококковой инфекции
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика дифтерии
- •Серологический метод
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения дифтерии.
- •Микробиологическая диагностика коклюша и паракоклюша
- •Серологический метод - ра и рск с парными сыворотками больных для констатации нарастания титра антител с целью ретроспективного подтверждения коклюша и диагностики его атипичных форм.
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики, профилактики и лечения коклюша:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Микробиологическая диагностика гемофильной инфекции
- •Микробиологическая диагностика бактериальных пневмоний и острых респираторных заболеваний (орз)
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 9. Возбудители бактериальных воздушно-капельных бактериальных инфекций: туберкулеза, менингококовой инфекции и актиномикоза
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Лабораторная диагностика туберкулеза и микобактериозов
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Ознакомление с препаратами, применяемыми для диагностики, лечения и профилактики туберкулеза:
- •Микробиологическая диагностика проказы
- •Микробиологическая диагностика менингококковой инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Биопрепараты для диагностики и профилактики менингококковой инфекции:
- •Микробиологическая диагностика актиномикоза
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 10. Возбудители бактериальных инфекций, передающихся половым путем: гонореи, сифилиса, бактериального вагиноза, урогенитального хламидиоза и микоплазмоза.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика бактериальных инфекций, передающихся половым путем
- •Микробиологическая диагностика сифилиса
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Серологическая диагностика сифилиса.
- •3. Ознакомиться с препаратами для диагностики и лечения сифилиса:
- •Микробиологическая диагностика мягкого шанкра
- •Микробиологическая диагностика гонореи
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить препараты для диагностики и лечения гонореи.
- •Микробиологическая диагностика урогенитального микоплазмоза
- •Лабораторная диагностика урогенитального хламидиоза
- •Самостоятельная работа студентов
- •Микробиологическая диагностика бактериального вагиноза
- •Самостоятельная работа студентов.
- •Тема 11. Возбудители риккетсиозов.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Микробиологическая диагностика риккетсиозов
- •Микробиологическая диагностика эпидемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика эндемического сыпного тифа.
- •Микробиологическая диагностика Ку-лихорадка.
- •Микробиологическая диагностика эрлихиозов
- •Микробиологическая диагностика бартонеллезов
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Серологический метод диагностики сыпного тифа:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 12. Общая вирусология: морфология и ультраструктура вирусов, методы их культивирования. Экспресс-диагностика вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы лабораторной диагностики вирусных инфекций
- •Взятие и подготовка материала для вирусологической диагностики
- •Вирусологический метод
- •Выделение вирусов на культурах клеток
- •Выделение вирусов на развивающихся куриных эмбрионах
- •Выделение вирусов на экспериментальных животных.
- •Экспресс-диагностика вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Изучение морфологии вирусов по электронограммам.
- •Тема 13. Общая вирусология: диагностика вирусных инфекций. Вирусологический метод исследования. Индикация и идентификация вирусов. Серологический метод диагностики вирусных инфекций.
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Методы выявления (индикация) и идентификации вирусов
- •Индикация вирусов
- •Идентификация вирусов
- •Учет вирусиндуцированных патологических изменений в чувствительных живых системах.
- •Серологический метод диагностики вирусных инфекций
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Индикация вирусов в клетках культуры ткани:
- •3. Выделение и индикация вирусов на ркэ.
- •4. Идентификация вирусов:
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика острых респираторных вирусных инфекций и гриппа
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика натуральной оспы
- •Вирусологическая диагностика герпеса
- •Вирусологическая диагностика кори
- •Вирусологическая диагностика краснухи.
- •Вирусологическая диагностика эпидемического паротита.
- •Самостоятельная работа студентов
- •Тема 15. Пикорнавирусы. Вирусы гепатитов. Ротавирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика пикорнавирусных инфекций Энтеровирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •4. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения:
- •Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Гепатит а
- •Гепатит в
- •Другие гепатиты
- •Самостоятельная работа студентов
- •1. Лабораторная диагностика вирусных гепатитов
- •Вирусологическая диагностика ротавирусных гастроэнтеритов.
- •Тема 16. Арбовирусы. Нейровирусы. Онкогенные вирусы. Медленные вирусные инфекции. Ретровирусы
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Вопросы для самостоятельного изучения
- •Вирусологическая диагностика нейровирусных инфекций Арбовирусные инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •3. Изучить биопрепараты для профилактики, диагностики и лечения клещевого энцефалита:
- •Бешенство
- •Самостоятельная работа студентов
- •2. Изучить биопрепараты, используемые для специфической профилактики и лечения бешенства:
- •Лабораторная диагностика вич-инфекции
- •Самостоятельная работа студентов
- •Вирусологическая диагностика парвовирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика аренавирусных инфекций
- •Вирусологическая диагностика филовирусных инфекций (Марбургская лихорадка и лихорадка Эбола)
- •Тема 17. Патогенные грибы. Возбудители глубоких и субкутанных микозов, дерматомикозов, оппортунистических микозов
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Элементы общей микологии и принципы лабораторной диагностики микозов Биологические свойства грибов
- •Лабораторная диагностика микозов
- •Лабораторная диагностика отдельных микозов Лабораторная диагностика глубоких (системных) микозов
- •Криптокккоз
- •Североамериканский бластомикоз (болезнь Джилкрайста—Стокса)
- •Южноамериканский бластомикоз (паракокцидиоидоз)
- •Гистоплазмоз
- •Кокцидиомикоз
- •Лабораторная диагностика подкожных (субкутанных) микозов Споротрихоз
- •Хромомикоз
- •Лабораторная диагностика эпидермомикозов Рубромикоз (руброфития).
- •Эпидермофития паховая.
- •Эпидермофития стоп.
- •Трихомикозы Трихофития
- •Микроспория.
- •Фавус (парша).
- •Лабораторная диагностика поверхностных микозов
- •Лабораторная диагностика микозов, вызываемых условно-патогенными грибами (оппортунистические микозы)
- •Кандидоз (кандидамикоз)
- •Другие оппортунистические микозы
- •Аспергиллез
- •Пенициллиоз
- •Фикомикоз (мукороз)
- •Пневмоцистоз
- •Самостоятельная работ студентов Лабораторная диагностика эпидермомикозов.
- •Лабораторная диагностика кандидозов.
- •Лабораторная диагностика глубоких микозов.
- •2. Серологический метод:
- •Педиатрические аспекты темы
- •Тема 18. Микробиологическая диагностика протозойных инфекций
- •Перечень конкретных учебно-целевых вопросов
- •Основные методы лабораторной диагностики протозойных инфекций
- •Малярия
- •Криптоспоридиоз
- •Токсоплазмоз
- •Трипаносомоз
- •Лейшманиоз
- •Лямблиоз
- •Трихомониаз
- •Амебиаз
- •Балантидиаз
- •Самостоятельная работ студентов
- •Педиатрические аспекты темы
- •Приложение 1
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для
- •Микробиологических исследований
- •Взятие крови.
- •Взятие спинномозговой жидкости
- •Взятие мочи
- •Взятие желчи.
- •Взятие материала из дыхательных путей
- •Взятие материала из уха.
- •Взятие отделяемого из ран, язв, брюшной полости
- •Взятие материала из глаз.
- •Взятие материала из женских половых органов
- •Взятие материала при аутопсии
- •Взятие, условия хранения и доставки венозной крови для проведения ифа и пцр.
- •Правила взятия и доставки биологических материалов для вирусологических исследований
Самостоятельная работа студентов
1. Бактериологический метод. Изучить этапы выделения чистой культуры возбудителя:
Учет посевов фекалий от больного с подозрением на эшерихиоз на средах Эндо, Левина, Ресселя, Олькеницкого, скошенном MПA (демонстрация).
Провести контроль чистоты выделенной культуры. Со скошенного МПА приготовлен мазок, окрашен по Граму. Промикроскопировать и зарисовать демонстрационный препарат кишечной палочки. Escherichia coli – беспорядочно расположенные грамотрицательные палочки с закругленными краями.
Идентификация выделенной культуры возбудителя по антигенным свойствам. Учесть ориентировочную реакцию агглютинации на стекле с комплексной ОВ-коли сывороткой (О-111, О-55, О-26) и типовыми О-коли сыворотками О-III, 0-55, О-26. Учесть развернутую реакцию агглютинации, поставленную с живой и кипяченой культурами и типовой сывороткой, с которой была положительная ориентировочная реакция агглютинации (демонстрация). Положительное заключение выдается только при положительной РА с убитой культурой (обнаружение специфического О-антигена).
2. Серологический метод. Учет демонстрационных реакций (РА, РНГА, ИФА) в парных сыворотках больных с целью определения нарастания титра антител к возбудителям эшерихиозов.
3. Биопрепараты для диагностики эшерихиозов: типовые агглютинирующие 0-коли сыворотки 0-111,0-55, 0-26.
Микробиологическая диагностика иерсиниозов
Энтеропатогенные иерсинии (Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis) вызывают кишечные инфекции, характеризующиеся поражением лимфоидного аппарата кишечника, токсико-аллергическими осложнениями, развитием генерализованных процессов.
Микробиологическая диагностика иерсиниозов включает бактериологическое и серологическое исследования.
Бактериологическое исследование. Материал, подлежащий исследованию (фекалии, кишечные биоптаты, лимфоузлы или ткань удаленного аппендикса, кровь, слизь из ротоглотки), обрабатывают в течение 1 минуты 0,5% раствором гидроксида калия в 0,5% хлориде натрия, затем делают посевы на агар CIN, Серова или среду Эндо, которые после посева инкубируют при 32 °С в течение 24—48 ч или 24 ч при 370 С и столько же при комнатной температуре. Параллельно посевы помещают в холодильник при температуре +40 С (иерсинии хорошо растут при низких температурах). Пересевы со среды накопления выполняют на 3, 5, 10, 15-е сутки на указанные выше питательные среды.
На 2-й (3-й) день изучают первичные посевы. Энтеропатогенные иерсинии образуют более мелкие колонии, чем прочие энтеробактерии, на средеCIN колонии имеют красный центр и бесцветную периферию («бычий глаз»), на среде Эндо колонии бесцветные или с более интенсивно окрашенным центром. У Y. enterocolitica и у Y. pseudotuberculosis часто наблюдается диссоциация колоний с переходом в R (шероховатые) формы. Характерные для иерсиний колонии пересевают для накопления чистой культуры на скошенный МПА или на среду Ресселя или Олькеницкого.
На 3-й (4-й) день проводят идентификацию чистой культуры по биохимическим и антигенным свойствам (биовар, серогруппа с помощью РА у культур, выращенных при температуре ниже 300 С), учитывают температуру физиологического оптимума иерсиний (28-300 С), определяют чувствительность к антибиотикам. Возбудители иерсиниоза и псевдотуберкулеза оксидазоотрицательны, ферментируют до кислоты глюкозу, обладают нитратредуктазой и другими свойствами (см. табл. 5).
В отличие от возбудителя псевдотуберкулеза, бактерии вида Y. enterocolitica по биологическим свойствам гетерогенны, включая безусловно-патогенные, условно-патогенные (возбудители оппортунистической инфекции или пищевого отравления) и непатогенные для человека иерсинии. Определение факторов вирулентности у Y. enterocolitica предполагает постановку реакций аутоагглютинации и кальцийзависимости, пиразинамидазного теста, определение плазмидассоциированных антигенов.
Тест аутоагглютинации. В две пробирки со средой Кларка засевают исследуемый штамм, инкубируют в течение 24 ч одну пробирку при 370 С, другую - при 26 - 280 С. При наличии вирулентности бактерии, выращенные при температуре 370 С, склеиваются в виде хлопьев, оседающих на дно и стенки пробирки. Культура, инкубированная при температуре 26 – 280 С, не агглютинируется.
Определение пиразинамидазной активности. На скошенную среду с пиразинамидом, засевают исследуемые культуры, выращенные при температуре 25-300 С на ПА, инкубируют при той же температуре в течение 48 часов, после чего смачивают скошенную поверхность раствором сульфата аммонийного железа, оставляя пробирку при комнатной температуре в течение 15 мин. В пробирках с культурами патогенных иерсиний цвет среды остаются без изменений; непатогенные иерсинии меняют цвет скошенной части среды на коричневый.
Тест кальцийзависимости ставят на кальций-дефицитном агаре, который готовят путем добавления раствора оксалата натрия к расплавленному МПА. После перемешивания вносят 4 мл 0,5М раствора хлорида магния. Исследуемую культуру засевают на 2 чашки с кальций-дефицитным агаром, одну чашку инкубируют 24 — 48 часов при 370 С, другую - при 26 - 280 С. При наличии вирулентности при дефиците кальция у клеток, инкубированных при 37 °С (но не 26 – 280 С), прекращается рост бактерий, при этом колонии на чашке либо имеют карликовые размеры (Y. enterocolitica), либо отсутствуют совсем (чаще у Y. pseudotuberculosis). При 26 – 280 С так же, как у непатогенных иерсинии при двух температурных режимах, наблюдается рост колоний обычных размеров.
Серологическое исследование заключается в постановке РА, РНГА или ИФА с иерсиниозными диагностикумами и парными сыворотками крови больных с подозрением на иерсиниоз с целью определения специфических антител.
Генодиагностика – обнаружение типичных фрагментов ДНК патогенных иерсиний в клиническом материале или пищевых продуктах методами ДНК-ДНК-гибридизация или ПЦР-анализа.