Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Книга по лабораторной диагностике.doc
Скачиваний:
1274
Добавлен:
29.02.2016
Размер:
1.1 Mб
Скачать

Области применения пцр

Ведущие фирмы мира уделяют огромное внимание развитию методов ПЦР-диагностики. В настоящее время ПЦР широко используется в ветеринарии для диагностики инфекционных заболеваний бактериальной и вирусной природы, а также для получения рекомбинантных вакцин. Мы приводим неполный перечень тех областей, в которых используют ПЦР:

  • Молекулярная биология

  • Медицина

  • Ветеринария

  • Судебно-медицинская экспертиза

  • Палеонтология

  • Пищевая промышленность

  • Контроль состояния окружающей среды

Принцип лабораторной диагностики при помощи ПЦР

Необходимым этапом является взятие проб для анализа у различных животных, в зависимости от заболевания. Первым шагом является выделение нуклеиновых кислот (ДНК или РНК). ДНК и РНК можно выделять из различных биологических образцов (крови, мочи, мокроты, костной ткани, биопсийного материала и даже из одиночного волоса). С помощью двух специфических праймеров – зондов и фермента (фрагмента Кленова) количество фрагмента-мишени (выбранного участка ДНК) можно увеличить в миллионы раз. С помощью метода ПЦР можно определять как ДНК- , так и РНК- содержащие вирусы, в исследуемых образцах. При детекции РНК, перед проведением ПЦР, должна быть проведена реакция обратной транскрипции (синтез ДНК- копии на основе выделенной РНК). Последним шагом является учет продуктов амплификации методом электрофореза в агарозном геле.

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это серия повторяющихся циклов полимеразной реакции in vitro (в пробирке), т.е. увеличение числа копий определенного участка ДНК, контролируемое человеком.

ПЦР состоит из следующих стадий:

  • Денатурации 94-95ºС (переход двухцепочечной формы ДНК в одноцепочечную форму, под действием высокой температуры)

  • Отжига (гибридизации) праймеров 50-60ºС (одноцепочечные участки ДНК и праймеров, комплиментарные друг другу, «отжигаются», т.е. образуют двухцепочечную форму ДНК.)

  • Полимеризации или элонгации (удлинение) цепи ДНК 72ºС (термостабильная ДНК-полимераза, или фрагмент Кленова, начинает синтезировать (достраивать) вторую цепочку по принципу комплементарности ДНК)

Для детекции продуктов ПЦР используется электрофорез, как самый простой. Дешевый и доступный метод на сегодняшний день. Электрофорез проводится в агарозном геле, содержащим бромистый этидий (агент связывающийся с нуклеиновыми кислотами и светящийся под действием ультрафиолетового света). Под действием электрического тока молекулы ДНК движутся от отрицательного полюса к положительному, при этом молекулы ДНК разной величины движутся с разной скоростью: короткие фрагменты за одно и тоже время походят большее расстояние от старта, чем длинные. После просматривания геля в ультрафиолетовом свете можно говорить о результатах ПЦР ( в случае успешного проведения ПЦР на геле видны светящиеся полоски).

Преимущества метода пцр

  • Чувствительность достигает 10-15 г, (что составляет несколько копий инфекционного агента на пробу объемом 0,2 мл)

  • Специфичность

  • Возможность диагностики латентных вирусных инфекций

  • Возможность обнаружения агрегированного возбудителя

  • Возможность дифференциации видов возбудителей

  • Возможность быстрого выявления возбудителя