Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Лакин Г.Ф. Биометрия учеб. пособие

.pdf
Скачиваний:
51
Добавлен:
25.10.2023
Размер:
16.09 Mб
Скачать

В данном случае доля телок в генеральной совокупности приня­ та равной 0,5, откуда выборочная ошибка доли (она же и ошиб­ ка разности) равняется

п /0,5 X 0,5

,---------

т <і = ^ ^ - г Ѵ - =

УО,0018 = 0,043 и т. д.

'

141

 

Для уровня значимости Р = 0,01 и числа степеней свободы, кото­ рое в таких случаях определяется по формуле k = n — 1= >30 по таблице Стьюдента (см. табл. V приложений) находим tst = 2,6. Так как во всех случаях /ф<7г, нулевая гипотеза сохраняется, вопрос о влиянии возраста производителей на пол потомства остается открытым.

Остановимся на одном из классических опытов Грегора Мен­ деля по скрещиванию двух константных сортов гороха, отличав­ шихся друг от друга по окраске семян: у одного были желтые, а у другого сорта зеленые семена. Во втором поколении от этого скрещивания, т. е. от посева гибридных семян, были получены следующие результаты (табл. 48).

Т а б л и ц а 48

М семьи (отдельные

Окраска

семядолей

Отношение желтых

растения)

желтая

|

зеленая

к зеленым

 

 

 

1

25

 

И

1 : 2 ,2 7

2

32

 

7

1 : 4 , 5 7

3

14

 

5

1 : 2 , 8 0

4

70

 

27

1

: 2 , 5 9

5

24

 

13

1

: 1 ,8 5

6

20

 

6

1

: 3 , 3 3

7

32

 

13

1

: 2 , 4 6

8

44

 

9

1

: 4 , 9 0

9

50

 

14

1 : 3 ,5 7

10

44

 

18

1

: 2 , 4 4

И т о г о . . .

355

 

123

 

1 : 2 , 8 9

В с е г о . . .

 

478

 

 

 

Необходимо установить, соответствуют ли полученные в опыте результаты ожидаемому отношению желтых к зеленым как 3:1. Исходя из теоретической предпосылки, ожидаемое отношение

желтых к зеленым должно быть как

3ДХ478 = 358,5 желтых к

74 X 478= 119,5

зеленым. Откуда доля

зеленых в генеральной

совокупности р

=

= 0,26. Разность р—Р 0,26—0,25 = 0,01.

Средняя ошибка этой разности

160

md = ] / 0’25^ -0-7- =

У0,0004 =

0,02.

 

478

 

 

 

Критерий достоверности t — 0,01

0,5. Эта

величина не

пре­

(Г02

 

 

 

вышает £Sf = l,96 для Р —0,05. Следовательно,

отвергнуть

нуле­

вую гипотезу нельзя; в данном случае имеется хорошее совпа­ дение опытных данных с ожидаемыми в Р2 по второму закону Менделя.

Оценка разности между эмпирическими и ожидаемыми частотами альтернатив по критерию хи-квадрат

При оценке различий, наблюдаемых между

эмпирическими

и ожидаемыми или вычисленными частотами

альтернативных

признаков, можно использовать .критерий Пирсона % 2 (хи-квад- рат). Покажем это на только что рассмотренном примере. Ожи­ даемые и полученные в опыте с горохом отношения желтых се­ мян к численности зеленых нам уже известны. Разность между

этими отношениями равна: для желтых семян

р—Р = 355—

—358,5 = —3,5 и для зеленых— 123—119,5= +3,5.

Возведем эту

разность в квадрат, полученный результат отнесем к ожидаемым частотам каждой альтернативы, т. е. к численности желтых и зеленых семян и, сложив полученные отношения, найдем вели­ чину критерия хи-квадрат:

Х 2 _

(~ 3.:5)2+

(+ 3І_5)2 =

о,034 +

0,103 = 0,137 0,14.

Л

358,5 ^

119,5

> -г

>

Остается сравнить полученную в опыте величину % 2 с ее кри­ тическим значением для взятого уровня значимости (Р) и числа степеней свободы, которое при табличной группировке частот определяется по следующей формуле:

k= (г -1 ) (с -1 ),

где г обозначает число граф (столбцов), а с — число строк таб­ лицы, в которой помещены сравниваемые величины; при этом итоговые столбцы и строки таблицы в расчет не принимаются. В данном случае сравниваются две группы признаков — желтые и зеленые семена. Следовательно, число степеней свободы к — = 2—1 = 1. Этому числу для уровня значимости Р = 0,05 соответ­

ствует %2st — 3,8

(см. табл.

VIII приложений).

Так как

%2ф =

= 0 ,1 4 < 3c2s< = 3 ,8 ,

нулевая

гипотеза сохраняется; наблюдаемые

расхождения между ожидаемыми и опытными

данными

носят

случайный характер.

 

 

 

6—2802

161

Применим тот же критерий к оценке результатов дигибридного скрещивания двух сортов гороха, с которыми эксперимен­ тировал Мендель, сравним результаты расщепления признаков во втором поколении с ожидаемым отношением 9 : 3 : 3 : 1 (табл. 49).

Т а б л и ц а 49

 

Данные

Желтые

Зеленые

Желтые

Зеленые

Всего

 

гладкие

гладкие

морщи­

морщи­

 

 

 

 

 

нистые

нистые

 

Наблюдаемые (р)

315

101

108

32

556

Ожидаемые

(р')

313

104

104

35

556

Разница

p')=d

2

3

4

3

Квадрат

(d2)

/ tf2 \

4

9

16

9

Отношение

0,01

0,09

0,15

0,26

0,51

^ — ; j

Приведенные в табл. 49 ожидаемые частоты вычислены умноже­ нием 9/іб желых гладких, 3/іб зеленых гладких, 3/і6 желтых мор­ щинистых и '/іб зеленых морщинистых на 556, т. е. на общее число наблюдений. Так как в данном случае число граф равно 4, а число строк — двум, число степеней свободы /г=(4—1)(2—

—1) =3. Этому числу для Р = 0,05 соответствует %2Sf = 7,8. Видим, что %2 0 <%2 st, следовательно, нулевая гипотеза сохраняется; рас­ хождения между ожидаемыми и полученными в опыте данными носят чисто случайный характер.

Критерий хи-квадрат можно использовать и для оценки раз­ личных состояний одного и того же качественного признака, группируемых в таблицы разной конструкции. Например, при изучении эффекта от добавочного опыления подсолнечника были получены следующие результаты (табл. 50).

 

 

 

Т а б л и ц а 50

 

Количество семян в корзинке

Опыление

заполненных

пустых

Всего

 

 

Естественное ....................

113

42

155

Д обавочное......................

131

11

142

В с е г о . . .

244

53

297

При таком расположении выборочных данных критерий хи-квад­ рат определяется по формуле:

Г1

 

n(ad cby

+

(89)

 

Ь) (с + d) (а + с) (Ь + d)

162

где а, b, с и d — численности

альтернатив, помещенные в клет­

ках четырехпольной таблицы;

n = a + b + c+d — общее число на­

блюдений. В данном случае критерий хи-квадрат, рассчитывае­ мый по указанной формуле, оказывается равным:

2

297(113 X 11 — 131 Х 42)2

тг =

----------------------------------- = 18,9.

А2 4 4 X5 3 X 155X 142

Для уровня значимости Р = 0,05 и числа степеней свободы k = = (2—1)(2—1) = 1 критическое значение критерия %2st = 3,8 (см. табл. VIII приложений). Полученная в опыте величина это­ го критерия почти в пять раз превосходит его стандартное (кри­ тическое) значение, что отвергает нулевую гипотезу. Следова­ тельно, нужно признать, что влияние добавочного опыления на урожай подсолнечника — явление не случайное, а вполне зако­ номерное.

Расчет критерия хи-квадрат по формуле 89, как это видно из приведенного примера, часто связан с перемножением много­ значных чисел, что создает известные неудобства. Чтобы избе­ жать последних, можно изменить группировку выборочного ма­ териала и определить критерий хи-квадрат по формуле 72. Про­ демонстрируем это на том же примере. Расчет критерия хи-квадрат показан в табл. 51. Ожидаемые частоты (р') рассчи­ тываются по итоговым числам четырехпольной таблицы. На­

пример,

частота

127,3,

что

стоит первой

во

второй

строке

табл. 51,

получена на

основании данных табл.

50 следующим

образом:

(244Х'155) : 297=127,3. Следующая за ней ожидаемая

частота

116,7

определена

аналогичным

способом:

(244Х

Х І42) : 297=116,7. Ожидаемая частота 27,7 найдена таким же способом: (53X155) : 297 = 27,7 и т. д. Остальные действия вид­ ны из табл. 51. Результат получился, как и следовало ожидать, тот же, т. е. % 2 = 18,85= 18,9.

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а 51

 

 

Заполненные семена

Пустые семена ■

 

Группы сравнения

естест.

добав.

естест.

добав.

Всего

 

 

опыление

опыление

опыление

опыление

 

Данные опыта (р)

113

131

42

п

297

Ожидалось

(/?')

127,3

116,7

27,7

25,3

297

Разница р p' = d

14,3

14,3

14,3

14,3

Квадрат d2

d2

204,5

204,5

204,5

204,5

Отношение

1,6

1,8

7,4

8,1

18,85

-

Р

Как уже сообщалось, распределение хи-квадрат является непрерывным. Поэтому при использовании этого критерия для

6:

163

оценки различий, наблюдаемых между фактическими и вычи­ сленными или ожидаемыми частотами дискретных величин, воз­ никают погрешности. На больших числах наблюдений эти по­ грешности существенного значения не имеют. На малочислен­ ных же группах они сказываются на величине критерия хи-квадрат, которая получается несколько завышенной. Чтобы избежать возможных неточностей при вычислении критерия хиквадрат на материале, группируемом в четырехпольную табли­ цу, в формулу 89 вносится поправка Йейтса на непрерывность:

/

п у

[ \ ad — bc\— — ) Х п

у 2 — -------------------------------------------------------

------------------------------------------ ( 9 0 1)

+ Ь) (с + d) + с) (b + d)

Эта формула обеспечивает более точные результаты, особенно на малочисленных выборках.

Применим эту формулу к рассмотренному выше примеру по испытанию действия эндотоксина на выживаемость облученных животных. Соответствующие данные приведены в табл. 46. Мы повторим их здесь для того, чтобы вместе с экспериментальными данными привести и их теоретически вычисленные значения (они заключены в скобки) (табл. 52).

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а 52

Группы особей

Выжило

Погибло

Всего

Опытные . . . . . I . . .

23

(18,72)

13

(17,28)

36

Контрольные.....................

3

(7,28)

11

(6,72)

14

В с е г о . . .

 

26

 

24

50

Если вычислить критерий хи-квадрат для этих данных без по­ правки Йейтса, получается следующая величина:

 

50(23 X П - З Х 13)2

2 289 800

 

1

~~ 26 X 24 X 36 X 14 —

314496 _

’ '

Внесение поправки Йейтса значительно снижает ее:

 

50 ( 123 X 11 — 3 X 131— 25)2

1 786 050

 

Х “

26 X 24 X 36 Х~Т4

_ 314 496*

 

* Прямые

скобки, в которых заключена разность ad be,

указывают на

то, что при использовании этой формулы берутся только абсолютные раз­ ности.

164

Нулевая гипотеза отвергается в обоих случаях, так как %2—і = 5,7>XS<2 = 3,8 для Р = 0,05 и k= (2—1) (2—1) = 1. Тем не менее поправка Йейтса, как видно из этого примера, гарантирует бо­ лее строгий вывод, который получается при сопоставлении фак­ тических и ожидаемых данных с помощью критерия хи-квадрат.

Результаты малочисленных наблюдений можно оценить и с помощью формулы 72, сопоставляя фактические данные с теоре­ тически вычисленными или ожидаемыми; причем величина кри­

терия хи-квадрат получается более точной, если

в указанную

формулу вносится поправка следующего содержания:

- - s f <ІР —P'l —0’5>- 1,

(в„

*Р 1

Применительно к рассматриваемому примеру по испытанию дей­ ствия эндотоксина на выживаемость облученных животных рас­ чет критерия хи-квадрат по этой формуле показан в табл. 53. Полученная величина %2 = 5,67 = 5,7 совпадает с ранее вычислен­ ной по формуле 90.

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а 53

р

Р'

p —p ’ =d

d - 0,5

(d—0,5)3

(rf—0,5)»

P'

 

 

 

 

 

23

18,72

4,28

3,78

14,29

0,76

13

17,28

- 4 ,2 8

3,78

14,29

0,82

3

7,28

- 4 ,2 8

3,78

14,29

1,96

11

6,72

4,28

3,78

14,29

2,13

Сумма . .

5,67

Если же критерий хи-квадрат вычислить для этих данных по формуле 72, т. е. без внесения в нее указанной поправки, полу­ чается величина %2= 7,2, которая была получена нами по форму­ ле 89 (без поправки Йейтса на непрерывность).

Расчет и оценка среднего эффекта доз

В борьбе с вредителями сельскохозяйственных культур, при испытании лечебных препаратов, учете действия на организм токсических веществ и радиоактивных излучений и в других по­ добных случаях приходится решать задачи, связанные с уста­ новлением эффективности различных доз действующего агента. В этих случаях тоже обнаруживается индивидуальная измен­ чивость, когда на одну и ту же дозу или одинаковый по силе раздражитель особи реагируют по-разному и в результате полу­ чается целая гамма индивидуальных различий (вариаций), ко­ торые, как и морфологические признаки, распределяются в виде

165

вариационного ряда. Поэтому испытания доз, как правило, про­ водятся не на отдельных особях, а на их группах или совокуп­ ностях.

Задача сводится, таким образом, к определению и оценке среднего эффекта доз. Решать ее можно по-разному. В одних случаях, когда изучается действие одной какой-либо дозы, ре­ зультаты испытаний обрабатываются по альтернативной схеме («есть эффект — нет эффекта»). Так поступают, например, при проверке действия лекарственных веществ, оценке иммуноген­ ных свойств вакцин, действия на организм токсических и других факторов. В таких случаях возможны лишь два исхода, две альтернативы, поэтому обработка результатов наблюдений про­ водится тем или иным способом, описанным в этой главе.

По-иному приходится подходить к оценке серийных испыта­ ний, когда изучается действие не одной, а сразу нескольких доз. Такие задачи возникают, например, при установлении леталь­ ных доз действующего агента в практике борьбы с вредными на­ секомыми и в других подобных случаях. Решая такие задачи, экспериментатор должен испытывать разные дозы, а для этого необходимо всю совокупность подопытных особей разделить на соответствующее число однородных групп. При этом практиче­ ски невозможно испытать все дозы в интервале от максималь­ ной, не дающей эффекта, до минимальной дозы, дающей 1 0 0 % эффект (например, гибель всех подопытных животных). Обыч­ но исследователь ограничивается испытанием нескольких доз, число которых редко превышает 10.

Как же оценивать результаты серийных испытаний доз? От­ вет на этот вопрос подсказала сама практика. Поскольку еди­ ницей измерения служит доза вещества, то эффект целой серии доз оценивается по средней, т. е. такой дозе, которая вызывает эффект у 50% подопытных особей; эту дозу принято обозначать символом ED50. В тех случаях, когда под эффектом дозы пони­ мается летальный исход, т. е. имеется в виду доза, вызывающая гибель особей, ее обозначают символом LD. Средней летальной дозой называется доза вещества, или действующего агента, вы­ зывающая гибель 50% подопытных особей; она обозначается символом LD50.

Существует два основных способа определения среднего эф­ фекта доз — графический и аналитический. Мы остановимся лишь на описании графического способа, отсылая читателей, ин­ тересующихся более подробно оценкой эффекта доз, и в част­ ности аналитическими методами оценки, к специальным руко­ водствам, указанным в списке литературы (см. ниже).

Оценка по кривой эффекта

При серийном испытании различных доз действующего аген­ та задача сводится, собственно, к установлению зависимости

1G6

между

ответной реакцией организма (следствием или эффек­

том) и

дозой действующего вещества (причиной). Установлено,

что при

достаточно большом числе испытаний, проводимых в

строго стабильных условиях, зависимость между дозой и числом положительных или отрицательных исходов выражается сигмо­

образной

кривой,

получившей название к р и в о й э ф ф е к т а

(Ван дер

Варден,

1960), или х а р а к т е р и с т и ч е с к о й кривой

(Треван, 1927). По ней и определяется средняя доза, вызываю­ щая эффект у 50% особей.

Описываемый графический способ оценки, основу которого положил Беренс (1929), исходит из того, во-первых, что индиви­ дуальные реакции на внешние воздействия распределяются по нормальному закону, а во-вторых, кумулята, или 5-образная кривая эффекта доз, симметрична, и, следовательно, ее цент­ ральная точка, делящая весь ряд накопленных частот пополам, совпадает с центром распределения данного признака. Доста­ точно соединить эту точку перпендикулярами с осью абсцисс и с осью ординат, чтобы найти на оси абсцисс среднюю дозу эффекта. График строится так, чтобы на оси абсцисс отклады­ вались дозы испытываемого вещества, а на оси ординат — ре­ зультаты действия доз, выраженные в процентах от величины каждой дозы. При этом проценты эффективности доз вычисля­ ются по значениям накопленных частот, которые образуются кумуляцией результатов испытания различных доз в направле­ нии от меньших значений к большим. Описываемую методику легче уяснить из соответствующего примера. Представим, что испытывалась сила яда в дозах, рассчитанных в мг на 1 кг веса животных. Испытания проводились на 10 особях и учитывались по летальному исходу. Результаты опыта и их обработка при­ водятся в табл.54.

 

 

 

 

 

 

Т а б л и ц а 54

Доза

Эффективность действия доз

Накопленные частоты

Процент

 

 

 

 

 

 

 

ВЫЖИЛО

 

ВЫ Ж И ВШ И Х

погибших

вещества

погибло

 

погибших

(% эффекта

вмг(кг

 

доз)

100

0

 

10

0

50

0,0

п о

0

 

10

0

40

0,0

1

 

9

1

30

3,2

120

 

 

 

 

 

130

3

'

7

4

21

16,0

140

4

 

6

8

14

36,4

150

6

 

4

14

8

63,6

160

7

 

3

21

4

84,0

170

9

 

1

30

1

96,8

180

10

 

0

40

0

100,0

Данные табл. 54 наносим на график, откладывая на оси абсцисс дозы вещества, а на оси ординат — эффективность доз, выра­ женную в процентах. Соединяя между собой узловые точки в

167

месте пересечения перпендикуляров, получим график летальных исходов (рис. 20). Затем опускаем перпендикуляр на кривую кумуляты из точки, где У = 50%, после чего из точки пересечения первого перпендикуляра с кривой кумуляты опускаем перпенди­ куляр на ось абсцисс и найдем, что средняя доза эффекта рав­ няется 145 мгікг. В этой оценке можно не сомневаться, ибо кумулята занимает площадь, равную 100% исходов. Следователь­ но, половина ее проекции на оси абсцисс соответствует в сред­ нем той дозе, которая вызывает ожидаемый эффект у 50% под­ опытных животных.

Рис. 20. Кумулята летальных исходов в зависимости от дозы вещества:

на оси абсцисс — дозы вещества, на оси ординат — эффектив­ ность доз в процентах

Пробит-анализ

Описанный метод прост, когда он применяется для опреде­ ления средней дозы. Но для нахождения других доз эффекта, например LD65l или LD&0, сигмообразная кривая недостаточно удобна. Чтобы приспособить график для определения не только средней, но и любой другой дозы эффекта, необходимо преобра­ зовать сигмообразную кривую в прямую линию. Трансформация S-образной кривой в график прямолинейной зависимости дости­ гается следующим образом. На оси абсцисс откладываются не сами дозы, а их логарифмы. А на оси ординат вместо эффекта доз, выраженного в процентах, откладываются условные веро­

ятностные единицы, называемые п р о б и т а м и

(от англ, probabi­

lity unit — вероятностная единица). Перевод

процентов эффек­

та в пробиты осуществляется с помощью специальной таблицы,

168

которая приведена в приложениях под № XIV. Количественный анализ, основанный на исследовании зависимости между лога­ рифмами доз и пробитами, соответствующими наблюдаемым в опыте эффектам, получил название прббит-анализа.

Т а б л и ц а 55

Доза

Логарифм

Процент

Пробиты

Доза

Логарифм

Процент

Про­

вещества

дозы

эффекта

вещества

дозы

эффекта

биты

(мг(кг)

 

доз

 

(мгікг)

 

доз

 

100

2,000

0,0

0,00

150

2,176

63,6

5,36

п о

2,041

0,0

0,00

160

2,204

84,0

5,99

120

2,079

3,2

3,15

170

2,230

96,8

6,88

130

2,111

16,0

4,00

180

2,255

100.0

7,50

140

2,146

36,4

4,65

 

 

 

 

Покажем применение этого метода на

примере,

который был

рассмотрен выше. В табл. 55 приведены дозы вещества и про­ центы их эффективности, а также преобразованные величины этих значений — логарифмы доз и пробиты. По этим дан­ ным строим график: на ось абсцисс наносим логарифмы доз, а на ось ординат — проби­ ты и находим связующие их точки в системе координат; че­ рез эти точки проводим пря­ мую линию так, чтобы эмпири­ ческие точки, если они не укла­ дываются на протяжении пря­

мой, примерно в равном коли­

Рис. 21. Пробитый график эффекта

честве оказывались по обе сто­

доз:

на оси абсцисс — логарифмы доз, на оси

роны от этой прямой. Построен­

ординат — пробиты

ная таким образом прямая ли­

 

ния будет наиболее точно отображать закономерность, т. е. зави­ симость эффекта от дозы вещества.

Полученная описанным способом прямая позволяет интерпо­ лировать и LDso и другие дозы, интересующие исследователя. Например, для Ы )5о-эффекта, т. е. в данном случае гибели 50% подопытных животных, lgLZ>5o=2 ,160, что соответствует дозе вещества, равной 145 мг/кг (пробит 50% равен 5). На рис. 21 определение дозы по пробиту 5,0 показано пунктирными линия­ ми. На том же рисунке сплошными линиями показано определе­

ние дозы, соответствующей пробиту 5,99 и lg —2,194.

Она

рав­

няется 156 мг/кг (пробит 5,99 приблизительно

равен

80%

эф­

фекта).

использован в

Описанный метод прост и легко может быть

практической работе, хотя он и не гарантирует во всех случаях высокую точность определений.

169