книги из ГПНТБ / Харт Э. Гидратированный электрон
.pdfПо-видимому, существует качественное и, возможно, полуколичествеиное соответствие между тенденцией компонентов живой клетки захватывать электрон и их реакционной способностью относительно е~ . Только с этой точки зрения информация о ре акциях биополимеров и их функцинальных групп с е~ может представлять интерес для молекулярной радиобиологии.
В последующих разделах рассматривается реакционная спо собность различных компонентов живой клетки по отношению
кle~q. При этом необходимо иметь в виду, что описанные
реакции следует использовать в молекулярной радиобиологии с известной осторожностью, только как модельные процессы. Дело в том, что меж- и внутримолекулярные процессы электрон ного переноса, определяющие химическое поведение данной сложной системы, могут не протекать в индивидуальных ее
фрагментах.
По мере усложнения биологических систем даже в разбав ленных растворах их поведение качественно изменяется. Вслед
ствие этого |
становится все более трудно делать |
определенные |
|
выводы о путях радиолитических превращений |
биологических |
||
систем на основании данных о радиационнохимических |
реак |
||
циях с участием более простых молекул. |
|
|
|
7.2. УГЛЕВОДЫ, ЖИРНЫЕ КИСЛОТЫ И СТЕРОИДЫ |
|
|
|
Углеводы |
по существу нереакционноспособны |
относительно |
|
е~ , и верхний предел констант скорости —порядка |
Ю5 М - 1 |
- с е к - 1 |
[146]. Этот результат находится в соответствии с нереакционноспособностыо спиртов и эфиров относительно e~q.
Насыщенные жирные кислоты с длинной цепью слабо рас творяются в воде даже в своей анионной форме. Так как ионы ацетата и пропионата, а равным образом и углеводороды не реакционноспособны по отношению к е~ , можно заключить, что ионы высших жирных кислот также будут нереакционноспо собны. Зная низкую реакционную способность этилена [133], можно предположить, что и ненасыщенные жирные кислоты будут проявлять низкую активность относительно е~ . Жиры — эфиры жирных кислот, по-видимому, должны быть более реакционноспособны (/JÄJIO7 М - 1 • се/с- 1 ). Стероиды вследствие их малой растворимости в воде еще не исследовались, однако их состав и структура говорят о том, что реакционноспособными могут быть только кетостероиды. В целом молено сказать, что углеводы, жирные кислоты и их обычные производные нереак ционноспособны. Маловероятно, что в лсивой клетке, содержащей гораздо более реакциоиноспособные вещества в значительных концентрациях, жирные кислоты, углеводы и стероиды имели возможность прореагировать с е~ •
180
7.3. АМИНОКИСЛОТЫ И ПЕПТИДЫ
Константы скорости аминокислот и пептидов приведены на рис. 7.1. Если в аминокислотах отсутствуют активные функцио нальные группы, то их реакционная способность относительно
•Цистин (6,1)
•Цистеин (6,3)
•Гистидин (5,96)
•Тиомочебина (6,4)
•Гистидин (6,7)
10* \-
•Триптофан (6,6)
Тирозин (5,8) ^-Фенилаланин (6,3)
10s Аргинин (6,1)
.Оксипрошн (7,0) Гистидин (8,6)
•Метионин (6,0)
<Гірошн (6,7)
Глутаминовая кислота (5,7) Лизин (7,8)
ю7
Прошн (10,1) Аргинин (11,5)
.His-his / Qiy-proi
I.Gly-gty-gly M/Gly-aspNH2(5,33) f/Gly-tryp
iPhe-phe I//GLy-tyr V/My-al */,Gly-leu (6,46) Z^,Gly-gly(6j8) *~Al-gly
»-AspHH2(7,3) Gly-gly-gly(11,f)
Z-Gly-aspNH2(11,4) *~^Gly-leu(8,8) ^•Gly-gly(11,75)
*-AspNH2(11,7) *—Acetyl-gly
•—Acetyl-al
•-At
Рис. 7.1. Константы скорости реакций |
e a q с некоторыми |
ами |
нокислотами и пептидами. |
|
|
al — алаиин; his — гистидин; gly — глицин; |
phe — феннлаланин; |
prol — |
пролин; leu — лейцин; tyr — тирозин; tryp — триптофан: a s p N H j — а с п а - рагнновая кислота; acetyl-a! — ацетнлалании; his-his — гнстндилгнстнднн и т. п. Цифры в скобках — значения pH растворов.
е~ низка [100, 101, 145]. Константа скорости для глицина зависит от pH. Это указывает на то, что реакционная способ ность о-аминокислот (сама по себе низкая: А = S -106 М^-секг1 при рН = 6) обусловлена в основном наличием в них аммониевой
181
кильная группа) имеют еще меньшие константы скорости реак-
группы. Соединения типа RCH(NH2 )COO- (где |
R = H или ад- |
|
ций с е~ ( £ < 1 0 8 М-1-сек-1) |
[145]. Наиболее |
реакционноспо- |
собными аминокислотами являются тирозин, фенилаланин,
триптофан, аргинин [& = |
(І-і-5) • 108 М^-сек~1] |
и, наконец, ги- |
стидин, цистеин и цистин |
( £ > 5 - 1 0 9 М - 1 - сект 1 ) |
[101]. Реакцион |
ная способность первых четырех кислот может быть объяснена наличием в них ароматической или гуанидиновой функциональ ной группы. Последние три кислоты, реакционная способность которых уже обсуждалась в гл. 6, показывают сильную зави симость константы скорости реакции от pH. Гистидин в своей кислой форме имеет константу скорости реакции с с~ почти на два порядка выше, чем биполярный ион. Последний, в свою очередь, в шесть раз активнее, чем анионная форма гистидина [101]. Изменение в 100 раз константы скорости реакции гисти
дина с е~ обусловлено различием в реакционной способности имидазолиум-ионз и имидазола. RSH- и RS~^opMbi цистеина
различаются по реакционной способности в пять раз. Цистин
реагирует с е~ с |
диффузионно-лимитируемой |
скоростью |
(£ = |
||
= 1,3-1010 М^-сек.-1 |
при рН = 6,1). Уменьшение |
этой |
константы |
||
в щелочной среде |
(£ = 2,5-109 М^-сек-1 |
при |
рН=10,7) |
[101], |
|
возможно, обусловлено отрицательным зарядом кислоты. |
|
||||
При восстановлении алифатических аминокислот гидратиро- |
|||||
ванным электроном |
происходит их дезаминирование |
[69, |
464]: |
||
RCH (NH+) СО7 + е~-+ RCH (NH3 ) COjf -+ RCHCCÇ + |
NH 3 . |
|
Такое поведение этих соединений отличается от поведения ионов метиламмоиия, которые при взаимодействии с е~ дают атомы H [381]. В ароматических аминокислотах дезаминирования не происходит, имеет место восстановление ароматического кольца гидратированным электроном [125]. В цистеине после элек тронного захвата разрывается связь С—S [465]:
HSCHoCH (NH2 ) C O O " + e~ -* HSCH2 CH (NH2 ) СОО=~ -* H S " +
+ C H 2 C H (NHa ) C O O -
и далее
HSCH2 CH (NH2 ) C O O - + |
CH 2 CH (NHS ) C O O " -* SCH2 CH (NH2 ) COO~ + |
+ |
CH 3 CH (NH2 ) C O O - . |
Пептиды значительно реакционноспособнее, чем аминокисло ты [102, 145]. Активность этой группы соединений опреде ляется аммониевой группой пептида, а не карбонильной, что следует из рассмотрения относительной реакционной способно сти ацетилглицина и глицилглицина. Константы скорости реак ций этих соединений с е~ отличаются на два порядка. Зави симость реакционной способности глицилглицина от pH также
182
подтверждает этот вывод [100]. Кроме того, установлена ли нейная связь между логарифмом константы диссоциации аммо ниевых групп аминокислот и дипептидов и логарифмов констан ты скорости их взаимодействия с е~ [100, 102] (рис. 7.2). На клон прямой (ордината, т. е. константа скорости, меняется на
|
ff |
|
7 |
8 |
|
g |
10 |
pH |
Рис. 7.2. Влияние рК протежированных групп некоторых амино |
||||||||
кислот и пептидов на константы скорости |
их реакций с е ~ |
: |
||||||
v a l — в а л і ш ; ser — серии; |
lys — лизни; |
arg — аргинин; Met — метноннн: |
||||||
загс — саркознн; |
HO-prol — оксипролнн; |
v-arn |
but. ас — ѵ - аминомасляная |
|||||
кислота; |
а - а| — а а л а н и н ; |
В - а| — 0 - аланнн: остальные |
обозначения см . |
|||||
на |
рис. |
7.1. |
|
|
|
|
|
|
четыре |
порядка) |
составляет 6,3 на |
единицу |
рК, что |
более чем |
вдвое превышает наклон, вычисленный из соотношения Бренстеда для неорганических и органических протонсодержащих кис лот, включая ион аммония [374] (см. гл. 5). Такое различие не удивительно, так как продуктом реакции кислых форм ами нокислот является аммиак, а не атом водорода [464]. В то же время это расхождение находится в соответствии с выводом, сделанным в гл. 5, согласно которому выполнение соотношения Бренстеда для реакций е~ не обязательно должно указывать на протонный перенос.
В гл. 6 было отмечено, что у аминокислот и пептидов истин ным реакционным центром служит карбонильная группа, кото рая активирована по отношению к нуклеофильной атаке сопря женной аммониевой группой. Поскольку эти группы оказывают друг на друга индукционное влияние, значение рК. иона NH^" в
183
них является функцией сродства к электрону карбонильной группы.
Пептиды, подобно аминокислотам, претерпевают дезаминирование в результате присоединения электрона к группе —CONIT— с дальнейшим разрывом пептидной цепи. Такой тип радиационного разложения характерен для дипептидов [197] и циклического полимиксин-додекапептида В [298]. Радикалы
—C(OH)NH—, по-видимому, имеют относительно большое вре мя жизни ( т і / 2 > 1 0 - 3 сек) и до того, как произойдет дезаминирование, могут окисляться до исходного пептида окислительны ми продуктами радиолиза, образующимися в сравнимых кон-' центрациях одновременно с гидратированиым электроном [255].
Радикалы —C(OIT)NH— также восстанавливаются добавками
веществ типа |
цистеина, участвуя в необратимом химическом |
превращении |
[255]. Таким образом, шістеии — классический |
радиопротектор, присутствующий в относительно низких концен
трациях, играет |
роль сенсибилизатора. |
Эти факты, находящиеся |
в соответствии |
с явлением ускорения |
радиационного разложе |
ния цитознна в присутствии цистеина, должны предостеречь би ологов от интерпретации поведения радиобиологической систе мы на основании известных законов радиолиза простых водных систем.
Как и при радиационном разложении цистеина, присутствие группы SH в олигопептидах качественно изменяет процесс раз ложения. Реакция е~ с глутатионом, например, приводит к вы делению K S - без разрыва пептидной цепи [303]. Очевидно, в длинном полипептиде или протеине происходит перенос атома H
от группы SH к восстановленной группе — C(OH)NH — в ре зультате внутримолекулярной перегруппировки. При этом уве личивается радиашюннохимический выход разрыва пептидных связей.
7.4. ПОЛИПЕПТИДЫ И ПРОТЕИНЫ
При переходе от аминокислот и олигопептидов к полипепти
дам появляются новые параметры, которые определяют |
|
реак |
||||||||||
ционную способность этих соединений. Импульсным |
методом |
|||||||||||
измерены |
константы |
скорости реакций |
полилизина |
(молекуляр |
||||||||
ный вес |
44 000) и полиглутаминовой |
кислоты с |
е~ |
при |
|
рН = |
||||||
= 6—12 |
в присутствии до 0,5 M NaCl [36]. Скорость реакции |
|
поли |
|||||||||
лизина |
уменьшается |
с |
ростом |
pH |
[£=(15,0; |
8,0; |
0,2; |
0,1 и |
||||
0,03)- 10й |
М - 1 - с е к - 1 |
соответственно |
при рН = 6,0; |
7,5; 9,0; |
10,5 |
|||||||
и 11,9]. В |
нейтральном |
растворе при |
р Н < 8 добавление |
|
NaCl |
|||||||
уменьшает |
скорость |
реакции |
|
[£=(10,0; |
0,9; |
0,15 |
и |
|||||
0,07) - 10й |
М - 1 -се/с-' в отсутствие |
NaCl |
и в 0,01; |
0,05; |
0,5 |
M ра |
створах NaCl соответственно]. Скорость реакции полиглутами новой кислоты не зависит от pH в интервале 6—12; добавление
184
0,5 |
моль/л |
NaCl |
увеличивает |
константу |
скорости |
до |
||
3-Ю9 |
М-1-секгК |
|
|
|
|
|
||
Полилизин в нейтральном растворе более реакционноспосо- |
||||||||
бен |
по |
отношению |
к е~ , чем лизин |
(k — 2-\07 |
M~l -се/с- 1 |
при |
||
рН = 7,8) |
или |
лизиллизин (&<5-108 |
М - |
1 - с е к - 1 при рИ = 8). |
Это |
повышение реакционной способности, возможно, связано с мультиположительным зарядом полиэлектролита (каковым является полилизин), так как константы скорости нейтральных молекул меньше по крайней мере на три порядка. Заряд обусловливает два эффекта: увеличивает размеры молекул в результате обра зования длинных спиралей из кольцеобразного нейтрального полимера и создает поле, притягивающее отрицательные гидратированные электроны. Заряд полиэлектролита, однако, может экранироваться противоионами, что в общем подобно нейтрали зации. Количественная оценка скорости реакций полилизина по
казывает, что как положительно заряженный |
полиэлектролит, |
|
так и кольцеобразный |
нейтральный полипептид |
реагируют с е~ |
со скоростью, близкой |
к лимитируемой диффузией. |
Скорость реакции полиглутамата также достигает диффу зионного предела. Во всей экспериментальной области pH поли электролиты находятся в отрицательно заряженной, частично кольцеобразной форме, и поэтому солевой эффект в этих систе мах небольшой. Добавление электролита, который экранирует отрицательные заряды, вызывает свертывание молекул поли электролита в спирали, уменьшая тем самым их размеры. Сле довательно, ожидаемое увеличение реакционной способности, обусловленное экранированием отрицательных зарядов, в неко торой степени компенсируется уменьшением общего поперечно го сечения молекулы полиэлектролнта.
Влияние конфигурации на реакционную способность прояв ляется и у протеинов. Реакционная способность рибонуклеазы, желатина и коллагена изменяется в 10 раз при переходе от бес порядочных колец к вытянутым цепям или спиралям [103]. Ско рость реакции при этом лимитируется диффузией, и различие в константах скорости может быть обусловлено только геомет рией соединений.
Таким образом, поведение систем е~ —полипептид можно объяснить тем, что гидратированный электрон, встречающийся с молекулой полиэлектролита, удаляется из раствора в резуль тате необратимого процесса. Хотя электрон и не может на зна чительное ( > 1 0 - 9 сек) время попадать на отдельную орбиталь, у него нет шансов избежать захвата при наличии высокой кон центрации ловушек в полиэлектролите. Другим объяснением по
ведет: л таких систем может служить существование в |
полиэлек |
||||
тролитах |
зоны |
проводимости. В этом |
случае |
константа |
скорости |
реакции |
е~ |
с соединением должна |
быть, |
по-видимому, равна |
сумме констант скорости для индивидуальных ловушек, каждая
185
из которых имеет относительно низкую реакционную способ ность. Последний механизм, возможно, относится к процессам туннелирования, которые характерны для многих реакцией ej .
Имеются определенные доказательства наличия туннельного механизма. Импульсным методом показано [36], что полилизин, содержащий один ион меди на одну молекулу полиэлектролита, реагирует с радикалами ОН со скоростью, лимитируемой диффу зией. При этом Си (II) количественно окисляется до Си ( I I I ) . В условиях эксперимента взаимодействие между ОН и Си (II)
практически исключено, поэтому должен происходить |
очень |
||
быстрый внутримолекулярный |
перенос электрона. |
Система |
|
рибонуклеаза — Си (II) ведет |
себя |
подобным же |
обра |
зом [307]. |
|
|
|
Теория внутримолекулярной электронной проводимости в не сопряженных полиэлектролитах находится в согласии с корре ляцией между константами скорости реакций желатина, лизо-
шіма |
и рибонуклеазы и суммой реакционных способностей |
ами |
|||
нокислотных составляющих |
этих |
соединений [100, |
102, |
103]. |
|
Эта |
корреляция, однако, |
может |
быть случайной, и |
протеины, |
которые реагируют со |
скоростями, |
достигающими диффузион |
|
ного предела, способны |
играть роль |
ловушек электронов вооб |
|
ще в соответствии с обычным механизмом |
захвата. |
||
Очевидно, в любом |
случае поведение |
полимерных молекул |
качественно отличается от поведения низкомолекулярных ве ществ. Это делает весьма сомнительной прямую экстраполяцию поведения мономерных компонентов живой материи к поведению биополимеров. Такой вывод, сделанный на основании поведения биополимеров в разбавленных растворах, тем более справедлив для внутриклеточной среды.
В клетке, где биополимеры находятся |
в тесном |
контакте |
друг с другом, вполне может происходить |
миграция |
электрона |
на расстояние, соответствующее размерам нескольких агрегиро ванных молекул биополимера. Независимо от механизма элек тронного переноса, будь то переход электрона в зону проводи мости, миграция по полимерным молекулам или туннелирование между несвязанными ловушками, электрон в конце концов^ за хватывается ловушкой с самым высоким сродством к электрону. Это обстоятельство может объяснить селективность радиацион ных повреждений в протеинах [102, 307]. Эксперименты пока зывают [7], что электроны могут переноситься от одной орга нической молекулы к другой по мере увеличения их сродства к электрону.
Хотя сродство к электрону функциональных групп в биопо лимерах и простых мономерах различно, в первом приближении этим можно пренебречь. Тогда восстановление одних и тех же аминокислот гидратированным электроном, по-видимому, долж но протекать одинаково как в протеине, так и в его разбавлен ном гидролизате. Отсюда становится ясным, что кинетическое
186
поведение мономеров по отношению к е~ несет в себе важную информацию, пригодную для использования в молекулярной радиобиологии.
7.5. ПУРИНЫ, ПИРИМИДИНЫ И НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
Как уже упоминалось в гл. 6, пурины и пиримидины прояв ляют высокую реакционную способность относительно е~ , и реакции большинства из них протекают со скоростями, лимити руемыми диффузией. Поэтому следует ожидать высокой реак ционной способности и у биологически активных молекул, со держащих пуриновые или пиримидиновые группы. Обнаружено,
что аденозин-5'-фосфат |
реагирует с е~ достаточно |
быстро |
(6 = 3,8-109 М~х -сек-1), |
хотя й несколько медленнее, чем мож |
|
но было ожидать для |
диффузионно-лимитируемой |
реакции |
[403]. Аденин взаимодействует в три раза быстрее, что объяс няется, видимо, влиянием отрицательно заряженного фосфата. Как и следовало предполагать на основании данных о реакци
онной |
способности |
низкомолекулярных соединений, Д Н К |
реаги |
|
рует |
с е~ |
со |
скоростью, лимитируемой диффузией |
(k> |
> 1 0 1 2 |
М - ' - с е к - 1 ) |
[103, 403]. Принимая во внимание очень вы |
||
сокое |
сродство |
к электрону всех азотистых оснований в Д Н К и |
легкость миграции электрона через я-связи сопряженных пури нов и пиримидинов, в настоящее время нельзя предсказать, ка кой из четырех реакционноспособных компонентов Д Н К яв ляется акцептором дополнительного электрона. Возможно, что электрон, присоединившийся сначала к ДНК, затем восстанав ливает одну из функциональных групп протеиновой оболочки ну клеиновой кислоты живой клетки. С другой стороны, не исклю чена возможность того, что один из радикалов, образованный при действии ОН или другого окислительного радикала, спосо бен восстанавливаться электроном, временно захваченным ДНКВероятность такого механизма находит экспериментальное под
тверждение. |
Так, |
Д Н К |
в концентрированных |
растворах |
|
(>0,6 мг/мл) |
почти |
не дезактивируется |
гидратированный элек |
||
троном, хотя |
она весьма |
чувствительна |
к действию |
радикалов |
ОН [92]. По-видимому, электрон, захваченный азотистым осно ванием, удаляется из него до того, как произойдет протонирование этого анион-радикала. Поэтому наиболее вероятно, что электроны имеют второстепенное значение в критическом по вреждении клеточного ядра, хотя они могут активно участвовать в репарационных процессах, протекающих за время < 1 0 - 8 сек.
В работах [276—278] найдено, что 5-бромурацил (BrU), введенный вместо тимина в ДНК, повышает радиочувствитель ность нуклеиновой кислоты. При этом вероятность радиацион ного повреждения Д Н К прямо пропорциональна содержанию в ней бромурацила. Эти факты находятся в соответствии с нашей
187
трактовкой роли Д Н К и электронов в молекулярной радиобио логии. Вероятно, BrU, будучи галоидопроизводным, имеет бо лее высокое сродство к электрону, чем тимин. Кроме того, имея присоединенный электрон, BrU, по-видимому, должен претерпе вать необратимое дегалоидирование с образованием свободного радикала. Таким образом, BrU — заместитель с высокой веро ятностью (р) химического превращения (см. разд. 7.1). Захва тывая электрон и являясь источником необратимого химического превращения, BrU удаляет из системы электрон, который в про тивном случае мог бы восстанавливать окисленное место, «за лечивая» таким путем некоторые из радиационных поврежде ний. По этой причине 5-бромурацил можно рассматривать как сенсибилизатор.
Механизм восстановления электроном радиационного по вреждения может быть проиллюстрирован на примере димеров тимина, которые предположительно являются продуктами его радиолиза. Эти димеры под действием гидратированных элек тронов превращются в мономеры [150]. Точный механизм та кой деструкции неизвестен.
Влияние геометрии трехмерной структуры на радиочувстви тельность биополимеров видно в случае ДНК . Показано, что
даже |
в разбавленных растворах двойная спираль гораздо ме |
нее |
радиочувствительна, чем беспорядочная кольцевая струк |
тура |
[453]. |
выводы
Некоторые агрегаты биополимеров в живой клетке, имеющие
объем |
~ 1 0 нм3, |
с вероятностью, близкой к единице, присоеди |
няют |
электрон, |
кинетическая энергия которого меньше 1 эв. |
Поэтому из изучения кинетики поведения этих систем в разбав ленных растворах можно получить очень мало информации, представляющей интерес для радиобиологии. Термализованиый (сольватированный или несольватированный) электрон реаги рует с макромолекулой при каждом столкновении. Затем про исходит перенос электрона в результате либо межмолекулярно го, либо внутримолекулярного процесса к месту с высоким срод ством к электрону, которое в то же время имеет высокую веро ятность необратимого химического превращения.
Для оценки радиационных повреждений, производимых электроном в живой клетке на молекулярном уровне, необходи ма идентификация функциональных групп, претерпевающих при этом необратимые изменения. Другими словами, молеку лярная радиобиология нуждается в информации о судьбе си стемы за время < 1 0 - 1 0 сек после присоединения электрона. За это время электрон может быть перенесен на значительное рас стояние в пределах агрегата биополимеров [7] или покинуть агрегат, присоединившись к соседней молекуле.
188
Возможно, роль электронов в радиационном повреждении минимальна. В пользу этого вывода говорит тот факт, что ре акции переноса электрона достаточно часто встречаются в обыч ных биологических системах. Однако неизвестно, насколько ча сты процессы электронного переноса в биохимии ядра клетки. Если принять, что электрон свободно перемещается по молекуле биополимера, то, введенный в систему радиационным способом, он, по-видимому, будет локализоваться в том же месте, где и электрон, введенный в систему ферментом в обычных биохими ческих процессах. Продукт радиолитического восстановления может затем регенерироваться в обычном биохимическом про цессе. Нельзя забывать, что общее число электронов, образовав шихся в живой клетке, облученной летальной дозой, не превы шает 1 нмоль/г. Это равно или меньше числа электронов, кото рые вносятся в клетку при обычных биохимических процессах за несколько секунд. Кроме того, образованные радиационным способом электроны реконструируют молекулы, поврежденные радикалами ОН, а потому скорее уменьшают, а не увеличивают радиационное повреждение. На основании приведенных выше фактов можно сделать вывод, что из всех продуктов радиолиза живой клетки электрон наносит наименьший вред.