Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Моделирование и масштабирование биотехнологических процессов. Учебное пособие для студентов магистратуры по направлению подготовки 19.04.01 «Биотехнол

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
07.09.2026
Размер:
1 Мб
Скачать
Министерство образования и науки Российской Федерации Сибирский государственный университет науки и технологий
имени академика М. Ф. Решетнева
П. В. Миронов
Е. В. Алаудинова
МОДЕЛИРОВАНИЕ И МАСШТАБИРОВАНИЕ
БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ
Утверждено редакционно-издательским советом университета
в качестве учебного пособия для студентов магистратуры
по направлению подготовки 19.04.01 «Биотехнология»
всех форм обучения
Красноярск 2017
1
УДК 561.284.579.61(075.8) ББК 30.16я73
М64
Рецензенты:
доктор химических наук, профессор С. Р. Л
ОСКУТОВ
(Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН);
кандидат технических наук, доцент Н. С. Р
ЕШЕТОВА
(Сибирский государственный университет науки и технологии
имени академика М. Ф. Решетнева)
Миронов, П. В.
М64 Моделирование и масштабирование биотехнологических процес-
сов : учеб. пособие для студентов магистратуры по направлению под-
готовки 19.04.01 «Биотехнология» всех форм обучения / П. В. Миро­нов, Е. В. Алаудинова, В. В. Тарнопольская ; СибГУ им. М. Ф. Решет­нева. – Красноярск, 2017. – 114 с.
Изложены вопросы создания математических моделей роста микроорганиз­мов в условиях периодического и непрерывного культивирования, также отраже­ны основные способы масштабирования процессов микробного роста. Материал поможет приобрести навыки создания и анализа математических моделей роста микробных популяций, грибного мицелия, тканей растений, что, в свою очередь, обеспечит формирование соответствующих компетенций в области моделирова­ния, разработки технологических процессов и проектирования биотехнологиче­ских производств у магистрантов, обучающихся по направлению подготовки
19.04.01 «Биотехнология».
УДК 561.284.579.61(075.8)
ББК 30.16я73
© СибГУ им. М. Ф. Решетнева, 2017 © Миронов П. В., Алаудинова Е. В., Тарнопольская В. В., 2017
2
ОГЛАВЛЕНИЕ
Предисловие ..................................................................................................... 5
1. Методы исследования биотехнологических систем ............................. 8
1.1. Основные принципы системного анализа ....................................... 8
1.2. Принципы построения математической модели
биохимического реактора ............................................................... 11
Контрольные вопросы и задания .......................................................... 15
2. Модели кинетики роста микроорганизмов
в биохимических реакторах .................................................................... 16
2.1. Рост и развитие микробной популяции ......................................... 16
2.2. Модели зависимости скорости роста микроорганизмов
от концентрации субстрата ............................................................ 21
2.3. Модели зависимости скорости роста микроорганизмов
от
концентрации продукта метаболизма ...................................... 28
2.4. Многофакторные модели ................................................................ 30
2.5. Отмирание биомассы (диссимиляция) .......................................... 32
2.6. Зависимость скорости роста микроорганизмов
от температуры ................................................................................ 34
2.7. Модели зависимостей скорости роста микроорганизмов
от величины рН ............................................................................... 35
2.8. Математические модели процессов биосинтеза
продуктов метаболизма как функции удельной
скорости роста ................................................................................. 37
2.9. Субстрат-зависимые математические модели
кинетики биосинтеза продуктов метаболизма ............................. 38
2.10. Модели биосинтеза продукта, основанные
на оценке возраста культуры микроорганизмов ........................ 40
2.11. Модели кинетики деградации (инактивации)
продуктов метаболизма ................................................................ 44
2.12. Модели кинетики потребления субстрата .................................. 45
2.13. Блочный подход к моделированию процессов
ферментации .................................................................................. 50
Контрольные вопросы и задания .......................................................... 51
3. Модели кинетики роста микроорганизмов в биореакторах
периодического действия ........................................................................ 53
3.1. Замедление скорости ростамодель Ферхюльста ...................... 54
3.2. Модель роста, учитывающая потребление субстрата ................. 56
3.3. Оптимизация продолжительности процесса
периодического
культивирования ................................................. 58
Контрольные вопросы и задания .......................................................... 60
3
4. Моделирование кинетики роста микроорганизмов
в биореакторах непрерывного действия .............................................. 61
4.1. Условия непрерывного культивирования
микроорганизмов ............................................................................. 61
4.2. Теория хемостатного культивирования ......................................... 63
4.3. Способы определения параметров роста культуры
из экспериментальных данных хемостатного
культивирования .............................................................................. 68
4.4. Ингибирование продуктами метаболизма в условиях
хемостатного культивирования ...................................................... 69
4.5. Непрерывное культивирование с рециркуляцией
биомассы ........................................................................................... 74
4.6. Автоселекция в процессе хемостатного
культивирования .............................................................................. 76
4.7. Сравнение производительности по биомассе
периодического и непрерывного процессов ................................. 77
Контрольные вопросы и задания ........................................................... 78
5. Масштабирование биотехнологических процессов ........................... 79
5.1. Постановка задачи масштабирования ............................................ 79
5.2. Подход к масштабированию на основе учета
концентрации растворенного кислорода:
аэрация при культивировании микроорганизмов ........................ 81
5.3. Влияние концентрации растворенного в среде
кислорода на рост микроорганизмов ............................................. 82
5.4. Абсорбция кислорода в биореакторах
периодического действия при культивировании
микроорганизмов ............................................................................. 86
5.5. Абсорбция кислорода в биореакторе непрерывного
действия при культивировании микроорганизмов ...................... 91
5.6. Методы определения параметра K
a в аппаратах
L
различного масштаба ....................................................................... 93
5.7. Другие критерии масштабного перехода ...................................... 95
Контрольные вопросы и задания ........................................................... 99
6. Стехиометрия в процессах биотехнологии ........................................ 100
6.1. Вывод «формулы» биомассы микроорганизмов ........................ 101
6.2. Расчет выхода биомассы на углеродный субстрат ..................... 103
6.3. Расчет тепла, выделяемого в биохимическом процессе ............ 107
Контрольные вопросы и задания ................................................ 109
Послесловие .................................................................................................. 110
Библиографический список ...................................................................... 111
Приложение .................................................................................................. 113
4
ПРЕДИСЛОВИЕ
Согласно определению Европейской ассоциации биотехнологов
(третий съезд, Мюнхен, 1984 г.), биотехнологияэто интегрирован-
ное использование биохимии, микробиологии и инженерных наук с целью технологического применения способностей микроорганиз­мов. Она создает возможность получения с помощью легкодоступных и возобновляемых ресурсов важных для жизни и благосостояния лю­дей веществ и соединений. В промышленном масштабе подобная биотехнология представляет собой уже биоиндустрию. Последняя включает в себя, с одной стороны, отрасли, в которых биотехнологи­ческие методы могут с успехом заменить широко используемые в на­стоящее время традиционные методы, а с другой – отрасли, в которых биотехнология играет ведущую роль.
Современный технический прогресс в биотехнологии и смежных отраслях связан с созданием новых высокоинтенсивных производств, использованием агрегатов большой единичной мощности, разработ­кой безотходных технологических процессов с замкнутыми энергети­ческими и сырьевыми циклами. Решение этих задач становится невозможным при использовании лишь интуиции научных работников и инженеров или качественных характеристик систем и требует дос­таточно точного и строгого количественного анализа. Значительную роль в решении такого рода задач играют методы математического моделирования и системного анализа.
Количественные представления элементарных процессов и их взаимосвязь, основанные на использовании фундаментальных законов физики, химии и биохимии, формируются в виде математических моделей отдельных стадий технологического процесса и системы в целом. Точность таких моделей, их адекватность реальному слож­ному процессу зависят от точности и правильности представлений закономерностей, описывающих элементарные процессы и их взаи­мосвязь.
Развитие прикладных биотехнологий, гибких автоматизирован­ных производственных систем и устройств и других, быстро разви­вающихся наукоемких отраслей, привели к дальнейшему усложнению биотехнологических процессов, аппаратов и систем. Их эксперимен­тальная отработка требует все больших затрат времени и материальных ресурсов, а в ряде случаев ее проведение в полном объеме преврати­лось в проблему, требующую нестандартных решений. В этих усло­виях существенно увеличилось значение расчетно-теоретического
5
анализа характеристик ферментационных аппаратов, технологий и систем.
Очевидно, что во всех проблемах биотехнологии математиче­ское моделирование должно играть первостепенную роль. Например, без математического моделирования невозможно осуществить опти­мизацию любых технологических процессов. В простейшем случае даже выбор наиболее благоприятного режима работы биореактора, при котором микробная культура достаточно хорошо развивается, требует знания закономерностей роста культуры.
В целом, математическое моделирование любого биотехнологи­ческого процесса, аппарата или системы сводится к оценке скорости протекания биохимических процессов, которая определяется скоро­стью биохимической деятельности (роста) микрообъектов в зависи­мости от одного или нескольких параметров среды, обеспечивающей протекание метаболических процессов. В качестве основных видов биохимической деятельности микрообъектов, используемых в био­технологии, как правило, выступают следующие:
рост клеточной биомассы, представляющей собой продукт;
биосинтез в процессе роста и развития клеток ценных биохи-
мических продуктов, выделяющихся в среду (внеклеточные продукты) или накапливающихся в биомассе (внутриклеточные продукты);
– биотрансформация – процесс, в результате которого под воздей­ствием биологической деятельности микроорганизмов или ферментов происходит изменение химического состава исходного химического вещества;
– потребление микроорганизмами из жидких сред различных веществ, которые являются загрязнителями;
– выщелачивание с помощью микроорганизмов, т. е. перевод в растворенное состояние некоторых веществ, находящихся в твер­дых телах;
– использование биохимической деятельности микроорганизмов с целью образования газов для создания, например, пористых мате­риалов. Данные процессы также широко используются в пищевой промышленности.
Кроме того, при переходе от лабораторных исследований к аппаратам большего объема в производственной практике практи­чески всегда возникает проблема масштабирования. Оказывается, что результаты лабораторных исследований процессов биосинтеза по производительности, по выходу продуктов существенно различают­ся для аппаратов большого объема, иногда в несколько раз.
6
Отсутствие научно обоснованных критериев масштабирования предопределяет многоступенчатость опытно-технологических работ, существенно замедляет внедрение полученных в полупроизводственных условиях технологических результатов и требует проведения дорого­стоящих и длительных экспериментов непосредственно на крупно­масштабном оборудовании. Сложность определения условий масштаб­ного перехода, с одной стороны, и важность изучения этих условий – с другой, приводят к необходимости применения системного подхода, суть которого в данном случае состоит в том, что вся информация, получаемая на лабораторных, опытных и промышленных установках, последовательно накапливается и обогащается в процессе разработки полной математической модели биореактора. Построенная таким образом математическая модель позволяет наиболее достоверно осуществлять масштабный переход и решать задачи оптимального проектирования биореакторов.
Эффективная работа биореактора во многом определяет технико­экономические показатели всего производства. При этом существует тесная взаимосвязь вопросов аппаратурного и технологического оформления процессов биосинтеза, в частности, рассмотрение вопро­сов гидродинамики и массопередачи являются определяющими при реализации процессов в крупнотоннажных ферментаторах.
В настоящее время масштабный переход от лабораторного био­реактора к промышленным аппаратам – ферментаторам без промежу­точных этапов иногда возможен лишь для отдельных узлов. На каждом этапе увеличения масштаба ферментации решаются конкретные задачи отработки режимов ведения процесса и его оптимизации. Для этой цели разработано большое количество упрощенных и достаточно сложных математических моделей, без которых проблему масштаби­рования биотехнологических процессов решить невозможно.
Задачей данного учебного пособия является способствовать становлению профессиональной компетентности магистрантов, обучающихся по направлению 19.04.01 «Биотехнология», через фор­мирование у них знаний и умений в области моделирования биотех­нологических процессов; приобретение навыков исследования и моделирования кинетики роста микроорганизмов, а также навыков масштабирования и расчета основного технологического оборудования.
Материал
пособия охватывает все разделы курса «Моделирова­ние и масштабирование биотехнологических процессов». Начинать процесс изучения дисциплины рекомендуется с ознакомления с пе­речнем ключевых слов (см. приложение). Для организации процесса контроля усвоения знаний каждый раздел пособия обеспечен кон­трольными вопросами и заданиями.
7
1. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМ
При исследовании биотехнологических систем в настоящее время широко применяются методы системного анализа и математи­ческого моделирования, без которых невозможно получение исходных данных для технологического проектирования биотехнологических производств.
1.1. ОСНОВНЫЕ ПРИНЦИПЫ СИСТЕМНОГО АНАЛИЗА
К основным положениям системного анализа, позволяющим, решать задачи исследования биотехнологических систем, можно отнести:
– четкую формулировку цели исследования, постановку задачи по реализации этой цели и определение критерия эффективности решения задачи;
– разработку развернутого плана исследования с указанием основных этапов и направлений в решении задачи;
– пропорционально-последовательное продвижение по всему комплексу взаимно-связанных этапов и возможных направлений;
– организацию последовательных приближений и повторных циклов исследований на отдельных этапах;
– принцип нисходящей иерархии анализа и восходящей иерархии синтеза в решении составных частных задач и общей задачи в целом.
Центральным понятием системного анализа является понятие системы. Биотехнологическая система (БТС) – это совокупность взаимно связанных технологическими потоками аппаратов, в которых осуществляется определенная последовательность операций (подго­товка сырья и минеральных солей, засевной биомассы, выращивание микроорганизмов, их выделение из жидкой фазы и т. д.) до получения товарного продукта. Продуктами биосинтеза могут быть биомасса микроорганизмов, биологически активные вещества и т. п.
Элементами БТС являются технологические аппараты, такие, например, как инокулятор – аппарат для получения засевной биомас­сы (инокулята); биохимический реактор (биореактор, ферментатор, культиватор) – аппараты для проведения собственно процесса фер­ментации; аппараты для выделения и сгущения биомассы, выпарные, сушильные установки и т. д.
8
Между элементами БТС имеется функциональная взаимосвязь. Элементы взаимодействуют между собой и с окружающей средой в виде материального, энергетического и информационного обмена. Для примера на рис. 1.1 показана упрощенная типовая схема получе­ния белковой биомассы. Технологический процесс обычно включает стадию подготовки сырьевых материалов, таких как углеродсодер­жащий субстрат, минеральная питательная среда, а также стадию подготовки засевной биомассы.
Засевная
биомасса
Субстрат
Вода на охлаждение
Культивирование
(ферментация)
Воздух
Рис. 1.1. Типовая технологическая схема
получения биомассы микроорганизмов
Сгущение
биомассы
Биологическая
очистка
Сточные
воды
Горячий
Горячий
воздух
воздух
Сушка
биомассы
Готовый
продукт
Подготовленное сырье и засевная биомасса далее поступают на стадию ферментации, технологически выполненную из нескольких параллельно или последовательно работающих биохимических реак­торов, где в условиях аэрации и перемешивания происходит интен­сивный рост и размножение микроорганизмов.
Затем суспензия микроорганизмов поступает на стадию сгущения. Здесь используются сепараторы, флотаторы, центрифуги, фильтры, выпарные и сушильные аппараты.
В производстве используется свежая вода, поступающая на стадии подготовки питательной среды, засевной биомассы и ферментации. В то же время, в технологической схеме часть свежей воды может быть заменена на отработанную культуральную жидкость, получен­ную при концентрировании суспензии микроорганизмов на стадии сгущения (оборотная вода). Неиспользованная непосредственно
9
в технологическом процессе культуральная жидкость подвергается биологической очистке.
Небольшая часть микроорганизмов уходит из технологических аппаратов с воздушным потоком (из ферментеров при аэрации, из сушильной установки с сушильным агентом и т. д.). Это количест­во биомассы также необходимо вернуть на стадию сгущения. Таким образом, на этой упрощенной схеме нетрудно проследить взаимное влияние элементов системы.
Одна из основных стадий – стадия ферментации будет работать эффективно лишь в том случае, если качественно функционируют стадии подготовки сырья и засевной биомассы. В тоже время процесс ферментации во многом определяет работу последующих стадий сгущения и сушки. Имеющиеся замкнутые циклы по жидкостным и газовым потокам создают возможность обратного влияния на процесс ферментации процессов подготовки сырья, сгущения и обработки биомассы.
Использование, например, отработанной культуральной жидко­сти на стадии ферментации представляется выгодным и целесообраз­ным с точки зрения минимизации потребления свежей воды. Однако повторное потребление культуральной жидкости в известной степени ухудшает работу стадии ферментации, так как в этой воде содержатся продукты метаболизма, не утилизируемый субстрат и т. п.
Из рассмотренного примера следует, что анализ и синтез опти­мальной технологической схемы, отвечающей высоким требованиям к современному производству, невозможен без рассмотрения работы системы в целом, без учета взаимодействия элементов системы. Последнее возможно только при высокой степени формализации функционирования системы с использованием количественных оценок. При этом эффективность производства будет определяться как усло­виями взаимодействия между элементами системы – технологически­ми аппаратами, так и качеством функционирования самих аппаратов.
При рассмотрении основного элемента БТС – биохимического реактора – также целесообразно использовать принцип системного подхода. Анализ работы любого технологического аппарата показы­вает, что качество его функционирования зависит от взаимодействия комплекса физико-химических и биохимических процессов, проте­кающих в нем.
Уровень сложности аппарата как системы определяется много­образием элементарных физико-химических и биохимических эффектов,
10
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]