2 курс / Биохимия / Книжки и сборники / Biokhimia_dlya_chaynikov
.pdfт
\уу У
Глава 9
Полинуклеотиды
и код жизни
»Структура нуклеотидных кислот
»Последовательность нуклеиновых кислот
»Секвенирование аминокислот
ВВ уклеиновые кислоты получили свое название из-за того, что впервые
были обнаружены в клеточном ядре. ДНК (дезоксирибонуклеиновая
Я ж кислота) — самая известная из нуклеиновых кислот — это неотъем- лемая часть хромосом, содержащая гены с информацией, на основе которой выполняется синтез белка. Многие из этих белков являются ферментами — каждый из них катализирует специфическую химическую реакцию, протекаю-
щую в организме. Такое суждение дало начало гипотезе “ один ген — один фер-
мент” , в основе которой лежит понимание того, что каждый ген ответственен за синтез одного фермента. Сейчас эта гипотеза трактуется скорее, как “ один ген — один белок” , так как гены способствуют образованию белков в самых разнообразных структурах и функциональных механизмах организма.
У ДНК есть две прямые функции: воспроизводить новую ДНК {реплика-
ция — это то, в чем заинтересовано большинство людей) так, чтобы предо-
ставить новым поколениям клеток необходимую для выживания информацию,
и производить РНК {рибонуклеиновую кислоту) посредством транскрип-
ции. РНК участвует в непосредственном синтезе белков, который называется
трансляцией. Такие белки необходимы для подержания жизни.
NH2
|
|
|
N |
c |
c |
N |
|
|
|
|
|
|
CH |
|
|
||
|
|
|
|
|
c |
|
|
|
|
|
|
HC |
^N |
H> |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
Аденин (A) |
|
|
||
|
О |
|
|
|
|
|
NH2 |
|
HN |
|
|
c |
N |
|
HC |
c |
N |
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
II |
CH |
HC |
|
|
|
H2N |
N |
' |
c |
/ |
|
|
N |
<4 |
|
|
Й |
|
|
H |
|
||
Гуанин (Г) |
|
|
Цитозин (Ц) |
|||||
|
О |
|
|
|
|
о |
|
|
СН3 |
.С. |
^ NH |
|
НС |
С |
NH |
||
|
|
|
|
|
||||
НС |
N |
<4 |
|
НС |
N - |
ч |
||
|
Н |
|
|
|
|
Н |
|
Тиамин (Т) Урацил (У)
Рис. 9.2. Аденин (А), гуанин (Г), цитозин (Ц),
тимин (Т) и урацил (У)
Атомы азота и кислорода на азотистых основаниях, обеспечивают ряд мест, в которых возможно водородное связывание. Оно самое эффективное и легко
образуется между определенными комбинациями азотистых оснований. Такие
комбинации представляют шаблоны, согласно которым передается информа- ция. Атомы на азотистых основаниях обычно нумеруются стандартным обра-
зом, а составляющие сахара обозначаются простыми числами.
Сладкая сторона жизни:сахара
К 5-углеродным сахарам, присутствующим в нуклеиновых кислотах, от-
носятся D-рибоза и D-дезоксирибоза. Различие между двумя этими сахара-
ми состоит в том, что у дезоксирибозы у второго атома углерода нет атома кислорода. Структура этих сахаров приведена на рис. 9.3. Стрелки на рисунке
ГЛАВА 9 Полинуклеотиды и код жизни 173
указывают спиртовую группу первого атома углерода — аномерический угле- род. Это то место, к которому прикрепляется основание. Оба сахара могут при-
нимать (3-форму фуранозного кольца. Нумерация сахара начинается с аномери-
ческого углерода (1) и продолжается по часовой стрелке до пятого углерода с группой -СН2ОН.
Кислая сторона жизни: фосфорная кислота
Третьим компонентом нуклеотида является фосфорная кислота (рис. 9.4).
При физиологическом значении pH она не может существовать в полностью протонированной форме, показанной на рисунке. Отвечает за “ кислотность” в
нуклеиновых кислотах. Разные нуклеотиды связываются вместе своими участ- ками фосфорной кислотой.
сн2он |
он |
сн он |
|
|
* |
|
|
|
|||
|
н |
о |
н I |
I |
н. |
Н |
он - |
|
|
|
|
сч |
|
с |
|
ч ^ . |
|
|
|
о |
|
||
н |
с |
|
|
с |
•с |
|
|
|
/,0— Р— |
о |
|
он |
н |
Н I |
I |
н |
|
н |
|||||
|
он |
|
он |
н |
|
|
о |
н |
|||
|
Рибоза |
Дезоксирибоза |
|
|
н |
||||||
Рис. 9.3. Структуры 5-углеродных сахаров, |
Рис. 9.4. Структура |
||||||||||
представленных нуклеиновыми кислотами |
фосфорной кислоты |
Долгий путь:от нуклеозида до нуклеотида
и нуклеиновой кислоты
Любите играть конструкторами? Складывать разные детали и каждый раз получать что-то новенькое? Подобным образом собираются и нуклеиновые кислоты. Вначале азотистое основание соединяется с 5-углеродным сахаром, чтобы образовать нуклеозид, а затем нуклеозид присоединяет фосфорную кис-
лоту, чтобы сформировать нуклеотид, и наконец, комбинация нуклеотидов дает
нуклеиновую кислоту.
Первая реакция:азотистое основание +
5-углеродный сахар = нуклеозид
Комбинация азотистого основания и 5-углеродного сахара дает нуклеозид.
Общий ход реакции изображен на рис. 9.5. Это реакция конденсации. Помните реакции конденсации, которые изучались при образовании сложных эфиров в курсе органической химии? Это точно такая же реакция. Здесь соединение,
174 ЧАСТЬ 3 Углеводы, жиры, нуклеиновые кислоты и другие...
представляют собой большие молекулы, обнаруживаемые в клетках ядра. Ге-
нетическая информация содержится в ДНК, зашифрованная в виде первичной и вторичной структуры. Подобно тому, как клетки делятся и размножаются, генетическая информация из них копируется в новые клетки, которые должны воспроизводиться предельно точно — ошибки здесь недопустимы. Роль РНК заключается в передаче генетической информации из ДНК в рибосомы, в ко- торых происходит синтез белка. ДНК и РНК позволяют жить всем нам. Такое утверждение известно как главная аксиома генетики.
н
о
нуклеотид
|
о |
|
|
|
о |
|
|
|
|
|
|
|
JL |
\ |
|
нуклеотид |
|
/ |
н |
|
н2о + |
о |
|
» |
н |
|
|
||
II |
|
I |
|
|
4.0тх'
нуклеотид
нуклеотид |
о |
|
|
о |
3 |
||
|
|||
|
|
н
Рис. 9.9. Упрощенное представление реакции объединения двух нуклеотидов
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
5 |
|
' |
N |
с |
с |
N |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
НС / |
|
|
сн |
|
О |
|
|
\ с |
N^ |
|||
|
|
|
N |
|
|
||
" |
|
|
|
|
' |
|
|
о— р— о— сн2 |
Н/. |
|
|
|
|||
о |
С |
н |
|
|
|
||
|
|
с |
С |
|
|
|
|
|
н |
I |
н |
|
|
|
|
|
|
|
он |
|
|
|
Рис. 9.10. Атомы углерода с номерами 5
и 3 аденозинмонофосфата
ГЛАВА 9 Полинуклеотиды и код жизни 177