- •Аминокислоты, входящие в состав белков
- •1. Классификация по полярности радикала R
- •R – полярный неионогенный радикал
- •R – полярный катионогенный радикал
- •R – полярный анионогенный радикал
- •Классификация по химическому строению
- •Гетероциклические
- •Серосодержащие
- •2. Стереоизомерия
- •3.Кислотно-основные свойства
- •4. Биологически важные реакции аминокислот
- •Дезаминирование
- •-неокислительное дезаминирование
- •Восстановительное аминирование
- •HOOC
- •Трансаминирование
- •Пептиды и белки
- •Первичная структура пептидов
- •Определение аминокислотного состава
- •Определение аминокислотной последовательности
- •Метод Эдмана
- •Частичный гидролиз пептидов
- •Синтез пептидов
- •Метод активации и защиты функциональных групп
- •Синтез дипептида глицилаланина
- •Твердофазный синтез пептидов
- •Пространственная структура пептидов и белков
- •• Cтроение пептидной группы
- •Вторичная структура пептидов и белков
- •• -Складчатая структура
- •Третичная структура пептидов и белков
- •• Ионные связи (солевые мостики)
- •• Дисульфидные связи
- •• Гидрофобные взаимодействия
- •• Структура коллагена
- •Суперспираль
- •Третичная структура пептидов и белков
- •Четвертичная структура
- •Денатурация белков
- •Трансаминирование
- •Трансаминирование
- •1. Первичная структура пептидов 1.1. Определение аминокислотной последовательности 1.2. Синтез пептидов
Метод Эдмана
|
|
|
|
|
O |
O |
C H N C S |
+ H2N CH C NH CH C |
|||||
6 |
5 |
|
|
|
|
|
ф ен илизо тио циан ат |
|
R1 |
R2 |
|||
|
|
|
|
pH 9 |
|
|
|
|
|
|
O |
|
O |
C6H5 NH C |
HN |
CH C |
NH CH |
C |
||
|
|
S |
|
R1 |
R2 |
|
|
|
|
|
H+ |
|
|
|
C6H5 |
S |
|
|
|
O |
|
N |
NH |
+ |
H2N |
CH C |
|
|
|
|||||
|
|
O |
R1 |
|
|
R2 |
|
|
|
|
|
ÔÒÃ-ï ðî èçâî äí î å |
óêî ðî ÷åí í û é ï åï òèä |
N-ко н цево й ам ин о кисло ты |
|
Частичный гидролиз пептидов
ïåí òàï åï òèä Val-Asp + Glu-His + Phe-Val + Asp-Glu
Phe-Val
Val-Asp
Asp-Glu
Glu-His
Phe-Val-Asp-Glu-His
Синтез пептидов
Ala-Val
Val-Ala
Ala + Val
Ala-Ala
Val-Val
Из |
n разных аминокислот образуется nm пептидов |
где |
m – число аминокислотных остатков в пептиде |
Метод активации и защиты функциональных групп
X |
|
|
|
|
|
|
O |
|
NH |
|
CH |
|
C |
||
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
Y |
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
R1 |
X NH CH
R1
H2N CH
R1
|
|
|
|
|
|
O |
+ |
H2N |
|
|
CH |
|
C |
|
|
|||||
|
|
OR |
||||
|
|
|
R2 |
|||
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
O |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
NH |
|
CH |
|
C |
|||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OR |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R2 |
O |
|
|
|
|
O |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
NH |
|
CH |
|
C |
|||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
R2 |
Синтез дипептида глицилаланина
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(CH ) C |
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(CH3)3C |
|
O |
|
C |
|
NH |
|
CH2 |
|
|
|
|
COOH |
||||||||||||||||||||||||
|
|
|
C |
|
|
N |
|
+ |
|
|
H N |
|
|
CH |
|
|
|
COOH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
2 |
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
- HN3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||
трет-буто ксиазид |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
глицин |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Cl |
|
C |
|
OC H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
|||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
|
2 |
|
|
|
5 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2N |
|
CH |
|
|
COOH |
|||||||||||||
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
этилхло рф о рм иат |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
àëàí èí |
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
(CH3)3C |
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
|
|
|
NH |
|
|
CH2 |
|
|
|
|
C |
|
|
|
|
O |
|
C |
|
OC2H5 |
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
- HCl |
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
- CO2, - C2H5OH |
||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CF COOH, 250C |
|||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(CH3)3C |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
|
|
NH |
|
|
|
CH2 |
|
|
C |
|
|
NH |
|
|
|
|
CH |
|
|
|
COOH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2N |
|
|
|
|
|
CH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
NH |
|
|
CH |
|
COOH + |
|
|
|
|
(CH3)2C=CH2 + CO2 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
глицилалан ин |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Твердофазный синтез пептидов
смола CH2Cl
XHN CH COOH
R1
смола CH2OCOCHNHX R1
смола CH2OCOCHNH2 R1
XHN CH COY
R2
смола CH2OCOCHNHCOCHNHX R1 R2
и т. д.
Пространственная структура пептидов и белков
вторичная |
третичная |
четвертичная |
• Cтроение пептидной группы
O
..
C N
H
O-
+
C N
H
транс-конфигурация
Вторичная структура пептидов и белков
• Спираль
H
N C
O
H
N C
O
H
N C
O
• -Складчатая структура
•параллельная |
•антипараллельная |
C-êî í åö |
C-êî í åö |
|
N-êî í åö |
N-êî í åö |
N-êî í åö |
C-êî í åö |