- •Аминокислоты, входящие в состав белков
- •1. Классификация по полярности радикала R
- •R – полярный неионогенный радикал
- •R – полярный катионогенный радикал
- •R – полярный анионогенный радикал
- •Классификация по химическому строению
- •Гетероциклические
- •Серосодержащие
- •2. Стереоизомерия
- •3.Кислотно-основные свойства
- •4. Биологически важные реакции аминокислот
- •Дезаминирование
- •-неокислительное дезаминирование
- •Восстановительное аминирование
- •HOOC
- •Трансаминирование
- •Пептиды и белки
- •Первичная структура пептидов
- •Определение аминокислотного состава
- •Определение аминокислотной последовательности
- •Метод Эдмана
- •Частичный гидролиз пептидов
- •Синтез пептидов
- •Метод активации и защиты функциональных групп
- •Синтез дипептида глицилаланина
- •Твердофазный синтез пептидов
- •Пространственная структура пептидов и белков
- •• Cтроение пептидной группы
- •Вторичная структура пептидов и белков
- •• -Складчатая структура
- •Третичная структура пептидов и белков
- •• Ионные связи (солевые мостики)
- •• Дисульфидные связи
- •• Гидрофобные взаимодействия
- •• Структура коллагена
- •Суперспираль
- •Третичная структура пептидов и белков
- •Четвертичная структура
- •Денатурация белков
- •Трансаминирование
- •Трансаминирование
- •1. Первичная структура пептидов 1.1. Определение аминокислотной последовательности 1.2. Синтез пептидов
3.Кислотно-основные свойства
Нейтральные аминокислоты ( pI 5,5 -6,3)
Аланин
H3N CH COOH |
- H + |
H N |
CH COO |
- H |
+ |
H2N CH COO |
||
|
|
|
|
|||||
|
+ H + |
3 |
|
+ H + |
|
|||
CH3 |
|
CH3 |
CH3 |
|||||
pKa1 |
= 2,34 |
|
pKa2 |
=9,69 |
||||
катио н |
áèï î ëÿðí û é èî í |
àí èî í |
||||||
|
|
|
|
|||||
pH<<7 |
|
|
|
|
|
|
pH>7 |
pI= ½ (pKa1+pKa2) = ½ (2,34+9,69) = 6,01
Кислые аминокислоты ( pI << 7)
O
H2N CH C OH
CH2
CO
OH
Аспарагиновая кислота (Asp)
O
H2N CH C OH
CH2
CH2
CO
OH
Глутаминовая кислота (Glu)
КислотноКислые аминокислоты-основные( pI << 7) свойства
Кислотно-основные свойства аспарагиновой кислоты
O |
- H+ |
O |
- H+ |
O |
|
H3N CH C O |
|||||
H N CH C OH |
|
H3N CH C O |
|
||
3 |
+ H+ |
|
+ H+ |
CH2 |
|
CH2 |
CH2 |
||||
pKa1=2,09 |
pKa2=3,86 |
C O |
|||
C O |
C O |
||||
|
|||||
|
|
O |
|||
OH |
|
OH |
|
||
|
|
|
|||
катион |
|
биполярный ион |
|
анион |
- H+ |
O |
|
|
H2N CH C |
O |
||
+ H+ |
|||
CH2 |
pI = ½ (pKa1+pKa2) = 3,0 |
||
pKa3=9,82 |
|||
C O |
|
||
|
|
||
|
O |
|
|
|
дианион |
|
Основные аминокислоты (pI>7)
O
H2N CH C OH
CH2
CH2
CH2
CH2
NH2
O
H2N CH C OH
CH2
N
NH
Лизин (Lys) |
Гистидин (His) |
O
H2N CH C OH
CH2
CH2
CH2
NH
CNH NH2
Аргинин (Arg)
Основные аминокислоты ( pI > 7) Кислотно-основные свойства лизина
Кислотно-основные свойства
O |
- H+ |
O |
- H+ |
O |
|
H3N CH C O |
|||||
H N CH C OH |
|
H3N CH C O |
|
||
3 |
+ H+ |
|
+ H+ |
(CH2)4 |
|
(CH ) |
(CH2)4 |
||||
2 4 |
pKa1=2,2 |
|
pKa2=9,0 |
NH2 |
|
NH3 |
NH3 |
||||
|
|
|
|||
дикатион |
|
катион |
|
биполярный ион |
|
|
|
|
- H+ |
O |
|
H2N |
CH C O |
|
+ H+ |
pI= ½ (pKa2+pKa3) = 9,8 |
|
pKa3=10,5 |
(CH2)4 |
|
NH2 |
||
|
||
|
анион |
Разделение аминокислот методом электрофореза (pH=6)
Аспарагиновая к-та |
Аланин |
Лизин |
4. Биологически важные реакции аминокислот
Декарбоксилирование
|
|
|
|
|
|
|
декарбо ксилаза + |
|
|
|
|
|
|
|
R |
|
|
|
CH |
|
COOH |
+ п иридо ксальф о сф ат |
R |
|
CH2 |
|
NH2 + |
CO2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
ам ин о кисло та |
|
|
áèî ãåí í û é àì èí |
|
O
H2N CH C OH
CH2
N
NH
Гистидин
O
H2N CH C OH
CH2
CH2
CO
OH
Глутаминовая кислота
H2N CH2 + CO2
CH2
N
NH
Гистамин
H N |
|
|
CH |
2 |
+ CO2 |
||
|
|||||||
2 |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
CH2 |
|
|||
|
|
|
CH2 |
|
|||
|
|
C |
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
OH
Аминомасляная кислота
Дезаминирование
-окислительное
Í ÀÄ+ |
|
|
|
|
|
|
|
|
+ H2O |
R C COOH |
|
NH3 |
||||||||||||
R CH COOH - Í ÀÄÍ , Í + |
R C COOH |
+ |
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
||||||||||||
|
|
|
NH2 |
NH |
|
|
|
|
||||||||||||||||
ам ин о кисло та |
им ин о кисло та |
|
кето кисло та |
|
|
|
|
|
|
+ |
H O |
Í ÀÄ+ |
|
CH |
|
C |
|
COOH + |
NH3 |
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
CH3 CH COOH |
|
|
|
|
|||||||||||||
|
2 |
- Í ÀÄÍ , Í + |
3 |
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
||||
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
àëàí èí |
|
|
|
|
п иро вин о градн ая |
|
HOOC |
|
CH2 |
|
CH |
|
COOH |
+ H2O |
Í ÀÄ+ |
HOOC |
|
CH |
|
C |
|
COOH + NH |
|||
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
- Í ÀÄÍ , Í + |
2 |
|
|
|
|
3 |
|||
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
||||
асп арагин о вая |
|
|
щ авелево уксусн ая |