- •Вопрос № 1.Белки. Разнообразие. Функции.
- •Вопрос № 2. Методы биохимии. Электрофорез.
- •Вопорос № 3. Хроматография.
- •Аффинная хроматография, или хроматография по сродству
- •Вопрос № 4. Методы количественного определения белка в растворе.
- •Вопрос № 5. Форма белков. Молекулярная масса.
- •Вопрос № 6. Аминокислоты. Пептиды.
- •Вопрос № 7. Первичная структура.
- •Вопрос № 8. Вторичная структура.
- •Вопрос № 9. Третичная структура белка.
- •Вопрос № 10. Четвертичная структура.
- •Вопрос № 11. Физико-химические свойства белков.
- •Вопрос № 12. Денатурация
- •Вопрос № 13. Коллоидные свойства растворов белков. Осаждение
- •Вопрос № 14. Классификация белков.
- •Вопрос № 15. Простые и сложные белки. Простетическая группа.
- •Вопрос № 16. Белки и лиганды. Активный центр белка.
- •Вопрос № 17. Связывание белка и лиганда.
- •Вопрос № 18. Доменная организация белков.
- •Вопрос № 19. Функциональное значение четвертичной структуры белка. Оперативность. Преимущества олигомеров над мономерами.
- •Преимущества белков с четвертичной структурой
- •Вопрос № 20
- •Вопрос № 21
- •Вопрос № 22
- •Каталитическая специфичность
- •Вопрос № 23
- •Вопрос № 24
- •Вопрос № 25
- •Вопрос № 26
- •Вопрос № 27
- •Неконкурентное ингибирование
- •I связывается с е также не в каталитическом центре, однако не со свободным е, а с комплексом еs, т.Е. Центр, связывающий I, становится доступным для I только после того, как свяжется s.
- •Вопрос № 29
- •Вопрос № 30
- •Особенности строения и функционирования аллостерических ферментов:
- •Вопрос № 31
- •Циклический гуанозинмонофосфат и Циклический аденозинмонофосфат – циклические формы нуклеотидов (производные гтф и атф.
- •Вопрос № 32
- •Вопрос № 33
- •Вопрос № 35
- •Вопрос № 36
- •Вопрос № 37
- •Классы ферментов
- •Вопрос № 38
- •Вопрос № 39
- •Вопрос № 40
- •Вопрос № 41
- •Вопрос № 42
- •Вопрос № 43
- •Вопрос № 44
- •Вопрос № 45
- •Единицы активности
- •Вопрос № 46
Вопрос № 15. Простые и сложные белки. Простетическая группа.
Классификация белков по химическому строению
Простые белки
Некоторые белки содержат в своём составе только полипептидные цепи, состоящие из аминокислотных остатков. Их называют "простые белки". Гистоны, эластин.
Сложные белки
Однако очень многие белки, кроме полипептидных цепей, содержат в своём составе небелковую часть, присоединённую к белку слабыми или ковалентными связями. Небелковая часть может быть представлена ионами металлов, какими-либо органическими молекулами с низкой или высокой молекулярной массой. Такие белки называют "сложные белки". Прочно связанная с белком небелковая часть носит название простетической группы.
Простетическая группа может быть представлена веществами разной природы. Например, белки, соединённые с гемом, носят название гемопротеины. Белки, соединённые с остатком фосфорной кислоты, называют фосфопротеинами. В состав белков часто входят углеводные остатки, придающие белкам дополнительную специфичность и часто уменьшающие скорость их ферментативного протеолиза. Такие белки носят название гликопротеинов. Белки, функционирующие в комплексе с липидами, называют липопротеинами, а в комплексе с металлами - металлопротеинами.
Сложный белок, состоящий из белковой части (апопротеин) и небелковой части (простетическая группа), называют "холопротеин".
Вопрос № 16. Белки и лиганды. Активный центр белка.
Каждый индивидуальный белок, имеющий уникальную первичную структуру и конформацию, обладает и уникальной функцией, отличающей его от всех остальных белков. Набор индивидуальных белков выполняет в клетке множество разнообразных и сложных функций.
Необходимое условие для функционирования белков - присоединение к нему другого вещества, которое называют "лиганд". Лигандами могут быть как низкомолекулярные вещества, так и макромолекулы. Взаимодействие белка с лигандом высокоспецифично, что определяется строением участка белка, называемого центром связывания белка с лигандом или активным центром.
Активный центр белков - определённый участок белковой молекулы, как правило, находящийся в её углублении ("кармане"), сформированный радикалами аминокислот, собранных на определённом пространственном участке при формировании третичной структуры и способный комплементарно связываться с лигандом. В линейной последовательности полипептидной цепи радикалы, формирующие активный центр, могут находиться на значительном расстоянии друг от друга.
Активный центр белка - относительно изолированный от окружающей белок среды участок, сформированный аминокислотными остатками. Объединение таких аминокислот в единый функциональный комплекс изменяет реакционную способность их радикалов.
Уникальные свойства активного центра зависят не только от химических свойств формирующих его аминокислот, но и от их точной взаимной ориентации в пространстве. Поэтому даже незначительные нарушения общей конформации белка в результате точечных изменений его первичной структуры или условий окружающей среды могут привести к изменению химических и функциональных свойств радикалов, формирующих активный центр, нарушать связывание белка с лигандом и его функцию. При денатурации активный центр белков разрушается, и происходит утрата их биологической активности.
Часто активный центр формируется таким образом, что доступ воды к функциональным группам его радикалов ограничен, т.е. создаются условия для связывания лиганда с радикалами аминокислот.
Центр связывания белка с лигандом часто располагается между доменами. Разные домены в белке могут перемещаться друг относительно друга при взаимодействии с лигандом, что облегчает дальнейшее функционирование белка. Основное свойство белков, лежащее в основе их функций, - избирательность присоединения к определённым участкам белковой молекулы специфических лигандов.