- •Кафедра биоорганической химии БГМУ
- •Из истории открытия НК
- •Схема фенольного метода выделения НК
- •Нуклеиновые кислоты
- •БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
- •БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ РНК
- •Стадийный гидролиз НК
- •Первичная структура НК
- •Общий план строения нуклеиновых кислот
- •Мононуклеотид состоит из
- •Гетероциклические азотистые основания
- •Пиримидиновые гетероциклические
- •ТИМИН Thy
- •ЦИТОЗИН Cyt
- •ЦИТОЗИН Cyt
- •Пуриновые гетероциклические
- •Гуанин Gua
- •Гуанин Gua
- •Гетероциклические основания существуют в таутомерных формах, различающихся устойчивостью
- •Гетероциклические основания НК
- •Минорные азотистые основания
- •Плоскостная структура азотистых оснований
- •Ароматичность азотистых оснований
- •Пентозы
- •НУКЛЕОЗИДЫ
- •Общая структура нуклеозидов
- •Нуклеозиды входящие в состав РНК
- •НУКЛЕОТИДЫ – ФОСФОРНЫЕ ЭФИРЫ НУКЛЕОЗИДОВ
- •Нуклеотиды проявляют кислотные свойства, так
- •Названия нуклеотидов
- •Структура АТР
- •ATP принимает участие в реакциях
- •ЦИКЛИЧЕСКИЙ 3',5'-АДЕНОЗИНМОНОФОСФАТ (ЦИКЛИЧЕСКИЙ AMФ) ЯВЛЯЕТСЯ ВТОРИЧНЫМ ПОСРЕДНИКОМ В РЕАЛИЗАЦИИ ДЕЙСТВИЯ РЯДА ГОРМОНОВ НА
- •Циклические мононуклеотиды- вторичные посредники
- •КОФЕРМЕНТЫ
- •Никотинамидадениндинуклеотид
- •Кофермент А
- •ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА НК
- •линейная последовательность мононуклеотидов связанных фосфодиэфирными связями.
- •Структура ДНК состоит из двух длинных антипараллельных цепей дезоксирибонуклеотидов связанных фосфодиэфирной связью. Фосфодиэфирная
- •пространственная организация макромолекулы
- •Две группы взаимодействий участвуют в стабилизации двойной спирали ДНК:
- •КОМПЛЕМЕНТАРНОСТЬ
- •Правила Чаргаффа
- •Основой стэкинг взаимодействия являются силы притяжения или отталкивания между азотистыми основаниями, расположенными друг
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА ДНК
- •1-ЫЙ УРОВЕНЬ УПАКОВКИ ДНК
- •Второй уровень упаковки. Структура «жемчужного ожерелья» ДНК закручивается в форме зигзага (b).
- •РНК имеют более простую структуру чем ДНК.
- •тРНК- малые РНК (содержат обычно примерно 74-95 нуклеотидов), которые связывают специфически активированные аминокислоты
- •СТРУКТУРА тРНК
- •Трехмерная структура малой (с) и большой (д) субъединиц р-РНК
- •КОМПЛЕКС МАЛОЙ И БОЛЬШОЙ СУБЪЕДИНИЦ РИБОСОМЫ
- •Синтез белка на рибосомах
- •Si-РНК и нокаут генов
- •Нокаутная по лептину мышь
- •Продукты деградации пуриновых оснований
- •Продукты деградации пуриновых оснований
- •Продукты деградации пуриновых оснований
- •УРАТЫ
- •Действие ультрафиолетового излучения
- •В завершение лекции
- •ДНК ЧЕЛОВЕКА
- •Никотинамидадениндинуклеотид
- •Флавинадениндинуклеотид
- •Флавинадениндинуклеотид
- •БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
- •БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
- •Нуклеозидполифосфаты в биохимических процессах
- •Нуклеозидполифосфаты в биохимических процессах
- •Двойная спираль
- •А. Вторичная структура и доменная организация
- •НУКЛЕОЗИДЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ РНК (РИБОНУКЛЕОЗИДЫ)
- •Д.Уотсон и Ф.Крик у модели двойной спирали ДНК
- •Вот мы такие !
- •СВЯЗИ В НУКЛЕОТИДАХ
- •Вторичная структура ДНК
НУКЛЕОТИДЫ – ФОСФОРНЫЕ ЭФИРЫ НУКЛЕОЗИДОВ
В НУКЛЕОТИДАХ ОСТАТОК ФОСФОРНОЙ КИСЛОТЫ АЦИЛИРУЕТ ГИДРОКСИЛЬНУЮ ГРУППУ У C5 ОСТАТКА D- РИБОЗЫ ИЛИ 2-ДЕЗОКСИ-D-РИБОЗЫ ЯВЛЯЮЩИХСЯ ЧАСТЬЮ НУКЛЕОЗИДОВ (5' положение)
АТОМЫ В ГЕТЕРОЦИКЛИЧЕСКИХ ОСНОВАНИЯХ И РИБОЗНОМ ФРАГМЕНТЕ НУМЕРУЮТ ОТДЕЛЬНО И ЧТОБЫ ИХ РАЗЛИЧАТЬ К НОМЕРАМ РИБОЗНОГО ФРАГМЕНТА ДОБАВЛЯЮТ ЗНАЧОК “'” ( “ПРИМ”).
Остаток фосфорной кислоты этерифицирует обычно гидроксил в 5' позиции D-рибозы.
Хотя он может появляться в позициях 2' и 3‘.
34
Нуклеотиды проявляют кислотные свойства, так
как содержат остаток фосфорной кислоты.
При физиологических условиях нуклеотиды присутствуют в ионизированной форме
|
|
|
NH2 |
|
|
N |
N Аденин |
O |
|
|
|
|
N |
|
|
HO P O CH2 |
|
N |
|
|
|
||
O |
|
N-гликозидная |
|
|
|
||
HO |
|
связь |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
Сложноэфирная |
HO |
OH |
|
|
|
|
|
связь |
|
D-рибоза |
|
|
|
|
|
Аденозин-5'-фосфат, |
35 |
|
5'-адениловая кислота |
||
|
Названия нуклеотидов
Азотистыеоснования нуклеозиды нуклеотиды сокр
аденин аденозин аденозинмонофосфат АМФ гуанин гуанозин гуанозинмонофосфат ГМФ цитозин цитидин цитидинмонофосфат ЦМФ урацил уридин уридинмонофосфат УМФ
тимин тимидин тимидинмонофосфат ТМФ
36
Полный гидролиз нуклеотидов идет в кислой среде (PH=1) и дает:
1.Гетероцикличeское основание 2.Пентозу: D-рибозу или 2-дезокси-
D-рибозу
3.Остаток фосфорной кислоты
Гидролиз в интервале от PH=4 до PH=9 приводит к образованию:
1.нуклеозидов 2.Остатков фосфорной кислоты
АТP
Аденозин 5'-трифосфат является аккумулятором и переносчиком энергии в клетке. Его молекула
Nu содержит 2 ангидридные связи. При гидролизе ангидридной связи
выделяется 32-35 кДж/моль энергии
O |
|
O |
O |
|
|
-O P |
O |
P |
O P O |
CH2 |
O |
|
|||||
O |
|
O |
O- |
H |
|
|
Mg |
|
|
H |
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
N |
N |
|
NN
H
H
OH
Ангидридные связи
38
Структура АТР
Макроэргическ
ие
связи
ATP принимает участие в реакциях
фосфорилирования (ацилировании остатком фосфорной кислоты) .
Например, первая стадия гликолиза является реакцией фосфорилирования глюкозы.
Фосфорный эфир глюкозы образуется по реакции нуклеофильного замещения по гидроксильной группе у C6 глюкозы.
Реакция нуждается в присутствии ионов магния, чтобы облегчить нуклеофильную атаку.
|
O |
|
O |
O |
|
A |
|
|
|
-O P |
|
O P |
O P O |
CH |
|
|
|
|
|
|
CH OPO 2- |
|||||
CH2OH |
|
|
|
|
2 O |
|
||
|
O |
- |
O- |
- |
H |
H |
2 |
3 |
O |
|
O |
||||||
|
O |
H |
H |
|
||||
OH |
|
|
Mg2+ |
|
OH |
|
||
|
|
|
|
OH |
OH |
|
||
OH |
OH |
|
|
|
|
OH |
|
OH |
OH |
|
|
|
|
|
|
|
OH40 |
ЦИКЛИЧЕСКИЙ 3',5'-АДЕНОЗИНМОНОФОСФАТ (ЦИКЛИЧЕСКИЙ AMФ) ЯВЛЯЕТСЯ ВТОРИЧНЫМ ПОСРЕДНИКОМ В РЕАЛИЗАЦИИ ДЕЙСТВИЯ РЯДА ГОРМОНОВ НА МЕТАБОЛИЗМ КЛЕТКИ
NH2
N N
CH2
NN
O
O
O |
|
P |
|
O |
OH |
|
|
||||
|
|||||
|
|
OH
Аденозин-3',5'-циклофосфат
41
Циклические мононуклеотиды- вторичные посредники
NH2 |
О |
|
|
||
|
N
N NH
N
О — СН2 |
|
|
N |
О — СН2 |
O |
N |
N |
NH2 |
|
O |
|
||||||
|
|
N |
|
|
|
|
||
О = Р |
|
|
|
О = Р |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
ОН |
ОН |
O |
ОН |
|
|
|
ОН |
|
|
|
|
|
3,5-циклоГМФ |
3,5-циклоАМФ |
|
43