Добавил:
ivanov666
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Молекулярная характеристика локусов, содержащих динуклеотидные микросателлиты, генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis. Монография
.pdf
k
l
l
1
n
j
k
1
i
На основании коммутативности операции сложения:
kil
11
Применяя выражение (25) имеем:
ljk
Следовательно, выражение:
i
m
n
i
cm
;
ij
1
ij
j
m
ij
n
j
j
m
ij
n
j
;
constc
(25)
ljk
m
i
11
ij
, (26)
n
j
clc
l
j
111
(24)
(27)
S
принимает вид:
S
Применяя выражение (25) имеем:
S
Так как
j
i
k
F
j
i
1
F
j
cl
k
F
constl
то:
m
ij
, (28)
m
l
k
1
n
j
i
m
ij
cln
1
j
m
ij
ki
1
n
j
1
const
j
cl
ij
11
n
j
m
1
cl
1
ij
, (29)
n
ki
1
j
1
c
, (30)
,
81
F
j
Утверждение доказано.
Следует отметить, что данное утверждение теряет свою силу, если
условие фиксированной гетерозиготности в отношении какого-либо локуса не
соблюдается.
Константность сумм частот различных аллелей локусов в популяциях
партеновидов позволяет предположить, что существует некоторый генетико-
популяционный механизм, приводящий генофонд партеновида относительно
частот аллелей в равновесное состояние, выход из которого
в результате мутационных событий или актов межвидовой и внутривидовой
гибридизации (что является достаточно распространенным явлением у
ящериц рода Darevskia [Даревский, 1993]) нарушается условие
фиксированной гетерозиготности особей партеновида.
.
ljZjconstS
...3,2,1,0|
происходит, если
82
Заключение
В заключении можно сказать, что результаты исследований позволяют
увидеть внушительные перспективы, открывающиеся перед
исследователями. И, прежде всего, следует указать на явную возможность
расширения предложенной математической модели в части интеграции на
её основе генетических, молекулярно-биологических, экологических и
климатических данных.
Так, на основе приведенных в этой работе данных, очевидно, что
особи популяции Кутчак и Та
пассивными», что можно связать с высокогорным расположением
популяций Кутчак и Тякарлу, георгафической изоляцией и «жесткими»
абиогенными факторами действующими на особей этих популяций не
способствующими демографической экспансии особей в генофонд вида, в
отличии от относительно «низинных» популяций Норатус, Лчап и Загалу,
расположенных в более «мягких» условиях побе
этом следует отметить, что «стрессогенные» природные условия обитания
способствуют большему генетическому разнообразию популяций. Так,
например, популяция Кутчак по локусу Du214 несет в геномах своих
особей 5 аллельных вариантов из 6-ти, популяция Такярлу – 3 из 6-ти, в то
время как особи популяций Норатус, Лчап и Загалу генетически
инвариантны по локусу Du214 и несут вс
существующих в генофонде вида D. unisexualis.
Таким образом, оценка генетического вклада может являться
количественной характеристикой успешности той или иной популяции в
рамках вида, а также показателем экологической адаптации особей той
или иной популяции в условиях действия абиогенных факторов. В
настоящий момент предложенная нами математическая модель и
соответ
ствующая ей аксиоматика развивается в сторону учета
экологических, географических и климатических факторов окружающей
кярлу являются «демографически
режья озера Севан. При
его по 2 аллельных варианта из 6
83
среды и влияния их на популяционные, физиологические и генетические
характеристики таких открытых и самоорганизующихся систем, которыми
по сути своей являются все живые организмы и их объединения.
84
Литература
1 Ал
2 Апонин Ю.М., Апонина Е.А. Иерархия моделей математической
3 Базыкин А.Д. Нелинейная динамика взаимодействующих
4 Бакланов Г.И. Некоторые вопросы индексного метода. М.:
5 Брусиловский П.М. Становление теоретической биологии и
6 Вергун А.А., Маркелова Е.С., Мартиросян И.А. Молекулярно-
тухов Ю.П., Салменкова Е.А. Полиморфизм ДНК в
популяционной генетике // Генетика. 2002. Т. 98. № 9. С.11-73.
биологии и численно-аналитические методы их исследования //
Математическая биология и биоинформатика, 2007. Т. 2. №2. С.347-
360.
популяций. М. – Иж.: ИКИ.
Статистика, 1972. 72 c.
математическое моделирование // Проблемы анализа биологических
систем: Сборник Под. Ред. В.Н.Максимова. - Изд-во МГУ, 1983. -
132 с.
генетическая характеристика локуса Du323, содержаще
типы микросателлитов, у партеногенетического вида ящериц
Darevskia dahli (Lacertidae) // Доклады Академии Наук, 2007. Т. 416.
№ 5. С. 690-692.
2003. 368 с.
го различные
7 Давоян А.Г., Асланян А.В., Даниелян Ф.Д., Даревский И.С.,
Мартиросян И.А. Определение аллельного полиморфизма в
популяциях партеногенетических ящериц Darevskia dahli (сем.
Lacertidae) с помощью локус-специфической ПЦР. // Генетика, 2007,
Т.43, №1. С. 27-31.
85
8 Елисеева И.И., Юзбашев М.М. Общая теория статистики. М.:
Финансы и Статистика, 2008. 655 c.
9 Животовский Л.А. Микросателлитная изменчивость в популяциях
человека и методы её изучения // Вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 1.
С. 74-96.
10 Забаровский Е.Р. Альтернативные подходы к секвенированию и
картированию генома // Молекулярная биология. 2001. Т. 35. № 2. С.
224.
11 Зимницкий А.Н., Башкатов С.А.,
Уразбаев В.Н. Тамдемные повторы
ДНК и концепция матричного синтеза протеогликанов. – М.:
Лабиринт, 2005. – 103 с.
12 Калюжный Д. Н., Бондарев Ф. С., Щелкина A. K., Лившиц M. A.,
Борисова O.Ф. Внутримолекулярные G-квадруплексы, образованные
микросателлитной последовательностью d(GT)
+
ионов К
// Молекулярная биология, 2008. Т.42. №1. С.693-700.
в присутствии
12
13 Корчагин В.И., Чуриков Н.А., Токарская О.Н., Севастьянова Г.А.,
Филлипович Ю.Б. Молекулярное клонирование и характеристика
аллельная вариантов (GATA)
-микросателлитного локуса Du281
n
генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis //
Доклады академии наук. 2004.Т. 394. №5 С. 693-695.
14 Костюченко М.В., Удина И.Г., Зайцев А.М., Храброва Л.А.,
Сулимова Г.Е. Изучение генетического разнообразия пород лошадей
отечественной селекции на основе RAPD-PCR и микросателлитных
маркеров //Сельскохоз. биология. 2001. №6. С.29-34.
15 Куприянова Л.А. Некоторые цитогенетические закономерности
сетчатого вид
ообразования однополых видов ящериц (Reptilia,
86
Lacertidae) и других групп позвоночных животных. // Цитология.
1997. Т.39. № 2. С. 1089 – 1108.
16 Левич А.П. Энтропия как мера структурированности сложных
систем // Труды семинара "Время, хаос и математические
проблемы". Вып.2. М.: Книжный дом "Университет". 2001. – С.163 –
176.
17 Левич А.П., Фурсова П.В. Задачи и теоремы вариационного
моделирования в экологии сообществ // Фундаментальная и
прикладная ма
тематика, 2002, том 8, вып. 4, с. 1035-1045.
18 Малышева Д.Н., Вергун А.А., Токарская О.Н. Нуклеотидные
последовательности аллельных вариантов микросателлитного локуса
Du215 (arm) у партеновида Darevskia armeniaca (Lacertidae). //
Генетика, 2007. Т. 43. № 2. С. 170-175.
19 Малышева Д.Н., Токарская О.Н., Даниелян Ф.Д., чл-корр. Даревский
И.С., чл-корр. Рысков А.П. Обнаружение микросателлитных
мутаций у па
ртеногенетических ящериц Darevskia armeniaca. //
Доклады Академии Наук. 2005. Т. 400(2). С. 265-268.
20 Мартиросян И.А., Кан Н.Г., Петросян В.Г. и др. Фингерпринтный
анализ вариабельности мини- и микросателлитных повторов ДНК у
партеногенетических ящериц Darevskia armeniaca. // Генетика. 2003.
Т. 39(2). С. 215-222.
21 Патрушев Л. И., Минкевич И. Г. Проблема размеров генома
эукариот // Успехи биологической химии, 2007. Т.4
7. С. 293-370.
22 Петросян В.Г., Токарская О.Н., Малышева Д.Н., Рысков А.П.
Количественная оценка генного разнообразия и межпопуляционной
дифференциации партеногенетических видов ящериц рода Darevskia
87
на основе мини- и микросателлитных маркеров ДНК.// Генетика,
2003, том 39, №10, С.1418-1426
23 Ризниченко Г.Ю. Лекции по математическим моделям в биологии. //
М-Ижевск, Изд. РХД, 2002, 236 с.
24 Ризниченко Г.Ю. Математические модели в биофизике и экологии.
М. – Иж.: ИКИ. 2003. 184 с.
25 Ризниченко Г.Ю. Математическое моделирование // 1999. -
http://www.library.biophys.msu.ru/MathMod/
26 Рис Э., Стернберг М. Введе
ние в молекулярную биологию: от клеток
к атомам: Пер. с англ. – М.: Мир, 2002. – 142с.
27 Рысков А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-
популяционных исследованиях биоразнообразия // Молекуляр.
биология, 1999. Т. 33. № 6. С. 997-1011.
28 Рысков А.П., Мартиросян И.А., Бадаева Т.Н., Корчагин В.И.,
Даниелян Ф.Д., Петросян В.Г.,
Супернестабильность (TCT/TCC)
Даревский И.С., Токарская О.Н.
микросателлитных ДНК у
n
партеногенетических ящериц Darevskia unisexualis (сем. Lacertidae).//
Генетика. 2003. Т. 39. № 9. С. 1-8.
29 Симан Н. Нанотехнология и двойная спираль // В мире науки, 2007.
№9. С.23-31.
30 Сингер М, Берг П. Гены и Геномы. М.: “Мир”. 1998. Т. 2. С. 201 –
204.
31 Сулимова Г.Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы
маркеров, их свойства и области п
рименения // Электронный
журнал лаб. Сравнительной генетики животных ИОГен им. Н.И.
88
Вавилова РАН, 2004. №1. (http://lab-
cga.ru/articles/Jornal01/Statia1.htm).
32 Токарская О.Н., Даревский И.С., Мартиросян И.А. Генетическая
нестабильность (GATA)
микросателлитных повторов ДНК и
n
соматический мозаицизм у однополых ящериц Darevskia unisexualis
// Доклады Академии Наук. 2003. Т. 388. №6. С. 825-828.
33 Токарская О.Н., Кан Н.Г., Петросян В.Г., и др. Вариабельность
GATA-микросателлитных ДНК в популяциях партеногенетического
вида ящериц Lacerta unisexualis Darevsky.// Генетика. 2000. Т.36. №
5. С. 693 – 698
.
34 Фо
мин С. В., Беркинблит М.Б. Математические п
роблемы в
биологии. М.: 1973. 200 с.
35 Хедрик Ф. Генетика популяций. М.: Техносфера, 2003.- 592с.
36 Шноль С.Э. Физико-химические факторы эволюции. – М.: Наука,
1979. 201с.
37 Aharoni A., Baran N., Manor H. Characterization of a multi-
subunit human protein which selectively binds single stranded
d(GA)
and d(GT)n sequence repeats in DNA. // Nucleic Acid
n
Research, 1993. V. 21. P.5221 -5228.
38 Anselmi С., Bocchinfuso G., De Santis P., Savino M., Scipioni A. A
Theoretical Model for the Prediction of Sequence-Dependent Nucleosome
Thermodynamic Stability // Biophysical Journal, 2000. V. 79. P. 601–
613.
39 Arcot S.S., Wang Z., Weber J.L., Deininger P.L. and Batzer M.A. Alu
repeats: a source for the genesis of primate microsatellites. // Genomics,
1995. V.29. P. 136 – 144.
89
40 Arribas O.J. Phylogeny and relationships of the mountain lizards of
Europe and Near East (Archaeolacerta Merttens, 1921, Sensu Lato) and
their relationships among the Eurasian Lacertid lizards. // Russian J.
Herpetology, 1999. V. 6(1). P. 1-22.
41 Badaeva T.N., Malysheva D.N., Korchagin V.I., Ryskov A.P. Genetic
variation and de novo mutations in the parthenogenetic Caucasian rock
lizard Darevskia unisexualis. // PloS One, 2008. V.3(7): e2730.
(http://www.plosone.org/home.action).
42 Berger S.L. Histone modifications in transcriptional regulation // Curr.
Opin. Genet. Devel., 2002. V. 12. P.142–148.
43 Bernardi G. Isochores and the evolutionary genomics of vertebrates.//
Gene, 2000. V. 241. P. 3–17.
44 Bernardi G. The neoselectionist theory of genome evolution. // Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 2007, V.104. P. 8385-8390.
45
Bertoni F., Codegoni A.M., Furlan D., Tibiletti M.G., Capella C.,
Broggini M. CHK1 frameshift mutations in genetically unstable colorectal
and endometrial cancers. // Genes Chromosomes
180.
Cancer, 1999. V. 26. P.176-
46 Biemont C., Vieira C. Genetics: Junk DNA as an evolutionary force //
Nature, 2006. V. 443. P. 521–524.
Biet E., Sun J., Dutreix M. Conserved sequence preference in DNA
47
binding among recombination proteins: an effect of
structure. // Nucleic Acids Research, 1999.V.27, P. 596-600.
ssDNA secondary
48 Bois P., Willianson J., Brown J. et al. A novel unstable mouse VNTR
family expanded from SINE B1 elements. // Genomics, 1998. V.49.
P.122-128.
90
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]