Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Шахнович, А. Р. Математические методы в исследовании биологических систем регулирования

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
21.10.2023
Размер:
9.19 Mб
Скачать

Roth

R.,

Roth

M- Data Unseerambling and the analysis inducible enzyme

synthesis.—

Math. Bioscience, 1969, 5, 7/2, 93.

Schick

K. Potassium efflux and nodal membrane structure. Math. Bioscience,

1968,

3, N

1/2.

Stark L . , Semmlow

L . , Tederman I. Automatic transfer function Math. Biosci­

ence,

1968,

2,

N 4.

Woo. Control characteristics of regulatory enzyme systems.— Math. Biosiences, 1972, 13.

Глава 111-2

МЕТАБОЛИЗМ

Вразделе I I приведено описание метаболизма мозга. Этот про­ цесс является динамическим, изменяющимся во времени (Рашевски, 1966). Обзор подобных работ приведен Шапиро (1971). Так, Bellman, Jocquez, Kalaba, Schcwimmer (1967) представили ме­ тодику количественной оценки констант кинетики химических про­ цессов. Подобная проблема рассмотрена как проблема многото­ чечного ограничения для систем обыкновенных нелинейных диф­ ференциальных уравнений.

Вработе Мого, Bharucha-Reid (1969) изучается система диф­ ференциальных уравнений, описывающих кинетику энзима. Дано обобщение этой модели, основанное на предположении, что время активации является случайной переменной.

Исследованию математической модели взаимоотношений двух метаболитов (в применении к устранению антагонистического раз­

баланса) посвящена работа Bernard-Weil, Mulletin (1970).

В последние годы было показано, что преобразования различ­ ных лекарственных веществ в терапевтических дозах неадекватны описанию линейными моделями. Многие энзиматические реакции

являются нелинейными. Buell, Kalaba

(1969) привели

теоретиче­

скую модель, пригодную для исследования некоторых

метаболи­

ческих

процессов, получив численные

результаты.

 

R .

Roth, M. Roth (1969) представили математический аппарат,

пригодный для оценки начальных условий, и привели систему дифференциальных уравнений, характеризующих энзиматические процессы. Математические представления основаны на квазили­ неаризации и динамическом программировании.

Heinmetz (1968) привел адаптивную модель системы энзима для транспорта субстрата в клетке. Энзиматические процессы ха­ рактеризуются дифференциальными уравнениями. Одна из про­ стейших возможностей взаимодействия метаболических процессов представлена на схеме (рис. 34) (Jacob, Monod, 1961).

150

Сложность математической модели определяется той точностью, которая требуется в конкретном исследовании и зависит от коли­ чества камер, взаимосвязи между которыми учитываются. Наи­ более грубый подход состоит в рассмотрении органа как отдельной камеры.

Более тонкий подход предлагает исследование взаимосвязи внутриклеточной жидкости и клетки организма как двух разных камер.

Рис. 34. Схема управления метабо­

лическими

циклами (Jacob, Monod,

1961)

 

 

 

 

 

S i , S 2

и с х о д н ы е с у б с т р а т ы ф е р м е н т о в ;

Е і . Е., Р , , Рг

— к о н е ч н ы е п р о д у к т ы с о о т ­

в е т с т в у ю щ и х

м е т а б о л и ч е с к и х

ц и к л о в ;

Оі

Ь2 — р е п р е с с и я

р е а к ц и и

S , - »

Р*;

яа

 

Î), — р е п р е с с и я

р е а к ц и и

S i ' - *

Pu

Oi

и н д у к ц и я фермента JE,; О,

— и н д у к ­

ц и я ф е р м е н т а Е а . П р и н а л и ч и и р а в н ы х и с х о д н ы х с у б с т р а т о в д л я с и н т е з а ф е р м е н ­

тов ( S i , S j )

м е т а б о л и ч е с к и е п р о ц е с с ы б у ­

д у т в н а ч а л е

ИДТИ С о д и н а к о в ы м и к о н е ч н ы ­

м и р е з у л ь т а т а м и ( Р і , Рг). О д н а к о п о д в л и ­

я н и е м д а ж е с л а б о г о в о з д е й с т в и я в с и с т е м е в о з н и к а е т а с и м м е т р и я , к о т о р а я н е и з б е ж н о

у г л у б л я е т с я и п р и в о д и т к т о м у , что и з

д в у х

в о з м о ж н ы х к о н е ч н ы х п р о д у к т о в

б у д е т

в ы р а б а т ы в а т ь с я о д и н

 

Наиболее тонкий подход приводит к учету клеток различных типов. Тогда рассматривается n -f- 1-камерная система (п — кле­

ток

и

жидкость).

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Линейная модель динамики метаболизма может быть получена

следующим образом (Рашевски, 1966).

 

 

 

 

 

 

Рассмотрим систему,

состоящую из п камер.

В

процессе

об­

мена участвует к метаболитов (к =

\...т),

которые продуцируются

или потребляются в некоторых из п камер.

 

 

 

 

 

Процесс обмена осуществляется с помощью диффузии из і-й

камеры в Z-ro смежную

камеру.

 

 

 

 

 

 

 

 

Пусть ѴІ — объем

і-ж камеры;

сік

— концентрация

к-ѵо мета­

болита в і-й камере. Если считать, что объем' і-й камеры VT

=

=const, то изменение концентраций /с-го

метаболита

в

і-й

камере

может быть представлено в виде

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

~ОГ

=

2l ß'-i. I (Clr

Cir)

+ Яіг,

 

 

 

 

 

где qik.

— удельная скорость образования метаболита. 6г,-,г =

a

 

-irтг I

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

' і

 

удельный коэффициент проницаемости мембраны [между

камерами

і и

I.

Полученное

выражение представляет

собой

линейную

154

модель динамики процесса метаболизма и может быть исполь­ зовано для определенных исследований. Однако при выводе этого выражения не учтены некоторые довольно существенные положе­ ния теории метаболизма. Так, при выводе первого члена правой части приток принят пропорциональным разности концентрации, что, вообще говоря, несправедливо для случая «активного тран­ спорта», метаболита и при учете конвекции, где зависимости имеют

нелинейный характер. Скорость образования метаболита qik

в об­

щем

виде

также является

нелинейной

функцией

концентра­

ции

сІІ:.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

В общей форме нелинейная модель метаболизма может быть

представлена (Дечев, Матвеев, 1969)

как:

 

 

 

 

 

 

-J7 =

ЯІ. (^О) хп)

хи

 

 

 

 

 

-Jf

Kn-lxn-l

<7n (a 'n)i

 

 

 

где

q (x0,

x„) — скорость

образования

конечного

продукта;

q(xn)

— скорость потребления конечного продукта;

ха

— концент­

рация вначале; xt — концентрация в

і-й

момент

времени;

Kt

константы

скорости,

или

 

 

 

 

 

 

 

 

 

j t

= / ( З і .

. .Xn,Ux.

. .

и,),

 

 

 

где ut — управление.

Однако нелинейное представление достаточно сложно для ана­ литического исследования. Поэтому при составлении математиче­ ской модели метаболического процесса представляется целесообраз­ ным использование метода квазилинеаризации (Buell, Kalaba, 1969) или более общего идентификационного подхода (Bellman, 1969).

Выше, в главе 1-1, была приведена идентификационная про­ цедура, основанная на квазилинеаризации. Эта процедура успеш­ но применяется для аналитического исследования метаболических процессов. Bellman, Jasques, Kalaba (1967) эту процедуру исполь­ зовали для определения в нелинейном дифференциальном урав­ нении кинетики химических процессов

^ = к{а-х){Ь-хУ — Кх* (ІИ-2-1)

скоростных констант к ж К при наличии экспериментальных дан­ ных.

При условии к — О, К =

0 и известных значениях

а и b миними­

зацией выражения

 

 

<?=

S ( * ( * i ) - W i ) 2

(ИІ-2-2)

152

с помощью четырех итерации получено значение констант с ошиб­ кой 15%..

Выше приведена линейная модель нормального метаболического процесса без внешних возмущений. Значительный интерес для практики представляет исследование процесса метаболизма при наличии внешнего возмущения — введении препарата в орга* низм.

Пусть г; — скорость введения метаболита; х — общее коли­ чество препарата в крови; у — общее количество препарата в тка­

ни;

Ѵх

— объем крови; Ѵ2 — объем ткани; S — площадь мембра­

ны;

h — проницаемость; % — коэффициент

распределения.

Тогда

концентрация препарата

в крови сх

= х/Ѵх,

 

 

 

 

 

у

 

 

концентрация препарата

в ткани с2 = рг ,

 

 

,

Sh

л

кѴх

 

 

константы к = -—,

К — —- ,

 

 

 

V

 

К 2

кх — константа распада.

С учетом изложенного выше общая скорость изменения содержа­ ния препарата в крови складывается из скорости введения и ско­ рости исчезновения, т. е. дифференциальное уравнение имеет вид

d£-v-k{x-%y)

— kx.

(III-2-3)

Здесь первый член правой части характеризует скорость введения, второй член — переход метаболита из крови в ткань, третий — исчезновение метаболита. Аналогично общая скорость изменения количества препарата в ткани описывается выражением

% = к{х-%у)-кц/

(ИІ-2-4)

(где к2 — константа распада в ткани). Таким образом, в линейном представлении динамика описывается уравнениями (ПІ-2-3) и (ИІ-2-4).

Одну из моделей кинетики химических процессов рассмотрели Gonsalez-Fenandes,' Atta (1968). Модель описывается двумя зависи­ мыми переменными Q и £, удовлетворяющими уравнениям в част­ ных производных

где jDr , DZ— значения коэффициентов диффузии в направлениях г и z цилиндрических координат; ср (Q) — функция концентрации кислорода Q для времени і.

153

Для кинетики

субстрата энзима

 

с начальными

условиями

 

 

^

= 0

для

г = г,;

0 < z < z c ;

^

=

0

для

0 < r < r , ;

z = 0;

^

=

0

для

0

z = zc ;

 

 

гс сЯ (І) Ç - гс с/ (І) -f rc vc | 5 -

2Д . g

= О

 

 

 

 

для r = rc;

0 ^ z ^

zc

 

 

и

уравнению в частных

производных

 

 

 

 

 

І = 4 ( Д Ш < 2 ( г с , * ) - / © ) ,

 

 

г д е

 

[ н ь Д ш к ц

- Ф у н

к Ц и я

Фракции.

 

 

 

 

 

с == [Hb] + [ Н Ь 0 2 ] ,

 

 

 

 

 

д(і) = д;®(і-9,

 

 

 

 

 

/(I)

=5C (Ê)|

 

 

 

и

граничным условием £ (0) =

| А , где | А артериальное

значе­

ние. На основании данного математического представления

полу­

чены

результаты с помощью итеративной

процедуры.

 

 

Выше были приведены некоторые линейные и нелинейные мо­

дели

динамики метаболизма.

 

 

 

 

 

В математическом исследовании динамики метаболизма воз­

можны следующие задачи

(Шапиро, 1970).

 

 

 

I . Исследование влияния параметров камер (площади, про­

ницаемости и т. д.) на динамику

процесса в линейной и нелиней­

ной моделях.

 

 

 

 

 

 

 

I I .

Исследование

динамики

метаболизма

при введении

по­

стоянного возмущения ѵ, что сводится к решению дифференциаль­ ных уравнений.

I I I . Определение оптимального процесса метаболизма при вве­ дении возмущения с постоянной скоростью или скоростью, зави­ сящей от времени ѵ (t) для заранее сформулированного критерия качества процесса.

Требования к качеству при исследовании оптимальной дина­ мики метаболизма могут быть весьма разнообразными:

оптимальное быстродействие (при исследовании перехода метаболита из одного состояния (количества) — в другое);

154

оптимальное качество изменения концентрации метаболита;

оптимальное приближение семейства случайных процессов динамики метаболизма к желаемому детерминированному процессу.

Во всех перечисленных случаях может быть записан функцио­ нал вида

т

J = ^ с(х, и, t) dt.

 

о

I V . Исследование

процесса метаболизма с учетом динамичес­

кого взаимодействия

двух процессов с противоположными ин­

тересами (синтез и распад, образование и потребление продукта и т. д.), происходящее в сложных .условиях (по температуре, давлению pH и т. д.), при наличии побочных продуктов обмена (Болдуин, 1949).

Среди перечисленных выше задача I является обычной задачей анализа и имеет практическое значение. Для ее решения необхо­ димы конкретные исходные данные. Решение этой задачи (Рашевски, 1966) имеет вид: изменение количества препарата в крови описывается уравнением

а изменение количества препарата в ткани описывается уравне­ нием

Ѵ_Г_і_ ,л _ - K t \ _ 1 - e-( A '-+ g '> ' I

Эти уравнения имеют широкое применение при исследовании ме­ таболических процессов.

При решении задач класса I I I представляется целесообразным использование принципа максимума Л. С. Понтрягина (см. главу 1-2), так как здесь имеют место математическая модель, критерий качества, граничные условия. Оптимальная задача, как известно, формулируется следующим образом: определить управление, принадлежащее к классу допустимых, переводящее точку в фазо­ вом пространстве состояний, динамика которой описывается

уравнением

 

^ = Ах + Bu,

I и I L

так, чтобы критерий качества достигал экстремального значения. Рассмотрим линейную модель, которая характеризует введе­

ние, накопление и удаление лекарственных веществ.

Пусть

р — количество лекарственных веществ, которые могут

 

быть введены в организм;

 

то — количество лекарственного вещества р на времени

 

£, введенного в организм;

155

?ni

— количество

лекарственного вещества

р на

времени

V

I, распределенное в некотором объеме;

 

 

 

 

 

 

 

 

 

пі2

— количество

лекарственного вещества

р,

выделяе­

 

мого на

времени t;

 

 

 

 

Ко

— постоянная

 

скорость

абсорбции

лекарственного

 

вещества

р

 

в некотором объеме на времени /;

Кх

— постоянная

 

скорость

выделения

лекарственного

 

вещества

р

на времени t;

 

 

 

gp (t) — скорость,

с

которой

лекарственное

вещество р

 

введено

на

 

времени

t;

 

 

 

тогда динамический процесс введения, накопления и выделения может быть представлен в виде

^= / « + ^ ( £ ) ,

?g = K$mS-Kïn$,

^ = KÏml

(Ш-2-5)

Поскольку лекарственное вещество удобно вводить стандарт­ ными порциями, модель процесса целесообразно привести к дис­ кретной форме тогда, если возмущение вида

 

N

 

gp(t)=

2

uK8(t-KT),

 

к=а

 

где ô (t) — функция Дирака, ик — количество лекарственного ве­ щества, вводимого на времени KT, действует на систему, описы­ ваемую уравнениями (III-2-5), то, вводя обозначения:

ml

(KT) = ук;

mf (KT)

= zK;

^

=

T;

 

a =

exp (—K0T);

b =

exp

{—KJT);

 

с =

T_

ехр (—КгТ)

{ехр [ -

( т -

1) Т\

-

1},

можно получить систему дифференциально-разностных уравне­ ний, описывающих процесс в виде

Ук+1 =

Щк +

аиК,

у0

= сук

+ bzH

+ cult,

z0.

Эквивалентное количество вещества в объеме zft + wk,

где w„- — монотонно убывающая последовательность. Требуется определить такую стратегию введения^лекарственного вещества

І56

(т. е. управляющую последовательность)

где U — подмножество неотрицательных действительных поведе­ ний, чтобы процесс приблизился к некоторому желательному с точки зрения терапии значению а, т. е. необходимо минимизиро­ вать функционал

N

J 0... UN-X) = 2 i z * (а — гок)]-.

В подобной формулировке задача решается с помощью динамиче­

ского

программирования.

 

 

 

 

 

Функция

оценки

(в терминах

динамического программирования)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

Іп К ,

с2)

=

min

 

{

2

l*k (а -

w*)]*} ,

 

 

 

 

 

uN-n—uN-l

 

 

ЧІ=ІѴ-(П-1)

 

'

 

 

UN-!

Œ

U,

 

i =

l...n,

 

 

 

 

IjN-n

=

C l ,

ZjV-n

C 2 .

 

 

Уравнение Беллмана

 

 

 

 

 

 

fn(ел)

=

min

{[ССІ -f- bc2

+

cf/N _„ — (a — wN_^-i))]z +

 

 

 

 

 

 

 

+

/ n - i (f l C i + awiv-n, cq -|- èc2 + сил _,г)}

с начальным

условием

 

 

 

 

 

 

 

 

/і (с к с2 ) =

min

 

[ССІ +

Ъсг -f

cwjv-i (a — w>N)]2.

Приведенные

выше результаты определения

оптимальной до­

зировки и моментов введения лекарства были получены для до­ статочно простого детерминированного случая (Buell, Jelleff, КаІаЬа, Sridahars, 1970).

Однако при решении такой задачи возникает необходимость использования стохастического подхода, так как-начальные усло­ вия уо и z0 могут трактоваться как случайные переменные с из­

вестным распределением и последовательность zk

также

может

быть стохастической.

 

 

 

 

 

 

 

 

Дальнейшее

углубление исследования

может

состоять

в

том,

чтобы учитывать изменение параметра К{° от

одного дня

к

дру­

гому.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Подобный подход приводит к проблеме адаптивного управления.

 

Выше был приведен пример использования

для решения опти­

мальной

задачи

метаболизма динамического

программирования.

В

ряде

других

задач

оптимальное

решение может

быть получено

с

помощью принципа

максимума

(см.

главу

1-2),

 

 

157

К I V из перечисленных выше классов может быть отнесен энзиматический процесс с двумя конечными продуктами (Woo, 1972), который, по-видимому, целесообразно рассматривать с помощью

теории

дифференциальных игр.

 

 

Л И Т Е Р А Т У Р А

Болдуин

Э. Основы динамической

биохимии. М., ИЛ, 1949.

Дечев Г.,

Матвеев М. Колебательные процессы

в биологических системах

как результат оптимального саморегулирования.— Биофизика, 1969, 14,

вып.

6.

 

 

Рашевски

Н. Некоторые медицинские аспекты математической биологии. М.,

«Медицина», 1966.

 

 

Шапиро Д. И. Об аналитическом

исследовании

процесса метаболизма.—

Труды Симп. по управлению

в организме

человека и животных. М.,

1970а.

Шапиро Д. И. Об одной математической модели метаболизма.— Труды Симп. по управлению в организме человека и животных. М., 19706.

Шапиро Д. И. Математические методы в медико-биологических исследова­ ниях. Информационные материалы Совета по Кибернетике АН СССР.

М.,

 

№ 2, 1971.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bellman

 

E. A new method for identification of systems.— Math. Bioscience,

1969, 5,

N 1/2.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bellman

 

R.,

Jasquez

J.,

Kalaba

R.,

Schwimmer

S.

Quasilinearization and

estimation of chemical rate constans from raw kinetic data.— Math. Bios­

cience,

1967,

1,

N 1.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Buell

J.,

Jelliff

Y.,

Kalaba

R. Modern control theory and optimal dang regi­

mes:

I

Platten

Effect.— Math.

Bioscience,

1969, 5, 3/4.

 

Buell

J.,

Kalaba

R.

Quazilinearization and fitting of nonlinear models of

drug metabolism to experimental kinetic data.— Math. Bioscience, 1969,

5,

1/2.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Buell

J.,

Jelliff

Y.,

Kalaba

R.,

Sridahar

R. Modern Control Theory and Opti­

mal

Drug. Mat. Bios.,

1970, 6.

 

 

 

 

 

 

Gonsalez-Fernandes

J.,

S. Atta. Transport

and Consumption of Oxygen in Capil­

lary — Tissue

Structures. Math.

Bios., 1968, 2, 3/4, 225.

 

Heinmetz

F., Model

A. System for the Induction of an Enzymatic

Transport

System

by External

Substral.

Math. Bios.,

1968, 3, 1/2, 175.

 

Jacob

F.,

Monod I. Coed Spring

Harbor

Sympos. on

Quant. Biol., 26, 1961

Moro

A.,

Bharucha-Reid

 

A. On the

Kinetics of Enzyme

Amplifier

Systems.

Math.

Bios.,

1969, 5,

3/4, 391.

 

 

 

 

 

 

Roth

R.,

Roth

M. Data

Unserambling

and the Analysis

Inducible

Enzyme

Synthesis.

Math.

Biol., 1969, 5, 7/2, 93.

 

 

 

 

Woo.

Control

Characteristics of Regulatory Enzyme

Systems Mathemat. Bio-

cience,

1972,

13,

1/2.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Barnard-Weil,

 

Mulletin

 

A. Mathematical Model for the Study Adrenal-Postpi-

tuitary Interrelationships: Its use in the Correction of Antagonistic

Imbalan­

ce.

Mathematical

Bioscience,

1970, 1/2.

 

 

 

 

Глава Ш - 3

КРОВОСНАБЖЕНИЕ МОЗГА

Проблема исследования кровотока складывается из широкого диапазона связанных между собой направлений. К подобным на­ правлениям принадлежат такие, как исследование процессов в

мембранах,

исследование процессов в капиллярах, исследование

процессов

протекания вязкой жидкости по эластичным сосудам,

и др.

 

По указанным направлениям проведены серьезные физиологи­

ческие работы и накоплен интересный экспериментальный мате­ риал.

В настоящее время в физиологических исследованиях все шире применяются математические методы.

Математические исследования, связанные с изучением пробле­ мы кровообращения, ведутся достаточно интенсивно, о чем сви­ детельствует значительная литература. При этом рассматриваются влияние эластичности сосудов, вязкости крови и другие характе­ ристики.

Аналитические исследования проблемы кровотока в настоящее время привлекают к себе все большее внимание. Среди опуб­ ликованных работ к этой проблеме можно отнести, например, следующие. Iberall (1967) привел математическую модель, позво­ ляющую представить некоторые характеристики системы (геомет­ рию и топологию, сопротивление течению и т. д.), и применения моделирования к решению некоторых конкретных задач. Elkart, Liberstein (1967) посвятили свою работу математическому иссле­ дованию течения без напора вязкой жидкости в эластичной трубе, обосновали введенные ограничения и получили аналитические ре­ зультаты.

Elcrat (1968) в своей работе решает математические задачи, связанные с исследованием истечения вязкой жидкости в трубе без напора, с помощью уравнений в частных производных.

На основании литературных данных о математических иссле­ дованиях системы кровообращения, а также экспериментального изучения механизмов саморегуляции кровоток представляется целесообразным следующим образом классифицировать математи­ ческие задачи (Шапиро, 1971): задачи идентификации; задачи ана­ лиза влияния параметров на процесс; задачи исследования пове­ дения процесса.

К первому из указанных направлений относятся задачи, свя­ занные с получением аналитических зависимостей, характеризую­ щих основные аспекты проблемы кровотока (которые сводятся в основном к дифференциальным уравнениям в частных производ­ ных). При этом представляют интерес как вид уравнений, так и

159

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ