- •2. Підкреслити хімічні групи в складі амінокислот, які формують пептидний зв’язок: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •30. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •23. Чи входить гістон н1 до складу корової частинки нуклеосоми? ні
- •29. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази не входить до складу ферменту під час елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •4. Чи можливі іонні взаємодії між двома аміногрупами за фізіологічних умов? так
- •8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.
- •9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?
- •13. Як називається пентоза, що містить он-групу при атомі с2'?
- •7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.
- •37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в днк.
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Який заряд в складі кожної амінокислоти несе на собі карбоксильна група за фізіологічних умов?
- •1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі позитивний заряд за фізіологічних умов?
- •37. Метилування днк в промоторних зонах корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •37. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в активному хроматині?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •5. Деякий процес супроводжується зростанням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?
- •8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
5. Деякий процес супроводжується зростанням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?
6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Leu.
7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Lys.
8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?
9. Водневі зв'язки між якими хімічними групами стабілізують вторинну структуру білків (аміногрупи, гідроксильні, пептидні, метильні, фосфатні)?
10. Підкреслити два типи вторинної структури в складі білків: α-спіраль, α-структура, β-спіраль, β-структура, γ-спіраль, γ-структура.
11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у відсутності ліганду?
12. Як називається сполука, що містить азотисту основу та пентозний цукор?
13. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?
14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?
15. Як називається пентоза, що входить до складу ДНК?
16. В якій формі існує подвійна спіраль РНК за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?
17. Скільки водневих зв'язків утворюється між G і C в GC-парі?
18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт TC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?
19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – GGCGTGC. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.
20. Чи завжди взаємодія білка з великим жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?
21. Як називаються молекули циркулярної ДНК, що розрізняються тільки за числом зачеплень?
22. Як називається елементарна структурна одиниця хроматину?
23. Скільки пар основ ДНК входить до складу корової частинки нуклеосоми (1056, 125, 145, 175)?
24. Якій посттрансляційній модифікації не піддаються гістони (ацетилування, глікозилювання, фосфорилювання, метилування)?
25. Гени – це ділянки ДНК, які кодують амінокислотні послідовності білків. Чи є цей вислів вичерпним (так/ні)?
26. Середня густина генів на ділянках геному людини корелює з GC-вмістом: а) позитивно; б) негативно; в) в залежності від хромосоми; г) не корелює.
27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?
28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?
29. Дайте повну назву ферменту, який прийнято скорочено позначати як RNAP.
30. До якого кінця мРНК приєднується черговий нуклеотид під час транскрипції?
31. Ділянка ДНК, що контролює активність певного промотору, називається trans- чи cis-регулятором?
32. Спорідненість певного білка до ДНК залежить від того, чи зв'язана на сусідньому сайті інша молекула цього чи іншого білка. Як називається такий феномен?
33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.
34. Складовою частиною якого базального транскрипційного фактору РНК-полімерази ІІ є білок ТВР?
35. Що означає абревіатура CTD, яка має відношення до РНК-полімерази ІІ?
36. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ піддається фосфорилюванню при: а) ініціації транскрипції; б) переході від інінціації до елонгації; в) елонгації; г) термінації.
37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.