Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
billets_mod1.doc
Скачиваний:
3
Добавлен:
21.11.2019
Размер:
2.98 Mб
Скачать

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.

8. Чи може один кодон кодувати різні амінокислоти?

9. Водневі зв'язки між якими хімічними групами стабілізують вторинну структуру білків (аміногрупи, гідроксильні, пептидні, метильні, фосфатні)?

10. Підкреслити два типи вторинної структури в складі білків: α-спіраль, α-структура, β-спіраль, β-структура, γ-спіраль, γ-структура.

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у відсутності ліганду?

12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?

13. Як називається пентоза, що містить атом водню при атомі С2'?

14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?

15. Як називаються нековалентні взаємодії, які головним чином стабілізують подвійну спіраль ДНК?

16. Яка структурна форма ДНК є переважною за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми GC парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт GG. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – ATTAGGT. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Чи завжди взаємодія білка з маленьким жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?

21. Як називаються ферменти, що змінюють топологічний стан циркулярної ДНК?

22. Скільки молекул гістонів входить до складу нуклеосоми?

23. Чи входить гістон Н1 до складу корової частинки нуклеосоми?

24. Залишки яких амінокислот є позитивно зарядженими за фізіологічних умов (Ala, Arg, Asp, Gln, Ile, Lys, Met, Tyr,Val)?

25. Підкреслить гістон, який відіграє провідну роль у конденсації хроматинової фібрили: Н1, Н2А, Н2В, Н3, Н4.

26. Яка приблизно частка геному прокаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?

27. Кластери генів еукаріотів, як правило, є: а) єдиними транскрипційними одиницями; б) гени в кластерах транскрибуються окремо; в) в еукаріотів немає кластерів генів.

28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, що є матрицею для синтезу мРНК?

29. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli?

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

31. Білок – транскрипційний фактор називається trans- чи cis-регулятором?

32. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою І: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів РНК-полімерази ІІ: TFII A, TFII B, TFII C, TFII D, TFII E, TFII F, TFII G, TFII H, TFII I, TFII J, TFII K.

34. Що означає абревіатура ТВР?

35. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ: а) містить активний центр; б) забезпечує взаємодію між субодиницями; в) забезпечує розкручування подвійної спіралі ДНК; г) має невпорядковану структуру.

36. Як називається регуляторна ділянка ДНК, яка підсилює ефективність транскрипції, знаходячись на деякій, часто значній, відстані від промотору?

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. Метилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

39. Основним наслідком АТР-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.

40. Комплекси ремоделювання хроматину рекрутуються в активні ділянки хроматину: а) транскрипційними факторами; б) ацетильованими гістонами; в) гістон ацетилтрансферазою; г) білками ядерного матриксу; д) реалізуються всі можливості.

Модуль 1. Білет 13.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?

2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

3. Чи можливі ван-дер-ваальсові взаємодії між гетероциклічними сполуками?

4. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить атом водню. Як вона називається?

5. Деякий процес супроводжується зниженням ентальпії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Met.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Arg.

8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?

9. Водневі зв'язки між якими хімічними групами стабілізують вторинну структуру білків (аміногрупи, гідроксильні, пептидні, метильні, фосфатні)?

10. Як називають просторову структуру білка, що складається з кількох субодиниць?

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у відсутності ліганду?

12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?

13. Підкреслити атом вуглецю пентози, до якого приєднані різні групи у рибози та дезоксирибози: С1', С2', С3', С4', С5'.

14. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його кінцева точка?

15. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

16. Подвійна спіраль ДНК в А-формі є правою чи лівою?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми GC парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – ATTAGGT. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. З великим чи маленьким жолобком взаємодіє переважна більшість білків, що впізнають певні нуклеотидні послідовності?

21. Як називаються ферменти, що змінюють топологічний стан циркулярної ДНК?

22. Як називаються основні білки хроматину?

23. Підкреслить два гістони, які формують гетеротетрамер в складі нуклеосоми: Н2А, Н3, Н1, Н4.

24. Яка ділянка в складі корових гістонів піддається посттрансляційним модифікаціям (N-кінцева, центральна, С-кінцева, нема такої ділянки)?

25. До ядерного матриксу прикріплюються: а) кінці хромосом; б) центромери; в) петлі хроматину; г) кожна нуклеосома; д) не прикріплюється інтерфазний хроматин.

26. Як називається сукупність послідовностей ДНК в гаплоїдному наборі даного організму?

27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?

28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?

29. Підкреслити субодиниці, які входять до складу кор-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

30. Які сполуки є субстратами синтезу мРНК?

31. Ділянка ДНК, що контролює активність певного промотору, називається trans- чи cis-регулятором?

32. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою І: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів РНК-полімерази ІІ: TFII A, TFII B, TFII C, TFII D, TFII E, TFII F, TFII G, TFII H, TFII I, TFII J, TFII K.

34. Що означає абревіатура ТВР?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує фосфорилювання С-кінцевого домену полімерази при переході до елонгації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. Як називається транскрипційний фактор, який стає активним у відповідь на зв'язування зі стероїдним гормоном?

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

39. CpG-острівці частіше зустрічаються в промоторах генів: а) активних тканьоспецифічних; б) репресованих; в) генів “домашнього господарства”; г) псевдогенів.

40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.

Модуль 1. Білет 14.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

3. Як називаються нековалентні взаємодії, які реалізуються між будь-якими групами чи молекулами на маленьких відстанях?

4. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить пару електронів, що не формують ковалентного зв'язку. Як називається ця група?

5. До чого призводить занурення неполярної групи чи молекули у водне середовище (зниження вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання ентальпії, зниження ентальпії)?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Phe.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається His.

8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?

9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?

10. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами амінокислот, що відстоять на 3 амінокислоти одна від одної вздовж ланцюга?

11. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами витягнутих поліпептидних ланцюгів?

12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?

13. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?

14. Нуклеотид складається з азотистої основи, пентозного цукру та фосфатного залишку. Між якими елементами формується ковалентний зв'язок у полінуклетидному ланцюгу?

15. Заряд якого знаку має фосфатний залишок у нуклеїнових кислотах за фізіологічних умов?

16. Подвійна спіраль ДНК в В-формі є правою чи лівою?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми АТ парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CT. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – TTAGGCC. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Незалежні від нуклеотидної послідовності білково-нуклеїновї взаємодії здійснюються переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?

21. Які нековалентні взаємодії майже завжди реалізуються в білково-нуклеїнових комплексах (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

22. Як називаються основні білки хроматину?

23. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

24. Якій посттрансляційній модифікації не піддаються гістони (ацетилування, глікозилювання, фосфорилювання, метилування)?

25. Як називається частина хроматину, яка значно декомпактизується і є потенційно транскрипційно активною в інтерфазі?

26. Скільки пар основ ДНК міститься в геномі людини (3 тис, 3 млн, 3 млрд, 33 млрд)?

27. Середня довжина інтронів у генах на ділянках геному людини корелює з GC-вмістом: а) позитивно; б) негативно; в) в залежності від хромосоми; г) не корелює.

28. Як називається ділянка первинного зв'язування РНК-полімерази з ДНК при ініціації транскрипції?

29. Підкреслити субодиниці, які входять до складу кор-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?

31. Деякий білок сприяє зв'язуванню РНК-полімерази з промотором. Позитивним чи негативним регулятором його називають?

32. Певний промотор є сильним. Слід очікувати, що транскрипція з цього промотору знаходиться під контролем активатора чи репресора?

33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів РНК-полімерази ІІ: TFII A, TFII B, TFII C, TFII D, TFII E, TFII F, TFII G, TFII H, TFII I, TFII J, TFII K.

34. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази відповідає за точну орієнтацію РНК-полімерази на промоторі (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ має кілька ферментативних активностей (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ піддається фосфорилюванню при: а) ініціації транскрипції; б) переході від інінціації до елонгації; в) елонгації; г) термінації.

37. Гістоновий код – це: а) співвідношення між послідовностями нуклеотидів в гістонових генах і амінокислот в гістонах; б) характер розташування гістонових генів в кластері; в) співвідношення між первинною і вторинною структурами гістонів; г) співвідношення між картиною посттрансляційних модифікацій гістонів і спорідненістю до певних білків.

38. Як називається фермент, що здійснює деацетилування гістонів?

39. Нуклеосоми розташовані відносно послідовностей пар основ ДНК: а) лише на певних послідовностях; б) незалежно від послідовності; в) деякі послідовності мають перевагу щодо формування нуклеосом.

40. Гістон ацетилтрансфераза рекрутується в активні ділянки хроматину: а) транскрипційними факторами; б) ацетильованими гістонами; в) комплексами ремоделювання хроматину; г) білками ядерного матриксу; д) реалізуються всі можливості.

Модуль 1. Білет 15.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?

2. Як називається полімерний ланцюг, що побудований з амінокислотних залишків?

3. Як називаються нековалентні взаємодії, які реалізуються між будь-якими групами чи молекулами на маленьких відстанях?

4. Чи можливий водневий зв'язок між групами –NH та ═O?

5. Деякий процес супроводжується зростанням ентальпії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Val.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.

8. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найменш важливою у визначенні амінокислоти?

9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?

10. Як називають просторову структуру поліпептидного ланцюга?

11. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами витягнутих поліпептидних ланцюгів?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу та пентозний цукор?

13. Як називається пентоза, що містить ОН-групу при атомі С2'?

14. Нуклеотид складається з азотистої основи, пентозного цукру та фосфатного залишку. Між якими елементами формується ковалентний зв'язок у полінуклетидному ланцюгу?

15. Як називаються нековалентні взаємодії, які головним чином стабілізують подвійну спіраль ДНК?

16. Скільки існує типів динуклеотидних контактів у полінуклеотиді, що складається з залишків чотирьох типів?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми АТ парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт AA. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – TTAGGCC. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Чи завжди взаємодія білка з великим жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?

21. Які нековалентні взаємодії, як правило, відіграють провідну роль у білково-нуклеїновому впізнанні (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

22. Як називається елементарна структурна одиниця хроматину?

23. Чи входить гістон Н1 до складу корової частинки нуклеосоми?

24. Базова фібрила інтерфазного хроматину має товщину: 10, 20, 30, 40, 50 нм.

25. Підкреслить гістон, який відіграє провідну роль у конденсації хроматинової фібрили: Н1, Н2А, Н2В, Н3, Н4.

26. Яка приблизно частка геному прокаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?

27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?

28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?

29. Дайте повну назву ферменту, який прийнято скорочено позначати як RNAP.

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

31. Деякий білок блокує транскрипцію на певному гені. Позитивним чи негативним регулятором його називають?

32. Спорідненість певного білка до ДНК залежить від того, чи зв'язана на сусідньому сайті інша молекула цього чи іншого білка. Як називається такий феномен?

33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

34. З яким стандартним елементом еукаріотичних промоторів зв'язується білок ТВР?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує фосфорилювання С-кінцевого домену полімерази при переході до елонгації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. Як називається транскрипційний фактор, який стає активним у відповідь на зв'язування зі стероїдним гормоном?

Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]