- •2. Підкреслити хімічні групи в складі амінокислот, які формують пептидний зв’язок: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •30. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •23. Чи входить гістон н1 до складу корової частинки нуклеосоми? ні
- •29. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази не входить до складу ферменту під час елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •4. Чи можливі іонні взаємодії між двома аміногрупами за фізіологічних умов? так
- •8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.
- •9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?
- •13. Як називається пентоза, що містить он-групу при атомі с2'?
- •7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.
- •37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в днк.
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Який заряд в складі кожної амінокислоти несе на собі карбоксильна група за фізіологічних умов?
- •1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі позитивний заряд за фізіологічних умов?
- •37. Метилування днк в промоторних зонах корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •37. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в активному хроматині?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •5. Деякий процес супроводжується зростанням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?
- •8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
37. Метилування днк в промоторних зонах корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?
38. Як називається фермент, що здійснює ацетилування гістонів?
39. CpG-острівці частіше зустрічаються в промоторах генів: а) активних тканьоспецифічних; б) репресованих; в) генів “домашнього господарства”; г) псевдогенів.
40. Типова послідовність зв’язування елементів при активації транскрипції: а) транскрипційний фактор ТF – гістон ацетилтрансфераза НАТ – комплекс ремоделювання хроматину СR – преініціаторний комплекс PIC; б) ТF – СR – НАТ – PIC; в) ТF – PIC – НАТ – СR; г) ТF – PIC – СR – НАТ; д) реалізуються всі названі сценарії.
Модуль 1. Білет 126.
Дата ________ Група________________
Прізвище ______________________
1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі негативний заряд за фізіологічних умов?
2. Як називаються нековалентні взаємодії між зарядженими групами чи молекулами?
3. Як називаються нековалентні взаємодії між двома групами, кожна з яких містить електронегативний атом, причому одна з них містить атом водню, а інша – пару електронів, що не формують ковалентного зв'язку?
4. Як називається міра невпорядкованості термодинамічної системи?
5. До чого призводить екранування неполярних груп чи молекул від води (зростання вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання енальпії, зниження ентальпії)?
6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Leu.
7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Gln.
8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?
9. Які нековалентні взаємодії стабілізують вторинну структуру білків?
10. Підкреслити два типи вторинної структури в складі білків: α-спіраль, α-структура, β-спіраль, β-структура, γ-спіраль, γ-структура.
11. Які нековалентні взаємодії є головною рушійною силою формування глобулярної структури в білках?
12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?
13. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?
14. Як називається ковалентний зв'язок між нуклеотидами в полінуклетидному ланцюзі (глікозидний, фосфодіефірний, пептидний, цукрофосфатний, полінуклеотидний)?
15. Як називаються нековалентні взаємодії, які головним чином стабілізують подвійну спіраль ДНК?
16. Подвійна спіраль ДНК в А-формі є правою чи лівою?
17. Подвійна спіраль ДНК в Z-формі є правою чи лівою?
18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?
19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – AAGTATG. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.
20. З великим чи маленьким жолобком взаємодіє переважна більшість білків, що впізнають певні нуклеотидні послідовності?
21. Як називаються ферменти, що змінюють топологічний стан циркулярної ДНК?
22. Скільки типів гістонів входить до складу нуклеосоми?
23. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?
24. Якій посттрансляційній модифікації не піддаються гістони (ацетилування, глікозилювання, фосфорилювання, метилування)?
25. Як називається частина хроматину, яка значно декомпактизується і є потенційно транскрипційно активною в інтерфазі?
26. Яка приблизно частка геному прокаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?
27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?
28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?
29. Дайте повну назву ферменту, який прийнято скорочено позначати як RNAP.
30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
31. Як називається кластер бактеріальних генів, який є єдиною одиницею транскрипції?
32. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.
33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.
34. Складовою частиною якого базального транскрипційного фактору РНК-полімерази ІІ є білок ТВР?
35. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ: а) містить активний центр; б) забезпечує взаємодію між субодиницями; в) забезпечує розкручування подвійної спіралі ДНК; г) має невпорядковану структуру.
36. Як називається транскрипційний фактор, який стає активним у відповідь на зв'язування зі стероїдним гормоном?
37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.
38. Як називається фермент, що здійснює деацетилування гістонів?