
- •Значения KM некоторых ферментов
- •Преобразования уравнения Михаэлиса - Ментен : двойной обратный график ( уравнение Lineweaver- Burk)
- •График Корниш-Боудена
- •ИНГИБИРОВАНИЕ ФЕРМЕНТОВ
- •I. НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •II. Обратимое ингибирование: конкурентное, неконкурентное, бесконкурентное, смешанное
- •1. КОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Сульфаниламиды – структурные аналоги п-аминобензойной кислоты
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •2. БЕСКОНКУРЕНТНОЕ (UNCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •3. НЕКОНКУРЕНТНОЕ (NONCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •3. НЕКОНКУРЕНТНОЕ (NONCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •ОСНОВНЫЕ СТРАТЕГИИ ФЕРМЕНТАТИВНОГО КАТАЛИЗА
- •Функции аминокислотных остатков в активном центре фермента
- •Сближение субстрата с активным центром фермента и его ориентация относительно каталитического центра
- •Общий кислотно-основной катализ
- •Аминокислотные остатки, участвующие в общем кислотно-основном катализе
- •Гексокиназа
- •Индуцированное соответствие в гексокиназе
- •Механизм действия лизоцима – пример общего кислотно-основного катализа
- •Пептидогликан
- •Лизоцим расщепляет связь между N-
- •Связывание гекса-N-ацетилглюкозамина с
- •Относительная скорость расщепления лизоцимом олигомеров N-ацетилглюкозамина
- •Структура части активного центра лизоцима
- •SN1-механизм
- •Стабильная форма интермедиата - полукресло
- •Водородные связи между субстратом и аминокислотными остатками в активном центре лизоцима
- •SN2-механизм
- •Ковалентный
- •Второй продукт
- •Химотрипсин – эндопептидаза
- •Гидролиз пептидной связи химотрипсином: ковалентный катализ
- •Схема активного центра химотрипсина
- •Модельная реакция: расщепление нитрофенилацетата
- •Последовательные этапы каталитического действия химотрипсина
- •1 стадия: образование фермент- субстратного комплекса
- •2 стадия: освобождение 1-го продукта
- •3 стадия: образование ацилфермента
- •4 стадия: связывание воды
- •5 стадия: деацилирование
- •6 стадия: образование свободного фермента
- •Катализ с участием ионов металлов
- •Структура активного центра енолазы
- •Механизм двуступенчатой реакции, катализируемой енолазой
- •Регуляция активности ферментов
- •Изменение конформации аллостерических ферментов при связывании модуляторов
- •Аспартат транскарбамоилаза
- •Регуляция по принципу обратной связи
- •Кинетика аллостерических ферментов
- •Эффект позитивных и негативных модуляторов
- •Примеры ковалентных модификаций ферментов
- •Регуляция активности фосфорилазы гликогена путем фосфорилирования
- •Протеолитическая активация пепсина


k1 |
k2 |
E + S ↔ ES ↔ E + P |
|
k-1 |
k-2 |
1.При высоких [S], [S] >>> Km , V0 = Vmax
2.При низких [S], [S] <<< Km , V0 = Vmax· [S] / Km
3.Константа Михаэлиса-Ментен: KM =(k2+ k-1 )/ k 1
M

Значения KM некоторых ферментов

Преобразования уравнения Михаэлиса - Ментен : двойной обратный график ( уравнение Lineweaver- Burk)
y = a∙x + b

График Корниш-Боудена
ИНГИБИРОВАНИЕ ФЕРМЕНТОВ
I) НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
II)ОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ : 1) конкурентное
2)бесконкурентное
3)неконкурентное
4)смешанное

I. НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ

II. Обратимое ингибирование: конкурентное, неконкурентное, бесконкурентное, смешанное
Субстрат
Фермент
Конкурентный
ингибитор
Неконкурентный
ингибитор

1. КОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
Продукт
Субстрат
Фермент
ингибитор
Субстрат (S) и ингибитор (I) связываются с одним и тем же сайтом

Сульфаниламиды – структурные аналоги п-аминобензойной кислоты

Кинетический тест для определения механизма ингибирования
(1) Конкурентное ингибирование
При увеличении концентрации ингибитора:
1.Vmax → не меняется
2.KM → увеличивается
3.Коэффициент наклона → увеличивается
4. α = 1 +[ I ] / kI |
Без ингибитора |
|
Наклон = |

2. БЕСКОНКУРЕНТНОЕ (UNCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
Ингибитор cвязывается |
|
только с фермент- |
|
субстратным комплексом |
Продукт |
|
Фермент
Субстрат |
ингибитор |
Субстрат (S) и игибитор (I) связываются с разными сайтами