- •ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •СТРУКТУРА АМИНОКИСЛОТ – МОНОМЕРНЫХ ЕДИНИЦ БЕЛКОВ
- •Классификация аминокислот по полярности бокового радикала
- •Аланин
- •Валин
- •Лейцин
- •Изолейцин
- •Метионин
- •Фенилаланин
- •Триптофан
- •Пролин -
- •Полярные
- •Глицин
- •Аспарагин
- •Глутамин
- •Серин
- •Треонин
- •Тирозин
- •Цистеин
- •Полярные
- •Аспарагиновая кислота
- •Глутаминовая кислота
- •Полярные
- •Лизин
- •Аргинин
- •Гистидин
- •Аминокислоты с алифатической боковой цепью
- •Ароматические аминокислоты
- •Аминокислоты с линейной кислородсодержащей цепью
- •Аминокислоты с серусодержащей боковой цепью
- •Кислые аминокимлоты и их производные
- •Аминокислоты с основной боковой цепью
- •Иминокислота - пролин
- •Некоторые характеристики аминокислот
- •НЕКОТОРЫЕ ФИЗИКО- ХИМИЧЕСКИЕ
- •Одинарные связи атома углерода
- •Хиральность
- •D-глицеральдегид L-глицеральдегид
- •D- и L-аминокислоты
- •Различные способы изображения энантиомеров
- •Природные аминокислоты – L-аминокислоты
- •Кислотно-основные свойства аминокислот
- •Слабая
- •Кривая титрования аланина
- •Кривая титрования лизина
- •Кривая титрования глутаминовой кислоты
- •Аминокисло
- •Спектр поглощения аминокислот
- •Пептидная связь и первичная структура белков
- •4 аминокислоты
- •Пентапептид
- •Свойства пептидной связи
- •Фрагмент полипептидной цепи
- •Карты Рамачандрана показывают «разрешенные» и « запрещенные»
- •Образование дисульфидных мостиков
- •1952 – 1956 Фредерик Сэнджер определил аминокислотную
- •Дисульфидные
- •Секвенирование полипептидов
- •Секвенирование по Сэнджеру
- •Секвенирование по Эдману
- •Масс-спектрометрия
- •Масс-спектр пептида GFYAEGSR
- •Пример схемы протеомных исследований
- •2. Масс-спектрометрия
ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
Структура аминокислот – мономерных единиц белков;
некоторые физико-химические свойства аминокислот;
пептидная связь и первичная структура белков.
СТРУКТУРА АМИНОКИСЛОТ – МОНОМЕРНЫХ ЕДИНИЦ БЕЛКОВ
|
|
H |
O |
|
|
||||
+ |
|
|
|
α |
|
|
|
|
O– |
|
|
|
|
|
|
|
|||
H3N |
|
|
|
|
|
|
|
||
|
C |
C |
|||||||
|
|
|
R
Классификация аминокислот по полярности бокового радикала
Неполярные аминокислоты
Аланин
+ |
H |
|
O |
|
|
||||
|
|
|
|
|
O– |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|||
H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3
Alanine (Ala or A)
Валин
Valine |
|
H |
|
O |
|||||
+ |
|
||||||||
|
|
|
|
|
O– |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|||
(Val or V) H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
||||||
|
|
CH |
|||||||
|
CH3 |
CH3 |
Лейцин
Leucine |
+ |
H |
|
O |
||||||||
|
|
|
|
|
O– |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
H3N |
|
C |
|
|
C |
|
|||||
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
||||||
(Leu or L) |
|
|
CH2 |
|||||||||
|
|
|
|
|
CH |
|||||||
|
|
|
|
|||||||||
|
|
CH3 |
CH3 |
Изолейцин
Isoleucine |
+ |
H |
O |
|||||||
|
|
|
|
O– |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
(Ile or I) |
H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|||||||
|
|
CH |
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
CH3 CH2CH3 |
Метионин
+ |
H |
|
O |
|
|
||||
|
|
|
|
|
O– |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|||
H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3SCH2CH2
Methionine
(Met or M)
Фенилаланин
+ |
H |
|
O |
|
|
||||
|
|
|
|
|
O– |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|||
H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2
Phenylalanine
(Phe or F)
Триптофан
+ |
H |
|
O |
|
|
||||
|
|
|
|
|
O– |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|||
H3N |
|
C |
|
C |
|
||||
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2
N
H
Tryptophan
(Trp or W)