- ••Особенности ферментов как биологических катализаторов
- •Особенности ферментов как биологических катализаторов
- •Изменение энергии активации в присутствии фермента
- •Каталитический цикл
- •КЛАССИФИКАЦИЯ И НОМЕНКЛАТУРА ФЕРМЕНТОВ
- •INTERNATIONAL UNION OF BIOCHEMISTRY AND
- •КЛАССЫ: по типу катализируемой реакции
- •ЕС 1 оксидоредуктазы
- •ЕС 2 трансферазы
- •ЕС 3 гидролазы
- •ЕС 4 лиазы
- •ЕС 5 изомеразы
- •ЕС 6 лигазы
- •Подподкласс – дальнейшее уточнение
- •Индивидуальный номер фермента
- •Номенклатура ферментов
- •СТРУКТУРА ФЕРМЕНТОВ
- •Химотрипсин
- •Свойства активных центров ферментов
- •Пространственная структура химотрипсина
- •Свойства активных центров ферментов
- •Пространственная структура активного центра химотрипсина
- •Формирование активного центра папаина
- •Функции аминокислотных остатков в активном центре фермента
- •Коферменты – производные витаминов
- •Тиамин (витамин В1)
- •Рибофлавин, В2
- •Кофермент ковалентно
- •биотинкарбоксилаза
- •Липоевая кислота
- •Пантотеновая кислота
- •Коферментная
- •Трехмерная структура глутаматмутазы, выделенной
- •Фолиевая кислота
- •Кофакторы – металлы
- •Влияние различных факторов на скорость ферментативной реакции
- •Влияние температуры
- •Влияние рН
- •Активность ферментов
- •Число оборотов некоторых ферментов
- •Влияние концентрации субстрата на скорость ферментативной реакции
- •УРАВНЕНИЕ МИХАЭЛИСА – МЕНТЕН
- •Значения Km некоторых ферментов
- •Преобразования уравнения Михаэлиса - Ментен : двойной обратный график ( уравнение Lineweaver- Burk)
- •График Корниш-Боудена
- •Многие ферменты катализируют реакции с участием 2-х и более субстратов
- •ИНГИБИРОВАНИЕ ФЕРМЕНТОВ
- •I. НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •II. Обратимое ингибирование: конкурентное, неконкурентное, бесконкурентное, смешанное
- •1. КОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Сульфаниламиды – структурные аналоги п-аминобензойной кислоты
- •Преобразования уравнения Михаэлиса - Ментен : двойной обратный график ( уравнение Lineweaver- Burk)
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •2. БЕСКОНКУРЕНТНОЕ (UNCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •3. НЕКОНКУРЕНТНОЕ (NONCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
•Особенности ферментов как биологических катализаторов
•Принцип действия ферментов
•Классификация и номенклатура ферментов
•Структура ферментов
•Влияние различных факторов на скорость ферментативной реакции
•Механизм действия ферментов
Особенности ферментов как биологических катализаторов
•Химическая природа ферментов: белки; рибозимы (РНК-ферменты)
•Необычайно высокая эффективность (ускоряют реакцию в 105 – 1017 раз)
•Специфичность
•Зависимость активности ферментов от температуры и
Тромбин
Изменение энергии активации в присутствии фермента
Каталитический цикл
КЛАССИФИКАЦИЯ И НОМЕНКЛАТУРА ФЕРМЕНТОВ
Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB)
In consultation with the IUPAC-IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN)
INTERNATIONAL UNION OF BIOCHEMISTRY AND
MOLECULAR BIOLOGY
Recommendations on Biochemical & Organic Nomenclature, Symbols & Terminology etc.
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/ World Wide Web material prepared by G. P. Moss
School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary, University of
London,
Mile End Road, London, E1 4NS, UK g.p.moss@qmul.ac.uk
To search the database click here .
КЛАССЫ: по типу катализируемой реакции
• ЕС 1 оксидоредуктазы
• (перенос электронов или протонов)
•ЕС 2 трансферазы
•(перенос функциональных групп)
•ЕС 3 гидролазы
•(расщепление связей С-С, С-N, С-О и др. с участием воды)
•ЕС 4 лиазы
•(присоединение групп по двойной связи и обратные реакции)
•ЕС 5 изомеразы
•(внутримолекулярный перенос групп)
•ЕС 6 лигазы
•(образование новых связей С-С, С-N, C-S, C-O с участием АТФ)
ЕС 1 оксидоредуктазы
Лактат- дегидрогеназа
Пируват 1.1.1.27 L-лактат
ЕС 2 трансферазы
|
L-аланин |
|
СН3 |
СН3 |
(пируват) |
|
Аланинаминотрансфераза
(трансаминаза) 2.6.1.2