ИЕРАРХИЯ
БЕЛКОВОЙ
СТРУКТУРЫ
• Первичная 
Вторичная
• Структурные домены 
Супервторичная
•Третичная
•Четверитчная
Весной 1951 г. Linus Pauling,
Robert Corey, and Herman Branson в серии из 8 статей, опубликованных в
Proceedings of the National Acad emy of Sciences
USA , предложили модель структуры
α-спирали и β-слоя.
The Structure of Proteins: Two
Hydrogen-Bonded Helical Configurations
of the Polypeptide Chain
ТОРСИОННЫЕ УГЛЫ В ПЕПТИДАХ
•ψ угол вращения вокруг связи N - Calpha
•Ψ угол вращения вокруг связи C – Calpha
•ω угол вращения вокруг связи C – N
N
ПАРАМЕТРЫ СПИРАЛИ
Шаг 
спирали
Диаметр спирали
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА –
ЭТО УПОРЯДОЧЕННОЕ РАСПОЛОЖЕНИЕ ОСНОВНОЙ ЦЕПИ ПОЛИПЕПТИДА БЕЗОТНОСИТЕЛЬНО К ТИПАМ БОКОВЫХ ЦЕПЕЙ И ИХ КОНФОРМАЦИЯМ
Типы вторичных структур:
1.Спирали
2.Складчатые листы (параллельные и антипараллельные)
3.Реверсивные повороты
Вторичная структура белка стабилизирована
водородными связями
О‒‒Н•••••О N‒‒H•••••O
O‒‒H•••••N N‒‒H•••••N
Энергия образования сильных водородных связей:
15 – 20 кДж/моль
0,18 нм |
|
|
|
|
|
0,19 нм |
|
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
C |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N |
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,29 нм |
|
|
|
|
|||||||
0,28 нм
H
N
OC C
H
C N
CO H
N
H 
C N O
H спираль |
|
|||||
N |
C |
H |
|
|
|
|
|
O |
CN |
|
O- |
+ |
|
C |
C |
|
|
|||
|
H |
H |
||||
O |
|
H N |
C |
N |
||
C |
C |
H |
H |
C H |
|
|
C |
H |
C |
||||
|
|
|||||
O |
|
N H |
H HO |
|
||
C |
C |
|
||||
|
O |
|
|
|
|
|
O
COH
C
H
H
H
N
OC C
H
C N
CO H
N
H 
C N O
H |
- спираль |
|
||||
N |
C |
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
O |
CN |
|
O- |
+ |
|
C |
C |
|
H |
H |
||
O |
|
H N |
C |
N |
||
C |
C |
H |
H |
C H |
|
|
C |
H |
C |
||||
|
|
|||||
O |
|
N H |
H HO |
|
||
C |
C |
|
||||
|
O |
|
|
|
|
|
O
COH
C
H
H
- спираль
R-группы располагаютсая вне спирали, определяя высшие уровни организации белка
R
R
RR
R R R
|
R |
R |
|
R |
|
R |
|
|
R |
|
|
|
|
|
|
R |
R |
|
|