Добавил:
Upload
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:биочемистри1 / Lect6.ppt
X
- •Значения KM некоторых ферментов
- •Преобразования уравнения Михаэлиса - Ментен : двойной обратный график ( уравнение Lineweaver- Burk)
- •График Корниш-Боудена
- •ИНГИБИРОВАНИЕ ФЕРМЕНТОВ
- •I. НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •II. Обратимое ингибирование: конкурентное, неконкурентное, бесконкурентное, смешанное
- •1. КОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Сульфаниламиды – структурные аналоги п-аминобензойной кислоты
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •2. БЕСКОНКУРЕНТНОЕ (UNCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •3. НЕКОНКУРЕНТНОЕ (NONCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •3. НЕКОНКУРЕНТНОЕ (NONCOMPETIVE) ИНГИБИРОВАНИЕ
- •Кинетический тест для определения механизма ингибирования
- •ОСНОВНЫЕ СТРАТЕГИИ ФЕРМЕНТАТИВНОГО КАТАЛИЗА
- •Функции аминокислотных остатков в активном центре фермента
- •Сближение субстрата с активным центром фермента и его ориентация относительно каталитического центра
- •Общий кислотно-основной катализ
- •Аминокислотные остатки, участвующие в общем кислотно-основном катализе
- •Гексокиназа
- •Индуцированное соответствие в гексокиназе
- •Механизм действия лизоцима – пример общего кислотно-основного катализа
- •Пептидогликан
- •Лизоцим расщепляет связь между N-
- •Связывание гекса-N-ацетилглюкозамина с
- •Относительная скорость расщепления лизоцимом олигомеров N-ацетилглюкозамина
- •Структура части активного центра лизоцима
- •SN1-механизм
- •Стабильная форма интермедиата - полукресло
- •Водородные связи между субстратом и аминокислотными остатками в активном центре лизоцима
- •SN2-механизм
- •Ковалентный
- •Второй продукт
- •Химотрипсин – эндопептидаза
- •Гидролиз пептидной связи химотрипсином: ковалентный катализ
- •Схема активного центра химотрипсина
- •Модельная реакция: расщепление нитрофенилацетата
- •Последовательные этапы каталитического действия химотрипсина
- •1 стадия: образование фермент- субстратного комплекса
- •2 стадия: освобождение 1-го продукта
- •3 стадия: образование ацилфермента
- •4 стадия: связывание воды
- •5 стадия: деацилирование
- •6 стадия: образование свободного фермента
- •Катализ с участием ионов металлов
- •Структура активного центра енолазы
- •Механизм двуступенчатой реакции, катализируемой енолазой
- •Регуляция активности ферментов
- •Изменение конформации аллостерических ферментов при связывании модуляторов
- •Аспартат транскарбамоилаза
- •Регуляция по принципу обратной связи
- •Кинетика аллостерических ферментов
- •Эффект позитивных и негативных модуляторов
- •Примеры ковалентных модификаций ферментов
- •Регуляция активности фосфорилазы гликогена путем фосфорилирования
- •Протеолитическая активация пепсина
Гексокиназа
(КФ: 2.7.1.1; Mw: 100,000)
гексокиназа
β-D-глюкоза |
β-D-глюкоза-6-фосфат |
Индуцированное соответствие в гексокиназе
Глюкоза
“Конформационное изменение”
Механизм действия лизоцима – пример общего кислотно-основного катализа
(КФ: 3.2.1.17; Мw 14296 Da; 129 а.к.о.)
Asp52
Glu35
1965 г. – определение 3-х-мерной структуры
Пептидогликан
клеточных стенок бактерий
– субстрат лизоцима
Cвязь, на которую действует лизоцим
N-ацетилмурамовая кислота N-ацетилглюкозамин
Лизоцим расщепляет связь между N-
ацетилглюкозамином и N-ацетилмурамовой кислотой (действует на связь С1-О1)
Связывание гекса-N-ацетилглюкозамина с
лизоцимом
Относительная скорость расщепления лизоцимом олигомеров N-ацетилглюкозамина
(NAG)2 0 (NAG)3 1 (NAG)4 8 (NAG)5 4,000 (NAG)6 30,000 (NAG)8 30,000
NAGNAGNAGNAGNAGNAG
A B C D E F
Структура части активного центра лизоцима
SN1-механизм
1-й этап: перенос Н+ от Glu35 на атом кислорода гликозидной связи
Соседние файлы в папке биочемистри1