- •Лекційний курс з дисципліни
- •2. Становлення та розвиток мікробіології.
- •2.1. Морфологічний період розвитку мікробіології
- •2.2. Еколого-фізюлогічний період розвитку мікробіології.Відкриття луї пастера.
- •2.3. Відкриття роберта коха. Розробка методів досліджень
- •2.4. Внесок у розвиток мікробіології вітчизняних учених
- •2.5. Розвиток мікробіології у XX ст.
- •3.Положення мікроорганизмів у природі.
- •3.1. Прокаріоти та еукаріоти.
- •3.2. Загальні властивості мікроорганізмів
- •Тема 2: морфологія та будова прокаріотної клітини.
- •2. Будова мікробної клітини.
- •2.1. Клітинна стінка мікроорганізмів та її поверхневі структури.
- •2.2. Мембрани мікробних клітин. Цитоплазматична мембрана.
- •2.3. Мембранні утворення у прокаріот.
- •2.4. Внутрішньоклітинні структури.
- •3. Ендоспори та інші форми спокою у бактерій.
- •3.1. Характеристика спороутворювальних бактерій.
- •3.2. Спороутворення (споруляція)
- •3.3. Інші форми спокою (цисти, екзоспори, міксоспори)
- •4. Відмінності прокаріот та еукаріот.
- •1. 1. Фізичні фактори.
- •1.2. Хімічні фактори.
- •1.3. Методи стерилізації.
- •2. Адаптивні реакції мікроорганізмів на стресові дії.
- •3.Хімічний склад бактеріальної клітини.
- •4. Живлення мікроорганізмів.
- •5. Фізіологія росту та розмноження бактерій.
- •Тема 4: систематика прокаріот.
- •1.1. Термінологія, що використовується в систематиці.
- •1.2. Концепція виду в бактеріології.
- •1.3. Історичні аспекти систематики бактерій.
- •3.1. Фенотипова систематика.
- •3.2.Геносистематика бактерій.
- •3.3. Філогенетична класифікація.
- •Тема 5: генетика мікроорганізмів.
- •1.Організація генетичного матеріалу бактерії.
- •2.Мінливість мікроорганізмів.
- •3.Генетичні рекомбінації.
- •4.Практичне значення генетики бактерій.
- •Тема 6: механізми обміну речовин і перетворення енергії у мікроорганізмів.
- •2. Біосинтетичні процеси у мікроорганізмів
- •3.Типи бродіння.
- •4. Перенесення електронів в анаеробних умовах (анаеробне дихання).
- •5. Використання неорганічних донорів водню: аеробні хемолітотрофні бактерії
- •6. Фіксація молекулярного азоту
- •7. Фототрофні бактерії та фотосинтез.
- •Тема 7: мікроорганізми і навколишнє середовище.
- •2. Типи взаємовідносин між організмами в природі.
- •3. Екологія мікроорганізмів.
- •4. Мікрофлора організму людини. Патогенні мікроби. Токсини. Інфекція.
- •5. Еволюція мікроорганізмів.
Тема 7: мікроорганізми і навколишнє середовище.
1. УЧАСТЬ МІКРООРГАНІЗМІВ У КРУГООБІГУ РЕЧОВИН У ПРИРОДІ.
2. ТИПИ ВЗАЄМОВІДНОСИН МІЖ ОРГАНІЗМАМИ В ПРИРОДІ.
3. ЕКОЛОГІЯ МІКРООРГАНІЗМІВ.
4. МІКРОФЛОРА ОРГАНІЗМУ ЛЮДИНИ. ПАТОГЕННІ МІКРОБИ. ТОКСИНИ. ІНФЕКЦІЯ.
5. ЕВОЛЮЦІЯ МІКРООРГАНІЗМІВ.
1. УЧАСТЬ МІКРООРГАНІЗМІВ У КРУГООБІГУ РЕЧОВИН У ПРИРОДІ.
За своєю роллю та функцією у балансі природи живі організми поділяються на три групи. Зелені рослини синтезують органічні речовини, використовуючи енергію сонця та вуглекислоту, тому їх називають продуцентами. Тварини є споживачами (коксументами); вони витрачають значну частину первинної біомаси для побудови свого тіла. Рештки рослин і тварин кінець кінцем піддаються розкладанню, в результаті якого органічні речовини перетворюються на мінеральні, неорганічні сполуки. Цей процес називається мінералізацією. Його здійснюють у першу чергу гриби та бактерії, у балансі природи вони служать деструкторами.
Кругообіг вуглецю. У кругообігу вуглецю мікроорганізми забезпечують мінералізацію вуглецю, переведеного зеленими рослинами в органічні сполуки, підтримуючи тим самим досить нестійку рівновагу. Атмосферне повітря містить трохи більше 0,03 % вуглецю. Фотосинтетична продуктивність зелених рослин є настільки великою, що запаси СО2 в атмосфері були б вичерпані приблизно за 20 років. Зеленим рослинам довелося б припинити фіксацію СО2, якби нижчі тварини та мікроорганізми не забезпечували повернення цього газу в атмосферу завдяки безперервній мінералізації органічного матеріалу. У загальному балансі речовин у природі ґрунтові бактерії і гриби відіграють не менш значну роль, ніж фотосинтезувальні зелені рослини. Взаємозв'язок усіх живих істот на Землі найчіткіше відображається у кругообігу вуглецю.
Ще однією особливістю процесу мінералізації є надходження невеликої частини мінералізованого вуглецю (1,0-1,5 %) в атмосферу не у вигляді СО2, а в формі метану (СН4). Цей газ утворюється з органічних речовин у місцях, недоступних для кисню (у ґрунтах тундр, на рисових полях, у рубці жуйних тварин). В утворенні метану беруть участь метаногенні бактерії.
Моря на перший погляд здаються великим резервом вуглекислоти. Проте слід враховувати, що швидкість обміну СО2 атмосфери з СО2 морів, де більш як 90 % цієї сполуки перебуває у формі Н2СО3, є досить низькою: за рік таким чином обмінюється лише десята частина атмосферного двоокису вуглецю. До того ж у газообміні моря з атмосферою бере участь лише тонкий поверхневий шар води. Впродовж багатьох останніх років вміст двоокису вуглецю в повітрі постійно зростає. Це можна пояснити двома причинами: спалюванням нафти та газу і зниженням фотосинтетичної фіксації СО2 в результаті вирубування великих лісових масивів і деградації ґрунтів. Слід зазначити, що Світовий океан являє собою потужну буферну систему, яка намагається підтримувати вміст СО2 в атмосфері на певному рівні.
У результаті фотосинтетичної фіксації СО2 зеленими рослинами утворюються в першу чергу цукри та споріднені з ними сполуки. Основна маса фіксованого вуглецю як у деревних, так і у трав'янистих рослин відкладається у формі полімерних вуглеводів. Оскільки серед продуктів асиміляції зелених рослин переважають полісахариди, то цукри відіграють велику роль у живленні всіх живих організмів, яким потрібна органічна їжа. Глюкоза та інші цукри у формі полімерів є кількісно переважаючим субстратом для процесів мінералізації в природі; у вигляді мономерів вони є найкращими поживними речовинами для гетеротрофних мікроорганізмів.
Кругообіг азоту. Центральне місце у кругообігу азоту займає амоній. Він є продуктом розкладання білків та амінокислот, які разом із рештками тваринного та рослинного походження потрапляють у ґрунт. У ґрунтах з високим рівнем аерації амоній піддається нітрифікації: бактерії родів Nitrosomonas та Nitrobacter окислюють його до нітриту та нітрату. Як джерело азоту рослини можуть використовувати як амоній, так і нітрат. За відсутності кисню з нітрату утворюється молекулярний азот (процес денітрифікації). Бактерії, які беруть участь у денітрифікації, використовують нітрат як термінальний акцептор електронів у анаеробному дихальному ланцюгу (анаеробне "нітратне" дихання). Денітрифікація супроводжується втратами азоту з ґрунтів. Разом з цим бактерії здатні і до фіксації молекулярного азоту. Азотфіксувальні бактерії є вільно існуючими та симбіотичними (перебувають в симбіозі з вищими рослинами).
Кругообіг фосфору. У біосфері фосфор представлений майже винятково у вигляді фосфатів. У живих організмів фосфорна кислота існує у формі ефірів. Після відмирання клітин ці ефіри швидко розкладаються, що супроводжується вивільненням іонів фосфорної кислоти. Для рослин доступною формою фосфору в ґрунтах є вільні іони ортофосфорної кислоти (Н3РО4). їх концентрація часто буває низькою; ріст рослин, як правило, лімітується не загальною недостатністю фосфатів, а утворенням малорозчинних його сполук (апатити, комплекси з важкими металами). У багатьох місцях фосфат з добрив потрапляє у проточні водойми. Оскільки концентрація іонів заліза, кальцію та алюмінію у водоймах є невисокою, фосфат залишається у розчинній формі, що супроводжується евтрофізацією водойм, особливо сприятливою для розвитку азотфіксувальних ціанобактерій. У ґрунтах же внаслідок утворення нерозчинних солей фосфати найчастіше швидко стають недоступними для рослин.
Кругообіг сірки. У живих клітинах сірка представлена сульфогідрильними групами у складі сірковмісних амінокислот (метіонін, цистеїн, гомоцистеїн). У сухій речовині організмів частка сірки становить 1 %. У процесі анаеробного розкладання органічних речовин сульфогідрильні групи відщеплюються десульфуразами; утворення сірководню під час мінералізації в анаеробних умовах називають також десульфуруванням. Проте найбільша кількість сірководню утворюється у процесі дисиміляційного відновлення сульфатів, яке здійснюється сульфатредукуючими бактеріями. Ці бактерії використовують сульфат як термінальний акцептор електронів у анаеробному дихальному ланцюгу ("сульфатне" дихання).
Сірководень, що утворився за відсутності кисню в осадах водойм, може бути окиснений анаеробними фототрофними бактеріями (Chromatiaceae) до сірки та сульфату. Коли сірководень проникає в зони, що містять кисень, він окиснюється або абіотично, або аеробними сіркобактеріями до сульфату. Сірку, необхідну для синтезу сірковмісних амінокислот, рослини та частина мікроорганізмів отримують шляхом асиміляційної сульфатредукції; тварини ж отримують відновлені сполуки сірки з їжею.
Фосфор та азот як фактори, що лімітують продукцію біомаси. Елементами, що обмежують ріст рослин і тим самим продукцію біомаси як на суші, так і в океанах, є фосфор та азот. За даними можна розрахувати, скільки біомаси може бути синтезовано з елементів, які містяться в 1 м3 морської води. Із 28 г вуглецю може утворитися 60-100 г біомаси, з 0,3 г азоту — 6, а з 0,03 г фосфору — лише 5 г. Отже, продукцію біомаси лімітують в основному фосфати. У морській воді навіть азотфіксувальні організми — ціанобактерії — не мають селективної переваги над іншими.