Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Современные методы изучения генетики человека. Учебное пособие

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
08.09.2026
Размер:
2 Мб
Скачать
☆
51
хромосом используются такие программы, как Ikaros, KaryoFISH, видеотесты Карио 3.1 и Карио 3.0.
Рис. 23. Цветная исчерченность хромосом человека при M-FISH:
а — метафазная пластинка; б — раскладка хромосом
Определение половой принадлежности, а также своевременное выявле-
ние аномалий полового развития, наследования болезней, сцепленных с полом,
не только представляет огромный интерес для врачей разных специальностей,
но и востребовано в спорте и судебной медицине.
М. Барр и Ч. Бертрам (1949), изучая нейроны кошки, обратили внимание на то, что в интерфазном ядре клеток содержится интенсивно окрашиваемое
тельце, причем оно присутствует только в ядрах клеток самок и отсутствует
у самцов. Было замечено, что между числом телец полового хроматина и чис-
лом X-половых хромосом имеется прямая связь. Это тельце получило название полового хроматина, или тельца Барра. У ряда позвоночных и у человека оно
появляется в раннем онтогенезе на стадии гаструлы, но раньше развития поло­вых желез. Половой хроматин в интерфазных ядрах обусловлен спирализацией
одной из Х-половых хромосом. На локализацию, форму и структуру полового
хроматина не влияют половые гормоны, следовательно, он не является вторич­ным половым признаком. Несколько исследователей одновременно высказали
предположение, что одна из Х-хромосом у нормальных женщин относительно
52
неактивна в генетическом отношении. В 1961 г. английская исследовательница М. Лайон выдвинула гипотезу о механизмах инактивации одной из Х-половых хромосом у женщин. Основные положения данной гипотезы следующие:
1. Одна из двух Х-хромосом клеток женщины неактивна. Неактивная
хромосома может быть отцовского или материнского организма.
2. Инактивация является механизмом, выравнивающим баланс генов по-
ловых хромосом в клетках мужчин и женщин.
3. Инактивация происходит в раннем эмбриогенезе и сохраняется во вре-
мя дальнейшего размножения и развития клеточной линии.
Если у женщин в ядре клетки несколько Х-половых хромосом, то и не­сколько телец Барра, активной остается лишь одна Х-хромосома. Х-хромосома
не вся инактивируется, часть короткого плеча остается генетически активной.
При увеличении количества Х-хромосом в кариотипе организма образуются тельца Барра в количестве на единицу меньше числа Х-хромосом.
Открытие глыбок гетерохроматина в интерфазных ядрах соматических клеток (телец Барра) позволило в дальнейшем использовать половой хроматин
для решения многих диагностических вопросов медицинской генетики. Перво-
начально для определения полового хроматина применяли биопсию кожи, но вскоре был описан метод исследования мазка слизистой оболочки ротовой по-
лости. Так, у женщин-спортсменок проводят половой контроль перед олимпий-
скими играми. Спортсменки, чей генетический пол не соответствует габитусу, имеющие морфологические признаки мужского соматотипа, имеют преимуще-
ство перед женщинами-спортсменками с женским кариотипом. Безусловно,
данный метод нашел применение и в медицине. Скрининговый тест, не требу­ющий глобальных материальных затрат, применяется для быстрой диагностики количественных нарушений в половых хромосомах, таких как синдром Шере-
шевского — Тернера, Клайнфельтера, полисомии Х (табл. 2).
Таблица 2
Количество телец Барра при геномных мутациях
Кариотип
Синдром
Количество телец Барра
45, Х0
Шерешевского — Тернера
0
47, XХY
Клайнфельтера
1
47, XYY
Джейкобса
0
47, XХХ
Трисомии Х
2
48, XХХХ
Тетрасомии Х
3
53
Клетки, не содержащие половой хроматин (хроматин-отрицательные клетки), обнаруживаются у здоровых мужчин и у женщин, имеющих набор хромосом 45, Х0. Часто в ядрах клеток нормального мужского организма встре­чается несколько псевдотелец Барра (конденсированных участков аутосом) и спирализованных Y-хромосом, имеющих меньшие размеры. Поэтому при ди-
агностике различных хромосомных заболеваний необходимо уметь отличать
эти образования от истинного Х-полового хроматина.
Материал соскоба с внутренней поверхности щеки, полученный с помо­щью шпателя, переносится на предметное стекло и окрашивается 1 %-ным рас-
твором ацетоарсеина, накрывается покровным стеклом и изучается с помощью
светового микроскопа. Неактивная Х-хромосома выявляется в виде компактной
темной глыбки в интерфазном ядре соматических клеток нормальных женщин
и называется тельцем Барра, или половым Х-хроматином (рис. 24). При любом числе Х-хромосом в активном состоянии будет только одна, следовательно, половой Х-хроматин в норме выявляется только у женщин и отсутствует у мужчин.
Рис. 24. Наличие (справа) и отсутствие (слева) полового хроматина
в ядрах клеток женщины и мужчины
Основные показания для проведения цитогенетической диагностики:
1. Нарушение репродуктивной функции неясного генеза у мужчин
и женщин.
2. Наличие у ребенка множественных врожденных пороков развития.
3. Задержка умственного и физического развития ребенка.
4. Подозрение на хромосомную болезнь по клинической симптоматике.
5. Подозрение на синдромы, характеризующиеся хромосомной неста-
бильностью.
6. Гемобластозы и онкологические заболевания.
7. Пренатальная и преимплантационная диагностика в супружеских парах
повышенного генетического риска.
8. Оценка мутагенных воздействий.
54
8. МЕТОДЫ ГЕНЕТИКИ СОМАТИЧЕСКИХ КЛЕТОК
Методы генетики соматических клеток в значительной мере компенси-
руют невозможность применения к человеку метода гибридологического ана­лиза. Методы генетики соматических клеток, основанные на размножении этих клеток в искусственных условиях, позволяют не только анализировать генети-
ческие процессы в отдельных клетках организма, но и благодаря полноценно-
сти наследственного материала, заключенного в них, использовать их для изу-
чения генетических закономерностей целостного организма.
Соматические клетки обладают свойствами, делающими их удобным
объектом генетических исследований:
– они могут быстро размножаться на искусственных питательных средах;
– из одной клетки путем клонирования можно получить генетически од­нородное потомство;
– генетически различные клетки могут сливаться и давать начало гибрид­ным клонам;
– можно получить любое количество биомассы клеток для биохимическо­го исследования;
– культивируемые клетки могут быть подвергнуты цитохимическому ис­следованию.
Соматические клетки человека могут сливаться с соматическими клетка-
ми другого человека или с клетками других видов млекопитающих (мышей, крыс, морских свинок, обезьян и др.). Образующиеся при этом клетки называ-
ются гибридными. В гибридных клетках ядра вначале не сливаются (гетерока­рион), а затем могут сливаться (синкарион). При этом в ядре оказываются два набора хромосом. Во время повторных митозов гибридной клетки хромосомы
одного вида постепенно элиминируются (теряются), а другого — сохраняются.
Например, при гибридизации соматических клеток человека и мыши теряются хромосомы человека, а в гибридных клетках человека и крысы элиминируются
хромосомы крысы.
Постепенная потеря хромосом человека из гибридных клеток параллель­но с изучением ферментов позволяет судить о локализации гена, контролиру-
ющего синтез того или иного фермента в определенной хромосоме.
С помощью метода гибридизации соматических клеток определяют лока-
лизацию генов в хромосомах человека, а также сцепление генов. Таким обра-
зом, например, был картирован ген тами-динкиназы (в 17 хромосоме) — фер-
мент, от которого зависит ощущение человеком вкуса фенилтиомочевины
(ФТМ).
55
Существуют следующие методы генетики соматических клеток че-
ловека:
– простое культивирование — использование культуры клеток различ­ных тканей и органов для изучения наследственности и изменчивости сомати­ческих клеток;
– клонирование — получение потомков одной клетки, например, гибри­дом. Гибридома — это клеточный гибрид, полученный путем слияния нор-
мального лимфоцита и опухолевой клетки, способный производить монокло-
нальные антитела одного типа (рис. 25);
– селекция — отбор клеток с заранее заданными свойствами;
– гибридизация. Для гибридизации могут использоваться клетки от раз-
ных людей, а также от человека и других животных (мыши, крысы, морской
свинки и др.). Гибридные клетки при делении обычно «теряют» хромосомы од­ного из видов. Например, в гибридных клетках «человек — мышь» постепенно утрачиваются все хромосомы человека, а в клетках «человек — крыса» сохра-
няются все хромосомы человека и одна хромосома крысы. Таким образом,
можно получать клетки с желаемым набором хромосом, что дает возможность
изучать сцепление генов и их локализацию, изучать механизмы первичного
действия и взаимодействия генов, регуляцию генной активности.
Рис. 25. Получение моноклональных антител
56
Методы генетики соматических клеток основаны на том, что соматиче-
ские клетки быстро размножаются на питательной среде, они успешно клони-
руются, могут сливаться и образовывать гибридные клоны, давая идентичное
потомство. Соматические клетки подвергаются селекционному отбору на пита-
тельных средах и могут долго сохраняться при глубоком замораживании. Ме-
тоды генетики соматических клеток дают возможность судить о генетической
гетерогенности наследственных болезней, изучать их патогенез на молекуляр-
ном и клеточном уровнях.
57
9. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ КАРТИРОВАНИЕ
Генетическая карта — схема расположения структурных генов и регу- ляторных элементов, а также генетических маркеров в хромосоме (рис. 26).
Рис. 26. Генетические карты 7, 8, 9 и 10-й хромосом человека
При создании генетической карты устанавливают последовательности расположения генетических маркеров по длине всех хромосом с определенной
плотностью, т. е. на достаточно близком расстоянии друг от друга. Генетиче­ские карты могут быть сопоставлены с цитологическими или цитогенетически­ми картами и широко используются в медицине при диагностике ряда тяжелых наследственных заболеваний (рис. 27).
В основе картирования генов лежат хорошо известные биологические яв­ления: сцепление генов, их рекомбинация во время мейоза и полиморфность генома. Благодаря сцеплению мутация, детерминирующая болезнь, передается потомкам вместе с блоком окружающих ее аллелей соседних локусов. Реком­бинация в ряду поколений уменьшает размер этих блоков. Чем ближе располо­жены два локуса, тем дольше их аллели сохраняются в одном блоке. Иденти­фикация блоков, полученных от различных родителей, обеспечивается поли­морфностью генома, многие локусы которого имеют не один, а несколько вариантов нуклеотидных последовательностей. Такие локусы служат генетиче-
скими маркерами. Для того чтобы картировать ген, вызывающий болезнь, до­статочно доказать совместную сегрегацию болезни и блока маркерных аллелей.
58
Рис. 27. Генетические карты 3 и Х-хромосомы человека
59
Существует два методических подхода, позволяющих выявить те блоки маркерных аллеей, которые сегрегируют вместе с комплексной болезнью: ана-
лиз сцепления и анализ ассоциаций.
Основная идея анализа сцепления, или рекомбинационного анализа, за­ключается в поиске блока маркеров, которые передаются от больного родителя преимущественно больным потомкам и не передаются здоровым. В разных се­мьях аллельный состав таких блоков может различаться, но их позиция в гено­ме должна быть одинакова. Информативными для анализа сцепления являются только гетерозиготные маркерные локусы. Поэтому предпочтительными для анализа являются полиморфные маркеры, имеющие много аллелей. Материа­лом для анализа сцепления всегда служат родственники: это могут быть пары
больных сибсов или расширенные родословные.
Самыми мощными считаются методы, базирующиеся на известной моде-
ли наследования признака, которая включает оценку популяционной частоты
мутантного аллеля и пенетрантности генотипов. Однако установление модели
наследования для комплексных болезней — достаточно сложная задача. Вслед­ствие данных трудностей, а также поскольку искажение модели наследования
приводит к потере мощности, более популярными являются статистические ме­тоды, свободные от модели наследования. В их основе лежит анализ идентич-
ности по происхождению маркерных аллелей у пар больных родственников.
Второй метод картирования — анализ ассоциаций, или неравновесия по
сцеплению. Неравновесие по сцеплению между двумя аллелями разных локу­сов выражается в том, что частота их совместной встречи в популяции отлича­ется от ожидаемой при случайной независимой встрече. Одной из основных, хотя и не единственной, причиной существования неравновесия по сцеплению
в популяции является тесное сцепление. Например, если в момент возникнове-
ния мутации, вызывающей болезнь, рядом находился определенный маркерный аллель, то в течение многих поколений этот аллель будет передаваться вместе с
мутацией. Рекомбинация постепенно разрушает ассоциацию, и происходит это тем быстрее, чем дальше друг от друга расположены локусы.
Основная идея картирования с помощью анализа ассоциаций заключается в следующем. Если у большинства больных в популяции мутантный аллель имеет общее происхождение, окружающие маркеры находятся с ним в нерав­новесии по сцеплению. Для локализации гена, контролирующего болезнь, надо найти такой маркер, один из аллелей которого преобладает у больных. В отли-
чие от анализа сцепления, здесь предполагается, что у больных из разных семей
этот маркер не только имеет одинаковую локализацию в геноме, но и содержит
один и тот же аллель. Поэтому при анализе ассоциаций не надо исследовать ро-
60
дословные, материалом для этого анализа могут служить независимые группы
больных и здоровых людей.
Существуют два основных подхода к картированию генов комплексных
признаков: изучение генов-кандидатов и позиционное клонирование, также называемое сканированием генома. Ключевым моментом при применении стра­тегии изучения генов-кандидатов является их выбор, который осуществляется
на основе знаний о биологии признака. Как правило, такие знания получаются при изучении модельных объектов. Идеальными свойствами модельного объек­та являются короткий жизненный цикл, возможность проведения направленных скрещиваний и других биологических манипуляций, а также адекватность мо-
делируемой системе.
Одним из наиболее известных успехов применения стратегии генов-
кандидатов в популяциях человека было изучение гена, кодирующего ангиотен-
зиноген (AGT, OMIM *106150). Роль ренин-ангиотензиновой системы в контро­ле давления крови была установлена уже в 1970-е гг. при изучении модельных объектов. В 1980-е гг. была охарактеризована структура человеческого гена AGT и установлена его позиция в геноме. В 1992 г. Jeunemaitre et al. (1992) на
примере 379 пар сибсов с повышенным давлением показали, что регион, со-
держащий AGT, сцеплен с этим признаком. В процессе секвенирования AGT они нашли 15 полиморфизмов и обнаружили, что два из них ассоциированы
с повышенным давлением. В последующие годы было проведено несколько де­сятков исследований ассоциации и сцепления AGT с повышенным давлением
крови и другими сердечно-сосудистыми патологиями. В настоящее время мо-
жет считаться установленным, что некоторые полиморфизмы в гене AGT свя-
заны с различными заболеваниями сердца и сосудов.
Позиционное клонирование не предполагает использования априорных
знаний о генетике признака: каждый участок генома последовательно тестиру­ется на участие в контроле признака. Этот процесс называют сканированием генома. Он позволяет идентифицировать новые гены и расширять наши знания о биологии признака. Сканирование генома можно проводить как с помощью
анализа сцепления, так и с помощью анализа ассоциаций. Основными пробле­мами стратегии геномного сканирования в настоящее время являются огромная
вычислительная сложность этой задачи, связанная с этим относительно слабая
разработанность методологии и отсутствие пакетов прикладных программ.
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]