Теоретические основы биотехнологии. Учебно-методическое пособие
.pdfКонтрольные вопросы
1.Проведите сравнительный анализ роста дрожжей на глюкозе и этаноле. Объясните биохимические особенности утилизации того или иного субстрата, используя рис. 2.2.
2.Почему клетке, способной ассимилировать С2-соединения,
необходим глиоксилатный шунт?
3.В каких условиях клетки дрожжей образуют уксусную кислоту?
4.Объясните роль источников минерального питания и факторов роста, которые вносятся в питательную среду для культивирования дрожжей.
5.Перечислите основные контролируемые и регулируемые параметры процесса культивирования дрожжей.
6.Каков критерий окончания процесса культивирования?
7.Каковы характерные признаки различных фаз роста?
8.Увеличиваются ли затраты на поддержание жизнедеятельности дрожжей в стационарной фазе роста?
9.На какой фазе роста содержание белка в клетках максимально?
10.Существует ли прямая корреляция между удельной скоростью роста и содержанием белка в биомассе?
11.Какие показатели относятся к кинетическим характеристикам роста культуры?
12.Какие показатели описывают стехиометрию роста микроорганизмов?
61
Литература
1.Бирюков В.В. Основы промышленной биотехнологии. – М.:
Высшая шк., 2004. – 356 с.
2.Манаков М.Н., Победимский Д.Г. Теоретические основы
технологии микробиологических производств. – М.:
Агропромиздат, 1990. – с. 97-99, 173-205.
3. Еникеев Ш.Г., Белялова З.М., Валеев Р.И. и др. Получение микробной биомассы на основе этилового спирта. – Казань: КХТИ,
1988. – 32 с.
4. Кантере В.М. Теоретические основы технологии
микробиологических производств. – М.: Агропромиздат, 1990. –
271с.
5.Решетник О.А. Общая микробиология. – Казань: КХТИ, 1984. – с. 59-66.
6.Егоров Т.А., Клунова С.М., Живухина Е.А. Основы биотехнологии. – М.: Академия, 2003. – 208 с.
7.Микробная биотехнология / Лещинская И.Б. Куриненко Б.М., Вершинина В.И. и др. – Казань: Унипресс: ДАС, 2000. – 368 с.
8.Елинов Н.П. Основы биотехнологии. – С-Пб.: Наука, 1995.
–600 с.
9.Беккер М.Е., Лиепиныш Г.К., Райпулис Е.П. Биотехнология. – М.: Агропромиздат, 1990. – 334 с.
10.Промышленная микробиология / Под ред. Н.С. Егорова.
–М.: Высшая школа, 1989. – 688 с.
62
Тема 3. Ингибирование роста микроорганизмов в условиях периодического культивирования
В процессе микробного роста в клетках протекают разнообразные биокаталитические реакции, которые протекают с участием множества ферментов.
Описание кинетики ферментативных реакций
При взаимодействии фермента (E) с субстратом (S) образуется
фермент-субстратный комплекс (ЕS) за счет сил физической природы. Различают 2 стадии ферментативной реакции, из которых собственно только вторая является биохимическим каталитическим превращением:
k+1 |
|
k+2 |
|
E + S |
ES |
E + P |
(3.1) |
k-1 |
|
|
|
химическая реакция
Скорость образования продукта (Р) равна:
V=k+2[ES] |
(3.2) |
Константа диссоциации фермент-субстратного комплекса (ES)
определяется как
Ks = [E][S] / [ES] |
(3.3) |
Общая концентрация фермента (E0) определяется суммарной
концентрацией индивидуального фермента и фермента, связанного в комплексе с субстратом:
[E0] = [E] + [ES], откуда [E] = [E0] - [ES] |
(3.4) |
63
Из уравнения (3.3) следует |
|
[ES] = [E][S] / Ks |
(3.5) |
Подставляя (3.4) в (3.5), получаем |
|
[ES] Ks = [E0] [S] - [ES] [S], откуда |
|
[ES] Ks + [ES] [S] = [E0] [S] или [ES] (Ks + [S]) = [E0] [S] |
|
[ES] = [E0] [S] /(Ks + [S]) |
(3.6) |
Подставляя (3.6) в (3.2), получим |
|
V = k+2 [E0] [S] / (Ks + [S]) |
(3.7) |
k+2 [E0] – максимальная скорость ферментативной реакции Vmax,
когда [ES]=[ E0], т.е. весь фермент связан в фермент-субстратном
комплексе, т.е.: |
|
V = Vmax [S] / (Ks + [S]) |
(3.8) |
Константу диссоциации Ks называют |
константой Михаэлиса и |
обозначают Km в уравнении (3.8): |
|
V = Vmax [S] / (Km + [S]) |
(3.9) |
Уравнение (3.9) представляет собой уравнение Михаэлиса-
Ментен, которое учитывает лимитирование скорости реакции концентрацией субстрата. Этим уравнением Л. Михаэлис и М.Л.
Ментен в 1913 году описали кинетику простых ферментативных реакций, не осложненных цепью сложных и разветвленных превращений субстрата в различные продукты, а также не связанных с ингибированием фермента.
64
В уравнении (3.9) константа Михаэлиса Km является мерой сродства фермента к субстрату и численно равна концентрации субстрата, при которой скорость ферментативной реакции равна половине от максимальной (V=Vmax/2).
Чем меньше значение Km, тем выше сродство фермента к данному субстрату, субстрат быстрее претерпевает превращение, т.е.
быстрее протекает ферментативная реакция.
Графическим образом уравнения Михаэлиса-Ментен является гипербола (рис. 3.1). Как любая нелинейная функция, она неудобна для нахождения параметров уравнения – Km и Vmax.
Vmax
скоростьНачальная Vmax/2
При S → ∞
Vнач = Vmax
При Vнач = Vmax/2
S = Km
Km |
Концентрация субстрата (S) |
Рис. 3.1 – Гипербола – графический образ уравнения Михаэлиса-
Ментен
65
Для нахождения численных значений Km и Vmax уравнение приводят к линейной зависимости (y=a+bx) различными способами.
Наиболее традиционным является зависимость Лайнуивера-Берка,
представляющая собой уравнение Михаэлиса-Ментен в обратных
координатах (1/V = f(1/S)): |
|
1/V = (Km + [S])/(Vmax [S]) = |
|
Km/(Vmax [S]) + [S]/(Vmax [S]) = 1/Vmax + (Km/Vmax)(1/[S]) |
(3.10) |
Таким образом, параметры уравнения Михаэлиса-Ментен легко найти из линеаризованного уравнения y=a+bx (рис. 3.2):
а = 1/Vmax (отрезок на пересечении прямой с осью у (1/V)); b = Km/Vmax (тангенс угла наклона прямой к оси x (1/S));
или -1/Km (отрезок на пересечении прямой с осью x (1/S)).
1/V
1/Vmax
-1/Km |
0 |
1/S |
Рис. 3.2 – Зависимость Лайнуивера-Берка – линеаризованное уравнение Михаэлиса-Ментен
66
Описание кинетики микробного роста
В 40-х годах 20-го века Ж. Моно (Monod) показал, что достаточно удачным и универсальным для описания роста большинства микробных культур является уравнение, вид которого аналогичен уравнению Михаэлиса-Ментен, которое использовалось для фундаментального описания кинетики ферментативных реакций,
в том числе внутри микробных клеток.
Таким образом, рост микроорганизмов зависит от питания
(субстрата) и для большинства микроорганизмов описывается
уравнением (моделью) Моно. Графическим образом уравнения Моно также является гипербола (рис. 3.3), а уравнение записывается с учетом лимитирующего действия субстрата на рост
микроорганизмов:
µ = µmaxS/(KS+S), |
(3.11) |
где µmax– максимальная удельная скорость роста; при избытке |
|
субстрата µ = µmax (рис. 3.3); |
|
KS – константа полунасыщения (Моно); она является мерой |
|
усвояемости субстрата в процессе роста |
микроорганизмов. На |
рис. 3.3 наименьшее значение KS отличает наиболее усвояемый субстрат (например, глюкозу); большее значение KS’ может соответствовать менее усвояемому субстрату (например, галактозе),
самое большое значение KS’’ может характеризовать наименее усвояемый субстрат (например, янтарную кислоту).
67
µ, ч-1
µmax
µmax/2
KSKS’ KS’’ |
S, г/л |
S
Рис. 3.3 – Гипербола – графический образ уравнения Моно
Лимитирование микробного роста концентрацией субстрата наблюдается в следующем:
чем выше концентрация субстрата, тем больше удельная скорость роста (но не больше максимально возможной для данной микробной культуры и для данных условий культивирования).
Следует также отметить, что существует диапазон минимальных концентраций субстрата S, для которых не наблюдается микробный рост (рис. 3.3): энергии небольших количеств субстрата недостаточно для обеспечения конструктивного обмена и построения клеточной биомассы.
Аналогично, характерные зависимости для кинетики ферментативных реакций с ингибированием фермента относятся к специфике ингибирования микробного роста.
68
Кинетика ферментативных реакций с ингибированием фермента
Прежде всего, ингибирующее действие на ферменты микроорганизмов и, соответственно, на их рост может оказывать субстрат в высоких концентрациях. С учетом ингибирующего действия субстрата на фермент уравнение Михаэлиса-Ментен записывается следующим образом:
V = Vmax [S] / (Km + [S] +S2/Ki), |
(3.12) |
где Ki – константа ингибирования субстратом.
Далее, кроме субстрата, не оказывающего ингибирующего действия, во взаимодействие с ферментом может вступать вещество-
ингибитор, снижающее активность фермента и конкурирующее или
неконкурирующее с субстратом за активные центры фермента.
При конкурентном ингибировании субстрат и ингибитор связываются с одним и тем же (!) активным центром фермента:
E + I |
k+2 |
EI |
|
+ |
k-2 |
+ |
|
|
Вытеснение |
||
S |
|
S |
ингибитора субстратом |
k+1 k-1 |
k+3 k-3 |
в насыщающей |
|
концентрации |
|||
ES + I |
k-4 |
EIS |
|
k+5 |
k+4 |
|
|
|
|
|
|
E + P |
|
|
|
Поэтому в присутствии |
ингибитора снижается сродство |
||
фермента к субстрату (т.е. повышается значение Кm). Величина Vmax
не изменяется, так как при «насыщающей» концентрации субстрат
69
вытесняет ингибитор из комплекса с ферментом. В этом случае
ингибирование имеет обратимый характер.
Для случая конкурентного ингибирования уравнение
Михаэлиса-Ментен выглядит следующим образом:
V = Vmax [S] / (Km + [S] +[I]/Ki), |
(3.13) |
где Ki = [E][I]/[EI] – константа ингибирования. |
|
При неконкурентном ингибировании субстрат |
и ингибитор |
связываются с разными (!) активными центрами фермента.
k+1 |
ES |
k+2 |
E + P |
E + S |
|
k-1
k+3
E + I
EI
E + P
k-3
непродуктивный
комплекс
При этом величина Кm не изменяется, а величина Vmax
снижается.
Уравнение Михаэлиса-Ментен с учетом неконкурентного
ингибирования:
V = Vmax [S] / (Km + [S]) . 1/(1+[I]/Ki), |
(3.14) |
Аналогично, фермент может подвергаться конкурентному или неконкурентному ингибированию продуктом реакции (Р):
При рассмотрении ингибирования ферментов следует отметить,
что оно может быть обратимым или необратимым, когда активность фермента соответственно восстанавливается или не восстанавливается после удаления ингибитора из среды.
70
