Классификация пространственных структур - α/β белки
Структура TIM-barrel |
Структура флаводоксина |
(β-бочонок, окруженный |
(β-слои, сложенные между |
α-спиралями) |
α-спиралями) |
Триозофосфатизомераза Бактериальный регулятор
хемотаксиса CheY
Классификация пространственных структур
α+β белки
Лизоцим |
Рибонуклеаза А |
Соотношение между первичной и пространственной структурами белка
• Вырожденность «стереохимического кода»
Семейство I структур <---> Пространственная структура I--->III - однозначно
I<---III – неоднозначно
• Что определяет сходную пространственную
структуру белков?
• Сходное распределение по последовательности
гидрофильных и гидрофобных остатков;
•Инвариантные ак остатки;
•Сохранение поворотов (Gly);
•Сохранение дисульфидных мостиков (Cys);
•Сохранение функционально важных аминокислот.
Сравнение первичной и пространственной структуры двух эволюционно далеких белков - белка альфа2 дрожжей (зеленый) и транскрипционного фактора Drosophila engrailed protein (красный), принадлежащих к одному семейству.
Идентичны 17 ак из 60
Ленточная модель (А), проволочная модель (В) и аминокислотные последовательности (С) ДНКсвязывающих доменов (гомеодоменов).