Третичная структура белка

•Третичной структурой белка называют распределение в пространстве всех атомов белковой молекулы

–Основа функциональности белка;

–Зависит от всей суммы взаимодействий;

–Не учитывается взаимодействие с соседними субъединицами и глобулами;

–Две основных типа белков – глобулярные и фибриллярные.

Структура глобулярных белков

•Внутренняя часть глобулы - «гидрофобное ядро»

–Образуется в основном гидрофобными аминокислотными (ак) остатками;

–В образовании участвует 20-30% общего числа ак остатков;

–Упаковка близка к плотной.

•Гидрофобное ядро окружено наружной оболочкой, имеющей контакт с водой

–Нет резкой границы между ядром и поверхностью белка;

–Содержатся гидрофильные и гидрофобные ак остатки (часто образуются гидрофобные «пятна»)

Стабилизация пространственной структуры белка

Связи, стабилизирующие третичную структуру:

–Основная движущая сила

процесса сворачивания – гидрофобный эффект;

–В дальнейшей стабилизации участвует весь комплекс нековалентных взаимодействий;

–Единственный тип