МОЛБИОЛ 2014-лекции / ОГК / Л5-Шапероны-1
.pdfУчастие молекулярных шаперонов в сборке белков I
Лекция 5 2014г.
1
• Молекулярные шапероны – белки, которые сами или
вместе с кофакторами временно связываются и
стабилизируют нестабильные конформеры других
белков. Благодаря регулируемому связыванию и освобождению, шапероны содействуют правильному формированию и функционированию белков in vivo, а именно:
• фолдингу белков (после синтеза белков de novo, транслокации
через мембраны или стресс-индуцированной денатурации);
•сборке белковых комплексов;
•внутриклеточному транспорту;
•переключению между активной и неактивной конформациями белков;
•протеолитической деградации,
хотя они не входят в конечную структуру белков и белковых комплексов.
• Основная роль – они препятствуют неправильной |
|
ассоциации или агрегации экспонированных |
|
гидрофобных поверхностей и направляют свои |
|
субстраты по пути правильного фолдинга, |
|
транспорта или деградации. |
2 |
Свойства молекулярных шаперонов
•Участвуют в сборке белков и белковых комплексов, но не входят в конечный продукт;
•Есть во всех компартментах клетки, где происходит сборка белков;
•Большинство шаперонов - АТФ-зависимые;
•Чаще всего нет специфичности (взаимодействуют с различными белками), однако есть и специфические (нуклеоплазмин при сборке нуклеосом);
•Защищают белки от нежелательных процессов, в том числе от агрегации;
•Могут выполнять транспортную функцию;
•Многие шапероны являются белками теплового шока
(heat shock proteins, Hsp);
•Могут сохранять белки в неактивном состоянии (Hsp90 связывается с рецепторами стероидных гормонов);
• Эволюционно консервативные белки. |
3 |
Представители шаперонов – семейства белков теплового шока (1)
Сем-во |
Шапероны |
Роль |
|
|
|
Hsp70 |
DnaK, |
Стабилизация развернутых |
|
Hsp70, |
белков, фолдинг белков, |
|
Hsc70, BiР |
трнслокация через |
|
|
мембраны, защита от |
|
|
стресса |
|
|
|
Hsp40 |
DnaJ, |
Стабилизация и фолдинг |
|
Hsp40, |
белков, |
|
HscB |
кошапероны для Hsp70 |
|
|
|
Hsp60 |
GroEL, |
Фолдинг белков |
|
TF55, |
|
|
Hsp60, TriС |
|
|
|
|
Hsp10 |
GroES, |
Фолдинг белков, |
|
Gp31, |
кошапероны для Hsp60 |
|
Hsp10, |
|
|
Cpn10 |
|
Heat shock proteins – Hsp (Белки теплового шока (БТШ4 ))
Представители шаперонов – семейства белков теплового шока (2)
Сем-во |
Шапероны |
Роль |
|
|
|
small Hsp |
Hsp25, IbpA, |
Защита от стресса, |
sHsp |
α-кристаллины |
предотвращение |
|
агрегации белков |
|
|
|
|
|
|
|
Hsp90 |
Hsp90, Grp94, |
Предотвращение |
|
ERp90, HtpG |
агрегации белков, |
|
|
регуляция активности |
|
|
рецепторов стероидных |
|
|
гормонов и киназ. |
|
|
|
Hsp100 |
Hsp104, ClpA, |
Предотвращение |
|
B, X, Y |
агрегации белков, |
|
|
содействие в |
|
|
протеолизе белков |
|
|
5 |
Некоторые семейства и отдельные представители шаперонов
Семейство |
Шапероны |
Роль |
|
|
|
Trigger factor |
TF |
Стабилизация растущей п/п цепи, |
|
|
участие в изомеризации Pro |
|
|
|
Calnexin/ |
Calnexin, |
Участие в созревании |
calreticulin |
calreticulin |
гликопротеинов в ЭР; контроль |
|
|
качества белков в ЭР |
|
|
|
Nucleoplasmin/ |
Nucleoplasmin, |
Сборка нуклеосом и рибосом |
nucleophosmin |
nucleophosmins |
|
|
|
|
GimC |
Gim 1–6, |
Участие в фолдинге актина, |
|
Prefoldin |
тубулина |
|
|
|
Clusterin |
Clusterin |
Защита от стресса, предотвращение |
|
|
агрегации белков вне клетки |
|
|
|
Фолдазы |
PPI, PDI |
Ферменты, ускоряющие процесс |
|
|
сворачивания белков |
|
|
|
6
Три филогенетических домена (надцарства)
Архебактерии и эубактериии отличаются:
Родство групп установлено по сходству нуклеотидных последовательностей рРНК
-по структуре рибосомной РНК (рРНК);
-по строению клеточной мембраны;
-по составу клеточной стенки;
-по составу и строению многих белков;
-по образу жизни и др.
Современная гипотеза происхождения эукариотических клеток - многократно происходивший в процессе эволюции эндосимбиоз различных прокариот, относящихся к бактериям и археям7.
Распространенность различных семейств шаперонов
Bacteria |
Archaea |
Eukaryotes |
|
|
|
Trigger Factor |
- |
- |
|
|
|
- |
NAC |
NAC |
|
|
|
Hsp70 |
[Hsp70] |
Hsp70 |
|
|
|
- |
prefoldin |
prefoldin |
|
|
|
Hsp60 (group I) |
Hsp60 (group II) |
Hsp60 (group II) |
|
|
|
small Hsp |
small Hsp |
small Hsp |
|
|
|
Hsp90 |
- |
Hsp90 |
|
|
|
Hsp100 |
Hsp100 |
Hsp100 |
|
|
|
SecB |
- |
- |
|
|
|
PapD/FimC |
- |
- |
|
|
|
- |
- |
Hip, Hop, Bag, |
clusterin, calnexin, |
||
|
|
calreticulin, etc. etc. |
|
|
8 |
Как работают шапероны при фолдинге белков?
•Связывают и стабилизируют полипептиды,
имеющие ненативную конформацию, взаимодействуя с гидрофобными областями молекул;
•Предоставляют возможность полипептидам,
имеющим ненативную конформацию, правильно свернуться в изолированном гидрофобном окружении.
9
Шапероны, взаимодействующие с растущей полипептидной цепью
TF
Trigger factor (TF):
•обнаружен только в эубактериях;
•ассоциирован с с большой субъединицей рибосомы;
•связывается с растущей п/п цепью большинства белков;
•распознает участки богатые гидрофобными (в основном ароматическими) и основными ак остатками;
•катализирует пептидил-пролил-цис/транс-изомеразацию;
• |
способствует правильному фолдингу белков. |
10 |
|
|